12 qu'îlet Flashcards

1
Q

C’est quoi un autre nom pour la synthèse protéique?

A

trad

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2
Q

Le code génétique se compose de quoi?

A

Codons (mots de 3 lettres comme UAC)

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3
Q

Les codons sont traduits dans quel sens?

A

5’ -> 3’

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4
Q

Qu’est-ce qu’il y a de particulier avec le codon AUG?

A

C’est le codon pour traduire la méthionine qui agit comme signal initiation de la traduction

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5
Q

C’est quoi la dégénérescence du code génétique et c’est quoi son avantage?

A

La plupart des aa ont plusieurs combinaisons de codons pour les traduire (ex: 6 pour Ser, 4 pour Gly). Les divers codons spécifiant un aa donné sont des codons synonymes. Cette dégénérescence du code génétique atténue l’effet des mutations parce que le changement d’une seule base forme souvent un codon qui spécifie encore le même aa.

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6
Q

C’est quoi les seuls aa spécifiés par un codon?

A

La méthionine (AUG) et le tryptophane (UGG)

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7
Q

C’est quoi le cadre de lecture ouvert?

A

La partie d’un cadre de lecture avec le potentiel d’encoder une protéine. C’est une série de codons sans codons de terminaison

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8
Q

Dans la structure des ARNt, l’extrémité 3’ est connu sous le nom _____________________, puisque c’est le site d’attachement des _______________.

A

tige acceptrice
aa

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9
Q

La boucle située à l’opposé de la tige acceptrice est connu sous le nom __________________

A

lobe antichoc

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10
Q

Dans l’ARNt, qu’est-ce qui contient la lobe tψc et la lobe D?

A

Lobe tψc porte une thymidine (t) suivie d’une pseudo-uridine (ψ) et d’une cytidine
Lobe D contient des résidus dihydro-uridine

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10
Q

Comment les molécules d’ARNt reconnaissent les molécules d’ARNm?

A

Grâce à l’appariement des anticodons (3’ -> 5’) avec les codons de l’ARNm (5’ -> 3’) aka antiparallèle

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11
Q

Pourquoi la position 5’ de l’anticodon est souvent appelée position de flottement?

A

Parce que la position 5’ de l’anticodon possède une flexibilité de conformation (une variance d’appariement) que Crick a surnommé wobble.

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12
Q

Comment s’appelle les diverses molécules d’ARNt qui portent toutes le même aa?

A

ARNt isoaccepteur

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13
Q

Un aa déterminé se lie par ________________ à l’extrémité ________ de la molecule d’ARNt qui lui correspond. Le groupe carboxyle de l’aa forme un liaison _______________ avec le 3’ ___________ de _________________. le produit de cette réaction d’aminoacylation est un __________________. Les enzymes qui catalysent cette réaction sont des _______________________.

A

covalence
3’
ester
OH
Adénosine
aminoacyl-ARNt
aminoacyl-ARNt synthétase

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14
Q

C’est quoi la réaction globale de la synthèse d’aminoacyl-ARNt?

A

aa + ARNt + ATP -> aminoacyl-ARNt + AMP + PPi

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15
Q

C’est quoi les 2 étapes pour synthétiser les molécules d’aminoacyl-ARNt?

A
  1. La formation d’un intermédiaire réactionnel (aminoacyl-adénylate)
  2. Le transfert du groupe aminoacyl de l’intermédiaire à l’ARNt
16
Q

Les ribosomes sont des _____________________ résultant de l’assemblage de 2 sous-unités: une petite sous-unité de ___________ et une grande sous-unité de _____________ chez les procaryotes, et une petite sous-unité de ___________ et une grande sous-unité de _____________ chez les eucaryotes. Le ribosome est fait de __________ d’ARN et ___________ de protéines.

A

ribonucléoprotéines
30s
50s
40s
60s
2/3
1/3

17
Q

Vrai ou faux, les protéines ribosomiques s’associe avec la surface de l”ARNr

A

Vrai

18
Q

Qu’est-ce que le complexe d’initiation comprend?

A

-Les 2 éléments du ribosomes
-L’ARNm servant de matrice à la traduction
-Un ARNt initiateur particulier (AUG Méthionine)
-Plusieurs protéines auxiliares appelées facteurs d’initiation

19
Q

Pourquoi chaque cellule possède au moins 2 types de molécules de méthionyl-ARNtmét qui reconnaissent le codon AUG?

A

un pour ARN initiateur: ne reconnaît que le codon AUG d’initiation
L’autre reconnaît les codons AUG (méthionine) à l’intérieur de la séquence codante

20
Q

Chez les eubactéries, l’ARNt initiateur s’appelle ___________________. L’ARNt initiateur chargé, désigné ___________________, est le substrat d’une __________________________ qui transfert un groupe formyl du _____________________ au résidu _________________ pour former le _________________

A

ARNtf^met
méthionyl-ARNt^mét
formyl transférase
10-formyltétrahydrofolate
méthionine
N-formylméthionyl-ARNtf^mét (fMet-ARNtf^mét

21
Q

Vrai ou faux, chez les eucaryotes, l’ARNt initiateur est formylé comme chez les eubactéries.

