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Biochimie > cycle de krebs > Flashcards

cycle de krebs Flashcards

1
Q

Quel sont les cofacteurs nécessaires pour la PDH

A

FAD, NAD+, Coenzyme A, TPP, Thiamine pyrophosphate, Lipoamide

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Q

Facilite la décarboxylation du pyruvate lors de la PDH

A

Thiamine pyrophosphate (TPP)

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3
Q

Bras oscillant permettant le transfert d’un groupement acétyle lors de la PDH

A

Lipoamide

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4
Q

Agent oxydant permettant de regénérer la lipoamide lors de la PDH

A

FAD

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5
Q

Agent oxydant permettant de regénérer la FAD
lors de la PDH

A

NAD+

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6
Q

Accepteur final du groupement acétyle
lors de la PDH

A

Coenzyme A

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7
Q

Qu’est ce que la PDH, et que fait-elle ?

A

Il catalyse une réaction de décarboxylation oxydative
Complexe enzymatique qui convertit le pyruvate (issu de la glycolyse) en acétyl-CoA, libérant du CO₂ et réduisant du NAD⁺ en NADH.
Irréversible et controlé.

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8
Q

Le glucose, les acides gras et certains acides aminés entrent dans le cycle de Krebs sous la forme de :

A

Acétyl CoA

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9
Q

Placez dans l’ordre les 8 réactions du cycle de Krebs:

Oxydation - Production d’un NADH
Décarboxylation oxydative d’un acide β-cétonique
Isomérisation
Oxydation - Production d’un FADH2
Condensation
Hydratation
Phosphorylation au niveau du substrat
Décarboxylation oxydative d’un acide α-cétonique

A

1.Condensation
2.Isomérisation
3.Décarboxylation oxydative d’un acide β-cétonique
4.Décarboxylation oxydative d’un acide α-cétonique
5.Phosphorylation au niveau du substrat
6.Oxydation - Production d’un FADH2
7. Hydratation
8.Oxydation - Production d’un NADH

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10
Q

Pour chaque molécule de glucose, combien de molécules de CO2 sont relâchées dans le cycle de Krebs?

A

4

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11
Q

Lequel des énoncés suivants est vrai pour toutes les déshydrogénases du cycle de Krebs?

A.Elles catalysent des réactions de condensation.
B.Elles convertissent une double liaison en simple liaison.
C.Elles génèrent des transporteurs d’électrons réduits.
D.Elles génèrent du CO2.

A

C

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12
Q

En aérobiose, quel est le maximum d’équivalents ATP produits lors de l’oxydation complète d’une molécule de glucose?

A

32

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13
Q

Le cycle de Krebs est un cycle amphibolique, ceci signifie :

A.Qu’il sert à la fois dans des processus anaboliques et cataboliques.
B.Qu’il est lié à d’autres cycles.
C.Qu’il catalyse des réactions exergoniques et endergoniques.
D.Qu’il peut fonctionner dans les deux directions (réversible)

A

A, il est irréversible

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14
Q

Comment appelle-t-on les réactions qui permettent de regarnir le cycle de Krebs en ses différents intermédiaires?

A.Réactions cataboliques
B.Réactions cataplérotiques
C.Réactions anaboliques
D.Réactions anaplérotiques
E.Réactions métaboliques

A

D

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15
Q

Comment appelle-t-on les réactions qui drainent les intermédiaires dans d’autres sentiers métaboliques ?
A.Réactions cataboliques
B.Réactions cataplérotiques
C.Réactions anaboliques
D.Réactions anaplérotiques
E.Réactions métaboliques

A

B

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16
Q

Laquelle de ces conditions a un effet négatif sur l’activité du complexe de la pyruvate déshydrogénase?

A.Un ratio élevé [ADP]/[ATP].
B.Un ratio élevé [NAD+]/[NADH].
C.Un ratio élevé [acétyl-CoA]/[CoA].

A

C

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17
Q

Lesquelle de ces conditions ont un effet positif sur l’activité du complexe de la pyruvate déshydrogénase?

A.Un ratio élevé [ADP]/[ATP].
B.Un ratio élevé [NAD+]/[NADH].
C.Un ratio élevé [acétyl-CoA]/[CoA].

