Dugga 1 Flashcards

Question 1

Q

Vilka två av nedanstående molekyler kan inte skapa vätebindningar?

Answer

A

CH4

- CH3COCH3

Question 2

Q

10 ml av en HCl lösning med ett pH på 2 späds med rent vatten till 1000 ml. Vilket pH får den nya lösningen?

Answer

A

Rätt svar:
Det här problemet kan lösas mycket enkelt då HCl dissocierar fullständigt
Tänk på sambandet pKw=pH+pOH=14 I det här fallet är alltså pH=2
Späder vi ut H+ koncentrationen 100 ggr (log 100 = 2)så kommer pOH värdet att stiga med två enheter från 2 till 4 alltså.
Svar: Det nya pH värdet blir 4

Question 3

Q

Vilken geometrisk form har följande molekyler, rita gärna!

Answer

A

Rätt svar
A rak 180 grader
b. rak 180 grader
c. böjd 2 fria elektronpar och två bindningar
d. tetraeder
e. trigonal pyramidal – tre bindningar ett fritt elektronpar f. platt 120 grader mellan bindningarna

Question 4

Q

Vid jämvikten H2(g)+I2(g)ó2HI (g) så är jämviktskonstanten 49. Beräkna massan fri I2 i ett prov som innehåller 0.2g H2 samt 10.00 g HI?

Answer

A

Vid jämvikt så innehåller alltså provet 0.2g H2 samt 10.00 g HI.
Vi beräknar hur många mol detta är
H2=0.1 mol
HI= 10g/(126.9+1) = 0.07118 mol
I2 är okänt och vi kan kalla det för X
Vi sätter upp jämviktsuttrycket: 49=[HI]2/([I2][H2]
Men vi har ju ingen volym? Hur kan vi då få en koncentration?
Om man tittar i formeln så skulle vi kunna kalla volymen för V i samtliga fall (alltså mol/V) för för den kommer ändå att kunna förkortas bort helt och hållet:
Vi stoppar in siffror och räknar ut X =(0.07118)2/490.1 Det ger 0.001247 mol
I2 väger 254 g/mol alltså blir svaret à 0.316 gram I2 Svar 0.316 gram

Question 5

Q

Det finns mycket i saliven som är av betydelse för tandhälsan.
Namnge 3 olika joner samt 3 olika proteiner i saliven som är viktiga för tänderna
(3p+3p)(TB)

Answer

A

Rätta svar 1. Ca
2. PO4
3. HCO3
4. IgA
5. PRP
6. Mucin
Men det finns fler rätt svar och möjligheter

Question 6

Q

Vilket av följande påståenden stämmer om aminosyror? (1p för ett rätt svar, 0p för två eller fler svar)(JS)
a) Alla aminosyror som förekommer i den mänskliga kroppen behövs för att bygga proteiner
b) Aminosyror med laddade sidokedjor är mål för posttranslationell modifiering
Rätt svar: c) Syra och basiska aminosyror är viktiga för interaktioner mellan proteiner.

Answer

A

Rätt svar: c) Syra och basiska aminosyror är viktiga för interaktioner mellan proteiner.

Question 7

Q

a) Den positiva respektive negativa laddningen hos respektive amino- / carboxylatgruppen hos aminosyror leder till peptidbindning.
Rätt svar: b) Peptidbindningar knyts inom ribosomer genom en kondensationsreaktion.
c) Aminosyror polymeriserar spontant i cellen under ATP förbrukning

Answer

A

Rätt svar: b) Peptidbindningar knyts inom ribosomer genom en kondensationsreaktion.

Question 8

Q

Matcha ihop begreppen 1-4 för strukturnivåer hos proteiner
med beskrivningarna a-d: (dvs dra linje mellan siffra och bokstav dvs 4 st linjer).
(4p för 4 rätta svar)(JS)
1) Primary structure (1)
2) Secondary structure (2) 3) Tertiary structure (3)
4) Quaternary structure (4)

a) Dimer or larger complex formation
b) Three-dimensional protein structure
c) Alpha-helices, beta-sheets and coils
d) Amino acid sequence

Answer

A

Rätt svar: 1-d, 2-c, 3-b, 4-a

Question 9

Q

Beskriv kortfattat två aspekter av begreppet ”proteinveckning”

Answer

A

Rätt svar: proteinveckning beskriver vilka energibidrag som driver att proteiner antar sina nativa strukturer, sambandet mellan primärsekvens och 3D struktur, vägen som en proteinkedja tar från oveckat till 3D struktur, hastigheten av övergången oveckat-nativt, hur proteiner inom celler efficient antar sina 3D strukturer och undviker felaktiga interaktioner

Question 10

Q

Vad kalls den speciella typ av protein är inblandad i proteinveckning i celler?

Answer

A

Chaperones, proteiner som hjälper andra proteiner med veckningen.

