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biocell 2 > cours 7 - réplication et réparation de l'ADN > Flashcards

cours 7 - réplication et réparation de l'ADN Flashcards

1
Q

La réplication mène à quoi?

A

Conduit à la production de deux molécules d’ADN complètes et de même séquence

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Q

De quelle façon la molécule d’aDN est-elle répliquée?

A

De façon semi-conservative

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3
Q

Que veut-on dire par le fait que la molécule d’ADN est répliquée de façon semi-conservative?

A

Chacun des brins parentaux forme un duplex avec un brin nouvellement répliqué (chaque nouvelle molécule double-brin contient un vieux brin et un brin neuf)

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4
Q

L’ADN est répliqué à partir de quoi?

A

D’origines de réplication

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5
Q

L’ADN est répliqué à partir d’origines de réplication via la formation de quoi?

A

De bulles de réplications bidirectionnelles

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6
Q

L’ADN se réplique dans une direction ou dans les deux?

A

Se réplique dans les deux directions

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7
Q

L’ADN polymèrase se lie où?

A

Aux deux extrémités de la bulle de réplication

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8
Q

Combien y-a-il d’origine de réplication par molécule d’ADN?

A

Une seule

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9
Q

Chaque origine forme combien de fourche?

A

Une origine = deux fourches

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10
Q

Comment fonctionne la réplication des deux brins d’ADN?

A

Les deux brins de l’ADN sont séparés et les nouveaux brins complémentaires commencent à s’allonger des deux directions (aux extrémités de la bulle)

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11
Q

Quel est le problème relié au déroulement de la double-hélice de l’ADN durant la réplication et la transcription?

A

Le déroulement provoque un surenroulement de l’ADN devant La Fourche de réplication ou le bulle de transcription

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12
Q

Quelles enzymes peuvent couper un ou deux brins d’ADN afin de diminuer le surenroulement?

A

Les topoisomérases de types I et II

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13
Q

Que font les topoisomérases de type I et II?

A

Elles coupent un ou deux brins d’ADN afin de diminuer le surenroulement dû au déroulement de l’ADN lors de la réplication et de la transcription, en utilisant de l’ATP

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14
Q

Qu’arriverait-il s’il n’y avait pas les topoisomérases pour couper les brins d’ADN en cas de surenroulement?

A

La Fourche réplication ne pourrait plus avancer, car il deviendrait trop difficile de dérouler l’ADN

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15
Q

Comment est l’orientation de la double-hélice d’ADN?

A

Antiparallèle des deux brins (5’-3’ et 3’-5’)

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16
Q

La double-hélice d’ADN est formé par l’appariement de quoi?

A

L’appariement des bases azotées via des ponts H entre les adénine-thymine (2 ponts) et entre les cytosine-guanine (3 ponts)

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17
Q

Quels sont les liens qui forment chaque brin d’ADN?

A

Des liens phosphodiesters entre le 3’ d’un désoxyribose d’un cucléotide et le 5’ d’un désoxyribose du nucléotide suivant

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18
Q

Quelle enzyme est responsable de la réplication de l’ADN durant la synthèse de l’ADN?

A

ADN polymérase

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19
Q

Quelle est l’activité de l’ADN polymérase?

A

Activité 5’-3’ polymérase

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20
Q

Les ADN polymérises nécessitent quoi pour démarrer la synthèse d’ADN?

A
  1. Amorce
  2. Brin matrice-modèle
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21
Q

Pourquoi les ADN polymérase nécessitent une amorce et d’un brin matrice-modèle pour démarrer la synthèse d’ADN?

A

Pour déterminer quel nucléoside triphosphate sera ajouté à la chaîne en élongation

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22
Q

Par quoi les ADN polymérases diffèrent-elles entre-elles?

A

Par leur vitesse d’action et leur précision (différents types sont utilisés dans différentes situations

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23
Q

Qu’est-ce qu’une amorce?

A

ARN brin matrice déjà associé à un peut brin d’ADN ayant un bout 3’ -OH libre

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24
Q

La synthèse d’un nouveau brin s’effectue à partir de quoi?

A

D’un brin matrice-modèle

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25
Q

L’ADN polymérase catalyse la réaction entre quoi et quoi?

A

Entre le 3’ -OH de la chaine en élongation et le premier groupement phosphate du nucléoside triphosphate approprié
(Ajoute un nucléotide au bout d’une chaine d’ADN double-brins)

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26
Q

Comment fonctionne les ADN polymérase?

A

Elles catalysent la réaction entre le 3’ -OH de la chaine en élongation et le premier groupement phosphate du nucléoside triphosphate approprié pour former un nouveau lien phosphodiester qui allonge la chaine d’ADN d’un nucléotide à la fois et forme un nouvelle paire de bases

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27
Q

V/F: les deux brins d’ADN sont synthétisés de façon continue

A

Faux, un brin est synthétisé de façon continue et l’autre de façon discontinue

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28
Q

Quel est l’effet qu’un brin est synthétisé de façon continue et l’autre de façon discontinue?