A

A & B

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18
Q

Quelles sont les trois enzyme qui controlent le cycle de krebs et leur role ?

A

Citrate synthase :
Catalyse la condensation de l’acétyl-CoA avec l’oxaloacétate pour former du citrate.
Inhibée par le citrate et le NADH.

Isocitrate déshydrogénase :
Convertit l’isocitrate en α-cétoglutarate en produisant du NADH.
Activée par l’ADP et inhibée par l’ATP et le NADH.

α-Cétoglutarate déshydrogénase :
Transforme l’α-cétoglutarate en succinyl-CoA, générant du NADH.
Inhibée par le succinyl-CoA, le NADH et l’ATP.
Etape 1, 2, 3 qui sont irréversible leur delta G très-.

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19
Q

Quelles sont les principales réactions cataplérotiques ?

A

Consomme pour éviter l’accumulation dans la cellule
Synthèse de glucide, d’Acides Gras, d’AA, et phosphorine

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20
Q

Quelles sont les principales réactions anaplérotique ?

A

Pour le réaprovisionnment immédiat en pyruvate
Voies de dégradation d’AA etcx et glycolyse

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21
Q

Bilan énergetique à partir du glucose ?

A

4 ATP
10 NADH (qui vont donner 25 ATP)
2 FADH2 (donnera 3 ATP)
4 CO2
TOTAL de 32 ATP glucose partiellement oxydé en CO2

22
Q

Placez dans l’ordre les substrats, intermédiaires et produits du cycle de Krebs.

Succinyl-CoA
Malate
Isocitrate
Oxaloacétate
α-cétoglutarate
Fumarate
Citrate
Acétyl-CoA et oxaloacétate
Succinate

A

Acétyl-CoA et oxaloacétate
Citrate
Isocitrate
α-cétoglutarate
Succinyl-CoA
Succinate
Fumarate
Malate
Oxaloacétate

23
Q

Quelle est l’importance fonctionnelle de la lipoamide? Nommez 2 enzymes qui utilisent ce cofacteur.

A

Un long bras, augmente la canalisation métabolique, se lie au substrat & vise 3 enzyme du complexe, cela produit une réaction immédiate vers la prochaine composante du système.
Les deux enzyme sont:
le complexe du pyruvate déshydrogénase (PDH)
le complexe de l’α-cétoglutarate déshydrogénase (cycle de Krebs)

24
Q

Le cycle de Krebs convertit le ? , un groupement à 2 atomes de carbone, en ? par ? . Dans le processus, il y a ? de coenzymes. La coenzyme qui sert de transporteur d’électron mobile et soluble dans l’eau se nomme ?.
L’autre coenzyme réduite lors du cycle de Krebs est le ?.
Ces coenzymes permettent de faire le lien entre le cycle de Krebs et ?.

A

le groupement acétyle
en CO2 par oxydation. Dans le processus, il y a réduction de coenzymes. La coenzyme qui sert de transporteur d’électron mobile et soluble dans l’eau se nomme NAD+.
L’autre coenzyme réduite lors du cycle de Krebs est le FADH2.
Ces coenzymes permettent de faire le lien entre le cycle de Krebs et la chaîne de transport d’électrons.

25
Q

À quelle étape du cycle de Krebs y a-t-il libération de CO2?

A

l’étape 3 , catalysée par l’isocitrate déshydrogénase.
l’étape 4 ,catalysée par l’α-cétoglutarate déshydrogénase.

26
Q

Quelle étape du cycle de Krebs est une phosphorylation au niveau du substrat?

A

L’étape 5 (catalysée par la succinyl-CoA synthétase)
formation d’une molécule de GTP par énergie libérée par le bris du lien thioester

27
Q

Quelles étapes du cycle de Krebs permettent la production d’équivalents réducteurs NADH & FADH?

A

Étapes 3, 4 et 8 – 1 NADH
Étape 6 – 1 FADH2

28
Q

Quelle étape du cycle de Krebs est une réaction d’isomérisation? Écrivez l’équation de la réaction.

