Cycle de l'acide citrique

Question 1

Où se produit la transformation du pyruvate en acétyl-CoA par le complexe de la PDH?
Quelles sont les principales réactions impliquées et les molécules produites?

Answer 1

Mitochondrie
Décarboxylation oxydative :
- Retrait CO2
- Réduction NAD+ en NADH
- Activation du groupe acétyl avec CoA
**

Question 2

PDH (complexe de 3 enzymes) : Quels sont ces principaux cofacteurs?

Answer 2

TPP
FAD
CoA
NAD+
Lipoate

Question 3

Faire un survol des principales réactions de cycle.

Quelles sont les étapes limitantes?

Answer 3

1. Acétyl-CoA cède son acétyle (2C) à l’oxaloacétate (Synthèse du citrate)**
2. Déshydratation et hydratation (Citrate -> Isocitrate)
3. Décarboxylation oxydative (Isocitrate -> a-cétoglutarate)**
4. Décarboxylation oxydative (a-cétoglutarate -> Succinyl-CoA) **
5. Phosphorylation (->Succinate) GTP
6. Déshydrogénation (-> Fumarate) **
7. Hydratation (-> Malate)
8. Déshydrogénation (-> Oxaloacétate)

Question 4

Quel est le bilan énergétique du cycle? (NADH, FADH, GTP)

Answer 4

Glycolyse : 2 ATP et 2 NADH (7ATP)

2 x Pyruvate -> Acétyl-CoA : 2 NADH (5ATP)

Cycle (pour 2 pyruvates) : 6 NADH, 2 FADH2 et un 2 ATP (20ATP)

Question 5

Pourquoi dit-on du cycle de Krebs qu’il est amphibolique?

Answer 5

Catabolisme et anabolisme

Oxydation du pyruvate + Génération d’intermédiaires métaboliques pour biosynthèse

Question 6

Quel est le lien entre l’évolution des enzymes du cycle et la détoxification de l’oxygène? Comparer le rôle et la présence de ces enzymes entre les bactéries anaérobies et les cellules eucaryotes aérobies.

Answer 6

Le lien provient du rôle biosynthétique du cycle.
Certaines réactions étaient utilisée par des bactéries anaérobies pour produire des précurseurs métaboliques.

4 enzymes étaient présentes : Permettait la conversion réversible de l’oxaloacétate en succinyl-CoA

Cyanobactéries : atm aérobie -> Pression sélective afin de détoxifier l’O2.

Question 7

Quels sont les principaux mécanismes de régulation du cycle? Quelles sont les enzymes impliquées et comment?

Answer 7

Régulation allostérique :
PDH
- ATP, A-CoA, NADH, AG longues chaines
+ AMP, CoA, NAD+, Ca++ (muscles)

CS
- NADH, succinyl-CoA, citrate, ATP
+ ADP

IsocitrateDH
- ATP
+ Ca++, ADP

Alpha-cétoglutarateDH
- succinyl-CoA, NADH
+ Ca++