Cours 4: Les sources de la variation phénotypique Flashcards
Définition d’un trait
Caractéristique d’un individu tel que la taille, la couleur du pelage, etc
Définition phénotype
Caractéristique observable et mesurable d’un individu
Vrai ou faux? Un phénotype ne peut pas être mesurer directement
Faux
Vrai ou faux? Il est possible d’observer et de mesurer des phénotypes qui ne sont pas visible à l’oeil nu. Si c’est vrai, donnez un exemple
Vrai, la structure d’une enzyme dans la cellule
Définition variation phénotypique
Donnez une exemple avec les coccinels
Représente les différents états observé par un caractère ( ou l’ensemble des caractères ) dans une population
Exemple: Nombre de points des coccinelles dans le dos qui passe de 3 à 18
Qu’est ce qu’un caractère possède toujours et provient de ou?
Possède toujours une base génétique et provient de l’expression d’un ou de plusieurs gènes
Quel serait un caractère qui provient de l’expression de plusieurs gènes?
La taille d’un humain
Quel serait un caractère qui provient de l’expression d’un gène?
La couleur d’un petit pois
Qu’est ce que la variation phénotypique apporte et permet?
Elle permet la survie différentielle des individus face à l’environnement de la population (sélection)
Héritabilité selon la théorie de l’évolution
Les survivants transmettent leur bagage génétique à la génération suivante
Vrai ou faux? Toute la variation phénotypique est pas forcément le résultat de variation héritable et toute variation phénotypique ne peut pas faire objet de la sélection
Faux, car ce n’est pas nécessairement à base génétique, ca peut être l’environnement aussi et la variation phénotypique peut faire l’objet de la sélection
Qu’est ce que la variation phénotypique héritable fera objet de et qu’est ce que ca veux dire?
Elle fera objet d’évolution par sélection, cela veut dire qu’elle va entrainer des variation de matériel génétique d’une variation à l’autre et potentiellement des adaptations locales
Définition de la variation génétique
Toutes les différences dans la séquences d’ADN d’un génome entre des organismes
Qu’est ce que des variants structuraux?
La variation génétique est présente sur une plus grande région de l’ADN
Mutation d’un nucléotide: QU’est que la mutation dans la région transcrite ou celle de régulation de gène va entrainer comme changement?
- Au niveau de la séquence transcrite, modifient les propriétés de l’ARN ou de la protéine traduite
- Au niveau des séquences régulatrice, modifie le niveau, la durée, l’endroit et/ou le moment de l’expression du gène
Qu’est ce que la composante génétique pur est?
La variation des caractères est généralement le résultats d’une mutation qui entraine des changement au niveau des gènes ou au niveau des séquences régulatrices des gènes
Donner une exemple d’effet génétique pur
L’hémoglobine: Une seule mutation au niveau des gènes va entrainer une changement d’acide aminé et un mauvais repliement de la protéine
Comment l’environnement peut-elle affecter la réalisation d’un phénotype?
- Carence en nutriments essentiels
2.Substances toxiques
3.Conditions modifiant la nature chimique des composantes
Vrai ou faux? Dans certain cas, il est possible que la composante environnementale soit héritable
Faux, dans tous les cas, la composante environnementale n’est pas héritables
Qu’est ce que l’effet environnement pur?
Provient de ressources insuffisantes ou de substances qui va empêcher la réalisation du phénotype prévu dans les conditions optimales pour un génotype donné (ex.Plantes beaucoup plus petite avec moins de nutriments)
Exemple d’effet environnement pur avec les fleurs?
Les fleurs des hortensias sont rose dans un sol neutre à casue du pigments delphinidine mais lorsque le pH est acide, le pigments devient bleu
Comment appele-t-on le lorsque lconcept lorsque l’environnement modifie le génotype prévu pour un génotype donné?
La plasticité phénotypique
Quelles sont les deux types de plasticité phénotypique?
passive et active
Qu’est ce que la plasticité phénotypique passive?
Conséquence des effets de l’environnement pur, au niveau des processus physiologiques
Le phénotype pour la plasticité passive sera proportionnel a quoi?