Question 11

Q

Nämn ett sätt hur protein ifrån denna grupp fungerar vid ”proteinveckning”. (1p)(JS)

Answer

A

Rätt svar: GroEL som veckar andra proteiner under ATP förbrukning, ”trigger factor” som skyddar ofärdiga nysyntetiserade peptidkedjor när en del av kedjan har matats ut från ribosomen

Question 12

Q

vilket påstående om hur enzymer fungerar är rätt?

a) Ökar reaktionshastigheten genom att påverka DG0 för reaktioner
Rätt svar: b) Ökar reaktionshastigheten genom att sänka aktiveringsenergin för reaktioner
c) Ökar reaktionshastigheten genom att minska entropin i systemet
d) Ställer in jämvikten för reaktioner snabbare genom att öka aktiveringsenergin
e) Ställer in jämvikten för reaktioner snabbare genom att koppla till energimässigt gynnsammare reaktioner

Answer

A

Rätt svar: b) Ökar reaktionshastigheten genom att sänka aktiveringsenergin för reaktioner

Question 13

Q

Vilket av följande påståenden om enzymreglering är mest korrekt? (1p)(SC)

a) Allosteri hos enzymer innebär att de kan utsättas för kompetitiv hämning
b) Cooperativitet hos enzymer är en form av allosteri där reaktionshastigheten påverkas genom att två olika rektioner kopplas till varandra
c) Fosforylering av enzymer är en form av alloster reglering
d) Alloster reglering av enzymer innebär alltid att reaktionshastigheten ökar
Rätt svar: e) Enzymer som regleras via allosteri får en konformationsförändring som påverkar dess funktion

Answer

A

Rätt svar: e) Enzymer som regleras via allosteri får en konformationsförändring som påverkar dess funktion

Question 14

Q

Vilket påstående om strukturen hos DNA är korrekt. (1p)(EJ)
(1p för ett rätt svar, 0p för två eller fler svar).
Rätt svar: De två DNA-strängarna löper antiparallelt med komplementära baser.
DNA innehåller fyra olika baser; Adenine, Uracil, Guanine och Cytosine
DNA:s struktur kallas för en alfa-helix
DNA är uppbyggt av ribonukleotider
Kovalenta bindningar håller samman de två DNA-strängarna så att de inte separerar från varandra.

Answer

A

Rätt svar: De två DNA-strängarna löper antiparallelt med komplementära baser.

Question 15

Q

Var börjar DNA replikationen?

Vid en TATA-box där initieringsfaktorer binder in.
Rätt svar: Vid origins där initieringsfaktorer binder in.
Vid promotorn i nära anslutning till en gen.
Vid centromererna på kromosomen
Vid telomererna på ändarna av kromosomerna.
På endast en plats på varje enskild kromosom hos människa.

Answer

A

Rätt svar: Vid origins där initieringsfaktorer binder in.

Question 16

Q

Vilket påstående om DNA skador är sant?

Vid base excision repair repareras större kovalenta modifieringar på baser, tex pyrimidin-dimerer.
Vid nucleotide excision repair tas ett socker bort från den skadade DNA-strängen för att ett DNA polymerase ska ersätta just den positionen med en korrekt nukleotid.
Det vanligaste felet som måste repareras efter DNA replikationen är T-T mismatches.
DNA ligas behövs inte vid DNA repair, till skillnad från DNA polymeras som alltid behövs.
Rätt svar: Det händer att vatten reagerar med DNA, vilket innebär att puriner lossnar från DNA.

Answer

A

Rätt svar: Det händer att vatten reagerar med DNA, vilket innebär att puriner lossnar från DNA.

Question 17

Q

Transkription i eukaryoter och prokaryoter skiljer sig åt genom att:

A) Prokaryoter behöver till skillnad från eukaryoter ingen primer för att starta transkription
Rätt svar:
B) Eukaryoter processar och modifierar det primära RNA:t C) Prokaryoter använder TTP istället för UTP som substrat för transkription
D) Transkription och translation är skild i tid och rum i prokaryoter.
E) Templatet i prokaryoter är packat i kromatin.

Answer

A

Rätt svar: B) Eukaryoter processar och modifierar det primära RNA:t

Question 18

Q

Räkna upp fyra huvudsteg där eukaryot genexpression kan regleras. Vilka principiella fördelar och nackdelar finns det med att en genprodukt regleras i ett tidigt respektive ett sent steg?

Answer

A

Rätt Svar:

a. Transkriptionsreglering.
b. RNA-processningsreglering.
c. Translationsreglering.
d. Proteinaktivitetsreglering.

Rätt Svar:
Tidig reglering:
Säker avstängning, men svårt detaljstyra.
Sparar produktionskostnad, men långsam påslagning.

Sen reglering:
Mindre säker avstängning, men lättare detaljstyra. Snabb påslagning (man kan jämföra med en Försäkring). ”Farliga” proteiner.

Question 19

Q

En välreglerad viktig process som är nödvändig för translation sker redan innan translationen startar. Vilken är processen?

