Cours 8 compartimetn II Flashcards
Par quoi passent les protéines lorsqu’ils se déplacent entre le cytosol et le Nucléole ?
Passe par un pore (bidirectionnelle)
Combien de membrane(s) traversent les protéines lorsqu’ils partent du cytosol et se rendent aux mitochondries et aux chloroplastes?
Passent pas 2 membranes
Combien de membrane(s) traversent les protéines lorsqu’ils partent du cytosol et se rendent au RE et peroxisome?
par 1 membrane
À partir du RE, comment se déplace les protéines ?
Trafic vésiculaire (voie de sécrétion et endocytose)
Les pores des mitochondries et des chloroplastes sont comment?
Pas suffisament grands pour faire passer des protéines complètes?
Comment les protéines traversent les membranes des mitochondries et des chloroplaste par les pores (comment doit être la protéine)?
Il faut garder les protéines dans leur structure primaire ou dérouler les protéines. Pas de structure tertiaire
Que faut il pour le transport à travers 2 membranes (3)?
Une étiquette, un récepteur (ou +plusieurs) et de l’énergie
Quels signaux sont les plus communs dans les mitochondries?
Une série d’acides aminés située en N-terminal formant une hélice alpha amphipile une moiti. hydrophobe + autre moitié chargée +.
Comment sera reconnu la partie hydrophobe?
Par un récepeteur situé sur la membrane externe de la mitochondrie.
qui est TOM?
Transport Outer Membrane
qui est TIM?
Transport Inner Membrane
Quels sont les récepteurs et les 2 translocateurs qui opèrent ensemble sous forme de complexes pour la mitochondrie?
TOM et TIM
Quand entrent les protéines dans TOM?
Lorsque les chaperonnes Hsp70 qui conservaient les protéines dépliés HYDROLYSENT l’ATP. (énergie) (Hydrolyse aussi pour Hsp 70 mitochondriale.)
Comment le signal est transporté dans l’espace intermembranaire?
TOM transfert le signal à TIM, qui fait passer les protéines dans la matrice.
Après être rentrer dans la membrane interne, qu’arrive-t’Il au signal ?
Le signal est coupé
De quoi dépend se qui se passe après l’entrer dans la membrane interne ?
Dépend des différents signaux internes
Qu’arrive t’il dans la plupart des cas après l’incorporation de la protéine?
Le peptide signal est coupé par des peptidases. Si signaux internes = pas coupés.
Quelles sont les deux façons d’importer les protéines dans la membrane interne?
Par les TOM apportés par les Hsp70 cytosoliques (chaperonne) ou soit sans l’aide des chaperonnes
Qu’est-ce qui est reconnu par les sous-unités de TOM lorsque la protéine rentre quand il n’y a pas de chaperonne ?
l’hélice- alpha amphiphile du signal (série d’a.a en N-terminal)
Les chloroplaste et les mitochondries ont ils les même principes pour l’importation des protéines?
Oui , quelques différences, mais même principes.
L’utilisation de l’énergie pour l’incorporation membranaire est moins bien ou très bien reconnue?
Moins bien reconnu
qu’est-ce qui est reconnu lorsqu’il y a une chaperonne?big fat mama need diet
La Hsp 70
Quels sont les complexes de transport interne et externe?
TOC (externe) et TIC (interne)
Combien de membrane comporte le chloroplaste?
3, venant des thylakoïdes, il faut donc un signal de plus pour entrer dans ce compartiment.
Qu’arrive t’il à un échantillon de RE lorsqu’il est centrifugé dans un gradient de densité?
Séparation en 2 types : REL et RER
Qu’est- ce que fait le REL?
Synthèse des lipides (production des membranes)
Que fait le RER?
S’occupe des protéines et sécrétion (voie sécrétion)
Quelles enzyme est située dans la membrane du REL ?
L’enzyme acyl-transférase.
Où se situe le site actif de l’enzyme acyl-transférase ?
Dans le cytoplasme
Comment le REL construit les phospholipides?
à partir de deux acides gras et d’un glycérol phosphaté
Où s’ajoutent les nouveaux phospholipides?
Dans le feuillet externe de la membrane du REL
Quels enzymes égalisent les 2 couches membranaires après l’ajout des phosphoslipides?
Les enzymes scramblases
Comment sont envoyés les phospholipides formé par le REL dans de nouveaux organites?
Par transport vésiculaires
Comment sont réarrangés les nouveaux lipides dans la membrane plasmique?
