Cours 6 Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qui provoque le mouvement dans le cytoplasme d’une cellule eucaryote?

A

Les moteurs protéiques

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Q

Quel organite protège et séquestre l’ADN?

A

Le noyau

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3
Q

Où se déroule la transcription?

A

Noyau

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4
Q

Où se déroule la traduction?

A

Cytoplasme

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5
Q

Quelles sont les étapes de maturation de l’ARNm transcrit à partir de l’ADN?

A

L’épissage (débarasser des introns), coiffe en 5’, poly-adenylation en 3’

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6
Q

Qui empêche la traduction précoce des ARNm et comment cela se déroule-t-il?

A

Le noyau contrôle la sortie des ARNm vers le cytoplasme

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7
Q

Nomme une caractéristique particulière du cytoplasme des bactéries (procaryote).

A

Les bactéries n’ont pas de moteurs protéiques

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8
Q

Nomme une caractéristique particulière de l’ADN bactérien et qu’est-ce que cela implique.

A

Il n’y a pas d’introns. La transcription et la tradcution ont lieu simultanément dans le cytoplasme

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9
Q

Vrai ou faux.
Les procaryotes ont un noyau.

A

Faux.

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10
Q

Quelle est la forme la plus condensée des chromosomes?

A

Les chromosomes mitotiques

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11
Q

Que sont les chromosomes mitotiques?

A

Des gros complexes d’ADN et de protéine (chromatine)

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12
Q

Quel colorant ou autre technique pouvons-nous utiliser pour visualiser les chromosomes mitotiques?

A

Le Giemsa comme colorant ou des sondes fluorescentes permettent de voir les chromosomes mitotiques

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13
Q

Que permet un karyotype? (2)

A

-Classer les chromosomes
-Observer les mutations

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14
Q

Sous quelle forme retrouve-t-on l’information génétique dans les chromosomes?

A

Les gènes

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15
Q

De quoi est fait un gène et à quoi chaque structure sert?

A

-Séquence régulatrice: Contrôle la transcription du gène (quand et combien il faut faire de protéines)
-Introns: Code pour rien/inutile (Seront coupés)
-Exons: Forme la structure primaire des protéines (Seront assemblés)

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16
Q

Combien de paires de bases possède le génome humain?

A

3 milliards

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17
Q

Quelles sont les trois séquences que l’on retrouve dans le gène et à quoi corresponde-t-elle?

A

-Séquence codante: Séquence qui code pour une protéine
-Séquence conservée: Séquence qu’on retrouve à travers l’évolution
-Séquence régulatrice: Séquence qui est là pour réguler le métabolisme de l’expression des gènes (où et quand s’exprimer, quantité)

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18
Q

Que permet un BLAST?

A

D’aligner les séquences d’ADN (en nucléotides) de plusieurs espèces différentes

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19
Q

Vrai ou faux.
Il n’est pas possible d’aligner les séquences des protéines (en acides aminés) connues chez plusieurs espèces.

A

Faux. C’est possible.

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20
Q

À quoi correspond la séquence consensus?

A

C’est la séquence conservée qui est composée d’acides aminés ou nucléotides qui occupent une position donnée le plus fréquemment.

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21
Q

Que sont les transposons?

A

Séquences non codantes répétées dont la majorité sont mobiles et se déplacent de manière autonome

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22
Q

En plus des transposons, que comporte l’ADN répétitif?

A

-Duplications de segments chromosomiques (crossing-over inégal durant la méiose)
-Séquences simples de 2-6 pb, répétées jusqu’à 100 fois (dans les centromères et télomères)

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23
Q

Quelle caractéristique retrouve-t-on dans les duplications de segments chromosomiques et chez les séquences simples?

A

Se sont des séquences non-mobiles.

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24
Q

Vrai ou faux.
Plus l’organisme est complexe, plus la densité génique est grande.

A

Faux.
Plus l’organisme est complexe, plus la densité génique est faible.

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25
Q

Comment se nomme le répertoire de tous les éléments de l’ADN et vise à identifier la fonction de chacune des bases du génome?

A

ENCODE (Encyclopedia of DNA elements)

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26
Q

Que retrouve-t-on principalement chez les bactéries?

A

Principalement des séquences codant pour des protéines

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27
Q

Vrai ou faux.
L’ADN humain mesure 1m de long.

A

Faux.
Il mesure 2 m.

28
Q

Quelle est la dimension du noyau d’une cellule eucaryote?

A

10-50 um (micro mètre)

29
Q

Qu’est-ce qui est problématique lors du compactage de l’ADN?

A

Les groupements P chargés négativement (accumulation de la charge du même type)

30
Q

Que doit-on ajouter pour faciliter le compactage de l’ADN?

A

Des protéines avec des charges “+”.

31
Q

Vrai ou faux.
Les protéines constituent la moitié de la masse moléculaire d’un chromosome eucaryote.

A

Vrai.

32
Q

Lors de l’interphase, quels sont les deux niveaux de compaction?

A

-Les fibres étendues environ 10 nm (région active pour la transcription)=perle sur un fil
-Les fibres condensée de >30 nm (région non transcrites)

33
Q

Comment se nomme le premier niveau de compaction?

A

Le nucléosome

34
Q

Vrai ou faux.
Le nucléosome est la structure de base de la chromatine.

A

Vrai

35
Q

Qu’est-ce que les nucléosomes?

A

Ce sont les bobines autour desquelles s’enroulent 146 pb.

