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Astro Final > cours 9 > Flashcards

cours 9 Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que la transamination?

A

La réaction de transamination est une réaction chimique réversible qui consiste en l’échange d’un fonction amine primaire entre un acide α-aminé et un α-cétoacide.

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2
Q

Comment les organismes obtiennent t’il l’azote et sous quel forme?

A

Les bactéries fixent l’azote de l’air le rendent disponible pour les plantes

Les plantesvont assimiler l’azote inorganique pour le convertir en azote organique.

Les animaux obtiennent l’azote déjà organifié par les plantes via les protéines.

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3
Q

Qu’est-ce qui est utilisé comme source d’azote our la biosynthèse des composé azoté chez les animaux?

A

Ce sont les acides aminés qui sont ensuite utilisés comme source d’azote pour la biosynthèse de la plupart de composés azotés chez les animaux.

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4
Q

Les animaux trouvent exclusivement l’azote dont ils ont besoin par quoi?

A

par leur alimentation en ingérant des protéines animales ou végétales

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5
Q

Que peut-on synthétise a partir des acides alpha cétonique dans la rx de transamination?

A

Les réactions de transamination permettent de redistribuer les groupements NH2 (surtout du glutamate, glutamine et de l’alanine) pour synthétiser les différents acides aminés

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6
Q

Qu’est-ce que toutes les rx de transaminases utilisent comme coenzyme?

A

le pyridoxal-phosphate (dérivé de la vitamine B6)

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7
Q

Les réactions de transamination impliquent toujours un _______________ donneur du groupement NH2 et un _______ comme accepteur. Après la réaction, __________ devient ________ et le ________ devient _______.

A

Les réactions de transamination impliquent toujours un acide aminé donneur du groupement NH2 et un cétoacide comme accepteur. Après la réaction, l’acide aminé devient cétoacide et le cétoacide acide devient aminé.

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8
Q

a- Quel et le produit d’une transamination avec le glutamate et le pyruvate?
b-quel enzyme est utilise?
c- quel est la coenzyme utilise?
d- intialement qui est l’acide amine et qui est le ceto acide
e- meme question que d Mais a la fin

A

a- alpha-cetoglutarate et alanine
b- glutamate-pyruvate transaminase
c- pyridoxal-phosphate
d- glutamate= a.a
pyruvate= alpha-ceto
e- alpha cetoglutarate= alpha-cetoacide
alanine= a.a

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9
Q

V ou F: Une rx de transamination est irreversible

A

faux, elle est reversible

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10
Q

Combien d’acide amine sont métabolises par transamination?

A

17

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11
Q

Qui est la plupart du donneur de nh2 dans les rx de transamination?

A

glutamate

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12
Q

donne les 2 rx de transamination avec OAA et pyruvate

A

1- glutamate + pyruvate = alpha- cetoglutarate + alanine

2- glutamate + OAA = alpha- cetoglutarate + aspartate

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13
Q

Les acides aminés sont synthétisés par les intermédiaires de quelles voies ?

A

Ceux de la glycolyse, le cycle de Krebs et la voie des pentoses

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14
Q

D’ou vient les groupements amino des acides aminés

A

Du glutamate et de la glutamine

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15
Q

Les êtres humains peuvent-ils synthétiser tous les acides aminés ?

A

Non

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16
Q

Combien d’acide amines sont essentiels?

A

10

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17
Q

qu’est-ce qu’un acide amine essentiel?

A

a.a quon ne peut pas synthétiser, il est obtenu par la diète

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18
Q

L’arginine est un acide aminé essentiel ?

A

Oui, même s’il peut être synthétisé par les cellules des mammifères, mais pas assez pour que cela rencontre les besoins de l’organisme

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19
Q

La méthionine est un acide aminé essentiel ?