Varför är det ett viktigt regleringssteg för translationens noggrannhet, vad skulle hända om det blev fel i denna process som inte åtgärdades?

Answer

A

Rätt Svar: inbindandet av en aminosyra till en tRNA. (aminoacyl-tRNA syntes)
Processen sker i två steg, vilka?
Rätt Svar: 1:a steget är aminosyra-aktivering. Aminosyran bildar en kovalent bindning till en adenin nukleotid vilket ger en aminoacyl-AMP. Reaktionen kan skrivas: aminosyra + ATP -> aminoacyl-AMP + PPi I steg 2 bildas en aminoacyl-tRNA genom att den aktiverade aminosyran kopplas till sin tRNA molekyl. Reaktionen kan skrivas: aminoacyl-AMP + tRNA -> aminoacyl-tRNA + AMP

Varför är det ett viktigt regleringssteg för translationens noggrannhet, vad skulle hända om det blev fel i denna process som inte åtgärdades?
Rätt Svar: om fel aminosyra har kopplats till en tRNA hjälper det inte att tRNAs basparning med mRNA är rätt vid själva translationen eftersom fel aminosyra sätts in i proteinet ändå.

Question 20

Q

Vad är SRP?

I vilken process deltar den?

Answer

A

Rätt Svar: SRP är en förkortning av signal recognition particle. Den deltar i translation och transport av cellens alla sekretoriska och membranbundna proteiner

Rätt Svar: SRP känner igen en signalpeptid i den N-terminala delen på de proteiner som ska transporteras till det endoplasmatiska retiklet (ER). Så fort signalpeptiden kommit ut ur ribosomen, innan proteinet translaterats färdigt, binder SRP till signalpeptiden vilket gör att translationen pausar. SRP transporteras sedan tillsammans med ribosomen till ER där de binder till receptorer I ER membraner. En kanal öppnas därmed i ER-membranet och translationen återupptas vilket gör att proteinet på samma gång syntetiseras och transporteras genom ER-membranet. Alla proteiner som ska transporteras ut ur cellen och alla proteiner som ska sitta förankrade i olika membraner i och på cellen syntetiseras på detta sätt.

Question 21

Q

Kromoxid reagerar med Al (s) enligt nedanstående reaktion
Cr2O3 + 2Aló2Cr + Al2O3
Hur stor massa rent Krom kan man få ut om 4 mol Al (s) förbrukas? (

Answer

A

Svar:
Ur formeln kan man se att vi får lika många Cr som vi förbrukar Al. Om vi förbrukar 4 mol Al så får vi alltså 4 mol Cr
Cr väger 52 g/mol så svaret blir alltså 4 * 52g = 208 gram
Svar 208 gram Cr

Question 22

Q

Ange om nedanstående reaktioner är redoxreaktioner eller ej?

a. AgNO3 (aq) + NaCl (aq) ó AgCl (s) + Na+ (aq) + NO3- (aq)
b. CH4 + O2óCO2 + 2H2O
c. LiCl (s) + H2O ó Li+ (aq) + Cl- (aq)
d. Ca (s) + Cl2(g) óCaCl2 (s)
e. Fe2O3 + 3H2 ó 2Fe (s) + 3H2O

Answer

A

Svar

Redox: b,d och e Inte redox: a och c

Question 23

Q

Vätebindningen är viktig i många biologiska sammanhang. Vilken typ av bindning är det och varför bildas den bara när väte binder N, O eller F?

Answer

A

Svar
Vätebindningen är en stark dipol-dipol bindning. En dipol bildas när två atomer med olika elektronegativitet binder till varandra. Detta leder till att molekylen får en partiellt positiv samt partiellt negativ sida. Denna starka dipol kan dock bara skapas om vätet sitter bundet till en atom med stark elektronegativitet samt en liten radie och gäller därmed bara N, O och F. Dessa atomer kan effektivt dra elektronmolnet från vätet och skapa en kraftig dipol. Vätebindningen som är en intermolekylärbindning bildas alltså när de partiella positiva och negativa laddningarna från två dipoler interagerar med varandra.
Atomen med vätet bundet till sig kallas H-bond donnor tex NH, OH och HF. Mottagaren kallas H-bond acceptor och kan vara N, O resp F.
Mottagaren behöver inte ha ett väte bundet till sig (F är en mycket dålig acceptor)

Question 24

Q

Jämvikten I2 (g) + H2 (g) ó 2HI har ett K på 2 vid en viss temperatur
Koncentrationerna på de olika ämnena är: [H2]= 0.1 M, [I2]= 0.1M och [HI]= 0.1 M. a. Beräkna Q

Answer

A

Svar
K= [HI]2/([I2]* [H2])
Q är den siffra på ”K” som man får om man enbart beaktar koncentrationerna i detta läge. Alltså, stoppa in de koncentrationer som vi fått ur frågan.
Ins ger att: Q=0.12/(0.1*0.1)=1
Svar Q=1

Question 25

Q

Är reaktionen i jämvikt, om inte åt vilket håll går den?