36
Q

Qu’est-ce qui compose chaque nucléosome?
Soit spécifique.

A

8 histones: 2x H2A, 2x H2B, 2x H3, 2x H4

37
Q

À quoi sert la cinquième histone H1 et quand joue-t-elle son rôle?

A

Elle stabilise l’ADN sortant des nucléosomes (approche les deux extrémités) et permet leur empilement en fibre de 30 nm.

38
Q

À quelle fibre correspond l’octamère d’histones, entouré d’ADN?

A

La fibre de 11 nm (fibres étendues/perles sur un fil)

39
Q

Vrai ou faux.
Les histones sont des lipides.

A

Faux.
Ce sont des protéines.

40
Q

Quel est le rôle de la queue N-terminale variable d’une histone?

A

Régulation de la liaison entre l’histone et l’ADN

41
Q

Quel est le rôle de la partie C-terminale conservée d’une histone?

A

L’assemblage du nucléosome.

42
Q

Qui est capable de modifier les queues N d’histones?

A

Les enzymes.

43
Q

Vrai ou faux.
Les queues N d’histones sortent du nucléosome.

A

Vrai.

44
Q

Quelles sont les 4 modifications possibles sur la queue N-terminale par les enzymes?

A
  1. Acétylation
  2. Phosphorylation
    3 et 4. Méthylation et ubiquitination
45
Q

Explique l’acétylation.

A

On cache la charge “+” sur les lysines des histones. Il y a une perte d’interaction avec l’ADN chargé “-“. L’ADN se détache et est moins condensé

46
Q

Explique la phosphorylation.

A

Un P est ajouté sur les sérines et neutralise un charge “+” voisine de la lysine ou de l’arginine. Le P peut ainsi augmenter l’effet de répulsion de l’ADN (en ajoutant plus de charge “-“)

47
Q

Explique la méthylation et l’ubiquitination.

A

L’ajout de ces groupements rend l’histone compatible à d’autres protéines. Change donc la configuration de la queue N-terminale.

48
Q

Quel nom donne-t-on à l’ADN en fibres de 11 nm qui peut être transcrit en ARN?

A

L’euchromatine.

49
Q

Quand parle-t-on d’hétérochromatine?

A

Lorsque nous sommes en présence d’une fibre de 30 nm (l’ADN est non transcrit).

50
Q

Comment est-il possible de faire des boucles avec de l’hétérochromatine?

A

En s’assurant d’avoir des queues N d’histonnes portant les modifications compatibles avec les protéines Sir, puis en ajoutant des protéines Sir (silent information regulator, une condensation de plus).

51
Q

Vrai ou faux.
Lorsque l’ADN est moins condensé, il est moins accessible aux protéines lors de la transcription, réplication, recombinaison.

A

Faux.
Lorsque l’ADN est plus condensée, il est moins accessible aux protéines lors de la transcription, réplication, recombinaison.

52
Q

À quoi ressemble le nucléole au microscope MET?

A

Fibrillaire au centre et granuleux en périphérie.

53
Q

À quoi correspond la zone fribrillaire du nucléole?

A

La zone de transcription des ARN ribosomaux

54
Q

À quoi correspond la zone granuleuse du nucléole?

A

Le site d’assemblage des sous-unités ribosomales (ARNr+protéines)

55
Q

Est-ce que le nucléole est délimité par une membrane?

A

Non

56
Q

Quel est le rôle du ribosome?

A

Il sert à la traduction de l’ARNm en protéine, dans le cytoplasme.

57
Q

De quoi est composé le ribosome?

A

De deux sous-unités (grosse et petite)

58
Q

À quel moment s’assemble les deux sous-unités du ribosome?

A

Seulement au moment de la traduction

59
Q

De quoi est composé chaque sous-unité du ribosome?

A

D’ARN (ARNr) et de protéines

60
Q

Où s’effectue la formation des sous-unités?

A

Dans le noyau, près du nucléole

61
Q

Quels sont les quatres sites de liaison au ribosome?
Explique.

A

-Site de liaison pour l’ARNm
-Site A: Fixe la molécule d’ARNt entrante portant un acide aminé
-Site P: Fixe la molécule d’ARNt liées à l’extrémité en croissance de la chaîne polypeptidique.
-Site E: Sortie de l’ARNt (expulsion/exit)

62
Q

Replace les étapes en ordre pour la biogenèse des ribosomes:
A. Modification des pré-ARN, RP et AF

B. Transport: exportation de pré-ribosomes vers le cytoplasme

C. Transcription des composants (ARNr, ARNm codant pour les protéines ribosomales (RP) et les facteurs d’assemblage (AF) et snoRNA)

D. Traitement (épissage des pré-ARNr)

E. Assemblage des sous-unités en périphérie du
nucléole (importation nucléaire de RP et d’AF)

F. Contrôle de la qualité et surveillance

A

C-D-A-E-B-F

63
Q

Où est transcrit l’ARNr?

A

Dans le nucléole, à l’intérieur du noyau.

64
Q

Où est transcrit l’ARNm?

A

À l’extérieur du nucléole, à l’intérieur du noyau

65
Q

Quels complexes ARN-protéines font l’épissage des ARNm durant leur maturation?

A

snRNPs (snurps)

66
Q

Que permettent les snoRNPs (complexes ARN-protéines)?

A

Modifier et couper les ARNr précurseurs lors de leur maturation.

67
Q

Qui assemblent/recyclent les snRNPs?

A

Les corps de Cajal