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biocell 2 > cours 8 - transcription et traduction > Flashcards

cours 8 - transcription et traduction Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que la transcription?

A

Action de polymérisation de l’ADN à partir de l’ARN

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Q

Qu’est-ce que la traduction?

A

Action de polymérisation des acides aminés en protéines à partir de l’ARNm (ARN en protéines)

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3
Q

Qu’est-ce que la régulation des gènes?

A

Toutes les cellules d’un même organisme possèdent le même génome, mais tous les gènes ne sont pas exprimés en même temps

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4
Q

V/F: la régulation des gènes s’effectue à plusieurs niveaux

A

Vrai

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5
Q

De quoi est composé l’ARN (acide ribonucléique)?

A

Ribose
Uracile
Simple-brin

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6
Q

Comment est la structure de l’ARN?

A

Peut prendre des structure particulières selon leur séquence, avec elle-même ou avec d’autres ARNs

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7
Q

Que contient l’ARN ribosomique des bactéries?

A
  1. Plusieurs types de structures (boucles, tiges, boucles-internes, tiges-boucles)
  2. Des appariements non-conventionnels (U-G)
  3. Bases modifiées
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8
Q

De quoi est composé l’ADN (acide désoxyribonucléique)?

A

Désoxyribose
Thymine
Double-brin

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9
Q

Pourquoi les ARN ont plusieurs fonctions dans la cellule?

A

Car ils sont une grande versatilité structurale

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10
Q

comment appelle-t-on les ARN ayant une activité enzymatique?

A

Ribozymes

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11
Q

V/F: l’ARN est plus versatile que les protéines pour les fonctions enzymatiques?

A

Faux, l’ARN est moins versatile que le sproétines pour les fonctions enzymatiques

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12
Q

Comment l’ARN simple-brin est capable de se replier de façons à avoir différentes structures importantes pour leur fonction?

A

En structures secondaires et tertiaires

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13
Q

Quels sont les trois types d’ARNs dans la cellule?

A
  1. ARNm
  2. ARNt
  3. ARNr
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14
Q

À quoi servent les ARNmessagers?

A

Véhiculent l’information continue dans l’ADN vers le cytosol, où ils seront pris encore ahrge par la machinerie traductionnelle

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15
Q

Quel est le seul type d’ARN qui code pour les protéines?

A

ARNm

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16
Q

À quoi servent les ARNtransferts?

A
  1. Processus de traduction
  2. Impliqués dans l’incorporation des acides aminés dans la porcine en cours de synthèse
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17
Q

Les ARNribosomiaux sont nécessaires à quoi?

A

Nécessaires à la traduction, puisqu’ils entrent dans la composition des ribosomes et coordonnent et positionnent l’ARNm et les ARNt

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18
Q

Pourquoi les ARNr sont nécessaires à la traduction?

A

Puisqu’ils entrent dans la composition des ribosomes et coordonnent et positionnent l’ARNm et les ARNt

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19
Q

Quels sont les rôles de l’ARNr?

A
  1. Sélection des ARNt
  2. fidélité de la traduction
  3. Liaison des facteurs protéiques de traduction
  4. Polymérisation des acides aminés
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20
Q

Quels sont les trois types d’aRN polymérises dans la cellule humaine?

A
  1. Pol I
  2. Pol II
  3. Pol III
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21
Q

Combien de type d’ARN polymérase existe-t-il dans les procaryotes?

A

Un seul

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22
Q

Que font les ADN polymérases?

A

Ils sont capables de synthétiser de l’ARN à partir de l’ADN en utilisant des ribonucléosides triphosphates (ATP, CTP, GTP, UTP)

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23
Q

Quelle est la cible transcriptionnelle des Pol I?

A

Gros ARNr

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24
Q

Quelle est la cible transcriptionnelle des Pol II?

A

ARNm

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25
Q

Quelle est la cible transcriptionnelle des Pol III?

A

Petits ARNt et petits ARNr

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26
Q

Quelles sont les caractéristiques de la polymérisation de la chaine d’ARN par les polymérases?

A
  1. Toujours de 5’ vers 3’
  2. Pas besoin d’amorce
  3. Synthétise la chaine d’ARN complémentaire au brin matrice-modèle
  4. Synthétise un seul brin d’ADN à la fois
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27
Q

Qui sont les précurseurs complémentaires au brin matrice utilisés dans la polymérisation?

