Cours 12: Flashcards
Biosynthèse des aa: quels sont les éléments impliqués
- 8 des 12 précurseurs essentiels de l’anabolisme
- certains impliquent de l’ATP
- certains impliquent des réactions d’oxydoréduction
Qu’est-ce qui est requis pour le transfert de groupement NH4
1- Ajout de groupement libre
ou
2- Transamination via glutamine ou glutamate
Quels acides aminés sont produits à partir du 3PG
- Serine
- Glycine
- Cystéine
Quelles sont le différentes géométries dans la biosynthèse des acides aminés?
- Linéaires (2)
2. bifurquées (2)
Deande énergétique de différentes voies de synthèse d’aa : quelle est la différenc eentre une enzyme synthase et une synthétase?
Synthase: n’hydrolyse pas l’ATP
Synthétase (ex: asparagine synthétase): hydrolyse l’ATP pour énergiser la réaction
On a vu que l’ajout d’un groupement amino se fait de deux manières. Quels sont leurs rôle?
- Ajout d’un groupement amino libre = synthèse du glutamine et glutamate
- transamination du glutamine et glutamate = synthèse de tous les autres acides aminés
La cystéine est importante pour une voie métabolique, quelle est cette voie?
métabolisme du souffre
Comment la cystéine est formée à partir du 3PG?
en gégéral (voir détal diapo 14)
Le 3PG est transaminé par la glutamate. Ce qui va nous donner la sérine par 3 enzymes
1. glycérate déshydrogénase
2. aminotrasnférase
3. phosphatase
La sérine va devenir la cystéine (en acceptant un souffre)
Quelles sont les enzymes responsables de la formation de la sérine à partir du 3PG?
- glycérate déshydrogénase (oxydation
- aminotransférase (ajout d’un groupement amine)
- Phosphatase
Quelle est l’enzyme responsable de la fromation de la glycine à partir de la sérine?
Hydroxyméthyl transférase
Quelles sont les enzymes resposables de la formation de la cystéine à partir de la sérine?
1- sérine transférase
2- cystéine synthase (pas d’ATP) - ajout de sulfure
Quel est le rôle du souffre dans l’anabolisme?
De se lier à la sérine pour former la cystéine
La méthionine ne provient pas directement d’un précurseur. D’où provient alors cet acide aminé?
De la formation de la cystéine.
Quelle famille d’acides aminés sont produits à partir du précurseur nommé oxaloacétate?
La famille aspartate
Quel acide aminé est impliqué dans la transamination de l’oxaloacétate pour devenir aspartate?
Glutamate
Quelle enzyme est utilisée pour créer l’aspartate à partir de l’oxaloacétate
aspartate aminotransférase
Un fois l’aspartate formée, on obtient de du alpha cétoglutarate, à quoi sert ce composé?
Il va être recyclé dans la voie d’incorporation de l’azote pour redonner du glutamate
Qu’a ton besoin pour réavoir du glutamate?
- aspartate + glutamine
- ATP
- Enzyme = asparagine synthétase
L’aspartate est aussi un précurseur pour d’autres acides aminés, lesquels ?
- thréonine
- lysine
- méthionine (redondant)
- DAP
- asparagine
- isoleucine (pas directement)
Quels sont les acides aminés formés directement à partir du pyruvate?
- valine
- alanine
- leucine (mais requiet acetyl-coA)
Il manque l’isoleucine, comment cet acide aminé est formé?
Cycle de krebs - oxaloacétate - aspartate-thréonine - isoleucine
Le pyruvate et aussi résponsable de la formation de certains acides aminés de la famille de l’aspartate, lesquels?
- DAP
- Lysine
- isoleucine (a partir de la thréonine)
Est-ce qu’on a besoin du pyruvate pour former la thréonine et la méthionine?
Non, mais on a besoin de pyruvate une fois la thréonine formée pour produire l’isoleucine
Quels sont le précurseurs requis pour la synthèse des acides aminés aromatiques?
- Erythrose-4P
2. Phosphoénolpyruvate
Quels sont les acides aminés aromatiques
- phénylalanine
- tryptophane
- tyrosine
A-t-on besoin d’énergie chimique pour former les acides aminés tryptophane, tyrosine et phénylalanine?
Oui
Sous quelle forme d’énergie chimique a-t-on besoin d’utiliser pour former les acides aminés aromatiques
- ATP
2. PEP
Les réactions menant à la formation d’acides aminés aromatiques impliquent-elles l’oxydoreduction et la transamination?
oui
Quel précurseur est formé au cours de la biosynthèse des acides aminés aromatiques (tryptophane, tyrosine et phénylalanine) ?
Le chorismate
Ce qu’il faut savoir sur la synthèse des aa aromatiques
- le cycle est formé en premier
- la redox sert à former le double lien (NAD)
- on abesoin de l’ATP
- le précurseur chorismate et former, pour ensuite former l’anthranilate pour enfin former le tryptophane
Le chorismate est responsable de la production de…
- tryptophane (NAD+ et NADP+)
- acide folique
- chelateur de fer
- quinone
Comment se forme le NADP et NAD à partir du trp ?
Est-ce que ce processus requiert de l’ATP ?
Trp - acide quinolinique - acide nicotinique mono - acide nicotinique di - NAD - NADP
Oui
Chez quelle espèce bactérienne se fait la synthèse du NAD+ et NADP+ à partir du Trp?
Xantomons pruni et actinomycètes
Comment se forme le NAD et le NADP à partir de l’aspartate?
Aspartate (NadB) - Iminoaspartate (NadA) - Quinolinate (NadC) - NaMN (sensuite mêmes étapes)
Haemophilus influenzae et Chlamydia ne peuvent pas synthétiser le NAD et NADP+, comment ces bactéries font pour combler ce besoin?
- par acquisition directe
2. par acquisition des intermédiaires dans l’environnement
Comment on nomme une bactérie qui ne peut pas synthétiser un composé organique qui lui est nécessaire?
Auxotrophe
Haemophilus influenzae peut acquérir directement le NAD dans l’environnement ainsi que les précurseurs nicotiniques on dit que la bactérie est auxotrophe pour …
La niacine
Chlamydia prend son NAD+ directement dans l’environnement, on dit qu’elle est auxotrophe pour
NAD ET NADP
Dans la biosynthèse du FAD, pourquoi la flavine synthase utilise de l’ATP alors que ce n’est pas une synthétase?
Car l’ATP est utilisé comme précurseur et non pas comme énergie chimique
Étapes du la formation du FAD
- Ribose 5p + GTP
- Riboflavine (Vit B2)
- Riboflavine kinase
- Flavine mono
- Flavine synthase (STP = précurseur)
- FAD
