Cours 7 Flashcards

Question

Fonctionnement de l'opéron trp

Answer 1

Le TrpR est un répresseur. Donc s'il est présent en grosse quantité, il va avoir de l'auto-régulation en venant se lier sur l'opérateur. En effet, il va faire de l'autorégulation négative en changeant de conformation en se liant à un co-répresseur.

Answer 2

En absence d'arabinose, la protéine AraC est liée au promoteur et elle exerce une répression sur l'opéron. Cela forme un repliement et l'ARN pol a de la difficulté à venir à se lier. Lorsque présent, l'arabinose se lie à la protéine AraC, ce qui modifie sa conformation et cesse la répression. Ensuite, la protéine CAP peut agir comme activateur quand le glucose est absent.

Answer 3

C'est un type de plasmide qui porte des gènes codant pour un ou des enzymes métabolisant des substances telles des xénobiotiques, des composés organiques. Comme avec l'opéron toluène

Answer 4

Quand le toluène est présent dans le milieu, le XylR colle le toluène pour former une conformation active pour activer certaines voies. La protéine XylR se lie promoteur Pu et agit comme un activateur de la transcription sur la voie du haut. XylR se lie aussi au promoteur Ps et active la transcription du gène XylS pour en avoir encore plus. Le toluène peut se former du benzoate. En présence de benzoate, la protéine XylS a une forte affinité pour le promoteur PL et agit comme un activateur de la transcription de la voie du bas. L'enzyme formé par XylS vont réagir avec le benzoate pour formé de la TCA qui est utilisé par la bactérie pour produire de l'énergie. Si on n'a pas du toluène, seulement du benzoate, seulement la voie du bas va être activer.

Answer 5

L'atténuation permet de stopper l'activité de l'ARN polymérase au tout début de la transcription d'un gène pour éviter qu'un ARN soit produit ( terminaison précoce). Il y a donc un arrêt de la transcription en cours.

Answer 6

Le facteur protéique rho se lie au transcrit en formation et cause la dissociation de la machinerie de transcription. En effet, le facteur rho reconnait la séquence de nucléotides de la fin de l'ARNm. L'ARNm va s'enrouler autour de rho et c'est son activité enzymatique qui va décoller le brin de l'ARN pol. La bicyclomycine est un antibiotique qui prévient l'action du facteur rho. Il possède une action léthale et un spectre large chez plusieurs espèces Gram -.

Answer 7

Elle se fait spontanément au niveau d'une séquence particulière de sur le transcrit. Il y a 2 séquences sur l'ADN qui sont riche en GC et qui sont inverses et complémentaires. Donc elles peuvent se coller si l'ARN se replie. Ces séquences complémentaires peuvent mener à la formation de boucle dans l'ARNm. Celles-ci peuvent causer un détachement de l'ARNm en formation donc un arrêt de la transcription. La boucle formée est très stable car elle possède des liens triples. Aucune enzyme ni protéine est impliqué, c'est seulement les séquences des nucléotides.

Answer 8

L'atténuateur se retrouve entre l'opérateur et le premier gène de structure TrpE. Nous avons donc la présence de séquences complémentaire. La transcription et la traduction ont lieu au même moment. Le ribosome va ensuite s'en aller sur le codons Trp et la traduction va être ralentie ou non selon la concentration dans la cellule.

Answer 9

Si la quantité de Trp est suffisante dans la cellule, la traduction n'est pas ralenti. L'ARN transcrit se replie ensuite lorsque ces séquences complémentaires sont transcrites pour former la boucle de pause. Cela a lieu de la même manière pour la boucle de terminaison. Toutefois, pour cette dernière, cela force l'arrêt de la traduction car ça créer une tension sur l'ARNm donc le complexe va se détacher.

Answer 10

Il n'y a donc pas assez de Trp de disponible, donc le ribosome est ralenti car on a de la difficulté à incorporer le Trp. Le ribosome est donc ralenti au niveau des codons. La transcription se fait donc plus rapidement que la traduction. Elle transcrit donc des régions complémentaires en amont du ribosome. C'est la boucle antiterminateur qui est formée. La dernière régions ne sera donc plus disponible pour former la boucle de terminaison. La transcription est donc en mesure de continuer jusqu'à la fin. Aucune tension n'est formé pour arrêter la transcription.

Answer 11

-On peut faire de la régulation au niveau de la transcription qui va avoir un effet car la demi-vie des ARNm est courte. -Le contrôle de l'expression génétique peut se faire en modulant la longueur de la demi-vie. La fixation de l'azote à partir N2 est couteuse en énergie, la vitesse de réaction est lente par rapport aux autres réactions enzymatiques et il faut beaucoup de nitrogénase. -Si présence de N2 comme seule source d'azote, la demi-vie des ARNm qui vont coder pour la nitrogénase est de 20 minutes. - Si présence de source azoté facilement assimilable, la demi-vie des ARNm qui vont coder pour la nitrogénase est de 2-3 minutes. Donc on ne perd pas d'énergie à dégrader l'azote.

Answer 12

Il peut avoir des protéines qui vont venir se fixer sur le site de liaison sur l'ARNm du ribosome et empêcher la traduction ou réduire sa fréquence. Il peut aussi avoir des ARN antisens qui vont se lier sur une région de l'ARNm et vont bloquer la place du ribosome donc cela va empêcher la traduction.

Answer 13

Ils peuvent venir se lier et enlever les boucles et les repliements en se liant à une partie du repliement. Ils peuvent aussi se lier et prévenir la liaison d'une ribonucléase ( enzyme qui dégrade les ARN)