Cytogenetique Flashcards
c’est quoi la cytogénétique
c’est la science qui étudie les chromosomes leur structure
leur fonction et leur anomalie
cytogénétique medicale
cherche les anomalies chromosomiques
aquis ou constutionnelles pour donner un conseil génétique
localisation du gene
cytogenetique : chromosome colore
moleculaire : +precise et base sur les paire de bases
le caryotype
1:cultiver des cellules pour faire le caryotype
2:bloquer la cell en metaphase par colchicine
…dispersion de chromosomes par solution hypertonique
…conservation de des propriétés physiologiques de chromosomes
3. coloration par GIESMA pout iden les chr
les chu deviennent rose avec succèssion des taches +ou- colore
bande G : riche en A T pauvre en gene actif tel mal colore
Bande R brd riche en C G riche en gene actif tel bien colore
bande c marqueur de centromere
bande tmarqueur de telomere
ces regions possédent: ADN repetitive /replic tardive /10 a 15% du genome avec haute polymérisation
trisomie 21
1 ere anomalie décrite chez l'homme elle cause : retarde mental brachycephalie cou courte tete ronde excès de peau hypotonie axial malformation cardiaque ou digestif leucemie
localisation cytogénétique
14q21 n1 : le nombre de chromosome q:bras long p:bras courts n3:la position au nv du bras ter :pres du telomere cen:pres du centromere
cytogenetique moléculaire : localisation moléculaire
appariement des bases d’ADN
+ precise que la loc cytogénétique
+permet de savoir la taille du gene et son emplacement dans le chromosomes
elle se base sur les paires de base d’ADN
tous le gen a été localise en 2003
La sonde
morceau d’ADN synthétise complémentaire a un des 2 brins d’ADN cible
on la marque par une atome radioactive ou une mol fluorescente pour savoir la taille et l’emplacement du gene sur le chromosome
drepanocytose =anemie falciforme =maladie des globules rouges
mutation de A par T
changement de glu par Val de la chaine B de globine
electrophorese du gene de Hb par 2 sondes une pour le gene normal et l’autre pour le gene muté
technique 1: FISH hybridation in situ en fluorescent
resolution de 50 kb a 2Mb
sonde spécifique du gene étudie marque par une mol fluorescente
Detecte les remaniements chromosomiques et anomalie chromosomique de nombre et de structure
CGH caryotype moléculaire
Resolution de 1Mb a quelque kb
plus efficace que le caryotype 100 a 1000 fois
resolution d’une puce contenant de l’ADN de patient et l’ADN témoin (marque par une mol fluorescente ‘’) hybridation -rapport de fluorescence sous forme graphique
detection de micromutation
PCR definition
succession de replication cible invitro
permet d’avoir des milliers de qtt d’ADN a partir d’un échantillon
melange :ADN qu’on veut réplique
*les amorces oligonucleotide a l’extrémité 3’
*ADN POLYMERASE resistant a haute temperature
PCR qualitative ou classique
Denaturation 95c hybridation a (45 - 60c) polymérisation a 72C répéter plusieurs fois fonction exponentielle
PCR quantitative ou en temps reel
utilise les intercalant:compose qui fluorescente seulement lorsque l’ADN est en 2 brins a la fin de elongation
on mesure la fluorescente et on réalise une courbe de variation
2 tech: sonde fluorescent ou agent qui se lie a l’ADN
le quantitative est meilleur car
il est plus rapide
sensibilite
qlq g d’ADN suffisent
quantification precise grace aux logicielles