cours 10 compartiments cellulaires Flashcards
à partir de quoi sont formées les vésicules COP-II
à partir du RER; Sar1 est activé par GEF ce qui l’insère dans la membrane
then Sec23/24 lient Sar1-GTP à un récepteur de cargaison (forment l’intérieur) puis Sec13/31 vont se lier par dessus pour former l’extérieur
processus de fusion des COP-II à membrane cible
utilisation des protéines Rabs et SNAREs
Rab-GTP s’insère dans la membrane quand activée par un GEF sur la membrane donneuse
fonctionnement des SNAREs
protéines membranaires sous forme de paires complémentaires
une v-SNARE sur la membrane vésiculaire
une t-SNARE dans la membrane cible
liaison entre les deux; très forte alors l’eau entre les deux est expulsée et fusionnent
comment on dissocie ensuite la paire de SNAREs
on doit utiliser l’énergie de l’hydrolyse de l’ATP
caractéristiques des vésicules COP-I
comme COP-II mais différentes protéines de recouvrement; formation commence par activation de ARF1 au lieu de Sar1
recouvrement des COP-I
manteaux se forment autour des protéines transmembranaires avec la séquence KKXX en C terminale
récepteurs KDEL font partie de ces transmembranaires
retour de lipides est continuel (constitutif)
qui trie les protéines
le cis-golgi
les deux modèles pour expliquer le mécanisme de transport des protéines à travers les vésicules du golgi
modèle de transport des vésicules; citernes sont statiques et c’est les protéines qui voyagent via les vésicules (rétro et antérograde)
modèle de maturation des citernes; maturation graduelle des citernes pour le mouvement antérograde et le transport rétrograde se fait par vésicules
à quoi sert et de quoi est composée la matrice extra-golgienne
responsable de l’intégrité structurale du golgi et aide au transport et positionnement du golgi dans la cellule
composée de protéines; golgines, qui sont associées aux membranes. Peuvent s’allonger et former un filet pour exclure les organites
fonctionnement des golgines
s’insèrent dans membrane golgi via leur C-terminal et le N-terminal peut se retrouver beaucoup plus loin dans le cytoplasme
structure en super hélice est interrompue pour flexibilité
différents types qui sont recrutées à des citernes spécifiques et eux pêchent vésicules spécifiques dans cytoplasme
attachement d’une vésicule ou d’une citerne à la golgine peut mener à
fusion membranaire (golgines qui interagissent avec SNAREs) ou stabilisation de matrice externe du golgi (empilement des citernes)
comment se passe la maturation des sucres dans le golgi
protéines arrivent et ont eu une glycolysation par le RER; toutes ont la même unité préformée
et les enzymes golgiennes travaillent sur cette unité de façon séquentielle pour former une unité de sucre différente
fonctionnement de la tomographie immunoélectronique
localisation de l’enzyme mannosidase par les anticorps couplés aux particules d’or, puis modélisation de l’appareil de golgi en 3D
les 5 mécanismes de la maturation des sucres
ciblage; pour signaler le lieu d’appartenance de la protéine lors du tri
augmente solubilité protéine pour aider à son repliement en milieu aqueux
couche protectrice permet résistance aux protéases
adhérence intercellulaire et au substrat
signalisation intercellulaire
les deux possibilités de chemin à partir du golgi
vers la membrane plasmique; par vésicules COP-I avec les bons Rabs et SNAREs. Protéines sont ciblées par un sucre complexe
vers endosomes-lysosomes; par vésicules de clathrine. Protéines sont ciblées par un sucre riche en mannose phosphaté
particularité des voies contrôlées versus les consécutives
protéines sont emmagasinées dans des vésicules qui attendent un signal avant de fusionner à la membrane
vs consécutives qui est toujours là et se lie tout seul
processus de concentration des protéines cargo ayant quitté le trans-golgi en une seule vésicule
retrait de membrane
et les membranes récupérées (faites de clathrine) vont retourner au golgi pour recycler
localisation du golgi chez les vertébrés
adjacent au MTOC et s’attache aux microtubules et MTOC directement
va s’accrocher à dynéine pour se déplacer
localisation du golgi chez les plantes
se positionne et se déplace grâce à l’interaction de sa matrice (extra-golgienne) avec l’actine F et la myosine
le golgi pendant la mitose
on le met en pause; phosphorylation des protéines de la matrice extra-golgienne ce qui bloque voies de sécrétions et on défait les citernes en petites vésicules
les vésicules sont distribuées de façon égale et à l’aide du fuseau mitotique et les dynéines
durant apoptose….
mort cellulaire programmée qui fait à peu près la même chose, bloque voie sécrétion et fragmentation du golgi mais c’est irréversible
dégradation
lysosome
le site de digestion intracellulaire; donc un espace acide venant d’un endosome qui devient de plus en plus acide et formé de vésicules de clathrines venant du golgi ou à partir de membrane plasmique
comment endosome devient plus acide
activité de la pompe ATPase de type V et accumulation des hydrolases acides par fusion avec des vésicules qui les contiennent
charge du noyau des lysosomes
noyau est généralement plus basique parce qu’il contient les histones qui ont plusieurs acides aminés chargés positivement
comment fonctionne l’étiquette des protéines destinées aux lysosomes
étiquettage dans le golgi avec un mannose-6-phosphate (M6P) qui est synthétisé par deux réactions en série;
- une phosphotransférase lie région signal de la future protéine lysosomale et transfère un GlcNAc-P sur un mannose
- hydrolase enlève GlcNAc et garde juste le phosphate
caractéristiques de la clathrine
vésicules se forment autour de leur cargaison grâce aux adaptines et celles-ci lient le récepteur membranaire du M6P d’un côté et la clathrine de l’autre
triskèle avec 3 grosses protéines (chaines lourdes) et 3 petites (chaines légères)
comment se forme le lysosome à partir du trans-golgi
dynamine (GTPase) fait un pincement final et détache la vésicule de la membrane donneuse. Cette prot se tord grâce à l’énergie de l’hydrolyse du GTP
vésicules détachées vont perdre leur manteau de clathrine (elle est recyclée) et cela expose les Rabs et SNAREs
transport des hydrolases acides
unidirectionnel puisque récepteur M6P fonctionne pas en pH acide donc
cargaison se détache et récepteur est recyclé vers golgi. finalement phosphatase acide enlève le P de M6P dans le lysosome alors cellule perd son signal
alors ce qui se passe dans l’endosome
tri des molécules reçues, recyclage des récepteurs avant début de digestion
prend vésicules de clathrine qui viennent de golgi et de membrane plasmique
pour faire pinocytose (utilise puits recouverts comme intermédiaires pour formation vésicules) ou endocytose par récepteurs qui profite de pinocytose et utilise adaptines
