DNA struktur

Question 1

Vilka tre delar består en nukleotid av?

Answer 1

• En kvävebas (purin eller pyrmidin)
• Ett femkolsocker (Ribos eller deoxyribos)
• Minst en fosfatgrupp

Question 2

Vilken position på ribos binder kvävebasen?

Answer 2

1’- kolet!

Question 3

Vilken position på binder fosfat till?

Answer 3

5’-kolet!

Question 4

Vilken position på ribos har en OH grupp? Är detta i DNA eller RNA?

Answer 4

3’-kolet!

RNA har en OH grupp på 3’ kolet i kolringen, därav namnet ribos.

DNA saknar OH - gruppen –> deOXYribos!

Question 5

Mellan vilka positioner uppkommer fosfodiesterbindningar?

Answer 5

Mellan 5’ fosfatguppen och 3’-OH gruppen hos två nukleotider.

Question 6

Vad är skillnaden mellan en nukleosid och en nukleotid?

Answer 6

En nukleosid består av ett fem-kol-socker och en kvävebas!

En nukleotid är en nukleosid plus en fosfatgrupp!

Question 7

Vilken typ av bindning är mellan kvävebasen och sockret?

Answer 7

• Glykosidbindning!

Question 8

Vilken typ av bindning är mellan 5’ kol och 3’ kol hos två socker?

Answer 8

Fosfodiesterbindningar!

Question 9

Vilken typ av bindningar och i vilken kvantitet uppstår mellan kvävebaserna?

Answer 9

• Mellan G-C finns 3 vätebindningar
• Mellan A-T finns 2 vätebindningar
• Mellan A-U finns 2 vätebindningar

Question 10

Vad är base-stacking?

Answer 10

Den uppsättning interaktioner som ger upphov till basernas 3-dimensionella struktur i samspel med varandra:

• Hydrofoba interaktioner
• van der Waals bindningar
• Elektrostatiska interaktioner

Question 11

Vad är ytterst, sckret eller kvävebaserna och varför?

Answer 11

Hydrofoba krafter organiserar sockret ytterst och kvävebaserna innerst

Question 12

Var finner du B-DNA?

Answer 12

Vanligaste typen!

• I cellkärnan
• Är högervridet!

Question 13

Var finner du A-DNA?

Answer 13

Finns i kondenserade prover och i RNA-DNA hybridhelix.

- Vänstervridet!

Question 14

Var finner du Z-DNA?

Answer 14

Finns temporärt och kan ha regulatorisk roll

- Metylerat DNA har Z-form!

Question 15

Var finner du mtDNA?

Answer 15

Mitokondriellt DNA!

- Finns i mitokondrien kopierat 2-10 ggr. Replikeras under mitokondrierdelninge.

Question 16

Sammanfatta packningen av DNA!

Answer 16

DNA –> DNA binder till nuklesomer –> nukleosomer läggs på varandra till kromatin –> “looped domains” –> heterochromatin –> kromosom!

Question 17

Hur många varv viras DNA kring en nukleosom?

Answer 17

Ca 1,65 (olika i olika böcker).

Question 18

På vilket sätt kan histonsvansarna modifieras och vad får detta för konsekvenser?

Answer 18

Metylering
- Kondensering och tätare packning av DNA –> Kromosomer

Acetylering
- Uppluckring till euchromatin för att replikationsmaskineriet ska kunna binda in.

Question 19

Vad kan underlätta supercoiling?

Answer 19

Condensin!

• Aktiveras av B-CDK1

Question 20

Skillnad mellan RNA och DNA?

Answer 20

RNA har en OH grupp på 2’-kolet på pentoset vilket gör det till ribos!

DNA har ingen OH grupp utan enbart en bunden proton
–> Deoxyribos!