Cours 7 : Bactériophages et alternatives aux ATB Flashcards
Quelles sont les alternatives thérapeutiques aux antibiotiques
-les bactériophages thérapeuthiques
-la vaccination
-probiotiques et bactériothérapie
Quelles sont les solutions au problème de la résistance aux atbs
-investissements dans le développement de nouvelles classes d’antibiotiques
-accélérer et faliciter le processus d’approbation et de mise en marché des nouveaux antibiotiques
-meilleure gestion et prescription des antibiotiques en médecine humaine
-réduction de l’utilisation des antibiotiques pour la croissance animale
Vrai ou faux: Le matériel génétique des virus infectant les eucaryotes peut être de l’ADN ou de l’ARN double ou simple brin
Vrai
Comment peut être la queue de certains phages
-longue et flexible
-rigide avec une gaine contractile
-petite et courte
Quelle est la forme la plus répendue des phages connues
Phages à ADN double brin possédant une queue
Comment se fait l’assemblage de la capside
-liaison des protéines de la capside entre elles pour former des capsomères
-capsomères s’associent ensemble pour former une capside vide sans acide nucléique
-capside vide est plus grande que la capside mature pour permettre aux acides nucléiques et les terminase d’y entrer
-lorsque les acides nucléiques sont insérés, la maturation s’accomplit par le clivage de certaines protéines ce qui ferme la capside de facon étanche
Décrire la caractéristique lytique d’un phage
-phages s’échappent de la bactérie en faisant éclater la cellule par lyse
-principalement les phages virulents qui utilisent cette méthode
Caractériser le fait que cetains phages filamenteux peuvent s’échapper en bourgeonnant de la cellule sans la faire lyser
Infection chronique
Décrire le cycle lytique d’un phage
1- attachement et pénétration: le phage se fixe sur la cellule hôte et injecte son ADN
2- L’ADN du phage prend une forme circulaire et le phage entre dans le cycle lytique
3- biosynthèse et maturation: l’ADN et les protéines nouvellement syntétisées sont assemblées en phages
4- libération: la cellule se lyse en libérant les phages
Décrire le cycle lysogénique
1- attachement et pénétration: le phage se fixe sur la cellule hôte et injecte son ADN
2-L’ADN du phage prend une forme circulaire et le phage entre dans le cycle lysogénique
3- l’ADN du phage s’intègre au chromosome bactérien devenant ainsi un prophage
4- en se répliquant, la bactérie lysogène reproduit le prophage
5- le prophage peut s’exciser du chromosome bactérien pour entamer un cycle lytique
Qu’est-ce que la conversion lysogénique
c’est lorsqu’un phage convertit une souche avirulente/non-toxinogène en une souche virulente/toxinogène après lui avoir transmis un gène encodant un gène ou un facteur de virulence
Quel est le seul type de phage à être utilisé en phagothérapie
les phages strictement lytiques
Quel a été le constat fait au cours des dernières années grâce à la démocratisation des méthodes de séquencage à haut débit
Que l’intestin regorge de virus mais aussi surtout de phages. l’ensemble de ces virus est appelé le virobiote/virome
-jusqu’à 10^8 phages dans 1 gramme de selles
Qu’utilise-t-on pour quantifier la taille de la progéniture engendrée par un seul phage
la courbe de réplication virale
Vrai ou faux: Les antibiotiques détruisent la flore microbienne et contribut au déséquilibre du microbiote et au développement de nouvelles bactéries pathogènes
Vrai
Vrai ou faux: L’entitée infectieuse disparait dans les premiers moments suivant l’infection mais réapparait lordque le virus est assemblé/libéré
vrai
Vrai ou faux: La phagothérapie est utilisée dans les pays occidentaux
vrai mais seulement en dernier recours lorsqu’aucun traitement standard ne fonctionne puisqu’elle n’est normalement pas autorisée dans ces pays
Quels sont les 2 cas cliniques au US qui ont ravivé l’intérêt pour la phagothérapie
-2016: premier patient a être traité avec succès suite à une infection par une forme intraitable de la bactérie Acinotobacter baumannii