A

Oui, mais il en faut pour faire tyrosine, cystéine et phénylalanine

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20
Q

Différence entre essentiel et non-essentiel

A

Essentiel : Doit venir de la diète
Non-essentiel : Peut être synthétisé

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21
Q

C’est quoi les acides aminés essentiels

A

Met, Leu, Val, Lys, Ile, Phe, Try, His, Thr, Arg

Met le dans ta valise, il fait trop d’histoire

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22
Q

Proline, lysine et thréonine sont métabolisés par quoi

A

par déshydrogénases

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23
Q

pourquoi l’être humain ne peut pas synthétiser certains a.a

A

l’humain de ne peut pas synthétiser les a.a ramifies ou aromatiques et ne peuvent pas incorporer le souffre de la methionine

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24
Q

quel est le transaminase de la réaction entre

a) pyruvate/alanine,
b) oaa /aspartate

A

a) GPT

b) GOT

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25
Q

Comment obtient on de l’aspartate?

A

glutamate + OAA = Aspartate + alpha-cetoglutarate

VIA GOT

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26
Q

Comment obtient on l’alanine ?

A

glutamate + pyruvate = alpha- cetoglutarate + alanine

VIA GPT

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27
Q

Comment est synthétiser la glutamine?

A

Glutamate -> Glutamine

VIA Glutamine synthétase

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28
Q

Comment on synthétise l’asparagine?

A

Aspartate + Glutamine + ATP -> Asparagine + Glutamate
VIA ASPARAGINE SYNTHÉTASE

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29
Q

Quelles sont les étapes de la biosynthèse de la serine ?

A

1-oxydo-reducation avec 3-phosphoglycerate & nad+
2-transamination
3-dephosphorylation

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30
Q

Qu’est-ce que la serine permet de synthétiser

A

glycine & cysteine

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31
Q

Quelle est la réaction de la biosynthèse de glycine et les unités à un atome de carbone?

A

Le tétrahydrofolate avec une enzyme servent à transformer la sérine en glycine.

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32
Q

À quoi sert le tétrahydropholate

A

À transporter des unités à 1 carbone

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33
Q

biosyntheses de la proline

A

la proline est synthétise a partir de la glutamate

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34
Q

Précurseur de tyrosine?
Qu’est-ce qui est de spécial dans cette réaction

A

Phenylalanine VIA phénylalanine hydroxylase
= a.a essentiel

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35
Q

Quel est maladie est provoque par la déficience en PAH (phénylalanine hydroxylase )?

A

La phénylcétonurie est due à l’accumulation des métabolites de la phénylalanine et au manque de tyrosine.

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36
Q

1) Quel acide aminé est essentiel?
L’aspartate
Le glutamate
La glutamine
La leucine

2)Quel est le transporteur des unités à un atome de carbone?
Tétrahydrofolate
Glycine
Aspartate
Vitamine C

3) Quel acide aminé est synthétisé par hydroxylation de la phénylalanine
Aspartate
Tryptophane
Tyrosine

A

1- leucine
2- tetrahydrofolate
3-tyrosine

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37
Q

Comment est numéroté un nucleotides?

A

Un ntd est composé par une base azotée liée par une liaison glycosidique au ribose qui est phosphorylé à la position 5

1’- liaison glycosidique
2’-OH
3’-OH
5’-Phosphate

38
Q

Quelles sont les 2 types de bases azotés qu’on retrouve dans la formation de l’ADN et l’ARN? Qui en font partie? Qu’est-ce qui les différencie?

A

-Pyrimidines : Cytosine (C), Thymine (T), Uracil (U)
-Purines : Adénine (A), Guanine (G)

*La différence est que les pyrimidines sont à un cycle alors que les purines sont de deux cycles.

39
Q

Qu’est-ce qu’un nucleoside?

A

nucleotide sans grp phosphate

40
Q

La synthèse de nucléotides arrive par deux voies. Lesquels?

A

-de novo
-recuperation

41
Q

difference entre synthèse de Novo et de récupération

A

de novo où les ntd sont faits à partir de précurseurs simples comme acides aminés et sucres; et récupération où les bases azotées sont récupérées après dégradation des acides nucléiques.

42
Q

Qu’est-ce qui différencie un pentose ribose vs pentose désoxyribose?