A

L’étape 2 est une réaction d’isomérisation (catalysée par l’aconitase). Citrate ↔ Isocitrate

29
Q

Pourquoi transformer le citrate en isocitrate?

A

Pour que ce soit plus facilement oxydable.

30
Q

Quelle étape du cycle de Krebs est une réaction de condensation? Écrivez l’équation de la réaction.

A

L’étape 1 elle est catalysée par la citrate synthase. Oxaloacétate + Acétyl-CoA + H2O → Citrate + Coenzyme A

31
Q

Quelle étape du cycle de krebs est une réaction d’hydatration ?

A

L’étape 7 Fumarate + H2O ↔ Malate, elle genere du FADH

32
Q

En quoi la succinate déshydrogénase est-elle différente des autres enzymes du cycle de Krebs? De quel autre sentier la succinate déshydrogénase fait-elle partie?

A

C’est la seule enzyme du cycle de Krebs associée à la membrane. Elle fait partie du système de transport des électrons

33
Q

Nommez les 3 enzymes régulées du cycle de Krebs. Quels sont les 3 principaux modulateurs allostériques de ces enzymes? Lesquels sont des inhibiteurs et lesquels sont des activateurs?

A

Enzymes : Citrate synthase, Isocitrate déshydrogénase , α-cétoglutarate déshydrogénase
Modulateurs allostériques:
Activateur allostérique : ADP
Inhibiteur allostérique : ATP et NADH
On peut simplifier en disant que le cycle de Krebs est activé lorsque les ratios ATP/ADP et NADH/NAD+ sont faibles, et inhibé lorsque ces mêmes ratios sont élevés.

34
Q

Quels sont les 6 principaux modulateurs allostériques du PDH? Lesquels sont des inhibiteurs et lesquels sont des activateurs?

A

Activateur allostérique : AMP, NAD+, CoA
Inhibiteur allostérique : ATP, NADH, acétyl-CoA

35
Q

Quelle étape génère du FADH2

A

Étape 7, succinate a Fumarate par la succinate deshydrogénase

36
Q

Quelle étape utilise du phosphate inorganique

A

Étape 5 , succinate CoA à succinate

37
Q

Ou est localisé la PDH

A

dans la matrice mitochondrial

38
Q

En anaérobiose, quel est le maximum d’équivalents ATP produits lors de l’oxydation complète d’une molécule de glucose?

A

2 ATP

39
Q

Le produit de la réaction catalysée par la pyruvate déshydrogénase (PDH), l’acétylCoA, est libéré à l’étape 3 de la réaction globale. À quoi servent les étapes 4 et 5?

A

Permet de regénérer le complexe enzymatique.
Étape 4, regénère E2, pour refaire lipoamide.
étape 5, regénère E3, en transférant ses électrons du FADH2 ou NAD+.

40
Q

Décrivez les différentes modifications chimiques que subit la lipoamide lors de la décarboxylation oxydative catalysée par le complexe de la pyruvate déshydrogénase (PDH)?

A

Le lien disulfide est brisé par le transfert du groupement sur la lipoamide et la formation d’un lien thioester.
ca doit être oxydé pour reformer le lien.

41
Q

Complétez la réaction suivante :
Pyruvate + CoA + ________ → Acétyl-CoA + ________ + ________ Pyruvate + CoA + NAD+ → Acétyl-CoA + NADH + CO2

a) Quelle enzyme catalyse cette réaction?

A

La PDH avec les enzymes : La thiamine pyrophosphate (TPP), la lipoamide, le FAD, le NAD+ et la CoA.

42
Q

Quel est l’avantage d’un complexe multienzymatique comme celui de la pyruvate déshydrogénase (PDH)?

A

Permet la canalisation métabolique , évite les pertes dans le cytosol

43
Q

En quoi cela serait-il désavantageux que le cycle de Krebs soit catalysé par un complexe multienzymatique comme la PDH?

A

Le cycle de Krebs est un sentier amphibolique. Plusieurs intermédiaire qui ne serait alors pas disponible comme précurseurs

44
Q

Comment nomme-t-on une réaction anabolique qui utilise un intermédiaire du cycle de Krebs comme précurseur?

