Dotplot 1 Flashcards
1
Q
Was bedeutet die diagonale durchgezogene DOtplotlinie?
A
Viele Matches der beiden Sequenzen
2
Q
Tool für Pairwise alignment?
A
Dotplot
3
Q
Wa gibt die distance in Dotplot an?
A
Die nötige Anzahl an Nukleotid changes um die Base zu verändern
4
Q
Pogramme um Nukleotidänderungsmatricen zu erstellen, basis für Dotplot
A
PAM und BLOSUM
5
Q
Welches PAM und Blosum braucht man bei geringem evol. Abstand?
A
kleine PAM und große BLOSUM
6
Q
Welches PAM und BLOSUM braucht man bei großem evol. Abstand?
A
große PAM und kleines BLOSUM
7
Q
Wo ist ein Aminosäurenaustausch unwahrscheinlich? Warum?
A
In sekundärstrukturen da diese meist verloren gehen weil hydrophob- polar Orientierung verworfen wird
8
Q
Was sind Indels?
A
Insertionen und Deletionen