A

La présence d’un groupement OH (ribose) vs présence de juste un H (désoxyribose)

43
Q

D’où provient le ribose?

A

Il vient du cycle de pentoses

44
Q

Quelle est la forme activée du ribose? Quelle est la réaction pour l’obtenir? Pour quoi est-il nécessaire?

A

Ribose 5-phosphate — PRPP synthétase + ATP —> 5-phosphoribosyl-1-pyrophosphate (PRPP)

PRPP nécessaire pour la synthèse de novo et la récupération.

45
Q

Par quoi est inhibé la PRPP

A

Purines et pyrimidine

46
Q

Quelles sont les deux voies possibles pour la biosynthèse de nucléotides? Quels sont les éléments nécessaires pour chacune des voies de la biosynthèse de nucléotides?

A

De novo :
-PRPP
-ATP
-Acides aminés
-Unités monocarbonées

Récupération :
-PRPP
-Bases azotées

47
Q

Quelle est la voie de Biosynthèse préféré, pourquoi?

A

La récupération

La synthèse de novo utilise des a.a comme précurseurs et a besoin de + énergie. C’est pour quoi la voie de récupération est favorisée.

48
Q

Dans la voie de novo pour la biosynthèse des nucléotides, quels sont les deux intermédiaires obtenus et à partir de qui?

A

À partir de purines, on obtient l’intermédiaire IMP.

À partir de pyrimidines, on obtient l’intermédiaire UMP.

49
Q

Purine utilise quoi pour faire AMP/GMP et combien d’étapes et d’ATP

A

IMP
11 étapes
6 ATP

50
Q

Pyrimidine utilise quoi pour faire AMP/GMP et combien d’étapes et d’ATP

A

UMP
6 étapes
2 ATP

51
Q

Expliquer comment se fait la synthèse de l’IMP à partir de purines?

A

La synthèse de l’IMP se fait par assemblage de la base périodique sur une molécule de ribose-5-phosphatase activé (PRPP) en utilisant la glutamine, la glycine, l’aspartate, le bicarbonate et des groupement formyles (donneur d’unité à un atome de carbone = tétrahydrofolate).

52
Q

V ou F: la synthèse de purines et de pyrimidines utilise des voies différentes

A

Vrai

53
Q

______ et _______ dérivent de l’IMP (un nucléotide purique).

A

L’AMP et le GMP

*L’AMP peut ensuite devenir ATP et GMP devient GTP

54
Q

Comment obtient on le CTP ?

A

La voie pour produire UMP a besoin de la glutamine, de l’aspartate et du bicarbonate. L’UMP est phosphorylé en UDP, puis en UTP
La CTP synthétase catalyse l’amination de l’UTP en CTP

55
Q

Quels produits finaux peut-on obtenir à partir de la synthèse de nucléotides pyrimidiques?

A

UMP —> UDP —> UTP —> CTP

56
Q

Différences entre synthèse de novo par les purines vs par les pyrimidines (5)

A

Purines : Seulement dans cytosol, sur PRPP, DGQ, besoin d’un transporteur à une unité de carbone (FTH) et HCO3-, consomme 6 ATP

Pyrimidines : Dans cytosol + 1 étape dans mitochondrie, base avant et après conjuration au PRPP, DQ (chaîne de transport des électrons), pas besoin d’un transporteur à une unité de carbone (FTH), mais besoin de HCO3-, consomme 2 ATP

57
Q

1) Parmi ces composés (1-glutamine, 2-glycine, 3-aspartate, 4- formyl-tétrahydrofolate) lesquels contribuent àla formation de purines?
1 et 4
1, 2 et 3
1, 2, 3 et 4

2)Le ribose 5’-phosphate pour la synthèse de nucléotides provient de?
Glycolyse
Cycle de Krebs
Voie des pentoses

A

1- 1,2,3,4
2- voie des pentoses

58
Q

Éléments qui composent l’ADN et l’ARN

A

ADN : Bases azotées = thymine, adénine, guanine, cytosine; sucre = désoxyribose (H2); groupement phosphate

ARN : Bases azotées = uracil, adénine, guanine, cytosine; sucre = ribose (OH); groupement phosphate

59
Q

Qui convertit les ribonucléotides en désoxyribonucléotides? Expliquer la réaction.

