Cours 6

Question 1

Qu’est-ce que le coefficient de similarité (Sab)?

Answer 1

Ce coefficient montre si deux espèces sont proches ou éloignées.

Si sab = 1 —> espèces identiques
Si sab = 0.1 —> espaces très éloignées

Question 2

Qui est le père de la phylogénétique?

Answer 2

Carl Woese

Question 3

Le premier résultat de Woese? Quelle est la valeur?

Answer 3

Les bactéries sont éloignées des eucaryotes
📕 Les valeurs de Sab de deux bactéries ou deux eucaryotes sont toujours supérieures à 0.2

Question 4

Caractéristiques Archaea? (3)

Answer 4

Procaryote unicellulaire
Aucun pathogène
Les archées ne sont pas les ancêtres des eucaryotes ou des bactéries. Ils ont un ancêtre commun

Note= elles sont plus primitives que les eucaryotes mais plus proche des bactéries.

Question 5

Théorie de l’endosymbiose?

Answer 5

Une archée ANCESTRALE invagine une bactérie = ce qui va donner un eucaryote

Question 6

Caractères uniques aux archées? (2)

Answer 6

La paroi cellulaire est fait d’ETHER. Et non d’ester.
Glycerol 1 phosphate.

Question 7

Mode de reproduction des Archees?

Answer 7

Par asexuelle par fission (bacterie like)

Question 8

Archees motiles?

Answer 8

Parfois possèdent des flagelles

Question 9

Flagelle unique? (6)

Answer 9

1. Plus fin que celui de la bacterie
2. Tres solide et pas creux
3. Rotation horaire seulement, moins rapide
4. Consomme ATP et non gradient proton
5. Plusieurs types de flagellines
6. Elongation par la base

Note= ressemble au Pili des bacteries

Question 10

Note = Certaine archee on une monocouche lipidique

Question 11

Paroi archees caracteristiques? (4)

Answer 11

1. Resistant aux lysozymes
2. Pas de peptidolgycane, mais pseudomuréine parfois (a.a L et liaison 1-3 au lieu de 1-4)
3. Pas de membrane externe
   📕 4. Couche S (composé d’une seule protéine ou glyco protéine avec une masse de 40 a 200 Kda. S’assemble en STRUCTURE BIDIMENSIONNELLES CRISTALLINES

Question 12

Forme du genome archee?

Beaucoup d’histones?

Cb d’origine de replication?

Hyperthermophiles?

Answer 12

Genome circulaire sous forme de particule (nucleosome like)

Oui!

1 seule!

Archee hyperthermophiles sont capable de surenrouler positivement l’ADN

Question 13

Machinerie de réplication des archées ressemble a qui?

Answer 13

A celle des eucaryotes!

Question 14

Les sequences initiatrices de la transcription ressemble à qui?

Answer 14

Aux bacteries!

Question 15

La transcription et la traduction ressemble a qui?

Answer 15

Aux bactéries, c’est a dire, de façon simultané

Question 16

Les promoteurs ressemblent a qui?

Answer 16

Aux eucaryotes, ressemble aux promoteurs de l’ARN pol II

Question 17

Toxine diphterique fait quoi?

Answer 17

Inhibe la transcription des archees!

Question 18

Combien de phylum d’archees et quels sont les noms? Le plus important?

Answer 18

Euryarcheae
Nanoaecheaum
Crenarcheae <—
Korarchaeum

Question 19

Les 4 ordres du phylum crenarchaeota?

Caracteristiques des archees cultivables? (2)

Answer 19

Desulfurococcal
Caldisphérales
Thermoproteales
Sulfolobales

Sont touts thermophiles. Caldiphaeales est thermoacidophile.
utilise le soufre: RÉDUCTION DES SULFURES

Question 20

Morphologie de 3 des 4 phylum?

Où se trouvent elles? La minorité cultivable et la majorité non cultivable?

Answer 20

Thermoprotale = batonnet filamenteux
Desulfurococcales = ovale applatie
Sulfolobales et caldipherales = ronds

Minorite dans les sources hydro-thermiques
Majorité dans les environnements non thermophiles

Question 21

Les archees methanogenes sont sensibles a quoi?

Answer 21

L’oxygene. De beaucoup

Question 22

Archees methanogenes sont quoi en terme de temperature? (2)

Answer 22

Meso et thermophiles

Question 23

Phyla = Euryarcheota. 3 ordres de methanogenes. Et leur morphologies

Answer 23

Methanococci = ronds
Methanobacteria = batonnet
Methanomicrobia = diverse

Question 24

Habitats des methanogenes (4)

Answer 24

Rhizosphere
Intestin
Eaux usees
Puit petrole

Question 25

Symbiose bacteries et archees

Answer 25

Bacteries produit hydrogene pour methanoarchee pour produire methane (methanogenese)

Question 26

Methanococci (4)

Answer 26

Motile car touffe de flagelles Couche S Besoin de H2 ou CO2 comme source d’energie Sensible au UV (pas de reparation)

Question 27

Methanobacteria (4)

Answer 27

Non motile Batonnet filamenteux Paroi en pseudomureine Supporte mieux O2

Question 28

Methanomicrobia (1) Methenosarcina barkeri

Answer 28

Non motile

Question 29

Caracteristiques Archee halophile extreme (3) Morphologies?

Answer 29

Minimum 2 M Nacl Produisent des pigments rouges caracteristiques Utilise K+ pour equilibrer la pression osmotique Diverses, mais aussi plate pour avoir une meilleure surface de contact. Presence de vacuoles frequentes

Question 30

Halobacterium salinarium (4)

Answer 30

Produit navteriorhodopsine Batonnet Mobile Demande au moins 3 M Nacl (enorme)

Question 31

Phylum koraecheota (1)

Answer 31

Aucun membre cultivé

Question 32

Nonarcheota? Nonarchaeum equitans

Answer 32

Un seul membre cultivé Seul thermophile symbiotique connu et seul parasite des archees connu

Question 33

Les virus des archées sont morphologiquement...

Answer 33

Très diversifiés et plus diversifiés que les bactériophages

Question 34

Les mécanismes des archéeovirus ? (3)

Answer 34

1. Les régulateurs viraux possèdent des motifs doigt de zinc (Zn) qui leur permettent de s'hybrider à l'ADN séquence spécifique. 2. Un répertoire de protéines virales permettent d'exproprier la machine de transcription de l'archée. 3. Utilisent des régulateurs viraux qui stoppent l’ARN polymérase et met fin à la transcription des genes de l’hote et du virus définitivement.