A

Faux, il n’est pas formylé et est désigné Met-ARNti^mét

22
Q

Quels facteurs aident à la dissociation des sous-unités ribosomales pour les activer?

A

le facteur d’initiation 3 (IF3) et le facteur d’initiation 1 (IF1)

23
Q

Les 3 éléments qui constituent le complexe tertaire dans l’assemblage du complexe d’initiation

A

ARNt - IF2 - GTP

24
Q

Qu’est-ce qui se passe lors de la dernière étape de l’initiation de la synthèse protéique?

A

Le GTP est hydrolysée par IF2, les facteurs d’initiation quittent et la sous-unité ribosomale 50s se lie. Le complexe est prêt à recevoir un premier aminoacyl-ARNt pour faire l’élongation de la chaîne peptidique

25
Q

C’est quoi le rôle de IF2?

A

Une protéine de liaison au GTP. Lie le fMet-ARNt^met initiateur et aide sa fixation à la petite sous-unité

26
Q

Qu’est-ce que la séquence Shine-Dalgarno?

A

C’est une région riche en purines placée juste en amont du codon initiateur de l”ARNm où la sous-unité 30s s’attache et cette séquence est complémentaire d’un segment riche en pyrimidine du bout 3’ de la molécule d’ARN 16s

27
Q

la séquence Shine-Dalgarno sert à quoi?

A

Pendant la formation du complexe d’initiation, les nucleotides complémentaires à la séquence Shine-Dalgarno s’apparient les uns aux autres en une structure double-brin qui arrime l’ARNm au ribosome et renforce également l’appariement du codon initiateur avec l’anticodon, de façon que la synthèse protéique démarre rigoureusement au codon approprié

28
Q

Vrai ou faux, la séquence Shine-Dalgarno est présente chez les procaryotes et les eucaryotes

A

Faux, seulement chez les procaryotes

29
Q

C’est quoi le rôle de eIF2?

A

une protéine de liaison au GTP et lie le MetARNt^met et aide sa fixation à la petite sous-unité qui forme le complexe tertiaire

30
Q

Les 3 étapes de microcycle passées par chaque aa pendant l’allongement

A

-La mise en place correcte de l’aminoacyl-ARNt au site A du ribosome
-La formation de la liaison peptidique
-La translocation (fait avancer le ribosome d’un codom sur l’ARNm)

31
Q

la mise en place du prochain aminoacyl-ARNt au site A est catalysé par quel facteur chez les bactéries?

A

par un facteur d’élongation appelé EF-Tu qui est un monomère protéique muni d’un site de fixation pour le GTP. Forme un complexe tertaire EF-Tu - GTP - aminoacyl-ARNt qui s’ajuste au site A

32
Q

Il n’est pas possible de former une liaison peptidique avant quoi?

A

avant l’hydrolyse du GTP en GDP par EF-Tu

33
Q

L’activité enzymatique responsable de la formation de la liaison peptidique est celle d’une ___________________ qui appartient à la _____________________________

A

L’activité enzymatique responsable de la formation de la liaison peptidique est celle d’une ___________________ qui appartient à la _____________________________
peptidyl transférase
grande sous-unité du ribosome

34
Q

Chaque liaison peptidique a besoin de combien d’ATP?

A

4 (chargement d’un aa sur l’ARNt par l’aminoacyl-ARNt synthétase requiert l’equivalence de 2 ATP (passage de l’ATP à AMP), tandis que l’élongation du polypeptide utilise un GTP à 2 étapes , soit 2 équivalents ATP)

35
Q

hydrolyse du GTP pendant l’élongation assure quoi?

A

L’irréversibilité des réactions de l’élongation

36
Q

Qu’est-ce qui se passe lors de la terminaison de la traduction?

A

l’un des 3 codons de terminaison (UGA, UAG, UAA) arrive en face du site A. Ces codons de terminaison ne sont reconnus par aucune molécule d’ARNt, mais par un des facteurs de terminaison (relargage): RF-1 reconnaît UAA et UAG, RF-2 reconnaît UAA et UGA. Le facteur RF-3 est lié à un GTP et rend plus efficace l’action des RF-1 et RF-2. La fixation de ces facteurs au site A modifie l’activité de peptidyl-transérase de telle sorte qu’elle hydrolyse alors la liaison ester du peptidyl-ARNt. La terminaison s’accompagne d’une hydrolyse de GTP et du départ des facteurs de relargage du ribosome. Les sous-unité de ribosome se détache de l’ARNm et se séparent