A

La fourche va s’ouvrir vers la droite (5’-3’), ce qui est bien pour l’ADN polymérise du bas, mais pas pour l’autre qui va dans l’autre direction

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29
Q

Quelle est la conséquence qu’un brin est synthétisé de façon continue et l’autre de façon discontinue?

A

Cela créer des fragments discontinus d’Okazaki

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30
Q

Quelles sont les étapes pour rectifier les fragments d’Okazaki?

A
  1. La primasse synthétise des courts fragments d’ARN (pas besoin d’amorce)
  2. Élongation par l’ADN polymérase (en utilisant les fragments d’ARN comme amorce)
  3. Retrait de la primasse et remplissage du trou par l’aDN polymérase
  4. Ligation des deux brins d’ADN sur le brin discontinu par l’ADN ligase
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31
Q

Quelles sont les enzymes utilisées lors de la réparation des fragments d’Okazaki?

A
  1. Primase
  2. ADN polymérase
  3. ADN ligase
32
Q

Est-ce que la primasse a besoin d’une amorce lors de la réparation des fragments d’Okazaki?

A

Non

33
Q

Est-ce que l’ADN polymérase a besoin d’une amorce lors de la réparation des fragments d’Okazaki?

A

Oui (fragments d’ARN synthétisés par la primase)

34
Q

Quelles autres protéines accessoires sont essentielles à la réplication de l’ADN, autres que l’ADN polymérase et la primase?

A
  1. ADN hélicase
  2. Proétines SSB
35
Q

Que fait l’ADN hélicase?

A

Deéroule l’ADN en simple-brin en utilisant ATP

36
Q

Que font les protéines SSB?

A

Se lient à l’ADN simple-bin et l’empêche de se replier en structures secondaires, ce qui pourrait nuire à la réplication de l’ADN polymérase

37
Q

V/F: des erreurs peuvent se produire durant la réplication de l’ADN?

A

Vrai

38
Q

Quelle est l’activité de l’ADN polymérase qui leur permet de retirer les nucléotides désappariés durant la réplication de l’ADN?

A

Activité exonucléase 3’-5’ et pochette de mésapariement

39
Q

Qu’est-ce que le mécanisme intrinsèque de réparation de l’ADN polymérase?

A
  1. L’enzyme marche à reculons en arrachant des nucléoles mal appariés en sens inverse
  2. Requiert une activité exonucléase 3’-5’
40
Q

Quelle est la conséquence des mésappariement de nucléotides?

A

Causent un changement dans l’angle des bases, donc une courber dans l’ADN

41
Q

Existe-t-il d’autres mécanismes de réparation de l’ADN autres que l’activité exnonucléase de l’ADN polymérase?

A

Oui, il y a différents mécanismes qui existent et qui sont capables de détecter les lésions dans l’aDN et de les réparer
- Le type de mécanisme dépend du type de dommage

42
Q

Quelles sont les quatre façons que les dommages de l’ADN sont détectés par la cellule?

A
  1. Changement de structure de l’aDN
  2. Blocage de la polymérase
  3. Détection d’une extrémité d’ADN libre 5’ ou 3’
  4. Détection de l’ADN simple-brin libre
43
Q

Quelle sont les différentes sources intrinsèques de dommages à l’ADN?

A
  1. Erreurs de réplication
  2. Métabolisme
44
Q

Quelle sont les différentes sources extrinsèques de dommages à l’ADN?

A
  1. Rayons UV
  2. Rayons ionisants (X et gamma)
  3. Produits chimiques
45
Q

Quels sont les cinq différents types de lésions dans l’ADN?

A
  1. Arrêt de la réplication
  2. Mutation
  3. Mauvais appariements de bases
  4. Bases modifiées chimiquement
  5. Dimère de pyrimidine (T-T ou C-C)
  6. Cassures du lien phosphodiester
46
Q

Qu’est-ce que le dommage dans l’ADN d’arrêt de réplication?

A

S’il y a trop de dommages, la cellule cesse de fonctionne
Sénescence, apoptose, nécrose

47
Q

Qu’est-ce que le dommage dans l’ADN de mutation?

A

Changement permanent dans la séquence de l’ADN

48
Q

Que peuvent causer les mutations dans l’ADN?

A
  1. Pertes de fonction des gènes
  2. Gains de nouvelles fonctions indésirables
  3. Cancer
49
Q

Par quoi est causé le mauvais appariement des bases?

A

Des erreurs de réplication de l’ADN (paires A-C ou G-T)

50
Q

Comment les bases peuvent-elles être modifiées chimiquement lors de dommage à l’ADN?

