Cours 5 : Viroides Flashcards
Quelle expérience a permis la mise en évidence des viroides ?
On a broyé des plantes, puis réalisé une extraction phénolique / purif de l’ARN : on récupère ensuite les ARN de faible PM et on vérifie si c’est des viroides en les injectant dans des plantes saintes.
Quelle expérience permet de vérifier la présence de viroides ?
On fait une migration sur gel des AN de plantes malades et sains, avec une DNase ou RNase. Il apparaitra une nouvelle bande chew les plantes malades, qui ne sera pas affectée par les DNases mais par la RNase.
Qu’est-ce qu’un viroide ?
C’est un ARN simple brin circulaire, fortement structuré au niveau secondaire, non codant et non encapsidé. Ils se répliquent par cercle roulant.
Que contient la séquence nucléique d’un viroide ?
L’information de la spécificité d’hôte, du mouvement et de leur réplication.
Pourquoi peut on dire que les viroides n’ont pas de capacité codante ?
Ils n’ont pas de codon AUG
ne pourraient coder que pour des protéines ridiculement petites
n’ont aucune activité messagaire dans un système acellulaire
Pas de différence sensible au niveau de l’analyse protéomique.
Comment est le taux de mutation d’un viroide ?
C’est le plus élevé de tous les réplicons.
Quelles sont les différences entre les deux familles de viroides ? Les nommer.
Pospiviroidae : réplication dans le noyau, asymétrique et dépendante entièrement de l’hôte. Sa structure secondaire est en bâtonnet simple.
Avsunviroidae : réplication dans les chloroplaste, asymétrique et utilise l’activité ribosyme du viroide. Structure branchée.
Comment se transmettent les viroides ?
Surtout par blessures mécaniques, et par transmission verticale via le pollen, graines, organe végétatifs. On ne sait pas s vecteurs ?
Au cours de la réplication, quelle structure est adoptée par le viroide ?
Celle d’une structure secondaire métastable.
Comment est-ce que les viroides se répliquent ?
Ils utilisent l’ARN polymérase cellulaire, ADN dépendante. Ils utilisent un mécanisme de cercle roulant, faisant la synthèse d’ARN de longueurs supérieures à une unité puis en les clivant par unité via une RNase cellulaire. Il y a ensuite circularisation
Est-ce que le brin + ou le brin - entre dans le noyau ?
Le brin +.
Rappeler diff entre réplication symétrique et asymétrique ?
Symétrique : les brins sont coordonés lors de la réplication, alors que sinon c’est un lagging et leading.
D’après la structure du viroide, que doit il se passer sur son génome pour permettre la réplication ?
Il doit y avoir un clivage, qui survient à deux endroits différents pour chaque brin + ou -.
Qu’est-ce qu’un ribozyme ?
C’est une protéine à activité de coupure autocatalytique des ARN, qui se forment transitoirement au cours de la transcription. Nécessitent Mg2+ pour fonctionner.
Donner les similarités dans la réplication de ces viroides.
Cercle roulant
Utilisent des concatémères, clivés par la suite, comme intermédiaires de réplication linéaires
La transcription commence à des sites spécifiques
Ligation pour obtenir des molécules circulaires