Answer

A

Om K=2 och Q= 1 så är K>Q reaktionen kommer att gå mot produkt.

Question 26

Q

ämvikten N2 (g) + 3H2 (g) ó2 NH3 (g) har ställt in sig i ett slutet kärl. Reaktionen är exoterm.
Vad händer med avseende på bildning av NH3 vid nedanstående åtgärder?

Answer

A

Rätt svar 0.5p
Fel svar -0.5p
Uteblivet svar 0p.
Max 2.5p (dock lägst 0p på uppgiften)

a. T emperaturen sänks
Detta är en exoterm reaktion, då värme enligt Chateuliers princip kan ses som en produkt så blir en sänkning samma sak som att ta bort produkt.

b. Tryckethöjs
Produkt gynnas (fler gasvolymer på reaktantsidan än på produktsidan)

c. Mer H2 tillförs
Produkt gynnas

d. Enkatalysatortillsätts
Förskjuter inte reaktionen åt nåt håll.

e. Mer NH3 tillförs
Reaktanter gynnas

Question 27

Q

500 ml av en lösning HCl med ett pH på 2.1 späds med rent vatten till 4 liter. Vilket pH får den nya lösningen?

Answer

A

Svar
Denna kan lösas på lite olika sätt. En variant är att räkna ut hur mycket H+ vi har totalt.
Ett pH på 2.1 betyder att vi har 10-2.1 M = 0,0079432 M
Nu späder vi denna från 0.5 liter till 4 vilket motsvarar 8 ggr spädning. Koncentrationen H+ sjunker nu 8 ggr.
0,0079432/8 = 9,929e-4 M
pH i den nya lösningen är -log på denna koncentration = 3.0003
Svar pH blir 3.0

Question 28

Q

Lösligheten av hydroxyapatit Ca5(PO4)3OH påverkas av pH.

Hur påverkas dess löslighet av att pH sänks och varför?

Answer

A

Svar
Hydroxyapatit dissocierar enligt
Ca5(PO4)3OH ó 5 Ca2+ + 3PO4- + OH-
Då en syra tillsätts kommer OH- att reagera med H+ och bilda H2O. Det blir detsamma som att ta bort produkt och reaktionen förskjuts därmed åt höger. Hydroxyapatit kommer att lösa sig lättare.

Question 29

Q

Rita upp den 3-dimensionella strukturen av nedanstående molekyler.

vatten
metan
metanol
Ammoniak

Question 30

Q

Saliven är av betydelse för tandhälsan

NAMNGE 5 olika SKYDDS-FUNKTIONER i saliv

Answer

A

Svar:
1. Abrasion
2. Attrition
3. Erosion
4. Karies
5. Mjukvävnadsskada
Ytterligare skydds-funktioner kan vara mot Infektioner

Question 31

Q

Vilken / vilka påståenden om aminosyror som ingår i proteiner stämmer: (JS)
a) vinkeln w i ryggraden avgör om en peptid ingår i en alfa-helix eller ett beta-flak. b) sidokedjans egenskaper avgör om en aminosyra hamnar i ett proteins kärna eller på utsidan
c) aminosyrorna glutaminsyra och serin som respektive innehåller en –COOH och – OH grupp i sidokedjan bildar ester som stabiliserar tertiärstrukturer
d) aminosyrornas NH2 och COOH grupper bildar peptidbindningar i en kondensationsreaktion.
(1p för ett rätt svar, -1p för fel svar)

Answer

A

svar: b, d

Question 32

Q

Describe the following terms: (JS)

a) secondary structure (1p)
b) Hydrogen bond (1p)
c) activation energy (1p)
d) exergonic (1p)

Answer

A

Svar:

a) local structural arrangement of the polypeptide chain in proteins into mainly a helix and b sheet.
b) a weak but important bond where a H atom which is bound to a strongly electronegative atom (N, O) binds to another electronegative atom (N, O)
c) the energy barrier that must be overcome for a chemical reaction to happen. The energy is put into the reacting molecules e.g. to distort them into a conformation that is favorable for the reaction.
d) a reaction that releases free energy DG

Question 33

Q

Proteinveckning kan beskrivas som jämvikt med en Gibbs fri energi
DG = DH – TDS. Beskriv tre energibidrag som påverkar storleken hos DG (3p)(JS)
Denna fråga togs bort från Duggan då många hade missuppfattat den.

Answer

A

Svar:

DH of protein chain, DH is negative because bonds (H bonds, van der Waals, etc ) are formed in the protein secondary and tertiary structure, so DH contributes towards folding.
DS of the protein chain, which is negative because the motional freedom of the peptide chain is strongly reduced during folding, and therefore this contributes a positive term to DG which opposes folding
DS of the water in the vicinity of the peptide chain. DHS is positive and therefore generates a negative term to DG which supports folding. The reason is that around the unfolded chain, water molecules near hydrophobic side chains have reduced motional freedom, which increases – and hence DS increases – when the hydrophobic side chains are buried in the protein’s hydrophobic core.

