Cours 7 Flashcards
La compétition? (2 + 1 NOTE)
1- Les partenaires utilisent la même ressource
2- La compétition intra-espèce est forte !
NOTE: La ressource va favoriser les m.o capables de la cataboliser. Ressource influence la communauté !
L’amensalisme (1)
1- L’un vie et produit des toxines, pendant que l’autre est neutre et meurt. (La production de la toxine à un coût pour le m.o qui la produit)
NOTE: Distinction difficile entre amensalisme et compétition !
Vrai ou faux ?
L’amensalisme est bénéfique pour l’un et neutre pour l’autre.
Faux. La relation est (0, -)
La prédation ? (1)
Exemple de bactérie prédatrice ? (1)
1- Élimination instantané d’un m.o par un autre. (RAPIDE)
Exemple de bactérie prédatrice? = Vampirococcus
Les caractéristiques de vampirococcus? (3)
1- Attaque les bactéries pourpre Chromatium minus
2- Attache des pilis et aspire le cytoplasme (essentiel a sa survie et multiplication !)
3- Fait l’objet de recherche comme agent anti tumoral
Le parasitisme (2 + 1 EXEMPLE)
1- Interaction DURABLE
2- Définitive ou temporaire (le temps de faire un cycle de reproduction)
B-dello-vibrio bacteriovorus –> MANGE le périplasme des Gram - (se souvenir du vidéo)
Le commensalisme (2 + 1 EXEMPLE)
1- Les effets positifs se font sur l’un mais pas sur l’autre
2- Aucun effet négatif sur les deux partenaires
E. coli intestinaux –> consomme l’oxygène dans l’intestin et rendent le milieu anaérobie pour les Bacteriodes anaérobie strictes. (E. coli ne retire aucun bénéfice de bacteriodes)
La pro-coopération (2+ 1 EXEMPLE)
1- Relation FACULTATIVE mutuelle
2- Les deux partenaires coopèrent dans certaines conditions seulement !
Nitrosomonas produit des nitrites qui sont utiles pour nitrobacter et nitrobacter élimine la trop grande concentration de nitrites qui est toxique pour Nitrosomonas.
Le mutualisme (1 + 1 EXEMPLE)
1- Relation OBLIGATOIRE mutuelle
Mutualisme ente Rhizopus et Burkholderia qui doivent les deux être présents pour infecter le riz
Le Quorum-sensing? (1 DÉFINITION + 2 caractéristiques)
1- Système de communication bactérien chimique qui va selon la densité de la population.
2- Permet la communication intra et inter-espèce
3- Fait intervenir des molécules appelée « auto-inducteurs »
Le quorum sensing se fait chez les GRAM + ou GRAM - ?
Chez les GRAM + grâce à des transporteurs ET les Gram - grâce à la diffusion.
Récepteurs à PAI?
Présents chez les gram + de nombreuses espèces et est hautement spécifique au PAI (peptide auto-inducteur) Intra et inter-espèce !
ET peut être spécifique à une seule espèce bactérienne
Molécules de communication AHL (AI-1)?
Présent chez les Gram -. Mauvaise communication en raison de molécules AHL sensibles. Elles se dénaturent facilement dans des PH ou températures élevées (quorum-quenching ou interférence)
ET n’est jamais spécifique à une seule espèce bactérienne
Molécules de communication AI-2?
Présente chez Gram + et Gram -. Communication inter-espèces.
Exemple avec Cholerae quorum sensing?
Utilisation en médecine ? (LuxO-P)
Lorsque la densité est faible –> facteurs de virulence et de biofilms sont codés.
Lorsque densité est forte –> Facteur de virulence et de biofilms sont inhibés ! –> Cholerae peut se disperser !
Utiliser un médicament qui mime les AI de Cholerae, donc ont peut lui faire penser que la densité est forte pour lui faire stopper sa virulence et son biofilm !
Les canaux ioniques?
Permet de faire passer des signaux électriques sur de longues distances dans les biofilms.
Du centre vers l’extérieur
Système à deux composantes? (4)
1- Système le plus répandue.
2- Permet la transduction du signal
3- (( Cascade de phosphorylation ))
4- +++ chez bactéries,+ chez humain, ++ chez levures
Les porines chez Cholerae? (OmpU)
Lorsque qu’un peptide antimicrobien déstabilise la membrane, le canal OmpU va être déstabilisé et le domaine isolé intramembranaire (YDF) va se déployer et activer degS qui va dégrader RseA et libérer sigma E. –> gènes de survie
Système à messagers secondaires? (2) (c-di-GMP)
1- Largement distribué chez les bactéries. N’existe pas chez les eucaryotes et archées !
2- Fonctionnement : Pool interne de GMP, une enzyme qui clive et une enzyme qui clive pas le GMP, lorsque c-di-GMP n’est pas clivé –> activation (EPS et fimbriae) et clivé —> désactivation (mobilité et virulence)
Système à messagers secondaires? (AMPc)
Adénylate cyclase convertit l’ATP en AMPc. AMPc active des protéines effectrices comme CRP (–> catabolisme).
Comment fonctionne la polymixine B (Non résolu)
Variation de phase? (DEF)
Phénomène d’apparition de variants au sein d’une population bactérienne.
conversion de phénotype pour être mieux adapté au milieu –> écotype
100 fois plus fréquent que la mutation spontannée!
5 sous-type de variation de phase =
1- conversion génique = recombinaison entre une copie silencieuse d’un gène et une copie fonctionnelle –> gène chimère. (on peut parler de cassettes)
2- Inversion site spécifique = Recombinaison de séquences répétées par un recombinase. Le transporteur est déplacé et permet la production de nouveaux gènes = AVANTAGE POUR LA PATHOGÉNÈSE
3- Insertion/excision = On retire un gène du génome et on le place ailleurs. Legionella insert et retire des gènes pour ses propres besoins. Besoin élément génétique mobile
4- Duplication = duplication d’une partie d’un gène pour le rendre non fonctionnel, mais correction après pour réverter et regagner la fonction. (S. pneumoniae)
5- Délétion = Non réversible (Yersinia pestis)
La variation de phase par régulation épigénétique
Ne modifie pas le génome ! Régulation par méthylation de l’ADN –> affecte la fixation des facteurs de transcription.
Les bactéries tricheuse? (3 modes)
1-Coopération = Bactéries qui s’entraident
2- Cheating = Une bactérie utilise les ressource cueilli par l’autre.
3- Counter-cheating = Les bactéries non tricheuse vont produire une molécule qui va réactiver le bactérie tricheuse et la faire produire la ressource à nouveau.
Dynamique des tricheurs?
Antibio = Les tricheurs envahissent la communauté parce qu’ils ont plus de ressources métaboliques (non pas besoin d’utiliser d’énergie pour la coopération) Les non-tricheurs meurt plus sous-l’effet de l’antibiotique.
Pas d’antibio = Les tricheurs volent lentement les ressources. Contré par les counter-cheaters.