A
  1. Oxydation
  2. Alkylation
51
Q

Que provoque les cassures du lien phosphodiester lors de dommage à l’ADN?

A

Bris de simple-brin ou doubles-brins

52
Q

Quels sont les cinq différents systèmes de réparation de l’ADN?

A
  1. NER
  2. BER
  3. MMR
  4. NHEJ
  5. HR
53
Q

Qu’est-ce que le système de réparation de l’ADN NER?

A

Réparation par excision de nucléotides

54
Q

Que répare NER?

A
  1. Dimères de pyrimidines
  2. Bases modifiées qui déforment l’hélice
55
Q

Quelles sont les deux voies possibles de détection/réparation de NER?

A
  1. TCR
  2. Globale
56
Q

Qu’est-ce que la voie de détection/réparation TCR de NER?

A

Où les gènes activement transcrites sont réparés en priorité de façon concomitante à la transcription

57
Q

Qu’est-ce que la voie de détection/réparation globale de NER?

A

Moins efficace que TCR, S’occupant du reste du génome (moins spécifique)

58
Q

Quelles sont les étapes de la réparation par excision des nucléotides NER?

A
  1. Reconnaissance du dommage par blocage de l’ARN polymérase su rue brin matrice-modèle ayant les gènes transcrits ou par détection de la torsion dans l’hélice induite par la lésion ayant lieu dans les autres endroits du génome
  2. Hélices déroule l’ADN autour du dommage
  3. Clivage du brin endommagé par des endonucléases
  4. Hélices enlève le brin endommagée
  5. ADN polymérase resynthétise l’information manquante en utilisant le brin intact comme matrice
  6. ADN ligase recolle le brin
59
Q

Qu’est-ce que le système de réparation de l’ADN BER?

A

Réparation par excision de bases

60
Q

Que répare BER?

A
  1. Mésappariements avec U ou avec T-G
  2. Bases modifiées
61
Q

Quel est le nom de l’enzyme qui reconnait les bases modifiées spécifiques?

A

Glycosylase

62
Q

Quelle est la différence entre la technique de réparation des bases modifiées de NER et de BER?

A

NER: enlève plusieurs bases
BER: enlève une seule base

63
Q

Quelles sont les étapes de la réparation par excision de bases BER?

A
  1. Reconnaissance de la base modifiée par une glycosylase spécifique
  2. Clivage de la base
  3. Endonucléase du site apurinique ou pyrimidique (AP) coupe le lien phosphodiester en 5’ du phosphate du site AP
  4. L’activité phosphodiestérase de l’ADN polymérase enlève le déosxyribose phosphate restant et polymérise le nucléotide manquant à partir du brin matrice-modèle intact
  5. ADN ligase complète la réparation
64
Q

Qu’est-ce que le système de réparation de l’ADN MMR?

A

Réparation des mauvais appariements

65
Q

Que répare MMR?

A

Mésappariements après réplication laissés par l’ADN polymérase

66
Q

pourquoi la reconnaissance du bon brin matrice lors de la réparation par MMR est importante?

A

Sinon cela produit une mutation

67
Q

Comment fonctionne la MMR?

A

Des protéines détectant la structure de l’ADN détectent le brin matrice et modifie le brin fille après la réplication

68
Q

Quelles sont les proétines travaillant avec la MMR?

A
  1. MSH2-MSH6 (paires de bases)
  2. MSH2-MSH3 (boucles d’ADN)
69
Q

Quelles sont les étapes de la réparation par réparation des mauvais appariements MMR?

A
  1. Reconnaissance de la lésion et du brin matrice et fille par les hétérodimères MSH2-MSH6 ou MSH2-MSH3
  2. Recrutement de l’endonucléase MLH1-PMS2 qui fait des simples-brins dans l’ADN à proximité de la lésion
  3. Exonucléase 1 vient digérer le brin désapparié sur une courte distance
  4. ADN polymérase resynthétise le brin-fille sans mutation
  5. ADN ligase complète la réparation
70
Q

Qu’est-ce que le système de réparation de l’ADN NHEJ?

A

Jonction non-homologue

71
Q

Que répare NHEJ?

A

Bris-doubles-brins

72
Q

Qu’est-ce que le système de réparation de l’ADN HR?

A

Recombinaison homologue

73
Q

Que répare HR?

A
  1. Bris doubles-brins
  2. Fourches de réparation bloquées
74
Q

Qu’on a en commun NHEJ et HR?

A

Les deux systèmes de réparation servent à réparer les cassures double-brins

75
Q

Quelles sont les différences entre NHEJ et HR?

A

NHEJ
- Recolle les deux extrémités des double-brins
- Efficae, mais commet plus d’erreur

HR
- Recopie l’information manquante à partir d’un brin homologue
- Plus difficile, mais commet moins d’erreur

76
Q

Quel mécanisme de réparation est très important pour éviter le cancer?

A

Recombinaison homologue (HR)

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