Question 34

Q

Vilket av följande påstående är korrekt om skillnaderna mellan prokaryoter och eukaryoter?

a. Prokaryoter har A-DNA medan eukaryoter har B-DNA, dock har båda samma genetiska kod.
b. På grund av deras snabba evolution har prokaryoter en enklare genetisk kod än eukaryoter.
c. Eukaryota celler har mer interna membraner än prokaryota celler.
d. Eukaryota celler har ingen cellvägg.

Answer

A

c. Eukaryota celler har mer interna membraner än prokaryota celler.

Question 35

Q

Enzymerna EA och EB har samma kcat och katalyserar samma reaktion. Du mäter initialhastigheten för EA och EB med identiska substratkoncentrationer, och finner att EA har en högre initialhastighet än EB. Vilken av de följande är möjliga förklaringar:

a. EB påverkas av ett fenomen som kallas produktinhibering, där P inhiberar EB.
b. EA har lägre Km är EB.
c. EB har lägre Km än EA.
d. EA har högre Vmax än EB.

Answer

A

b. EA har lägre Km är EB.

Question 36

Q

Vilket påstående är korrekt om allosteri:

a. Allosteri kan bara ske när enzymer är mättade med avseende på substrat.
b. Allosteri kan leda till att ett enzym inte följer Michaelis-Mentens kinetik.
c. Allosteri leder alltid till en minskning av ett enzyms aktivitet.
d. Alla alternativ ovan är rätt.

Answer

A

b. Allosteri kan leda till att ett enzym inte följer Michaelis-Mentens kinetik.

Question 37

Q

Vilken betydelse har topoisomeraser för att DNA-replikationen ska fungera?

Answer

A

Svar: a) Vid replikation kommer DNA-helixen att bli ”åtskruvad” (positiv supercoiling) framför replikationsgaffeln och ”uppskruvad” (negativ supercoiling) efter replikationsgaffeln. Detta leder även till att DNA-kedjan kan trasslas ihop på olika sätt. Topoisomerasernas funktion är motverka åtskruvningen/uppskruvningen och tilltrasslingen.

Question 38

Q

I vilken annan viktig process är topoisomeraser viktiga?

Answer

A

Svar: b)Topoisomeraser är även viktiga vid transkription, speciellt vid
transkription av långa gener.

Question 39

Q

Namnge de två vanligaste topoisomerasen och beskriv hur de skiljer sig åt i funktion.

Answer

A

Svar: c) c) Topoisomeras I klyver tillfälligt en fosfodiesterbindning i den ena DNA-strängen vilket gör att supercoilat DNA kan återfå sin normala coiling. Processen kräver ingen energi (=ATP). Topoisomeras II klyver tillfällig fosfodiesterbindningar i båda DNA-kedjorna och kan reda ut strukturer där DNA-kedjorna är tilltrasslade på ett sätt där de omsluter varandra. Kräver energi (ATP).

Question 40

Q

Vid replikationen sker ibland felaktig insättning av en deoxyribonukleotid. Detta korrigeras oftast av att de replikativa DNA-polymeraserna har en 5 ́-3 ́- exonukleasfunktion som omedelbart korrigerar felet. Ibland sker det ändå att felet inte korrigeras direkt av de replikativa DNA-polymerasen. Skadan kan då ändå repareras kort efter det att replikationen skett. (SB)
a) Vad kallas den reparationsmekanismen?

Answer

A

Svar: a) Mis-match reparation.

Question 41

Q

Hur kan cellen veta vilken av deoxyribonukleotiderna i de båda DNA-strängarna som är den korrekta? Detta sker på olika sätt i prokaryoter och eukaryoter, men det räcker att beskriva ett av systemen.

Answer

A

b) I både eukaryoter och prokaryoter gäller det att cellerna kan skilja på vilken av DNA-strängarna som är gammal och vilken som är nysyntetiserad I prokaryota celler identifieras den gamla strängen genom att den är metylerad på vissa specifika positioner. I eukaryota celler identifieras den nya strängen antingen genom att den innehåller nicks mellan Okazakifragmenten (lagging strand), eller att den innehåller ribonukleotider var 600-1000 baspar, som inte hunnit bytas ut förrän efter en viss fördröjning (leading och lagging strand).

Question 42

Q

Var i cellen sker splicing?

Answer

A

Sker i cellkärnan

Question 43

Q

Vilka komponenter är inblandade och hur sker reaktionen?

