DNA- och RNA-struktur Flashcards
Vad står “DNA” respektive “RNA” för?
Deoxyribonukleinsyra och ribonukleinsyra.
Vilka är purinerna?
Adenin och guanin.
Vilka är pyrimidinerna?
Cytosin, tymin och uracil.
Vad har tymin som skiljer tymin från uracil?
En metylgrupp.
Vad för grupper sitter i DNA:s och RNA:s 5’- respektive 3’-primposition?
En fri fosfatgrupp respektive en fri hydroxylgrupp.
Vilken typ av bindningar finns mellan kvävebaserna och hur många bindningar mellan respektive typ av kvävebaspar, i DNA?
Vätebindningar. Två mellan A och T, och tre mellan G och C.
Hur hålls DNA-molekylen ihop annars?
Med “base-stacking”-interaktioner (hydrofoba interaktioner och van der Waals-bindningar) mellan baserna på samma sträng, samt för att vattenmolekylerna som exkluderas frå helixens hydrofoba insida ansamlas på utsidan och trycker ihop strängarna.
Vad är A-format DNA?
Dehydrerat DNA som bildas i cellen temporärt och som har purinrika sekvenser.
Vad är Z-format DNA och i vilka sekvenser finns det mest av det?
Bildas temporärt och har en regulatorisk roll. Påträffas framför allt i metylerade G-C-sekvenser.
Vad är palindromska DNA-sekvenser säte för?
Restriktionsenzymer och metylering.
Vad gör korsformat DNA?
Reglerar replikation, rekombination, genuttryck och kromosomstruktur, samt är måltavla för DNA-bindande proteiner som p53 och H1.
När bildas hårnålsformat DNA och var kan det finnas?
På ssDNA under DNA-reparation. Finns i vissa virus.
När kan trippelhelixar/H-DNA bildas och vad kan det ha för konsekvenser?
Om mirror repeatsen inte är exakta spegelbilder. Kan påverka replikationen och transkriptionen samt kan destabilisera DNA, eftersom det hindrar bindning av reparationsenzymer. Detta kan leda till mutationer som T-cells-leukemi.
Hur supercoilas DNA i prokaryoter respektive i eukaryoter?
Plectonemiskt respektive solenoidalt.
Vad heter de minsta repeterande beståndsdelarna i kromatin?
Nukleosomer.
Vad utgörs nukleosomen av?
DNA-spiralen som virat sig två varv runt nukleosomkärnan som i sin tur består av ett histonkomplex med åtta olika histontyper.
Vilket histon håller ihop nukleosomerna?
H1.
Vilka är de fyra olika histontyperna som det finns två av varje av, och som tillsammans utgör nukleosomkärnan?
H2A, H2B, H3 och H4.
Vad gör cohesin?
Håller samman systerkromatiderna i eukaryota celler tills de separeras i anafasen.
Vad gör condensin?
Binder till systerkromatiderna i början av mitosen och supercoilar DNA:t (“kondenserar” det).
Vad kräver DNA-polymeras vid replikationen?
En primer.
Vad levereras nukleotiderna som och vad sker med detta?
dNTP, trifosfat, där två fosfater kommer att avspjälkas och ingå i fosfodiesterbindningen.
Vad för korrekturläsning har DNA-polymeras?
Exonukleasaktivitet.
Vad är en primer?
En enkelsträngad sekvens av RNA som binder komplementärt till modersträngen och förlängs därefter. Enzymer tar bort primern sedan, eftersom RNA ej ska finnas i generna.
Vad är två viktiga skillnader mellan RNA-polymeras och DNA-polymeras?
RNA-polymeras behöver ingen primer och har inte en lika omfattande korrekturläsningsaktivitet.
Vad är ribosomer och vad består de av?
Ribozymer. Består av rRNA och proteiner.
Vad är ett ribozym och vad kan det också kallas? Vad har de ofta för kofaktor?
En RNA-molekyl som kan katalysera en kemisk reaktion. Även kallat RNA-enzym eller katalytiskt RNA. Mg+.
Vilka tre reaktioner katalyserar omvänt transkriptas?
- “RNA-dependent” DNA-syntes.
- RNA-nedbrytning.
- “DNA-dependent” DNA-syntes.
Vad sker vid “DNA-dependent” DNA-syntes?
ssDNA kommer att syntetisera ett (komplementärt) cDNA.
Vad är telomeras?
En typ av transkriptas (omvänt transkriptas) då det har RNA i sig.
Vad är RNA-replikas?
Ett enzym vars mekanism påminner om RNA-polymeras, och som vissa virus använder vid replikering.
