DNA- och RNA-struktur

Question 1

Vad står “DNA” respektive “RNA” för?

Answer 1

Deoxyribonukleinsyra och ribonukleinsyra.

Question 2

Vilka är purinerna?

Answer 2

Adenin och guanin.

Question 3

Vilka är pyrimidinerna?

Answer 3

Cytosin, tymin och uracil.

Question 4

Vad har tymin som skiljer tymin från uracil?

Answer 4

En metylgrupp.

Question 5

Vad för grupper sitter i DNA:s och RNA:s 5’- respektive 3’-primposition?

Answer 5

En fri fosfatgrupp respektive en fri hydroxylgrupp.

Question 6

Vilken typ av bindningar finns mellan kvävebaserna och hur många bindningar mellan respektive typ av kvävebaspar, i DNA?

Answer 6

Vätebindningar. Två mellan A och T, och tre mellan G och C.

Question 7

Hur hålls DNA-molekylen ihop annars?

Answer 7

Med “base-stacking”-interaktioner (hydrofoba interaktioner och van der Waals-bindningar) mellan baserna på samma sträng, samt för att vattenmolekylerna som exkluderas frå helixens hydrofoba insida ansamlas på utsidan och trycker ihop strängarna.

Question 8

Vad är A-format DNA?

Answer 8

Dehydrerat DNA som bildas i cellen temporärt och som har purinrika sekvenser.

Question 9

Vad är Z-format DNA och i vilka sekvenser finns det mest av det?

Answer 9

Bildas temporärt och har en regulatorisk roll. Påträffas framför allt i metylerade G-C-sekvenser.

Question 10

Vad är palindromska DNA-sekvenser säte för?

Answer 10

Restriktionsenzymer och metylering.

Question 11

Vad gör korsformat DNA?

Answer 11

Reglerar replikation, rekombination, genuttryck och kromosomstruktur, samt är måltavla för DNA-bindande proteiner som p53 och H1.

Question 12

När bildas hårnålsformat DNA och var kan det finnas?

Answer 12

På ssDNA under DNA-reparation. Finns i vissa virus.

Question 13

När kan trippelhelixar/H-DNA bildas och vad kan det ha för konsekvenser?

Answer 13

Om mirror repeatsen inte är exakta spegelbilder. Kan påverka replikationen och transkriptionen samt kan destabilisera DNA, eftersom det hindrar bindning av reparationsenzymer. Detta kan leda till mutationer som T-cells-leukemi.

Question 14

Hur supercoilas DNA i prokaryoter respektive i eukaryoter?

Answer 14

Plectonemiskt respektive solenoidalt.

Question 15

Vad heter de minsta repeterande beståndsdelarna i kromatin?

Answer 15

Nukleosomer.

Question 16

Vad utgörs nukleosomen av?

Answer 16

DNA-spiralen som virat sig två varv runt nukleosomkärnan som i sin tur består av ett histonkomplex med åtta olika histontyper.

Question 17

Vilket histon håller ihop nukleosomerna?

Answer 17

H1.

Question 18

Vilka är de fyra olika histontyperna som det finns två av varje av, och som tillsammans utgör nukleosomkärnan?

Answer 18

H2A, H2B, H3 och H4.

Question 19

Vad gör cohesin?

Answer 19

Håller samman systerkromatiderna i eukaryota celler tills de separeras i anafasen.

Question 20

Vad gör condensin?

Answer 20

Binder till systerkromatiderna i början av mitosen och supercoilar DNA:t (“kondenserar” det).

Question 21

Vad kräver DNA-polymeras vid replikationen?

Answer 21

En primer.

Question 22

Vad levereras nukleotiderna som och vad sker med detta?

Answer 22

dNTP, trifosfat, där två fosfater kommer att avspjälkas och ingå i fosfodiesterbindningen.

Question 23

Vad för korrekturläsning har DNA-polymeras?

Answer 23

Exonukleasaktivitet.

Question 24

Vad är en primer?

Answer 24

En enkelsträngad sekvens av RNA som binder komplementärt till modersträngen och förlängs därefter. Enzymer tar bort primern sedan, eftersom RNA ej ska finnas i generna.

Question 25

Vad är två viktiga skillnader mellan RNA-polymeras och DNA-polymeras?

Answer 25

RNA-polymeras behöver ingen primer och har inte en lika omfattande korrekturläsningsaktivitet.

Question 26

Vad är ribosomer och vad består de av?

Answer 26

Ribozymer. Består av rRNA och proteiner.

Question 27

Vad är ett ribozym och vad kan det också kallas? Vad har de ofta för kofaktor?

Answer 27

En RNA-molekyl som kan katalysera en kemisk reaktion. Även kallat RNA-enzym eller katalytiskt RNA. Mg+.

Question 28

Vilka tre reaktioner katalyserar omvänt transkriptas?

Answer 28

1. “RNA-dependent” DNA-syntes.
2. RNA-nedbrytning.
3. “DNA-dependent” DNA-syntes.

Question 29

Vad sker vid “DNA-dependent” DNA-syntes?

Answer 29

ssDNA kommer att syntetisera ett (komplementärt) cDNA.

Question 30

Vad är telomeras?

Answer 30

En typ av transkriptas (omvänt transkriptas) då det har RNA i sig.

Question 31

Vad är RNA-replikas?

Answer 31

Ett enzym vars mekanism påminner om RNA-polymeras, och som vissa virus använder vid replikering.