A

Les ribonicléosides triphosphates

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28
Q

Quelle est la réaction chimique de la polymérisation de la chaîne d’ARN par les polymérases?

A

Réaction irréversible
1. Libération de pyrophosphate
2. Hydrolyse en deux phosphate inorganiques

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29
Q

Quelles sont les trois grandes étapes de la transcription?

A
  1. Initiation
  2. Élongation
  3. Terminaison
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30
Q

Quelles sont les étapes de l’initiation de la transcription?

A
  1. Liaison au promoteur
  2. Fusion de l’ADN (séparation des brins) et formation d’une bulle de transcription
  3. Ajout de deux premiers nucléotides du transcrits
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31
Q

Quelle est l’étape de l’élongation de la transcription?

A
  1. Polymérisation de l’ARN du brin matrice
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32
Q

Quelle est l’étape de la terminaison de la transcription?

A
  1. Rencontre de la séquence de terminaison dans l’ADN et relâchement de l’ARN
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33
Q

En somme, quelles sont les étapes de la transcription (les trois grandes étapes combinées)?

A
  1. Liaison au promoteur
  2. Fusion de l’ADN (séparation des brins) et formation d’une bulle de transcription
  3. Ajout de deux premiers nucléotides du transcrits
  4. Polymérisation de l’ARN du brin matrice
  5. Rencontre de la séquence de terminaison dans l’ADN et relâchement de l’ARN
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34
Q

Les ARN polymérises ont besoin de quoi pour trouver leurs promoteurs?

A

Facteurs de transcription

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35
Q

Qu’est-ce que la région promotrice des gènes?

A

Permet la liaison et le positionnement de l’ARNpol

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36
Q

Chez les eucaryotes, le promoteur est reconnu par quoi?

A

Les facteurs généraux de transcription

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37
Q

Quelles sont les six facteurs généraux de transcription?

A
  1. TFIID
  2. TFIIA
  3. TFIIB
  4. TFIG
  5. TFIIE
  6. TFIIH
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38
Q

Que fait le facteur de transcription TFIID?

A

TBP: reconnait et lie la boite TATA
TAF: lie d’autres régions comme l’initiateur

39
Q

Que fait le facteur de transcription TFIIA?

A

Stabilise le contact TBP-ADN

40
Q

Que fait le facteur de transcription TFIIB?

A
  1. Sélectionne le site d’initiation de la transcription
  2. Oriente l’ARN Pol II
41
Q

Que fait le facteur de transcription TFIG?

A
  1. Se lie directement à la Pol II
  2. Facilite l’ouverture de la bulle de transcription
42
Q

Que fait le facteur de transcription TFIIE?

A
  1. Aide à maintenir la bulle de transcription ouverte
  2. Interagit acec TFIIH
43
Q

Quelles sont les trois activités enzymatiques de TFIIH?

A
  1. Kinase: phosphore la Pol
  2. Hélicase: déroule l’ADN
  3. ATPase: déroule l’ADN
44
Q

Chez les eucaryotes, en plus du promoteur reconnu par les facteurs généraux de transcription, quoi d’autres sont liés par ces facteurs?

A

Les amplificateurs

45
Q

Que sont les amplificateurs?

A

Éléments de contrôle distaux

46
Q

À quoi servent les amplificateurs?

A
  1. Aident à stabiliser le complexe de transcription au niveau du promoteur
  2. Détermine à quel moment et à quelle intensité un gène doit être exprimé
47
Q

Quelles sont les caractéristiques des amplificateurs?

A
  1. Liés par des facteurs de transcription
  2. Peuvent posséder plusieurs éléments de réponses
48
Q

Quels sont les rôles des facteurs généraux de transcription?

A
  1. Permettent le recrutement et le bon positionnement de l’ARN Pol II au niveau du promoteur
  2. Ouvrent l’ADN grâce à de activités hélicases
49
Q

Comment les facteurs de transcriptions permettent le recrutement et le bon positionnement de l’ARN Pol II au niveau du promoteur?

A

Grâce à la reconnaissance d’éléments conservés dans l’ADN (boite TATA)

50
Q

V/F: Chaque activateur possède son site de liaison spécifique dans l’ADN

A

Vrai

51
Q

Quelles sont les trois domaines de la structure des facteurs de transcription?

