Édition du génome Flashcards
Pourquoi modifier le génome?
Pour corriger des gènes défectueux
Nommer des caractéristiques de la thérapie génique conventionnelle
-Addition d’un gène
-intégration plus au moins au hasard = effets secondaires
-Ne permet pas de corriger tous les problèmes
-Possibilité de protéines toxiques
Nommer des caractéristiques de la thérapie génique par édition
-Correction de la mutation
-Pas de présence d’un gène sauvage
-Pas d’insertion au hasard
Dans le cas des thérapies géniques, avec quoi se fait la livraison
La livraison se fait in vivo avec un virus (adénoassocié ou lentivirus)
Quels sont les virus de choix pour la livraison des thérapies ?
adénoassocié ou lentivirus
Qu’est-ce que la thérapie génique conventionnelle in vivo
-Transfert de matériel génétique en utilisant des virus
-Virus majoritairement utilisés : rétrovirus et adénovirus
-Risque associé à l’intégration dans le génome : pas capable de cibler certaine région du génome qui aurait 0 risque
Qu’est-ce que la thérapie génique conventionnelle ex vivo
-Modification de cellules hématopoïétiques
-Isolation de cellules du patient ou d’un donneur
-Amplification des cellules in vitro et reçoivent la thérapie génique
-Retransfère des cellules dans le corps du patient
-Permet de remonter les cellules immunitaires à un niveau normal
Quels sont les enjeux de la thérapie génique conventionnelle
-Faisable avec la technologie existante
-Résultats encourageant pour certaines maladies
-Défis :
Est-ce que le gène va bien s’exprimer ?
Est-ce que l’effet thérapeutique sera durable (jours, semaines, mois, années) ?
Est-ce que l’intégration du transgène va perturber le fonctionnement du génome ?
Décrire le principe générale de la technique CRISPR
1.Coupure de l’ADN dirigé dans le génome.
2.Fait par une enzyme nucléase cas9 et dirigé par ARN guide.
3.Une partie de l’ARN guide est complémentaire au site cible et une complémentaire au site PAM pour que la coupure se fasse dans un endroit voulu du génome.
Quel est le mode d’action de Cas9
1.L’endonucléase Cas9 est exprimée avec un signal de localisation cellulaire.
2.Un ARN guide permet de cibler Cas9 sur une séquence du génome particulière.
3.Cas9 déshybride l’ADN et coupe les deux brins avant le site PRAM (proto-spacer adjacent motif, 5’-NGG-3’)
4.Deux types de recombinaison possible : NHEL : indel et recombinaison homologue
Quels sont les particularités de l’échafaud dans le système CRISPR
-ARN guide = échafaud + séquence cible
-L’échafaud est toujours le même, ne change pas en fonction de la cible
-L’échafaud aide Cas9 à lier l’ADN
Par quel étape commence toujours l’édition du génome avec Cas9
Coupure double brin de l’ADN
Qu’est-ce que fait un indel
changement du cadre de lecture ou si la délétion est de 3 nucléotides ou un multiple de 3, alors le cadre de lecture ne change pas. Création du codon stop prématuré, donc une protéine tronquée.
Qu’est-ce que fait une recombinaison homologue ?
apporte un ADN donneur qui a de part et d’autre de la coupure des séquences parfaitement identiques.
Quels sont les 4 stratégies pour le transfert du système CRISPR ?
- Plasmides
- Complexe ribonucléoprotéique: Cas9+gRNA
- ARNm Cas9 + gRNA
- Adénovirus, virus adéno-associé, lentivirus