Par les flippases qui hydrolyse de l’ATP (distribution asymétrique des bicouches)
Comment sont appelés les protéines produites par le RER?
Les peroxines, elles migrent vers le REL
Que donne le RE par bourgeonnement?
Une vésicule précurseur
Où sont synthétisées les autres protéines du peroxysome?
Dans le cytoplasme et sont incorporés dans l’organites par les peroxines
De quelle façon les peroxysomes sont incorporés dans l’organite par les peroxines?
De façon post-traductionnelle (signal SKL)
Vrai ou faux, les peroxysomes peuvent croître et se diviser par eux-mêmes?
Vrai bitch
Quelles sont les fonctions du peroxysome?
- Oxydation des molécules organique
- Neutralisation du H2O2
(détoxifie)
quels sont les étapes pour former un peroxysome? résumé
1) RER produit peroxines, migrent vers le REL
2) donne bourgeonnement, Vésicule précurseur
3) Vésicule précurseurs ont peroxines et les autres protéines sont synthétisés dans cytoplasme et incorporé par peroxines de fac¸on post-traductionnelle (signal SKL)
4) peroxysome
Quelles sont les 2 façons de former un peroxysome?
- synthèse de novo
- la croissance-fissions des peroxysomes existants
Que fait la synthèse de novo&
Fusion hétérotypique de 2 vésicules de RE + incorporation post-traductionnelle.
Que fait la croissance-fission des peroxy existant?
Réception vésicules et incorporation des protéines. Peroxysomes volumineux, PEX 11 permet l’allongent, DRP constriction et coupage
Que fait le DRP dans la croissance fission des peroxysomes existants?
Coupage et constriction
Résumé de synthèse de novo?
1) Pex3 = étiquette pour peroxysomes. PMPs = complexe de translocation
2) Fusion hétérotypiqu grâce à Pex1-6 = construire les complexes de translocations.
3) Croissance de peroxysome par ajout de V3 (ajout de membrane)
4) croissance du peroxysome par incorporation pt des protéines (Pex5 se colle dessus et hydrolyse ATP)
Comment dépend la fonction des peroxysomes?
Des protéines qui sont importés et du type cellulaire.
Est-ce que la forme sphérique du peroxysome peut s’allonger et devenir réticulaire?
Oui..
peroxysome, est-ce que le cycle cellulaire et le taux de multiplication des peroxysomes sont similaires?
Oui, et le taux de multiplication est augmenté s’ils sont demandés pour leur rôle métabolique
Où se fait le contrôle du taux de multiplication?
Au niveau transcriptionnel, en réponse aux conditions environnementales.
Le peroxysome peut se diviser en 2 peroxysomes, peuvent ils avoir des activités métaboliques différentes?
Oui!
Est-ce que les peroxysomes peuvent avoir différentes fonctions?
Oui, les lucioles produisent de la bioluminescence.
Les membranes du RE aux mito au chloro : est-ce que le trafic vésiculaire communique avec les mito et chloro?
Non, ils reçoivent leur nouveaux lipides grâce à des protéines d’échange des phospholipides (PEPs)
Que font les protéines d’échange des phospholipides (PEPs)?
Permettent mito et chloro de recevoir nouveaux lipides en faisant le lien entre le RE et mito et chloro. (FAIS LE LIEN)
Les protéines destinées à des organites ou à une membrane doivent passer par quoi? (à part celles du peroxysome)
Le RER et la voie du trafic vésiculaire
L’entrée des protéines dans le RER se fait de quelle façon?Traductionnelle, transcriptielle ou co-traductionnelle?
De façon co-traductionnelle (l’énergie nécessaire vient du ribosome)
qu’est-ce que le peptide signal pourrentrer dans le RER?
une zone hydrophobe de 20 a.a nommée PSIT
Le signal (PSIT) peut être suivi par quoi?
d’un site de clivage AXA (ALANINE TOUJOURS) (petit signal de clivage)
Que fait le PSIT dès qu’il est traduit?
Se lie à une poche hydrophobe situé dans la SRP
Qu’est-ce que la SRP?
Une GTPase soluble formée de 6 protéine et d’un ARN(particule de reconnaissance de signal)
Que fait la SRP lorsqu’elle se lie à un PSIT (lié à une protéine)?
Elle bloque la traduction en bloquant le site A du ribosome
Comment la SRP liée au PSIT est reconnue par le RER?