A
  1. Domaine de liaison à l’ADN
  2. Région d’activation
  3. Domaine de dimérisation
52
Q

À quoi sert le domaine de liaison à l’ADN de la structure des facteurs de transcription?

A

Reconnaissance d’une séquence spécifique dans l’ADN

53
Q

À quoi sert la région d’activation de la structure des facteurs de transcription?

A
  1. Interaction avec un ou des composants de la machinerie de transcription
  2. Forme des interactions protéines-protéines avec les composants de la machinerie
  3. Permet le recrutement de proétines sur l’ADN
  4. Recrute des coactivateurs pour aider à ouvrir l’ADN
54
Q

À quoi sert le domaine de dimérisation de la structure des facteurs de transcription?

A

Permet l’association de facteurs de dimères

55
Q

La région d’activation de la structure des facteurs de transcription sert à quoi?

A

Elle sert de pont entre l’aDN et la machinerie de transcription (recrutement)

56
Q

Qu’est-ce que la région d’activation de la structure des facteurs de transcription peut recruter?

A
  1. ARN Pol II
  2. Facteurs de transcription
  3. Enzyme de remodelage de la chromatine (coactivateurs)
  4. Enzymes de modification de histones (coactivateurs)
57
Q

Quelle est la structure de l’ARN Pol II?

A

Possède une queue C-terminale (CDT): longue chaîne peptidique répétée

58
Q

Quels sont les rôles de la queue C-terminale de l’ARN Pol II?

A
  1. Signale la transition de l’étape d’initiation vers l’étape d’élongation
  2. Sert de plateforme d’interaction protéine-protéine
  3. Plusieurs facteurs restent au promoteur, d’autres suivent la Pol II en élongation
59
Q

La maturation des ARNm arrive en même temps que quoi?

A

Que l’étape d’élongation de la transcription

60
Q

La terminaison de la transcription arrive en même remps que quoi?

A

Que l’étape de maturation finale

61
Q

Quelles sont les étapes de la maturation des ARN?

A
  1. Ajout de la coiffe en 5’
  2. Clivage au site poly A
  3. Polyadénylation
  4. Épissage
62
Q

À quoi sert l’ajout de la coiffe 5’ lors de la maturation des ARN?

A
  1. Protège l’extrémité contre la dégradation
  2. Permet la traduction de l’ARNm
63
Q

Quelles sont les étapes de l’épissage lors de la maturation des ARN?

A
  1. Implique la formation d’un line phosphodiester non-conventionnel (5’-2’)
  2. Formation d’un lasso
  3. Jonction de l’extrémité 3’ du premier exon à l’extrémité 5’ du deuxième exon
  4. Le lasso est détruit
64
Q

L’épissage est effectué par quel complexe ribonucléique?

A

Le spliceosome

65
Q

Que permet l’épissage?

A

Permet de rabouter les exons entre eux en enlevant les introns

66
Q

Quelles sont les composantes du complexe protéique qui ajoute la queue poly-A?

A
  1. CPSF
  2. CStF (endonucléase)
  3. PAP (poly-A polymérase)
67
Q

Que fait la CPSF lors de l’ajout de la queue poly-A?

A
  1. Reconnait le site de terminaison
  2. Facteur spécifique de clivage et de polyadénylation
68
Q

Que fait la CStf lors de l’ajout de la queue poly-A?

A
  1. Coupe l’ARN
  2. Stimule le clivage
69
Q

Que fait la PAP lors de l’ajout de la queue poly-A?

A

Ajoute la queue sur le 3’ -OH de l’ARN clivé

70
Q

Quelles sont les fonctions de la queue poly-A?

A
  1. Protège l’extrémité 3’ de l’ARNm
  2. Permet la traduction
71
Q

Quelles sont les proétines responsables de la liaison de la queue poly-A?

A

PABPII et PABPI

72
Q

Quelle est la fonction la plus importante de l’épissage?

A

L’épissage alternatif

73
Q

Qu’est-ce que la fonction d’épissage alternatif de l’épissage?

A

Production de plusieurs sortes de polypeptides (ARNm matures différents) à partir du même gène

74
Q

Que permet la production de plusieurs sortes de polypeptides à partir du même gène lors de l’épissage alternatif?