Au niveau d’intensité de la variable de l’environnement
À quoi servent les processus épigénétique?
Modifier l’expression des gènes sans recours aux mutations
Les modifications chimiques pour l’épigénétique va être réaliser ou?
Au niveau des histones ou des nucléotides du génome
Que fait l’acétylation de certaines acides aminés des histones?
Réduit l’affinité entre les histones et l’ADN ce qui va permettre l’accéssibilité aux gènes
Que fait la méthylation des cytosines de l’ADN?
Empêche le positionnement des protéines requises pour initier la transcription et donc empêche l’expression du gène
Vrai ou faux? La plupart des modifications épigénétiques proviennent d’intéraction avec l’environnement. Comment appellons-nous cette intéraction?
Vrai. Plasticité
Qu’est ce que l’épimutation?
Des modifications épigénétiques qui surviennent par accidents
Qu’est ce que l’effet épigénétique pur?
Provient des épimutations, les changements épigénétiques accidentels vont entrainer une changement au niveau de l’expression des gènes
Vrai ou faux? Les changements épigénétiques ne sont généralement par héritables
Vrai
Le taux d’épimutation est plus élevé que quoi et produit quoi?
Beaucoup plus élevé que celui des mutations ce qui produit multiples génotypes à chaque génération
Qu’est que l’épigénétique-environnement? Quel sorte de plasticité c’est?
Les intéractions proviennent de changement épigénétiques programmé (non-aléatoire) en réponse à un signal environnemental. C’est la plasticité phénotypique active
La plasticité phénotypique active est quoi?
Une adaptation qui va permettre à un génotype de développer une des phénotypes possible en fonction de l’environnement
Le changement phénotypique dns la plasticité active résulte de quoi?
D’une modification de la régulation des gènes
Exemple d’intéraction épigénétique-environnement? (oeuf mâle-femelle)
La température d’incubation va déterminer le patron de phénotype a mettre en place, c’est au niveau du gène de l’aromatase que le profil de méthylation se fait. Si le gène fonctionne, l’aromatase prend l’endrogène et le transforme en oestrogène et donc femelle.
Exemple d’intéraction épigénétique-environnement? (abeille)
La diete (gelé royal) donnée au larve affecte la méthylation au niveau des gènes associé a la fécondité, soit ouvrière stérile ou reine fertiles
Exemple d’intéraction épigénétique-environnement? ( Blanc ou roux d’un renard)
La photopériode va affecter le patron d’expression des gènes. Va faire option de si on mut ou on ne mut pas
Que doit-il se passer pour qu’un caractère fixe devienne un caractère plastique?
Il faut une ou des mutations au niveau des gènes impliqués dans le caractère
Comment sont les phénotypes de plasticité passive?
Une gamme continue de phénotypes
Comment sont les phénotypes de la plasticité active?
Peu de phénotype et souvent discontinus
Comment est-il possible de déterminer s’il y a plasticité?
Norme de réaction
Qu’est ce que la norme de réaction permet de faire?
Représenter les différents phénotypes produits par un génotype lorsqu’il se développe dans des environnements différents
Qu’est-il important d’utiliser pour faire la norme de réaction?
Des clones
Que sont les traits monogéniques ou discrets?
Traits affecté par le produit d’un seul gène
Quel sont les phénotypes possible pour les traits monogéniques ou discrets?
Peu de phénotype possible
Quel sont les valeurs qui vont être observer pour les phénotypes de traits monogéniques ou discrets?
Des valeurs discrètes qui vont varier selon l’allèle présent
Que sont les traits polygéniques ou quantitatifs?
La valeur du trait est contrôlée par la variation du génotype pour plusieurs gènes
Comment sont les états des traits polygéniques ou quantitatifs?
Multiple et une gradation +/- continue entre les extrêmes. Les états peuvent être mesurer
Quels sont quelques traits polygéniques et quantitatifs?
La taille d’un humain, couleur de la peau, résistance aux maladies
COmment les états des traits polygéniques sont-elles mesurer et comment sont-elles présentées?
