DNA - uppbyggnad & struktur Flashcards
Vad är replikation, och hur drivs det framåt?
DNA kopieras till DNA. Sker vid celldelning. Är enzymdrivet.
Vad är transkription?
Transkription är processen DNA -> RNA.
Största skillnaderna mellan replikation och transkription? (3)
- Vid replikation är slutmolekylen DNA, vid transkription är det RNA.
- Transkription ger en tillfällig kopia av genetisk information.
- Vid replikation replikeras hela DNA’t, vid transkription transkriberas enbart det som behövs
Vad är translation, och hur drivs det framåt?
Translation är ett annat ord för proteinsyntes. Är enzymdrivet och kräver väldigt mycket energi i form av ATP & GTP
Vad är molekylärbiologins centrala dogma?
Det genetiska flödet i en cell
Hur kan nukleinsyrors strukturnivåer delas in, och vad innefattar de?
- Primärstruktur - basernas ordning i polynukleotidsekvensen
- Sekundärstruktur - ryggradens 3D-konformation
- Tertiärstruktur - typen av molekylens supercoiling
- Kvartärstruktur - nukleinsyrornas interaktioner med proteiner
Vilka delar består en DNA-molekyl av?
Kvävebas, sockermolekyl (sitter i mitten) och fosfatdel
Vad är det för skillnad mellan nukleosid och nukleotid?
Nukleosiden består av sockermolekyl + kvävebas.
Nukleotiden är nukleosiden + fosfatgrupp
Hur numreras kolatomerna i sockerdelen?
Kvävebasen vid 1’, fosfatgruppen vid 5’
Hur skiljer sig DNA från RNA i uppbyggnad?
RNA har på kolatom 2 i sockermolekylen en hydroxylgrupp, vilket innebär att den bildar ribos. DNA har ingen hydroxylgrupp på 2’ och benämns deoxyribos.
Vilket håll läses DNA (och RNA) på, och varför?
Riktning 5’ till 3’. Detta eftersom DNA-polymeraset skapar molekylen i samma riktning
Varför är bindningen G-C mer stabil än bindningen A-T?
Eftersom bindningen A-T består av två vätebindningar, medan bindningen G-C består av tre.
Vad är minor och major groove, och hur uppstår det?
Då bp inte sitter helt diametralt vid uppbyggnaden av dubbelhelixen bildas minor och major groove, där bp sitter närmare varandra i minor groove än i major
Vad beror base stacking på?
Det sker hydrofoba interaktioner mellan pi-bindningarna i molekyler före och efter i sekvensen
Vad kallas den vanligaste/mest optimala formen på helixen? Och vilka övriga former återfinns? Hur ser dessa ut, och varför bildas de?
B-form
Dessutom återfinns A-form och Z-form.
A-form bildas genom att DNA dehydreras. Detta leder till att strukturen kollapsar, vilket bidrar till att molekylen vinklar sig. Finns troligen inte i DNA i naturen
Z-form bildas om det finns alternerande G-C, G-C, G-C och dessutom metylering, vilket leder till att allt inte får plats. Ryggraden gör då extra svängar, för att utgöra mer plats, vilket ger ett sick-sack mönster
Vad är supercoiling?
Tertiärstrukturen för DNA, och är ett sätt att packa DNA och skydda det från t.ex. DNAser.
Negativ supercoiling = underwining. Naturligt förekommande för packning av DNA
Positiv supercoiling = overwinding. Sker vid celldelning
Vad är topoisomeras, och vad gör det?
Topoisomeras är en grupp enzymer som kan ändra supercoilingen, och göra DNA-molekylen relaxerad. Topoisomeras II bryter bägge strängarna, och typ I bryter vara en.
Hur klassificeras en mutation?
Permanent förändring i DNAmolekylens nukleotidsekvens
Hur klassificeras en mutant?
En organism med mutation
Hur benämns en organism med “normal” icke-muterad sekvens?
Vildtyp
Vilka typer av punktmutationer finns?
Substitution, deletion och insertion
Vad innebär polymorfism?
Genetisk variation bland befolkningen
Vad innebär transition?
En mutation som ändrar en purin till en annan purin, alt. en pyrimidin till en annan pyrimidin
Vad innebär transversion?
En mutation som ändrar en purin till en pyrimidin eller tvärtom
Vad innebär en tyst mutation?
Mutation i DNA som kodar för samma aminosyra
Vad innebär en missensemutation?
Mutation i DNA som kodar för en annan aminosyra
Vad innebär en nonsensemutation?
Mutation i DNA som kodar för ett stopkodon
Vad innebär en frame-shiftmutation?
Deletion eller insertion i DNA som leder till förflyttning av kodonet
Vad innebär suppressormutation?
Mutation som delvis eller helt återställer effekterna av en annan mutation. Fel + fel = rätt
Vilka orsaker finns det för skador på DNA i levande celler?
Spontana förändringar, replikationsfel och kortvågig strålning
