cours 7 :bactériophage Flashcards
Qu’est-ce qu’un bactériophage?
Matériel génétique encapsidé par des protéines qui infecte les bactéries
Vrai ou faux, les bactériophage peuvent être de l’ARN ou de l’ADN que ce soit mono ou bicatenaire?
Vrai
Vrai ou faux, le matériel génétique des bactériophages ne peut être que circulaire?
Faux
Comment se nomme un phage qui tue la bactérie après l’infection ?
Phage virulent
Comment se nomme un phage qui peut s’intégrer dans le génome bactérien sans la tuer ?
Phage tempéré
Comment se nomme une bactérie qui comporte un phage intégré dans son génome?
Bactérie lysogènique
Comment regroupe-t-on les phages ?
En famille selon:
1- spécificité d’hôte
2- caractéristiques
Quelles sont les étapes de l’attachement du bactériophage T4?
1- Atterissage 2- Fixation 3- Contraction 4- pénétration -percement 5- Injection de l'ADN
Avec qu’elle région du bactériophage T4 se fait l’attachement?
Longues fibres
En quoi consiste l’étape de l’atterissage?
Première intéraction faible entre longues fibres et le LPS de la surface bactérienne
Avec quelle région du T4 se fait la fixation?
Fibres courtes
En quoi consiste la fixation ?
Interaction forte et irréversible entre fibre croute et structure de la membrane externe
En quoi consiste la pénétration - percement?
Tube va percer et rentrer mais seulement dans la membrane externe (ne perce pas la membrane plasmique)
Si on a une bactérie Gram+, quelle structure sera perçée?
Le peptidoglycan
Qu’elle structure est impliquée dans l’injection de l’ADN ?
Les protéine pilotes
Comment se déroule l’injection de l’ADN
Les protéines pilotes guident l’entrée de l’AND phagique à travers la membrane plasmique
La tête sera vide
Quelles sont les caractéristiques du phage T4?
ADN linéaire bicatnaire
Comment se déroule le cycle du phage T4?
5 mins: ARNm et protéines précoces 15 mins: réplication de l'ADN 20 mins: ARNm et protéine tardifs 25-30 mins: packaging 40 mins: lyse de la bactérie
Comment se fait la régulation de la transcription chez les bactériophages ?
Chaque classe de gène inhibe la classe précédente et stimule la transcription de la classe qui suit
Comment se fait la transcription des gènes précoces?
Par la polymérase de la bactérie
Comment se fait la transcription des gènes tardifs et intermédiaires?
Polymérase phagique
Quels phages sont à ADN circulaire monocatenaire?
M13 et X174
Quelles sont les étapes de la réplication de l’ADN du phage M13?
1- ARN réplique le brin complémentaire minus et on obtient un RF double brin
2- Une endonucléase (priduit du gène 2), coupe le brin + et on obtient plusieurs RF par réplication à cercle roulant
3- Le produit du gène 5 va se lier au brin + nouvellement synthétisé pour :
- arrêter de produire des nouveaux RF
- emballage dans la tête
Comment se déroule le cycle d’infection du phage M13
- ADN rentre par le pilus F
- ADN devient double brin
- Se réplique jusqu’à 1000 copies mais ne s’intègre pas dans le génôme
- chaque cell fille reçoit des copies
Comment se déroule la réplication du phage X174
Même chose de M13 sauf que protéine pour faire le nick est différente (primosome)
Quels sont les phages à ADN linéaire bicatenaire
T4
T7
PHI29
Comment se déroule la réplication du phage T7 ?
- Extrémités ont des séquence répétées
- 2 fourches : lagging strand vs leanding strand
- Il va y avoir des extrémités incomplètes qui sont complémentaire = appariement
- L’appariement va former les concatemère
- les concatemères vont se répliquer pour s’allonger
- Encapsidation
Durant l’encapsidation des concatemère formés par le phage T7, pourquoi l’information n’est pas perdue ?
Il y a une enzyme phagique qui coupe aux séquence répétées
Comment se déroule la réplication du phage PHI29?
- Les protèines terminales servent d’amorce
- polymérase phagique participe à la réplication
- le brin déplacé se replie en forme d’épingle pour la réplication de l’autre brin
Pour la réplication du phage PHI29, à quoi sert le slide back?
La polymérase peut se tromber, donc le slide back c’est pour augmenter la spécificité
Qu’elles sont les caractéristiques du phage T4?
- Linéaire bicaténaire
- redondant aux extrémités
- permutation circulaire
Comment se déroule la réplication du phage T4 ?
Stade 1 : réplication origine spécifique
Stade 2: réplication recombinaison dépendante
- déplacement des brins d’ADN se fait par recombinaison
- extrémité 3’ OH des brins déplacés sert comme amorce
Comment le phage T4 frome les concatèmes?
Par recombinaison homologue
Pourquoi vers la fin du processus, la tête du phage T4 contient 103% du génome?
Car il y a une coupure qui se fait un peu après la fin du génome
Une fois les concatèmes du phage T4 coupés et aspirés par la la tête du phage, est-ce que tous les phages vont avoir les mêmes gènes?
Oui mais l’ordre sera différent à cause de la permutation circulaire
De quel type est le phage lambda (virulent ou tempéré) ?
Tempéré
Comment se déroule la réplication du phage lambda?
- ADN est linéaire mais une fois dans la cell devient circulaire (à cause des séquences cos)
- Protéines importantes : O (ouverture) et P (DnaB)
- Réplication thêta
- Protéine Gam + endonucléase phagique va faire la réplication cercle roulante (car bloque RecBCD)
- Cercle roulante provoque la formation de longs concatemères
Parfois, un phage tempéré peut devenir lysogénique, pourquoi et quel phage peut le faire?
Induction à cause des facteurs de l’environnement
phage lambda