Elles sont mesurés individuellement et sont représenter au niveau de la population sous forme de moyenne et de variance
Qu’est ce que l’héritabilité?
C’est la proportion de la variation observée pour un trait qui est expliqué par la variation génétique
Héritabilité généralement égale à 1.
Lorsqu’un seul gène influence, cela fait donc que l’environnement a peu ou pas d’impact sur la variation. Le phénotype est donc le réflet direct du génotype
Héritabilité varie entre 0 et 1
Lorsque de nombreux gènes influencent. L’environnement peut avoir une grande influence sur la variation associé au caractère.
Quelles sont les deux façons de mesurer l’héritabilité?
Héritabilité au sens large (H2) ou héritabilité au sens strict (h2)
Qu’est que l’héritabilité au sens large mesure?
La proportion de la variation phénotypique qui est expliqué par toute la variation génétique durant le développement du phénotype. Quelle soit transmissible ou non
Qu’est que l’héritabilité au sens stric mesure?
La proportion de la variation phénotypique qui est expliqué exclusivement par la variation génétique transmisble à la génération suivante
Qu’est ce que les effets génétiques non héritable?
Des effets confondants ne permettant plus de prévoir le phénotype à partir d’un phénotype
Comment les effets génétiques non héritable peuvent survenir? (2)
- Dominance (intéraction entre différents allèles d’un génotype hétérozygote)
- Lorsque l’allèle d’un gène affecte les allèles d’un autre gènes (épistasie)
Pourquoi la dominance et l’épistasie n,est pas héritable?
Car dans un système sexué, un génotype n’est pas transmis, c’est les allèles qui sont transmis au niveau des gametes
De quoi doit-on disposer pour pouvoir faire l’H2?
De plusieurs génotypes différents avec plusieurs individus par génotypes ainsi que de plusieurs environneemnt différents.
H2: Si la variation phénotypique observé dans les milieu et que les deux génotypes réagissent de façon semblable, qu’est ce que cela veux dire?
C’est l’environenemnt qui est responsable de l’environnement. L’héritabilité sera alors proche de 0
H2: Si la variation phénotypique est observer entre les génotypes et non selon les environnement, qu’est ce que cela veux dire?
C’est essentiellement la variation génétique. L’héritabilité sera alors proche de 1
H2: Si la variation phénotypique est expliqué par les génotypes et l’environenemnt, qu’est ce que cela veux dire?
Il y a intéraction entre les deux facteurs et donc chaque génotyes réagit différement à un environnement donné. L’héitabilité sera alors entre 0 et 1.
Comment peut-on mesurer les effets relatifs de la variation génétique et de l’environnement chez des humains pour l’H2?
En comparant le phénotype de jumeaux monozygote et les phénotypes de jumeaux non identiques
Pourquoi on ne peut pas seulement comparer le phénotype de jumeaux identiques?
Car pour que les analyses soient adéquates, il faudrait que les paires de jumeaux aient grandit dans les même conditions, sinon la corrélation pourrait être expliqué par l’environnement
Qu’est ce que l’h2 permet de prédire?
Le phénotype des rejetons à partir du phénotypes des parents
Pourquoi h2 est indispensable?
Afin de prévoir les effets de la sélection sur l’évolution d’un trait
Comment faisons-nous pour faire l’h2?
La variation phénotypique entre les parents et leurs enfants, dans la mesure ou ils sont dans le même environnement
Qu’est ce que cela veux dire s’il y a corrélation pour h2?
Cela veut dire qu’on peut prédire le trait des descendants à partir des parents et donc que l’héritabilité du trait est très forte
Qu’est ce que cela veux dire que la pente (héritabilité) d’un caractère est proche de 1 pour h2?
Les effets de la sélections sont rapides car sont lié a la variation génétique
Qu’est ce que cela veux dire que la pente (héritabilité) d’un caractère est de 0 pour h2?
Il n’y aura aucune évolution par sélection
Héritabilité élevée de la variation de la taille chez les humains avec une légère différence?
L’environnement affecte un peu plus la variation en taille chez les femelles
