Cours 7 : Bactériophages et alternatives aux ATB

Question 1

Quelles sont les alternatives thérapeutiques aux antibiotiques

Answer 1

-les bactériophages thérapeuthiques
-la vaccination
-probiotiques et bactériothérapie

Question 2

Quelles sont les solutions au problème de la résistance aux atbs

Answer 2

-investissements dans le développement de nouvelles classes d’antibiotiques
-accélérer et faliciter le processus d’approbation et de mise en marché des nouveaux antibiotiques
-meilleure gestion et prescription des antibiotiques en médecine humaine
-réduction de l’utilisation des antibiotiques pour la croissance animale

Question 3

Vrai ou faux: Le matériel génétique des virus infectant les eucaryotes peut être de l’ADN ou de l’ARN double ou simple brin

Answer 3

Vrai

Question 4

Comment peut être la queue de certains phages

Answer 4

-longue et flexible
-rigide avec une gaine contractile
-petite et courte

Question 5

Quelle est la forme la plus répendue des phages connues

Answer 5

Phages à ADN double brin possédant une queue

Question 6

Comment se fait l’assemblage de la capside

Answer 6

-liaison des protéines de la capside entre elles pour former des capsomères
-capsomères s’associent ensemble pour former une capside vide sans acide nucléique
-capside vide est plus grande que la capside mature pour permettre aux acides nucléiques et les terminase d’y entrer
-lorsque les acides nucléiques sont insérés, la maturation s’accomplit par le clivage de certaines protéines ce qui ferme la capside de facon étanche

Question 7

Décrire la caractéristique lytique d’un phage

Answer 7

-phages s’échappent de la bactérie en faisant éclater la cellule par lyse
-principalement les phages virulents qui utilisent cette méthode

Question 8

Caractériser le fait que cetains phages filamenteux peuvent s’échapper en bourgeonnant de la cellule sans la faire lyser

Answer 8

Infection chronique

Question 9

Décrire le cycle lytique d’un phage

Answer 9

1- attachement et pénétration: le phage se fixe sur la cellule hôte et injecte son ADN
2- L’ADN du phage prend une forme circulaire et le phage entre dans le cycle lytique
3- biosynthèse et maturation: l’ADN et les protéines nouvellement syntétisées sont assemblées en phages
4- libération: la cellule se lyse en libérant les phages

Question 10

Décrire le cycle lysogénique

Answer 10

1- attachement et pénétration: le phage se fixe sur la cellule hôte et injecte son ADN
2-L’ADN du phage prend une forme circulaire et le phage entre dans le cycle lysogénique
3- l’ADN du phage s’intègre au chromosome bactérien devenant ainsi un prophage
4- en se répliquant, la bactérie lysogène reproduit le prophage
5- le prophage peut s’exciser du chromosome bactérien pour entamer un cycle lytique

Question 11

Qu’est-ce que la conversion lysogénique

Answer 11

c’est lorsqu’un phage convertit une souche avirulente/non-toxinogène en une souche virulente/toxinogène après lui avoir transmis un gène encodant un gène ou un facteur de virulence

Question 12

Quel est le seul type de phage à être utilisé en phagothérapie

Answer 12

les phages strictement lytiques

Question 13

Quel a été le constat fait au cours des dernières années grâce à la démocratisation des méthodes de séquencage à haut débit

Answer 13

Que l’intestin regorge de virus mais aussi surtout de phages. l’ensemble de ces virus est appelé le virobiote/virome
-jusqu’à 10^8 phages dans 1 gramme de selles

Question 14

Qu’utilise-t-on pour quantifier la taille de la progéniture engendrée par un seul phage

Answer 14

la courbe de réplication virale

Question 15

Vrai ou faux: Les antibiotiques détruisent la flore microbienne et contribut au déséquilibre du microbiote et au développement de nouvelles bactéries pathogènes

Answer 15

Vrai

Question 16

Vrai ou faux: L’entitée infectieuse disparait dans les premiers moments suivant l’infection mais réapparait lordque le virus est assemblé/libéré

Answer 16

vrai

Question 17

Vrai ou faux: La phagothérapie est utilisée dans les pays occidentaux

Answer 17

vrai mais seulement en dernier recours lorsqu’aucun traitement standard ne fonctionne puisqu’elle n’est normalement pas autorisée dans ces pays

Question 18

Quels sont les 2 cas cliniques au US qui ont ravivé l’intérêt pour la phagothérapie

