Cours 6 Flashcards
Qu’est-ce que le coefficient de similarité (Sab)?
Ce coefficient montre si deux espèces sont proches ou éloignées.
Si sab = 1 —> espèces identiques
Si sab = 0.1 —> espaces très éloignées
Qui est le père de la phylogénétique?
Carl Woese
Le premier résultat de Woese? Quelle est la valeur?
Les bactéries sont éloignées des eucaryotes
📕 Les valeurs de Sab de deux bactéries ou deux eucaryotes sont toujours supérieures à 0.2
Caractéristiques Archaea? (3)
Procaryote unicellulaire
Aucun pathogène
Les archées ne sont pas les ancêtres des eucaryotes ou des bactéries. Ils ont un ancêtre commun
Note= elles sont plus primitives que les eucaryotes mais plus proche des bactéries.
Théorie de l’endosymbiose?
Une archée ANCESTRALE invagine une bactérie = ce qui va donner un eucaryote
Caractères uniques aux archées? (2)
La paroi cellulaire est fait d’ETHER. Et non d’ester.
Glycerol 1 phosphate.
Mode de reproduction des Archees?
Par asexuelle par fission (bacterie like)
Archees motiles?
Parfois possèdent des flagelles
Flagelle unique? (6)
- Plus fin que celui de la bacterie
- Tres solide et pas creux
- Rotation horaire seulement, moins rapide
- Consomme ATP et non gradient proton
- Plusieurs types de flagellines
- Elongation par la base
Note= ressemble au Pili des bacteries
Note = Certaine archee on une monocouche lipidique
Paroi archees caracteristiques? (4)
- Resistant aux lysozymes
- Pas de peptidolgycane, mais pseudomuréine parfois (a.a L et liaison 1-3 au lieu de 1-4)
- Pas de membrane externe
📕 4. Couche S (composé d’une seule protéine ou glyco protéine avec une masse de 40 a 200 Kda. S’assemble en STRUCTURE BIDIMENSIONNELLES CRISTALLINES
Forme du genome archee?
Beaucoup d’histones?
Cb d’origine de replication?
Hyperthermophiles?
Genome circulaire sous forme de particule (nucleosome like)
Oui!
1 seule!
Archee hyperthermophiles sont capable de surenrouler positivement l’ADN
Machinerie de réplication des archées ressemble a qui?
A celle des eucaryotes!
Les sequences initiatrices de la transcription ressemble à qui?
Aux bacteries!
La transcription et la traduction ressemble a qui?
Aux bactéries, c’est a dire, de façon simultané
Les promoteurs ressemblent a qui?
Aux eucaryotes, ressemble aux promoteurs de l’ARN pol II
Toxine diphterique fait quoi?
Inhibe la transcription des archees!
Combien de phylum d’archees et quels sont les noms? Le plus important?
Euryarcheae
Nanoaecheaum
Crenarcheae <—
Korarchaeum
Les 4 ordres du phylum crenarchaeota?
Caracteristiques des archees cultivables? (2)
Desulfurococcal
Caldisphérales
Thermoproteales
Sulfolobales
Sont touts thermophiles. Caldiphaeales est thermoacidophile.
utilise le soufre: RÉDUCTION DES SULFURES
Morphologie de 3 des 4 phylum?
Où se trouvent elles? La minorité cultivable et la majorité non cultivable?
Thermoprotale = batonnet filamenteux
Desulfurococcales = ovale applatie
Sulfolobales et caldipherales = ronds
Minorite dans les sources hydro-thermiques
Majorité dans les environnements non thermophiles
Les archees methanogenes sont sensibles a quoi?
L’oxygene. De beaucoup
Archees methanogenes sont quoi en terme de temperature? (2)
Meso et thermophiles
Phyla = Euryarcheota. 3 ordres de methanogenes. Et leur morphologies
Methanococci = ronds
Methanobacteria = batonnet
Methanomicrobia = diverse
Habitats des methanogenes (4)
Rhizosphere
Intestin
Eaux usees
Puit petrole
Symbiose bacteries et archees
Bacteries produit hydrogene pour methanoarchee pour produire methane (methanogenese)
Methanococci (4)
Motile car touffe de flagelles
Couche S
Besoin de H2 ou CO2 comme source d’energie
Sensible au UV (pas de reparation)
Methanobacteria (4)
Non motile
Batonnet filamenteux
Paroi en pseudomureine
Supporte mieux O2
Methanomicrobia (1)
Methenosarcina barkeri
Non motile
Caracteristiques Archee halophile extreme (3)
Morphologies?
Minimum 2 M Nacl
Produisent des pigments rouges caracteristiques
Utilise K+ pour equilibrer la pression osmotique
Diverses, mais aussi plate pour avoir une meilleure surface de contact.
Presence de vacuoles frequentes
Halobacterium salinarium (4)
Produit navteriorhodopsine
Batonnet
Mobile
Demande au moins 3 M Nacl (enorme)
Phylum koraecheota (1)
Aucun membre cultivé
Nonarcheota?
Nonarchaeum equitans
Un seul membre cultivé
Seul thermophile symbiotique connu et seul parasite des archees connu
Les virus des archées sont morphologiquement…
Très diversifiés et plus diversifiés que les bactériophages
Les mécanismes des archéeovirus ? (3)
- Les régulateurs viraux possèdent des motifs doigt de zinc (Zn) qui leur permettent de s’hybrider à l’ADN séquence spécifique.
- Un répertoire de protéines virales permettent d’exproprier la machine de transcription de l’archée.
- Utilisent des régulateurs viraux qui stoppent l’ARN polymérase et met fin à la transcription des genes de l’hote et du virus définitivement.
