Cours 7 Flashcards
Qui est le père fondateur de la microbiologie?
Leeuwenhoek
VRAI OU FAUX:
L’ère des études sur les microflores pathogènes, commensaux ou bénéfiques était pendant les années 40.
Faux, les années 50
Comment appelle-t-on l’aire biotique du microbiote: l’espace où les communautés microbiennes vivent?
Microbiome
Comment appelle-t-on les communautés microbiennes vivants dans un environnement donné?
Microbiote
Comment étudiait t’on le microbiote?
Culture en milieu solide ou liquide + observation au microscope
Quels sont les portions conservées lors d’amplification d’amplicons (PCR)?
Amorces
VRAI OU FAUX:
L’unité taxonomique opérationnelle (OTU) est une unité de mesure de la biodiversité microbienne et ne donne pas l’espèce.
Vrai
Qu’est-ce que: taxons en communs de différentes
communautés microbiennes?
'’Core microbiome’’
Quelles sont les 5 méthodes qui permettent de déterminer le core microbiome d’un environnement donné?
- Appartenance
- Composition
- Phylogénie
- Persistance
- Connectivité
Quelle est l’utilité du core microbiome?
Repérer les taxons qui semblent interagir avec leur hôte
VRAI OU FAUX:
En ce qui concerne le microbiote, par rapport aux nourrissons allaités, les nourrissons nourris au lait
maternisé présentaient une plus grande richesse d’espèces.
Vrai
VRAI OU FAUX:
En ce qui concerne le microbiote, les nourrissons nés par césarienne présentaient une richesse et une
diversité bactérienne particulièrement riche.
Faux, une diversité bactérienne faible
VRAI OU FAUX:
Le métagénome du microbiome intestinal de l’Homme est constitué de 3,3 millions de gènes, soit 150x le nbr de gènes humains.
Vrai
Quels sont les 4 phyla dominants de la composition du microbiome intestinal?
- Bacteroidetes
- Firmicutes
- Actinobacteria
- Proteobacteria
Qu’est-ce que: le groupe de composition bactérienne intestinale spécifique chez l’humain?
Entérotype
VRAI OU FAUX:
Le profile taxonomique détermine les entérotypes.
Vrai
Selon le régime alimentaire, il n’y a que 2 entérotypes. Quels sont-ils?
- Bactéroides
2. Prévotella
VRAI OU FAUX:
Le microbiote intestinal évolue et s’enrichie au cours de la vie d’un individu.
Vrai
Quels sont les facteurs (4) qui affectent le microbiote intestinal humain?
- Antibiotiques
- Médicaments
- Stress
- Alimentation
VRAI OU FAUX:
Le microbiome de patients atteints d’Alzheimer a une plus grande diversité microbienne.
Faux, diversité microbienne faible
Qu’est-ce qui représente la plus grande biomasse du microbiome des plantes?
Champignons
Le microbiome des plantes est formé principalement par (2)?
- Bactéries
2. Champignons
Qu’est-ce que la zone entourant les parties aériennes de la plante?
Phyllosphère
Qu’est-ce que la zone entourant les racines?
Rhizosphère
Comment appelle-t-on l’interface racine-sol?
Rhizoplan
En ce qui concerne le microbiome des plantes, comment appelle-t-on les compartiments internes?
Endosphère
Que peut contenir le microbiome de la rhizosphère (6)?
- Nodules
- Éctomycorhizes
- Endomycorhizes
- G+
- G-
- Actinobactéries
Comment appelle-t-on l’interaction de l’environnement des microbes qui influencent ou qui sont influencés par la plante?
Phytobiome
Quels sont les stress abiotiques (6) pour le phytobiome?
- Température
- Sécheresse
- Salinité
- Sels minéraux
- Polluants
- pH
Quels sont les stress biotiques (3) pour le phytobiome?
- Microbes phytopathogènes
- Insectes ravageurs
- Compétition
VRAI OU FAUX:
L. Margulis (années 1960) a présenté la théorie de l’endomycorhize.
Faux, endosymbiose
Qu’est-ce qu’une entité composite formée par un hôte et l’ensemble des ses symbiotes (chaque entité est soumise à la sélection naturelle)?
Holobionte
VRAI OU FAUX:
L’holobionte lui-même en tant qu’entité ne constitue pas lui aussi une espèce.
Faux, il constitue lui même une espèce
Qu’est-ce que l’évènement de transformation
(morphologique, physiologique, comportementale) chez des organismes qui adaptent leur traits pour interagir l’un avec l’autre?
Co-adaptation
Qu’est-ce que la co-adaptation sur une longue durée?
Co-évolution
Qu’est-ce que la spéciation de l’hôte entrainant la spéciation du symbionte?
Co-spéciation
Qu’est-ce que l’ensemble des génomes de l’hôte et du microbiome?
Hologénome
VRAI OU FAUX:
Les bactéries poussent dans des hyphes des
champignons mycorhiziens dans un milieu d’agarose-eau (sans nutriments).
Faux, à la surface des hyphes
Pro- ou pré-biotique? Substance (souvent des glucides) qui développe le microbiote, mais qui en elle-même n’inocule pas de nouveaux micro-organismes.
Pré-biotique
Pro- ou pré-biotique? Organismes vivant qui peuvent avoir un effet bénéfique sur la santé.
Pro-biotique
VRAI OU FAUX:
Les plantes fertilisées avec extrait d’algues ne poussent pas mieux que celles sans.
Faux, elles poussent mieux avec l’extrait d’algues
Comment peut-on traiter les infections de C.difficile dans le colon (gros intestin)?
Greffe fécale