A

La ribonucléotide réductase

La réaction utilise le NADPH comme source ultime de pouvoir réducteur avec l’enzyme pour réussir la conversion.

60
Q

Combien y a-t-il de classes de ribonucléotides réductase? Quelle est celle que portent les mammifères et la plupart des bactéries?

A

Il existe 3 classes (classe 1, 2, 3). La classe 1 est celle protée par les mammifères et la plupart de bactéries.

61
Q

Par qui se fait la régulation allostérique de la ribonucléotide réductase par rapport à son domaine d’activité (2)? Et son domaine de spécificité (3)?

A

Domaine d’activité : dATP (effet inhibiteur), ATP (effet activateur)

Domaine de spécificité : dATP, dGTP, dTTP

62
Q

Les substrats de la ribonucléotide diphosphate réductase sont ____, le ____, le ____ et _____

A

Les substrats de la ribonucléotide diphosphate réductase sont l’ADP, le GDP, le CDP et l’UDP

63
Q

La thymine est un nucléotide produit par ________. Donner la réaction.

A

Méthylation

Désoxyribose-phosphate dUMP + méthylène-tétrahydrofolate (donneur d’unité à un atome de carbone) — thymidylate synthase —> désoxyribose-phosphate dTMP (thymine) + dihydrofolate

64
Q

Quelle enzyme permet de régénérer le cofacteur réduit, le méthylène-tétrahydrofolate?

A

La dihydrofolate réductase permet de transformer le dihydrofolate en méthylène-tétrahydrofolate.

65
Q

Quel est l’inhibiteur de la régénération du méthylène-tétrahydrofolate qui permet la production de thymine?

A

Le méthotrexate inhibe la dihydrofolate réductase ce qui inhibe la réaction de transformation de dihydrofolate en méthylène-tétrahydrofolate.

66
Q

La dégradation de purines produit de _________. La dégradation de pyrimidines produit la _________.

A

-l’acide urique
-bêta alanine

67
Q

1) La formation de désoxynucléotides est une réaction de:
Réduction
Oxydation

2) La conversion de DHF en THF par DHFR est une réaction de:
Réduction
Oxydation

3) La goutte touche environ 1% des hommes. Le régime alimentaire qui leur est donc recommandé inclut:
a) Boire du lait comme source de protéines
b) Manger de la viande comme source de protéines

A

1-reduction
2-reduction
3-boire du lait et ….

68
Q

uelles sont les voies possible de catabolisme des acides aminés (2)?

A

-Élimination de l’azote : renversement des voies de synthèse jusqu’à l’ammoniac

-Métabolisme de cétoacides : récupération de l’énergie, gluconéogenèse et cétogenèse

69
Q

Comment se traduit le catabolisme des produits azotés chez les bactéries?

A

Certaines bactéries sont capable de catabolisme l’ammoniac en N2 (bactérie dénitrifiantes) ou en nitrites (nitrosomonas, nitrosospira) et nitrates (nitrobacter, nitrospira) avec production de l’énergie.

70
Q

Vrai ou faux : L’ammoniac est très toxique pour les organismes supérieurs, il est éliminé sous plusieurs formes.

A

Vrai

71
Q

Sous quelle forme est éliminée l’ammoniac chez la plupart des animaux aquatiques, chez les animaux (mammifères et poissons cartilagineux) et chez les autres organismes (reptiles terrestres, oiseaux, insectes)? Comment se nomme chaque classe d’organismes selon la forme que prend l’ammoniac pour être évacuée?

