Cours 12: Flashcards

1
Q

Biosynthèse des aa: quels sont les éléments impliqués

A
  1. 8 des 12 précurseurs essentiels de l’anabolisme
  2. certains impliquent de l’ATP
  3. certains impliquent des réactions d’oxydoréduction
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Q

Qu’est-ce qui est requis pour le transfert de groupement NH4

A

1- Ajout de groupement libre
ou
2- Transamination via glutamine ou glutamate

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3
Q

Quels acides aminés sont produits à partir du 3PG

A
  1. Serine
  2. Glycine
  3. Cystéine
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4
Q

Quelles sont le différentes géométries dans la biosynthèse des acides aminés?

A
  1. Linéaires (2)

2. bifurquées (2)

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5
Q

Deande énergétique de différentes voies de synthèse d’aa : quelle est la différenc eentre une enzyme synthase et une synthétase?

A

Synthase: n’hydrolyse pas l’ATP

Synthétase (ex: asparagine synthétase): hydrolyse l’ATP pour énergiser la réaction

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6
Q

On a vu que l’ajout d’un groupement amino se fait de deux manières. Quels sont leurs rôle?

A
  1. Ajout d’un groupement amino libre = synthèse du glutamine et glutamate
  2. transamination du glutamine et glutamate = synthèse de tous les autres acides aminés
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7
Q

La cystéine est importante pour une voie métabolique, quelle est cette voie?

A

métabolisme du souffre

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8
Q

Comment la cystéine est formée à partir du 3PG?

en gégéral (voir détal diapo 14)

A

Le 3PG est transaminé par la glutamate. Ce qui va nous donner la sérine par 3 enzymes
1. glycérate déshydrogénase
2. aminotrasnférase
3. phosphatase
La sérine va devenir la cystéine (en acceptant un souffre)

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9
Q

Quelles sont les enzymes responsables de la formation de la sérine à partir du 3PG?

A
  1. glycérate déshydrogénase (oxydation
  2. aminotransférase (ajout d’un groupement amine)
  3. Phosphatase
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10
Q

Quelle est l’enzyme responsable de la fromation de la glycine à partir de la sérine?

A

Hydroxyméthyl transférase

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11
Q

Quelles sont les enzymes resposables de la formation de la cystéine à partir de la sérine?

A

1- sérine transférase

2- cystéine synthase (pas d’ATP) - ajout de sulfure

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12
Q

Quel est le rôle du souffre dans l’anabolisme?

A

De se lier à la sérine pour former la cystéine

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13
Q

La méthionine ne provient pas directement d’un précurseur. D’où provient alors cet acide aminé?

A

De la formation de la cystéine.

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14
Q

Quelle famille d’acides aminés sont produits à partir du précurseur nommé oxaloacétate?

A

La famille aspartate

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15
Q

Quel acide aminé est impliqué dans la transamination de l’oxaloacétate pour devenir aspartate?

A

Glutamate

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16
Q

Quelle enzyme est utilisée pour créer l’aspartate à partir de l’oxaloacétate

A

aspartate aminotransférase

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17
Q

Un fois l’aspartate formée, on obtient de du alpha cétoglutarate, à quoi sert ce composé?

A

Il va être recyclé dans la voie d’incorporation de l’azote pour redonner du glutamate

18
Q

Qu’a ton besoin pour réavoir du glutamate?

A
  1. aspartate + glutamine
  2. ATP
  3. Enzyme = asparagine synthétase
19
Q

L’aspartate est aussi un précurseur pour d’autres acides aminés, lesquels ?

A
  1. thréonine
  2. lysine
  3. méthionine (redondant)
  4. DAP
  5. asparagine
  6. isoleucine (pas directement)
20
Q

Quels sont les acides aminés formés directement à partir du pyruvate?

A
  • valine
  • alanine
  • leucine (mais requiet acetyl-coA)
21
Q

Il manque l’isoleucine, comment cet acide aminé est formé?

A

Cycle de krebs - oxaloacétate - aspartate-thréonine - isoleucine

22
Q

Le pyruvate et aussi résponsable de la formation de certains acides aminés de la famille de l’aspartate, lesquels?

A
  1. DAP
  2. Lysine
  3. isoleucine (a partir de la thréonine)
23
Q

Est-ce qu’on a besoin du pyruvate pour former la thréonine et la méthionine?

A

Non, mais on a besoin de pyruvate une fois la thréonine formée pour produire l’isoleucine

24
Q

Quels sont le précurseurs requis pour la synthèse des acides aminés aromatiques?

A
  1. Erythrose-4P

2. Phosphoénolpyruvate

25
Q

Quels sont les acides aminés aromatiques

A
  1. phénylalanine
  2. tryptophane
  3. tyrosine
26
Q

A-t-on besoin d’énergie chimique pour former les acides aminés tryptophane, tyrosine et phénylalanine?

A

Oui

27
Q

Sous quelle forme d’énergie chimique a-t-on besoin d’utiliser pour former les acides aminés aromatiques

A
  1. ATP

2. PEP

28
Q

Les réactions menant à la formation d’acides aminés aromatiques impliquent-elles l’oxydoreduction et la transamination?

A

oui

29
Q

Quel précurseur est formé au cours de la biosynthèse des acides aminés aromatiques (tryptophane, tyrosine et phénylalanine) ?

A

Le chorismate

30
Q

Ce qu’il faut savoir sur la synthèse des aa aromatiques

A
  1. le cycle est formé en premier
  2. la redox sert à former le double lien (NAD)
  3. on abesoin de l’ATP
  4. le précurseur chorismate et former, pour ensuite former l’anthranilate pour enfin former le tryptophane
31
Q

Le chorismate est responsable de la production de…

A
  1. tryptophane (NAD+ et NADP+)
  2. acide folique
  3. chelateur de fer
  4. quinone
32
Q

Comment se forme le NADP et NAD à partir du trp ?

Est-ce que ce processus requiert de l’ATP ?

A

Trp - acide quinolinique - acide nicotinique mono - acide nicotinique di - NAD - NADP
Oui

33
Q

Chez quelle espèce bactérienne se fait la synthèse du NAD+ et NADP+ à partir du Trp?

A

Xantomons pruni et actinomycètes

34
Q

Comment se forme le NAD et le NADP à partir de l’aspartate?

A

Aspartate (NadB) - Iminoaspartate (NadA) - Quinolinate (NadC) - NaMN (sensuite mêmes étapes)

35
Q

Haemophilus influenzae et Chlamydia ne peuvent pas synthétiser le NAD et NADP+, comment ces bactéries font pour combler ce besoin?

A
  1. par acquisition directe

2. par acquisition des intermédiaires dans l’environnement

36
Q

Comment on nomme une bactérie qui ne peut pas synthétiser un composé organique qui lui est nécessaire?

A

Auxotrophe

37
Q

Haemophilus influenzae peut acquérir directement le NAD dans l’environnement ainsi que les précurseurs nicotiniques on dit que la bactérie est auxotrophe pour …

A

La niacine

38
Q

Chlamydia prend son NAD+ directement dans l’environnement, on dit qu’elle est auxotrophe pour

A

NAD ET NADP

39
Q

Dans la biosynthèse du FAD, pourquoi la flavine synthase utilise de l’ATP alors que ce n’est pas une synthétase?

A

Car l’ATP est utilisé comme précurseur et non pas comme énergie chimique

40
Q

Étapes du la formation du FAD

A
  1. Ribose 5p + GTP
  2. Riboflavine (Vit B2)
  3. Riboflavine kinase
  4. Flavine mono
  5. Flavine synthase (STP = précurseur)
  6. FAD