Answer

A

Svar: Nysyntetiserat RNA binds under pågående transkription till snRNAs (small nuclear ribonucleic acids) (0.5 p) och snRNPs (small nuclear ribonucleoproteins) (0.5 p) som bildar ett RNA-proteinkomplex kallat spliceosomen (0.5 p). Splicing sker genom att snRNP U1 binder till en konserverad 9-mer i 5 ́-ändan på intronet därefter byggs ett s k spliceosomen upp av snRNP U1-U6. Detta komplex genomgår en konformationsändring som gör att intronet snörps ihop varvid en kritisk adeninrest nära intronets 3 ́-ända kommer i närheten av intronets 5 ́-ända. Adeninrestens 2 ́-OH-grupp utför sedan en nukleofil attack på fosfodiesterbindningen i bindningen mellan exon- introngränsen i intronets 5 ́-ända och via en transesterifiering (0.5 p) bildas en ny fosfodiesterbindning mellan adeninet i bransch-point och intronets först ribonukleotid. En konformationsförändring i spliceosomen leder sedan till att exonets frisatta 3 ́-ända hamnar nära gränsen mellan intronet och nästa exon. Exonets fria 3 ́-ända utför då en nukleofil attack på fosfodiesterbindningen mellan intronet och nästa exon. Vi en andra transesterifiering (0.5 p) sammankopplas så det första exonets 3 ́-ända med nästa exons 5 ́-ända via en fosfodiesterbindning. Introner frisätts som en lariat (=lasso)-formad struktur (0.5 p) som sedan bryts ned.

Question 44

Q

Nämn tre typer av modifieringar av aminosyror hos histoner.

Answer

A

De vanligaste modifieringarna av histonsvansar är acetylering och metylering av lysiner samt fosforylering av seriner.

Question 45

Q

Hur påverkar modifieringarna av histonerna kromatinet

Answer

A

Svar: Fosforylering och acetylering leder till att histonernas N-terminala svansar blir mer negativt laddade (0.5 p). Det gör att de repellerar från DNA:t och leder till att kromatinet luckras upp (0.5 p). Metyleringar gör att svanserna kan binda kännas igen av andra kromatin-remodellerande proteinkomplex som leder till ytterligare uppluckring av kromatinet (0.5 p). Modifieringarna av svansarna kan göra så att kromatinstrukturen luckras upp alternativt packas ihop vilket medför att reglerande och generella transkriptionsproteiner får lättare/svårare att binda till sina igenkänningssekvenser. Detta leder följaktligen till ökad/minskad (=reglerad) transkription.

Question 46

Q

Beskriv den principiella skillnaden mellan cap-beroende translationsinitiering i eukaryoter och translationsinitiering i prokaryoter?

Answer

A

I eukaryoter binder 40S-subenheten plus vissa initieringsfaktorer till cap- strukturen på 5’-ändan på mRNA (0.5 p) . Efter inbindning scannar complexet mRNA från 5’-ändan till första AUG, vid vilken start av translation sker (0.5 p) (naturligtvis bildas ett 80S initierings-komplex före translations-start). [Detta är en förenklad version utan att ange alla faktorernas namn.]
I prokaryoter binder 30S-subenheten till SD (Shine and Delgarno)-sekvensen på mRNA som ligger 5-8 nukleotider uppströms start-AUG (0.5 p). SD är komplementär till en sekvens i 16S rRNA (0.5 p) . [Det krävs inte att ange “5-8 nukleotider”; “just” eller “nära” går också bra. Alternativa ordval till “uppströms” start-AUG är “före” start-AUG eller “5’” start-AUG .]

Question 47

Q

Vad innebär zymogenaktivering?

Ge ett exempel på ett viktigt protein vars aktivitet regleras med hjälp av zymogenaktivering.?

Answer

A

a) Vissa proteiner bildas som ett zymogen, vilket är en inaktiv form av proteinet (proenzym). Proteinet kan sedan aktiveras när det behövs, t ex genom klyvning eller genom en konformationsförändring. b) T ex insulin, koaguleringsfaktorer

T ex insulin, koaguleringsfaktorer

Question 48

Q

Hybridisering är ett viktigt steg i flera molekylärbiologiska metoder.

a) Vad är hybridisering? (1p)
b) Förklara kortfattat hur hybridisering används vid PCR (1p)
c) Förklara kortfattat hur hybridisering används vid Microarray-analys? (1p)

Answer

A

a) Svar: Sekvensspecifik basparning mellan nukleinsyror
b) Svar: De sekvensspecifika primrarna i PCR hybridiserar till templatet.
c) Svar: De sekvensspecifika proberna på arrayen hybridiserar till det RNA eller DNA som eftersöks.

Question 49

Q

Vilket av följande påståenden om kariessjukdom är fel?

a) Man kan ha mycket hål i tänderna p.g.a. genetiska orsaker
b) Streptococcus mutans bakterierna bygger nätverk av dextraner där syra-
produktionen leder till områden med lokalt lågt pH.
c) Högasyranivåeritandbeläggningarna,sk.dentalacidos,kanman
neutralisera genom att andas snabbare vilket då via bikarbonat-systemet
buffrar bort syran.
d) Kariessjukdom kan bero på dålig buffrings-förmåga i saliven.

Answer

A

c) Höga syranivåer i tandbeläggningarna ,sk. dental acidos, kan man neutralisera genom att andas snabbare vilket då via bikarbonat-systemet
buffrar bort syran.

