cours 9 réticulum endoplasmique et peroxysome

Question 1

les deux types de réticulum endoplasmique et comment peut les observer

Answer 1

en centrifugeant dans un gradient de densité; REL (lisse), RER (rugueux, granuleux)

Question 2

rôle des deux types de RE

Answer 2

REL s’occupe de la synthèse des lipides (production des membranes)
RER s’occupe des protéines pour la sécrétion

Question 3

fonctionnement de la formation des lipides

Answer 3

enzyme acyl-transférase dans la membrane du REL, mais son site actif dans le cytoplasme

elle construit les phospholipides à partir de deux acides gras et d’un glycérol phosphaté. Ceux formés s’ajoutent au feuillet externe de la membrane puis des enzymes (scramblases) égalisent les deux couches

Question 4

ce qui se passe avec les phospholipides après leur formation dans le REL

Answer 4

sont envoyés par transport vésiculaire à d’autres organites membranaires
à la membrane, sont réarrangés par flippases qui hydrolysent ATP pour générer une distribution asymétrique des lipides sur les deux couches

Question 5

fonctions du peroxysome

Answer 5

oxydation des molécules oganiques
neutralisation du H202

Question 6

du RE au peroxysome (production et synthèse)

Answer 6

RER produit des protéines membranaires (peroxines) qui migrent vers le REL, ce qui va donner une vésicule précurseur

les autres protéines du peroxysome sont synthétisées dans le cytoplasme et incorporée dans l’organite par les peroxines de façon post-traductionnelle (signal SKL en c-terminal)

les peroxysomes peuvent croitre et se diviser par eux-mêmes

Question 7

une façon de faire croitre un peroxysome; synthèse de novo

Answer 7

synthèse de novo par fusion hétérotypique de deux vésicules de RE (V1 et V2), puis incorporation post-traductionnelle des protéines

Question 8

croissance de peroxysomes; fission des peroxysomes existants

Answer 8

réception des vésicules V3 et incorporation post traductionnelle des protéines
une fois peroxysome volumineux, Pes 11 permet allongement, DRP-interaction protein fait la constriction membranaire alors que DRP (dynamin related protein) fait la coupure finale

Question 9

généralités sur le peroxysome (fonctions, forme, etc.)

Answer 9

fonction dépend des protéines qui y sont importés et peut changer selon le type cellulaire et environnement cellulaire

différents types peuvent coexister dans la même cellule

forme sphérique qui peut s’allonger et dévenir réticulaire selon les besoins

peuvent partager fonctions avec autres organites (communication)

Question 10

métabolisme des peroxysomes; taux de multiplication

Answer 10

similaire au cycle cellulaire, mais grossissent et se multiplient d’avantage quand en demande

plus de peroxysomes quand plus d’acides gras dans le milieu (modification de l’activité métabolique)

le contrôle se fait au niveau transcriptionnel en réponse aux conditions

Question 11

métabolisme des peroxysomes; subdivisions

Answer 11

un peroxysome d’origine peut se subdiviser en 2 peroxysomes avec des activités métaboliques différentes

Question 12

métabolisme des peroxysomes; lucioles

Answer 12

production de bioluminescence se produit dans les peroxysomes des cellules de l’abdomen

Question 13

trafic vésiculaire; chemin du RE aux mitochondries et chloroplastes

Answer 13

RE vers golgi vers vésicules
ne communique pas directement avec mitochondries et chloroplastes, eux reçoivent leurs lipides par les protéines d’échange de phospholipides (PEPs) qui font le lien entre le RE et les mitochondries et chloroplastes

Question 14

entrée des protéines dans le RER

Answer 14

protéines doivent passer par le RER et la voie du trafic vésiculaire pour se rendre à son organite

entrée se fait de façon co-traductionnelle et énergie nécessaire au transfert vient du ribosome

Question 15

acteurs dans l’entrée des protéines dans le RER

Answer 15

peptide signal est une zone hydrophobe de 20 acides aminés en N-terminal qui s’appelle PSIT (peptide signal d’initiation de transfert)

signal peut être suivi d’un site de clivage AXA car signal est souvent coupé de la protéine mature par une peptidase

Question 16

action de PSIT une fois traduit

Answer 16

lie une poche hydrophobe située dans la particule de reconnaissance du signal (SRP); une GTPase soluble formée de 6 protéines et d’un ARN

quand SRP lie un PSIT, elle bloque la traduction en cours en bloquant le site A du ribosome; site A est le site où ARNt chargé s’installe lors de traduction