Answer 18

-2016: premier patient a être traité avec succès suite à une infection par une forme intraitable de la bactérie Acinotobacter baumannii
-2019: adolescent atteint de la fibrose kystique et d’une infection récurrente à Mycobacterium abcessus a été traité avec des phages suite à une transplantation des poumons. Première utilisation d’un phage génétiquement modifié chez l’humain

Question 19

Vrai ou faux: Les phages ne sont pas utilisés pour d’autres indications que chez les humains

Answer 19

Faux, sont utilisés chez les animaux d’élevages, en agriculture, sur des carcasses de viande et des produits prêts à la consommation

Question 20

Quels sont les obstacles a franchire avant l’utilisation des phages chez les humains

Answer 20

-démonstration de l’efficacité des phages par des études cliniques vigoureuses qui respectent les standards actuels en science

Question 20

Quels sont les incovénients de l’utilisation des phages

Answer 20

-ils sont parfois trop spécifiques, il faut donc connaitre la souche exacte ciblée pour utiliser le(s) bon phages
-une résistance à l’infection peut se développer
-une qte minimale de bactéries métaboliquement actives sont nécessaires pour que les phages puissent se répliquer et avoir leur efffet thérapeutique
-une lyse trop rapide et massive de bactéries à GRam - peut causer un choc toxique en libérant une trop grande qte d’endotoxine
-une préparation de phages contient nécessairement des mutants dont on ne connait pas les impacts
-les phages tempérés posent un risque de conversion lysogénique

Question 20

De quelles facons les phages peuvent-ils être administrés

Answer 20

-voie orale
-intraveineuse
-intrapéritonéale
-nébulisation
-topique

Question 21

Quels sont les avantages des phages par rapport aux antibiotiques

Answer 21

-ils sont très spécifiques à la bactérie ciblée
-ils s’auto-amplifient au site d’infection
-ils sont efficaces contre des bactéries multiresistances aux atb
-leur innocuité a été démontrée par plusieurs décennies d’utilisation
-les phages peuvent être rapidement isolés dans la nature et des mutants peuvent être isolés si une résistance aux phages se développe chez la bactérie
-on peut plus facilement modifier génétiquement des phages afin de les améliorer

Question 22

Qu’est-ce que la phagothérapie

Answer 22

utilisation de phages thérapeutiques pour traiter ou prévenir certaines infections bactériennes

Question 23

Quels sont les alternatives des phages complets

Answer 23

-endolysine
-bactériocine

Question 24

Décrire les endolysines

Answer 24

-dégradent la paroi de peptidoglycane afin de permettre aux phages de lyser la cellule
-au fil du cycle de réplication, la holine s’accumule et s’associent pour créer des pores
-peuvent aussi traverser les membranes cytoplasmiques, hydrolysent le peptidoglycane fragilisant la cellule qui éclate à cause de la pression osmotique

Question 25

Quels sont les avantages des endolysines

Answer 25

-peut produire ces protéines à grande échelle
-spectre d’action généralement plus large que les phages, tuent habituellement toutes les souches

Question 26

Quels sont les inconvénients des endolysines

Answer 26

-protéines qui ont un pouvoir immunogène et peuvent induire une réponse immunitaire
-doit être administré en grande quantités
-production à l’échelle industrielle difficile
-devons précoir encapsilation pour libérer les enzymes au bon endroit

Question 27

Comment fonctionne les bactériocines

Answer 27

possèdent des queues contractiles n’ayant aucun matériel génétique mais pouvant reconnaitre les cellules cibles et perforer les membranes comme une seringue brisant ainsi l’équilibre de la cellule et menant à sa mort

Question 28

Décrire la vaccination

Answer 28

-approche efficace pour immuniser les gens contre certaines infections bactériennes
-peut cibler la bactérie elle-même ou des composantes bactériennes comme les toxines

Question 29

Décrire la transplantation fécale

Answer 29

-consiste à prélever des fèces de personne saine puis de les homogénéiser pour en faire une suspension qu’on administre par voie rectale ou nasogastrique1

Question 30

Quel est le principal incovénient de la transplantation fécale

Answer 30

on ne connait pas tous les les impacts possibles à long terme. certains agents pathogènes non-détectés pourraient aussi être transférés

Question 30

Décrire les probiotiques

Answer 30

-consommation de bactéries vivantes
-effet dépend du microbiote des receveurs
-conclusion controversé: trop grande variabilités des données

Question 31

Décrire les prébiotiques

Answer 31

-substrats qui peuvent stimuler la croissance de certaines bactéries intestinales