A

Animaux aquatique = ammoniotéliques = ammoniac éliminé en hydroxyde d’ammonium ou ammoniac (NH4OH)

Mammifères et poissons cartilagineux = uréotéliques = ammoniac éliminé en urée

Reptiles terrestres, oiseaux et insectes = uricotéliques = ammoniac éliminé en acide urique

72
Q

Quelle est le taux de réutilisation des acides aminés chez les animaux uréotéliques

A

80%

73
Q

Quelle proportion de NH3 est éliminé dans le foie vs le rein

A

80% vs 20%

74
Q

L’ammoniac produit dans les autres tissus est d’abord transporté au ________ sous forme de ________ (tissu non-musculaire) ou sous forme _________ via le cycle alanine/glucose (tissu musculaire).

A

-foie
-glutamine
-alanine

75
Q

Expliquer le transfert au foie de l’ammoniac formé dans les tissus non-musculaires (4 étapes).

A

L’ammoniac est transporté au foie sous forme de glutamine (rôle de la glutamine synthétase dans le tissu et de la glutaminase dans le foie).

1-Le glutamate est transformé en glutamine par la glutamine synthétase + 1 ATP

2-La glutamine est transporté des tissus vers le foie

3-Dans le foie, la glutamine est transformé en glutamate par la glutaminase

4-La transformation de la glutamine en glutamate génère un ammoniac qui va être éliminé par urée

76
Q

Expliquer le transfert au foie de l’ammoniac formé dans les tissus musculaires (4 étapes)

A

1-L’ammoniac est d’abord concentré sur le glutamate par l’enzyme glutamate déshydrogénase

2-L’ammoniac est transféré au pyruvate pour former de l’alanine pour transport au foie

3-Au foie, le regroupement NH2 est transféré au a-cétoglutarate pour former le glutamate (alanine redevient pyruvate) (cycle de l’urée)

4-La glutamate déshydrogénase libère l’ammoniac du glutamate qui va être éliminé par urée

*Le pyruvate est recyclé sous forme de glucose et retourné au muscle (cycle glucose-alanine)

77
Q

Vrai ou faux : La glutamine synthétase et la glutamate déshydrogénase sont dans le cytosol.

A

Faux : La glutamine synthétase et la glutamate déshydrogénase sont dans les mitochondries.

78
Q

1) Lesquels de ces êtres vivants excrètent l’azote sous forme d’acide urique?
Insectes, reptiles et oiseaux
Requins, amphibiens adultes et mammifères
Bactéries, reptiles et oiseaux

2) Par quelles voies l’ammoniaque produit dans l’organisme est-il éliminé?
50 % dans le rein en forme d’ammoniaque et 50 % via le cycle de l’urée.
80 % dans le rein en forme d’ammoniaque et 20 % via le cycle de l’urée.
20 % dans le rein en forme d’ammoniaque et 80 % via le cycle de l’urée.

2)De quelle façon l’azote est-il éliminé quand l’eau est très abondante?
Urée
Acide urique
N2
Ammoniac

A

1-insectes….
2- 20% dans le rein….
3- ammoniac

79
Q

Expliquer le cycle de l’urée (1 réaction de préparation + 6 étapes). Dire si les réactions/étapes se font dans la mitochondrie ou dans le cytosol.

A

1-L’enzyme carbamoyl phosphate synthétase combine l’ammoniac et le bicarbonate pour former le carbamoyl phosphate. 2 ATP consommés. (Mitochondrie)

2-L’enzyme ornithine transcarbamoylase combine l’ornithine avec le carbamoyl phosphate pour donner la citrulline (mitochondrie)

3-La citrulline passe de la mitochondrie vers le cytosol

4-L’enyme AS synthase combine l’aspartate et la citrulline pour donner l’arginosuccinate. 2 liaisons de 1 ATP de consommées (ATP —> AMP) (cytosol)

5-L’ensyme AS lyase transforme l’arginosuccinate en arginine et en fumarate (va dans le cycle de Krebs) (cytosol)

6-L’enzyme arginase transforme l’arginine en urée et en ornithine (cytosol)

7-L’urée est éliminé par urine tandis que l’ornithine retourne dans la mitochondrie pour reprendre le cycle de l’urée

80
Q

L’arginosuccinate (cycle de l’urée) possède combien de groupements NH2 (combien d’atomes d’azote)? D’où proviennent-ils?