A

Une réaction cataplérotique

45
Q

Quels intermédiaires du cycle de Krebs sont des précurseurs pour la synthèse d’autres molécules? Pour chaque intermédiaire, mentionnez à la synthèse de quel composé il participe.

A

La synthèse des acides aminés utilise l’oxaloacétate (qui permet d’obtenir l’aspartate) et l’α-cétoglutarate (qui entre dans la synthèse du glutamate).
La synthèse des lipides utilise le citrate comme précurseur. La synthèse de glucose (gluconéogenèse) utilise l’oxaloacétate comme précurseur.
La synthèse de porphyrine requiert la présence de succinyl-CoA.

46
Q

Il y a plus d’intermédiaires à 6 carbones dans le cycle de Krebs que d’intermédiaires à 4 carbones ?

A

Faux, il y a 2 intermédiaires à 6C, 1 à 5 C et 5 à 4C

47
Q

Par mole de glucose, le cycle de Krebs produit autant d’énergie via phosphorylation au niveau du substrat que la glycolyse.

A

vrai

48
Q

Les intermédiaires du cycle de Krebs qui sont utilisés lors de réactions anaboliques sont remplacés par les produits de réactions anaplérotiques.

A

vrai

49
Q

Lequel de ces énoncés sur l’étape reliant la glycolyse et le cycle de Krebs est FAUX?

A.Le complexe de la pyruvate déshydrogénase (PDH) est un assemblage de trois enzymes différentes (E1, E2 et E3) et de cinq coenzymes.
B.E1 catalyse la décarboxylation du pyruvate et la formation d’un intermédiaire hydroxyéthyl-TPP.
C.L’intermédiaire hydroxyéthyl-TPP est oxydé afin de former un groupement acétyle qui est transféré directement du TPP à la CoA.
D.Chez les eucaryotes, la réaction reliant la glycolyse au cycle de Krebs s’effectue dans les mitochondries.
E.La décarboxylation oxydative du pyruvate donne de l’acétyl-CoA, du CO2 et du NADH.

A

C

50
Q

Lequel de ces énoncés sur la logique chimique du cycle de Krebs est FAUX?

A.L’oxydation de l’isocitrate produit un intermédiaire acide β-cétonique facilement décarboxylable.
B.Le groupement -CH3 de l’acétyl-CoA est attaché à l’oxaloacétate ce qui forme un groupement -CH2- plus facilement oxydable.
C.La décarboxylation des acides β-cétoniques utilise un complexe similaire à celui de la pyruvate déshydrogénase (PDH).
D.La présence d’un carbonyle au bon endroit dans la molécule est essentielle aux réactions de décarboxylation.
E.Les étapes 6 à 8 du cycle de Krebs permettent la régénération de l’oxaloacétate.
F.Chaque étape permet soit de conserver l’énergie d’oxydation, soit de préparer la molécule à l’oxydation et à la décarboxylation.

A

C

51
Q

Lesquelles de ces conditions diminuent l’activité du cycle de Krebs?

A.Un ratio élevé [ADP]/[ATP].
B.Un ratio élevé [ATP]/[ADP].
C.Un ratio élevé [NADH]/[NAD+].
D.Un ratio élevé [NAD+]/[NADH].

A

B & C

52
Q

Plusieurs intermédiaires du cycle de Krebs servent de précurseurs lors de la synthèse de différentes molécules. Associez chacun de ces intermédiaires au(x) type(s) de complosé qu’il permet de synthétiser.

1.Oxaloacétate
2.α-cétoglutarate
3.Citrate
4.Succinyl-CoA
5. Isocitrate
6. Succinate
7.Fumarate
8.Malate

A

1.Oxaloacétate : Acides aminés et glucose
2. α-cétoglutarate : Acides aminés
3.Citrate: Lipides
4.Succinyl-CoA: Porphyrine (hème)
Citrate : Lipides et acides gras
5.Isocitrate : Acides aminés et glucides
6.Succinate : en glucose via la gluconéogenèse
7.Fumarate : Participe à la synthèse d’arginine et au cycle de l’urée
8.Malate : Participe à la gluconéogenèse (synthèse de glucose)

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