-2019: adolescent atteint de la fibrose kystique et d’une infection récurrente à Mycobacterium abcessus a été traité avec des phages suite à une transplantation des poumons. Première utilisation d’un phage génétiquement modifié chez l’humain
Vrai ou faux: Les phages ne sont pas utilisés pour d’autres indications que chez les humains
Faux, sont utilisés chez les animaux d’élevages, en agriculture, sur des carcasses de viande et des produits prêts à la consommation
Quels sont les obstacles a franchire avant l’utilisation des phages chez les humains
-démonstration de l’efficacité des phages par des études cliniques vigoureuses qui respectent les standards actuels en science
Quels sont les incovénients de l’utilisation des phages
-ils sont parfois trop spécifiques, il faut donc connaitre la souche exacte ciblée pour utiliser le(s) bon phages
-une résistance à l’infection peut se développer
-une qte minimale de bactéries métaboliquement actives sont nécessaires pour que les phages puissent se répliquer et avoir leur efffet thérapeutique
-une lyse trop rapide et massive de bactéries à GRam - peut causer un choc toxique en libérant une trop grande qte d’endotoxine
-une préparation de phages contient nécessairement des mutants dont on ne connait pas les impacts
-les phages tempérés posent un risque de conversion lysogénique
De quelles facons les phages peuvent-ils être administrés
-voie orale
-intraveineuse
-intrapéritonéale
-nébulisation
-topique
Quels sont les avantages des phages par rapport aux antibiotiques
-ils sont très spécifiques à la bactérie ciblée
-ils s’auto-amplifient au site d’infection
-ils sont efficaces contre des bactéries multiresistances aux atb
-leur innocuité a été démontrée par plusieurs décennies d’utilisation
-les phages peuvent être rapidement isolés dans la nature et des mutants peuvent être isolés si une résistance aux phages se développe chez la bactérie
-on peut plus facilement modifier génétiquement des phages afin de les améliorer
Qu’est-ce que la phagothérapie
utilisation de phages thérapeutiques pour traiter ou prévenir certaines infections bactériennes
Quels sont les alternatives des phages complets
-endolysine
-bactériocine
Décrire les endolysines
-dégradent la paroi de peptidoglycane afin de permettre aux phages de lyser la cellule
-au fil du cycle de réplication, la holine s’accumule et s’associent pour créer des pores
-peuvent aussi traverser les membranes cytoplasmiques, hydrolysent le peptidoglycane fragilisant la cellule qui éclate à cause de la pression osmotique
Quels sont les avantages des endolysines
-peut produire ces protéines à grande échelle
-spectre d’action généralement plus large que les phages, tuent habituellement toutes les souches
Quels sont les inconvénients des endolysines
-protéines qui ont un pouvoir immunogène et peuvent induire une réponse immunitaire
-doit être administré en grande quantités
-production à l’échelle industrielle difficile
-devons précoir encapsilation pour libérer les enzymes au bon endroit
Comment fonctionne les bactériocines
possèdent des queues contractiles n’ayant aucun matériel génétique mais pouvant reconnaitre les cellules cibles et perforer les membranes comme une seringue brisant ainsi l’équilibre de la cellule et menant à sa mort
Décrire la vaccination
-approche efficace pour immuniser les gens contre certaines infections bactériennes
-peut cibler la bactérie elle-même ou des composantes bactériennes comme les toxines
Décrire la transplantation fécale
-consiste à prélever des fèces de personne saine puis de les homogénéiser pour en faire une suspension qu’on administre par voie rectale ou nasogastrique1
Quel est le principal incovénient de la transplantation fécale
on ne connait pas tous les les impacts possibles à long terme. certains agents pathogènes non-détectés pourraient aussi être transférés
Décrire les probiotiques
-consommation de bactéries vivantes
-effet dépend du microbiote des receveurs
-conclusion controversé: trop grande variabilités des données
Décrire les prébiotiques
-substrats qui peuvent stimuler la croissance de certaines bactéries intestinales