A

Possède 2 atomes d’azote —> Un provient du Carbamoyl-phosphate et l’autre de l’aspartate

*Il y a donc élimination de deux N par tour de cycle

81
Q

Expliquer le lien entre le cycle de l’urée et le cycle de Krebs.

A

le fumarate produit dans le cycle de l’urée rentre au cycle de Krebs et produit l’oxaloacétate (OAA). L’OAA par transamination prend le groupe amine du glutamate pour former l’aspartate qui est le donneur du 2e azote pour le cycle et l’alpha cétoglutarate qui est aussi un métabolite du cycle de Krebs.

82
Q

Combien d’ATP sont requis pour la formation d’une molécule d’urée?

A

4 ATP

83
Q

Combien y a-t-il de réactions du cycle de l’urée dans le foie?

A

4 réactions

84
Q

Combien d’ATP il faut pour le cycle de l’urne?

A

2 atp

85
Q

Expliquer le contrôle du cycle de l’urée? Par qui, comment?

A

L’activité du cycle de l’urée est contrôlée au niveau de la réaction de la carbamoyl-phosphate-synthétase qui est régulée par le n-acétylglutamate, un activateur allostérique.

Le n-acétylglutamate (NAG) est fait à partir du glutamate et acétyl-CoA par la NAG synthase, une enzyme activée par glutamate et arginine. Ces deux acides aminés sont des indicateurs de haut niveau des amines.

86
Q

Comment se débarrasser de l’ammoniac en excès? Quel peut être les effets de ce mécanisme?

A

La réaction de la glutamine synthétase permet l’élimination de l’ammoniac par la formation de glutamine à partir de glutamate.

Cependant, l’augmentation en glutamate conduit à la formation de glutamine ce qui vide les réservoirs de glutamate, lesquels sont nécessaires au tissu nerveux puisque le glutamate est à la fois un neurotransmetteur et un précurseur de la synthèse du gamma-aminobutyrate (GABA), un autre neurotransmetteur.

Les réductions en glutamate dans le cerveau vont affecter à la fois la production d’énergie et les transmissions nerveuses.

87
Q

1) Identifiez l’énoncé qui est vrai.
L’argininosuccinate est converti en urée et ornithine dans le cycle de l’urée (CU).
Le carbamoyl phosphate donne les deux atomes d’azote de l’urée dans le CU.
La formation de l’urée génère de l’énergie.
L’arginine est hydrolysée en urée et en ornithine dans le CU.

2) À pH 7.3, le rapport NH3/NH4+ est:
100/1
10/1
1/1
1/10
1/100
pK NH4+ = 9.3, pH= pK + log(A- )/(AH)

3) Identifiez l’énoncé qui est faux. La déficience d’arginase augmente le niveau sanguin de l’:
a) urée, b) arginine, d) ammoniaque

A

1-arginine est hydro..
2- 1/100
3- uree

88
Q

Selon leur point d’entrée dans les voies métaboliques, les 20 acides aminés se répartissent en 3 groupes. Quels sont-ils?

A

1-Glucogénique : produisent pyruvate ou des intermédiaires du cycle de Krebs et s’il n’y a pas de glucose ils peuvent la produire par gluconéogenèse

2-Cétogéniques : produisent des corps cétoniques

3-Amphiboliques : lorsqu’ils sont à la fois glucoformateurs et cétogéniques

89
Q

Classer les 20 acides aminés selon leur groupe (glucogénique, cétogénique, amphibolique).

A

Glucogénique : alanine, asparagine, aspartate, cystéine, glutamate, glutamine, glycine, proline, sérine, arginine, histidine, méthionine, valine

Cétogénique : leucine, lysine

Amphibolique : tyrosine, isoleucine, phénylalanine, tryptophan, thréonine

90
Q

En présence d’énergie abondante, les acides aminés sont convertis en _________ via ________.

A

-acides gras
-l’acétyl-Coa

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