Question 17

ce qui reconnait la SRP liée au PSIT

Answer 17

le récepteur situé à la membrane du RER
quand lié; SRP hydrolyse son GTP ce qui fait relâchement du signal PSIT

aussi translocateurs à la membrane du RER à proximité des récepteurs pour permettre au PSIT et au reste de la protéine d’entrer dans le RER

Question 18

structure et fonction du translocateur

Answer 18

un complexe protéique appelé Sec61 avec une poche hydrophobe dans sa couture et un bouchon dans le fond

PSIT libéré dans SRP tasse le bouchon pour aller s’installer à la couture et l’ouvrir
alors le reste de la protéine peut se glisser dans le RER au fur et à mesure qu’elle est traduite
mais PSIT reste dans le translocateur

Question 19

protéine soluble dans RER

Answer 19

entre et leur PSIT sera coupé par une peptidase membranaire qui coupe au niveau du site AXA juste après le PSIT

Question 20

proteine membranaire dans le RER

Answer 20

vont garder leur PSIT ce qui leur sert d’ancrage à la membrane (alors PSIT est situé plus loin dans la protéine; pas en N-terminal)

Question 21

production d’une protéine membranaire

Answer 21

à partir de signal; la séquence d’arrêt de transfert (SAT) qui est une séquence da.a hydrophobe

les protéines membranaires avec des hélices alpha hydrophobes (régions PSIT et SAT) sont toutes synthétisées dans le RER et sa membrane

Question 22

caractéristiques du SAT

Answer 22

ne peut pas traverser le translocateur ni aller dans sa couture (forme non complémentaire puisque le centre est hydrophile et les régions hydrophobes ne peuvent pas le traverser)

donc est relâché directement dans la membrane et l’incorporation de la protéine s’arrête

Question 23

suite du chemin des protéines une fois dans le RER

Answer 23

vont passer vers golgi via les vésicules, à ce point certaines continuent leur chemin et d’autres retournent vers le RER

Question 24

structure des protéines qui retournent au RER

Answer 24

doivent posséder en plus du PSIT en N-terminal, un signal de rétention en C-terminal (séquence KDEL pour les protéines solubles et KKXX pour les protéines membranaires)

les protéines entrent par leur tête (N) et sont retenues par leurs pieds (C)

Question 25

protéines synthétisées dans le RER doivent pouvoir résister à l’environnement extérieur; rôle du disulfide isomérase

Answer 25

catalyse la formation ou la rupture de ponts disulfures
s’assure que les liens S-S soient bien faits avant la sortie de la protéine

Question 26

protéines synthétisées dans le RER doivent pouvoir résister à l’environnement extérieur; rôle d’une ancre lipidique de GPI

Answer 26

glycosyl phosphatidyl inositol
peut être ajoutée sur les protéines par le complexe enzymatique transmidase, alors les protéines GPI se retrouvent dans les radeaux lipidiques et peuvent être libérées par une phospholipase

Question 27

protéines synthétisées dans le RER doivent pouvoir résister à l’environnement extérieur; rôle des sucres

Answer 27

une oligosaccharide transférase membranaire ajoute une unité préformée de sucre sur le résidu asparagine (Asn doit faire partie du motif N-X-S/T)
l’unité de sucre ajouté est toujours la même (oligo de 14 sucres)
durant la maturation de la protéine (RER et Golgi) l’unité ajoutée sera modifiée et taillée pour finir avec un modèle de base à 5 sucres (2 NAG et 3 mannoses)

Question 28

protéines synthétisées dans le RER doivent pouvoir résister à l’environnement extérieur; modification des sucres

Answer 28

permet un contrôle qualité

les deux glucoses terminaux sont enlevés à la fin de la traduction et les différentes chaperonnes vérifient la forme de la protéine; si prot ok, le dernier glucose est clivé et elle sort du RE
; si elle est mal repliée, le glucosyl transferase lui ajoute un glucose et la protéine doit repasser par les chaperonnes qui vont la plier correctement

Question 29

le voyage des protéines à partir du RER

Answer 29

compartiments cellulaires entourés par une membrane sont liés par le trafic vésiculaire. vésicules transportent les protéines à l’aide de moteurs protéiques et éléments du cytosquelette polaires (microtubules et actine F)

vésicules se forment par bourgeonnement et une fois rendu, fusionne avec la membrane du compartiment cible