Question 50

Q

I saliven finns många proteiner och på tandytorna finns oftast andra proteiner, Ringa in det protein, dvs ett svar som finns framförallt på tandytorna

Amylas
PRP
Statherin
Myeloperoxidas 5. Mucin
Defensiner

Question 51

Q

Kirala kol är ett problem vid läkemedelstillverkning då det resulterar i två olika former av molekylen med identiska fysikaliska egenskaper men med olika tredimensionell struktur. Vanligen (nästan alltid) är det bara den ena formen som är aktiv medan den andra istället utgör en risk då den möjligen kan resultera i oönskade biverkningar.
Ibuprofen och amfetamin innehåller båda ett kiralt kol, ringa in vilken bokstav (a. – e.) som indikerar detta kol i deras strukturformel nedan?

Answer

A

Rätt svar A = d Rätt svar: B = c
(TITTA BILDEN)

Question 52

Q

Le Chateuliers princip beskriver hur ett jämviktssystem påverkas av olika faktorer. 3H2 + 2N2 2NH3
Ovan visas den så kallade Haber-Bosch reaktionen som beskriver hur kväve kan bindas ur luften. Reaktionen är exoterm. Åt vilket håll förskjuts reaktionen i nedanstående fall

Answer

A

—– (TITTA BILDEN)

Question 53

Q

0.20 mol av en enprotonig syra löses i vatten till en total volym på 1.00 liter. Detta ger ett pH på 2.0. Vilket pKa har syran?

a. 2.0
b. 0.4
c. 3.3
d. 4.0
e. 5.3
f. 7.0

Answer

A

c. 3.3

Lösning
HAcóH+ + Ac-
Ka= ([H+]*[Ac-])/[HAc] H+ = 10-2 =0.01M Ac-=10-2 =0.01 M HAc= 0.2-0.01 =0.19
Ins ger Ka = (0.012)/0.19 Ka=5.26*10-4
pKa= 3.3

Question 54

Q

Frågan felaktig och togs således bort från tentamen poängen.

CaOH2 är ett salt med en löslighetsprodukt på 5.5*10-6 i vatten. Till vilken koncentration kan CaF2 lösas maximalt?

Answer

A

a. 0.011
b. 0.0036 M
c. 2.1510-4 M
d. 0.15 M
e. 4.610-8

Question 55

Q

1 liter HCl (aq) med ett pH på 1.50 späds med 1 liter NaOH (aq) pH 12.00. Vilket pH får den nya lösningen?

Answer

A

Lösning:
Här får man klura lite på vad som händer. Om en stark bas sätts till en stark syra så kommer det att stökiometriskt förbruka varandra. Det gäller alltså att se vilken det är mest av och sedan hur mycket som blir kvara av denna. Det gäller äeven att tänka på att vi får en utpädning.
Konc H+= 10^-1.5 = 0.0316 Molar
Konc OH- = p[OH] = 10^-2 = 0.01 M
Vi har alltså lite mer HCl så vi kan redan här se att pH kommer att ligga under 7.
Vi räknar ut det som blir över av H+ = 0.0316-0.01 = 0.0216 mol. Nu fick vi ju dock en utspädning som vi måste beakta då vi går från 1 till 2 liter. Koncentrationen H+ blir därför 0.0216/2 = 0.0108
pH=-log0.0108 = 1.97 Svar pH 1.97

Question 56

Q

Sätt upp ett uttryck för jämviktskonstanten K för följande reaktioner?

a. N2(g) +3H2(g) 2NH3 (g) b. H2 (g)+S(s) H2S(g)
c. Cu(BrO3)2(s) Cu2+(aq) + 2 (BrO3) (aq)
d. Ca (PO ) OH (s) 5Ca2+ (aq) + 3PO -3 (aq) + OH-(aq)

Answer

A

Svar
(Här har många missat att fast fas inte tas med i uttrycket).
a. Kc= [NH3]2/([N2] *[H2]3)
b. Kc=H2S/H2
c. Ksp= [Cu2+]*[BrO3]2
d. Ksp= [Ca2+]5 + [PO -3]3 *[OH-]

Question 57

Q

Världens sammanlagda koldioxidutsläpp ligger idag på en för hög nivå för att nå Parisavtalets mål och hålla den globala uppvärmningen under 2 grader. Utsläppen per capita behöver minskas dramatisk för att inte processen skall bli självförstärkande när metangas börjar läcka från den Sibiriska tundran. Mänskligheten bör sikta på ca 1.5 ton per person och år. En resa ToR mellan Umeå och Bangkok förbrukar ca 400 kg fotogen per person. Fotogen är en blandning av olika mättade kolväten med i snitt ca 14 kolatomer och kan förenklas till C14H28
Hur många kg koldioxid genererar denna resa?