A

Permet de produire plusieurs isoformes d’une proétine particulière

75
Q

Qu’est-ce que le ribosome eucaryote?

A

Ribonucléoprotéine composée de proétines et d’ARN formée de deux sous-unités de 40S et 60S

76
Q

Quelles sont les trois cavités importantes du ribosome?

A
  1. Site A: aminoacyl
  2. Site P: peptide
  3. Site E: exit
77
Q

Qu’est-ce que l’information contenue dans l’ARNM détermine?

A

La séquence des mainoacyl-ARNt acceptés par le ribosome durant la traduction

78
Q

Que comporte la structure des ARNt matures?

A
  1. Une portion CCA-OH en 3’ (où les acides aminés sont ajoutés)
  2. Boucle anticodon
79
Q

Quelle enzyme vient ajouter des acides aminés sur la portion CCA-OH en 3’ des ARNt matures?

A

Les ARNt synthétases spécifiques

80
Q

La boucle anticodon de l’ARNt mature s’apparie avec quoi?

A

Aux codons complémentaires sur les ARNm à l’intérieur du ribosome

81
Q

À quoi servent les anticodons appariés aux codons?

A

Permettre de traduire le message de l’ARNm, soit du gène, dont il est issu en protéine

82
Q

Quelles sont les étapes de la maturation du pré-ARNt?

A
  1. Une séquence en 5’ est retirée lors de la maturation et des bases sont modifiées en 3’
  2. CAA attache les aminoacyl
  3. Les bases modifiées sont impliquées dans la reconnaissance
  4. L’extrémité 3’ est le site de liaison de l’acide aminé via le carbonyle de l’acide aminé
  5. Les bons acides aminés sont ajoutés aux bons ARNt par des aminoacyl synthétases
83
Q

Quelle est l’activité qui est considérée la plus complexe de la cellule?

A

La traduction

84
Q

Que requiert la traduction?

A
  1. ARNt attachés à leurs acides aminés
  2. ribosome
  3. ARNm
  4. Protéines de traduction
  5. Énergie GTP
85
Q

Quelles sont les trois étapes de la traduction?

A
  1. Initiation
  2. Élongation
  3. Terminaison
86
Q

En quoi consiste l’étape d’élongation de la traduction?

A
  1. Sélection de l’aminoacyl-ARNt
  2. Formation du lien peptidique
  3. Translocation
  4. Relâchement de l’ARNt déacylé
87
Q

Durant l’initiation de la traduction, combien de complexes sont formés pour initier la traduction?

A

Deux complexes sont formés pour initier la traduction

88
Q

Quelles sont les étapes de l’initiation de la traduction?

A
  1. Le complexe 43S comprenant la sous-unité 40S du ribosome, l’ARNt Met initateur et le facteur elF2 lié au GTP vont s’associer avec le complexe ARNm lié par d’autres facteurs d’initiation de la traduction
  2. Scan du ribosome jusqu’à l’AUG initial (codon start)
  3. L’hydrolyse du GTP par elF2 permet de recruter la sous-unité 60S
  4. La traduction peut commencer
89
Q

Quelles sont les étapes en détails de l’élongation de la traduction? (voir notes pour vraiment en détails)

A
  1. Le ribosome est bien positionné au site d’initiation et un ARNt-Met est présent au site P du ribosome
  2. Le bon ARNt complémentaire au codon suivant est sélectionné par le ribosome et la GTPase eEF1a
  3. La formation d’un lien peptidique transfère l’acide aminé présent sur l’ARNt du site P à l’ARNt du site A
  4. La GTPase eEF2 déplace l’ARNm d’un codon dans le ribosome
90
Q

Les codons STOP dans l’ARN sont reconnus par quoi?

A

Par des facteurs de relâchement eRF1

91
Q

Quels sont les trois codons stop?

A

UAA
UAG
UGA

92
Q

Que nécessite l’étape de terminaison de la traduction?

A

La terminaison a lieu à un des trois codons stop et nécessite des facteurs de relâchement (eRF1) qui reconnaissent les codons stop

93
Q

Quelles sont les étapes de la terminaison de la traduction?

A
  1. Le lien ester entre le polypeptide et l’ARNt du site P est hydrolysé
  2. Dissociation du ribosome
  3. Désassemblage du ribosome
  4. Relâchement de la protéine

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