Par son récepteur situé à la membrane du RER. Une fois liée à son récepteur, SRP hydrolyse son GTP. —> relâchement du signal (PSIT)
Que font les translocateurs situé à la membrane du RER?
Ils permettent au PSIT d’entrer à l’intérieur du RER.
Le translocateur : complexe protéique appelé Sec61 possède quoi?
Une poche hydrophobe dans sa « couture » et un bouchon dans le fond
Que fait le PSIT (signal) lorsqu’il est libéré de la SRP?
Tasse le bouchon pour s’installer au niveau de la couture pour l’ouvrir
Que permet l’ouverture de la couture?
La protéine a de la place pour glisser vers la lumière du RER, au fur à mesure qu’elle est traduite.
Les protéines solubles (hydrophiles) qui entre dans le RER se veront leur PSIT coupé par ?
Peptidase membranaire, qui coupe au niveau du AXA
Est-il possible que certaines protéines membranaires gardent leur PSIT?
Oui, sert à l’ancrage de la membrane. PSIT situé un peu plus loin de la protéine
Quelles sont les 2 protéines dans le RER?
Protéine soluble et Membranaire
Comment une protéine membranaire peut être produite à partir d’un autre signal?
La séquence d’arrêt de transfert (SAT) = séquence a.a hydrophobe
Où sont synthétisés les protéines membranaires avec des hélices alpha hydrophobes?
Dans le RER à l’exception des protéines mitochon et chloroplast
à quoi corresspondent les protéines membranaires avec des hélices alpha hydrophobes?
à des régions PSIT et SAT
Le centre du translocateur est ____ et les régions _____ ne peuvent pas le traverser?
Hydrophiles/ Hydrophobes
Le SAT ne peut pas traverser quoi?
Le translocateur, ni aller dans la couture. Il est relâché dans la membrane directement et incorporation de la protéine
Qu’est-ce que le PSIT?
Peptide Signal d’initiation de transfert (lié à une protéine)
Que font toutes les protéines une fois entrées dans le RER?
Ils passent vers le Golgi via les vésicules
À partir du Golgi, certaines protéines continueront leur périple alors que d’autres?
Retourneront vers le RER (car le rôle est dans le RER)
Que doivent posséder les protéines qui retournent au RER?
Un signal de rétention en C-terminal ( en plus du PSIT N-terminal)
Le rôle du RER dans la modification des protéines : la plupart des protéines synthétisées dans le RER seront sécértéees où?
à l’extérieur de la cellule, elles doivent être capable de résister à l’environnement.
Que fait la disulfide isomérase ?
Catalyse la formation ou la rupture de pont disulfures. S’assurent que les liens S-S soient bien fait!
par qui peut être ajouté une ancre lipidique de GPI sur les protéines ?
Par le complexe enzymatique transmidase. Les protéines GPI se retrouvent sur les radeaux lipidiques.
Par quoi peut être libéré une protéine GPI des radeaux lipidique.
peuvent être libérées par une phospholipase
Que fait une oligosaccharide transférase membranaire sur le résidu asparagine?
Une unité préformée de sucre
Est-ce que l’unité de sucre ajoutés sur le résidu d’asparagine est toujours le même?
OUIII, oligossacharide de 14 sucre (glucose, mannose)
Durant la maturation de la protéine (RER et Golgi), l’unité préformé de sucre sera modifiée et taillées pour ?
Finir avec un modèle de base à 5 sucre
Modifications des sucres = ?
Contrôle qualité
Dans le RER, les 2 glucoses terminaux sont enlevés quand? et qui vérifient la forme de la protéine?
à la fin de la traduction
les chaperonnes vérifient la forme
Si la protéine est OK selon chaperonne, qu’arrive t’il?
Le dernier glucose est clivé et protéine sort du RE par vésicule vers Golgi
Si protéine pas OK, soit mal repliée, que se passe-t-il?
Une glucosyl transférase lui ajout un glucose et la protéine recommence le proccès.
Les compartiment cellulaire sont entourés par quoi et liés par quoi?
entourés par une membrane et lié par le trafic vésiculaire
Les vésicules transportent les protéines d’un endroit à l’autre à l’aide de quoi?
à l’aide de moteurs protéiques et des éléments du cytosquelettes polaires
Les vésicules se forment comment ?
Par bourgeonnement
Une fois rendue à leur destination, que font les vésicules?
Elles fusionnement avec la membrane du compartiment cible.