Answer

A

Svar
Förbräning av C14H28 kommer att ge 14CO2 samt 14 H20. Vi vill veta hur mycket den bildade CO2 gasen från 400 kg fotogen väger.
För att räkna ut detta måste vi veta andelen kol i C14H28. Kol väger 12 och H väger 1
Den totala andelen kol blir alltså (14*12)/((14*12)+28*1)) = 0.85714. Av total 400 kg fotogen kommer alltså 342 kg att vara kol.
En CO2 väger ju dock 44 g/mol till skillnad från kol som ju bara väger 12. Det betyder att vikten kommer att öka med 44/12.
Vikten av koldioxiden blir alltså 44/12*342 = 1257 kg.
Svar 1257
(det bör tilläggas att man i verkligheten också skulle räkna in den så kallade höghöjdseffekten vilken gör att i CO2 ekvivalenter så är utsläppet dubblat, ca 2.7 ton, men detta ingick inte i frågan).

Question 58

Q

Beräkna pH i följande lösningar: (2p)

a. [OH] = 0.4 M = 14-(-log0.4) = 13.6
b. pOH=7
c. I en lösning med 0.2 M HAc och 0.2M Ac- (pKa för HAc är 4.8)
d. 0.25 M HCl

Answer

A

a. [OH] = 0.4 M = 14-(-log0.4) = 13.6
b. pOH=7 =pH7

c. I en lösning med 0.2 M HAc och 0.2M Ac- (pKa för HAc är 4.8)
Enligt Hendersson-Hasselbach är pH=pKa+ log([Bas]/[syra]), vid lika mycket bas som syra blir logaritmen för denna kvot = 0 och pH=pKa
Svar pH=4.8

d. 0.25 M HCl
Detta är en stark syra som dissocierar fullständigt Svar pH = -log0.25 = 0.6

Question 59

Q

Vilket av följande är en förutsättning för biologisk evolution så som den sker på jorden? (1p)

a. Att det finns flera arter.
b. Att prokaryoter kan överföra gener till eukaryoter.
c. Att ärftlig genetisk variation ger individer olika reproduktionsframgång.
d. Att miljöbetingelser kan påverka DNAt så att en individs gener förändras beroende på miljön.

Answer

A

c. Att ärftlig genetisk variation ger individer olika reproduktionsframgång.

Question 60

Q

Which angles in the backbone of proteins define the secondary structure elements of proteins?

Answer

A

—- TITTA BILDEN

Question 61

Q

Vilka rotationsvinklar i ryggraden hos proteiner definierar sekundärstrukturelement hos proteiner?

Answer

A

—- TITTA BILDEN

Question 62

Q

The side chains of the amino acids of an a helix (1p)

fill the inside of the helix and stabilize it by van der Waals contacts
stabilize the helix by amide bonds between basic and acidic side chains 3. all curve in the same direction so that the helix fits.
point outwards from the helix and stabilize the tertiary structure

Answer

A

point outwards from the helix and stabilize the tertiary structure

Question 63

Q

Sidokedjorna hos aminosyror som bildar en a helix

Fyller interiört helixen och stabiliserar den med van der Waals kontakter
stabiliserar helixen med amidbindningar mellan basiska och sura sidokedjor 3. Är alla böjda åt samma håll så att helixen passar ihop
Pekar utåt från helixen och stabiliserar tertiär-strukturen.

Answer

A

Pekar utåt från helixen och stabiliserar tertiär-strukturen.

Question 64

Q

For endergonic reactions holds: (1p)

It has a low activation energy and therefore starts spontaneously 2. It can occur spontaneously if it is exothermic
It has in equilibrium more starting material than product
It cannot be catalyzed by enzymes

Answer

A

It has in equilibrium more starting material than product

Answer 63

A

De har i jämvikt mer startmaterial än produkt

Answer 64

A

b. Enzymer sänker en reaktions aktiveringsenergi ΔG‡ och ökar därigenom dess hastighet.

Answer 65

A

c. Fosforylering av ett enzym kan antingen aktivera eller inaktivera det.

Answer 66

A

b. De replikativa DNA poymeraserna kräver en fri 3 ́-OH ända för att påbörja DNA-syntes

Answer 67

A

a. Nucleotideexcisionrepair

Answer 68

A

b. De sänker RNA polymerasets generella förmåga att binda till DNA och starta transkription vart som helst, samt ökar RNA polymeraset förmåga att binda till promotorer

Answer 69

A

e.SplicingkatalyserasavettkomplexbeståendeavbådeRNAochprotein

Answer 70

A

d. Är viktiga för korrekt translation

Answer 71

A

b. 5 ́-CAP-strukturen

Answer 72

A

d. Den binder till den N-terminala peptiden på proteiner som ska
transporteras till det endoplasmatiska retiklet

Answer 73

A

Det skulle inte bli någon DNA-syntes i vår PCR eftersom dideoxynukleotider (ddNTPs) inte har en OH-grupp på 3’-kolet att koppla nästa byggsten till.

Brainscape's Knowledge GenomeTM

Dugga 1 Flashcards

Brainscape's Knowledge Genome^TM