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Cours-4 Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qu’un gène?

A

L’ensemble de tous les gènes, porte les caractères transmissibles

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2
Q

Pourquoi gène= protéines n’est pas une bonne définition?

A

Un gène ne code pas nécessairement une protéine, il peut coder autre chose, donc on dit qu’il code un transcrit

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3
Q

Opérons?

A

Regroupement de plusieurs gènes chez les bactéries

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4
Q

Transcrits polycistroniques?

A

Contenant l’information pour plusieurs protéines, plusieurs séquences codantes

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5
Q

Cistron?

A

Séquence codante

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6
Q

Gènes eucaryotes codent pour une ou plusieurs protéines?

A

Le gène eucaryote, généralement plus long, code un seule protéine (mais les transcrits peuvent être modifiés)- Monocistronique

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7
Q

Génomes?

A

L’ensemble des informations contenues dans l’ADN. Contenu dans le noyau chez les eucaryotes et en un seul chromosome circulaire chez les bactéries

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8
Q

Quelle est la 1e souche bactérienne a avoir été séquencés?

A

La souche K12 de E.coli (1997)

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9
Q

Est-ce que les bactéries ont des séquences non codantes (exons?)

A

NOP, ils n’ont que des séquences codantes

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10
Q

Chez l’Eucaryote, vers quel moment l’ADN est condensé sous forme de chromosome? Et en chromatine?

A

Lors de la mitose.

Durant l’interphase, on se retrouve dans le noyau sous forme de longs filaments appelés la chromatine.

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11
Q

Quelle est la différence au microscope électronique entre l’ADN génomique Eucaryote et d’E. coli?

A

Eucaryote: Amas noir au centre du noyau.

E.coli: Structure claire au centre de la cellule.

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12
Q

PEUT importe l’espèce, l’ADN est liée à une sou plusieurs protéines?

A

À plusieurs protéines (en chromatine)

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13
Q

Plasmide? combien?

A

Petits ADN circulaires indépendants du chromosome (bactérie). La bactérie peut avoir une même copie mais celui-ci ne se réplique que lors de la division.

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14
Q

Quel est la différence entre le génome bactérien (chromosome circulaire ) et les plasmides?

A

Les plasmides ne contiennent pas de gènes imp pour la croissance MAIS parfois caractères avantageux (résistance antibio)

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15
Q

ADN mitochondrial?

A

Les génomes des mitochondries et des plastes ressemblent aux génomes bactériens.

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16
Q

où se trouve les copies de l’ADN mitochondriale?

A

à l’intérieur du stroma

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17
Q

Cellules polyploïdes? comme?

A

Plusieurs copies du génome; EX: les mégacaryocytes (plaquettes sanguines 64N chromosomes)

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18
Q

Trois divisions majeurs du règne du vivant?

A

Bactéria (eubactérie), Archaea (génome circulaire mais semblable à eucaryote) et Eucaryotes (chromosomes linéaires)

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19
Q

Densité génique vs grosseur du génome?

A

Le génome est proportionnel à la complexité de l’individu mais plus il est gros, plus il y a des introns et des espaces intergéniques (non codantes).. donc gros génome mais faible densité génique

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20
Q

Quel est le % du génome humain qui sert à coder pour les protéines?

A

2%,

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21
Q

Chromatine?

A

Compaction de l’ADN, + protéines qui lui sont associées

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22
Q

Les protéines qui enroulent l’ADN représente ___ de la masse moléculaire des chromosomes?

A

la moitié

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23
Q

La majorité des protéines de la chromatine sont des petites protéines basique appelés?

A

histones

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24
Q

La structure de la chromatine doit être modulée pour permettre aux enzymes responsable de ces fonctions d’accéder à l’ADN? VRAI OU FAUX

A

VRAI, le compactage de l’ADN en chromatine diminue l’accessibilité de l’ADN pour les enzymes.

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25
Faut-il enrouler le seul chromosome des procaryote, considérant qu'il est bcp plus petit?
OUI, par une structure appelés nucléoide
26
Les bactéries contiennent des histones dans leur chromatine?
NOP, il N'ont PAS d'histones, mais d'autres petites protéines basiques qui jouent un rôle similaire
27
1 nucléosome = ? histones?
8
28
VRAI ou FAUX? l'ensemble des nucléosomes forment la chromatine.
VRAI
29
L'ADN s'enroule 1,65 fois autour de chaque noyau d'histone, combien de pb par tour?
150
30
Comment est appelé l'ADN reliant chaque nucléosome?
Intercalaire
31
De quoi est composé le cœur de chaque nucléosome?
d'un noyau d'histone, Chaque noyau contient deux dimères et un tétramère. 4 protéines en 2 copies (donc 8 protéines)
32
Les histones contiennent un fort % d'aa chargé négativement (Lys et Arg) VRAI ou FAUX
Faux: Les histones contiennent un fort % d'aa chargé positivement (Lys et Arg), ce qui leur permet d'interagir avec l'ADN chargé nég
33
Assemblage des nucléosomes?
Le tétramère H3•H4 se lie à l’ADN ✤ Les deux dimères H2A•H2B se joignent ensuite au complexe ✤ Chacune des histones du noyau a une longue extension N-terminale appelée queue
34
L'affinité des histones pour l'ADN est très grande ou faible?
TRÈS grande
35
Il a-t-il de la spécificité de séquence dans la liaison des histones à l'ADN? (la composition/séquence de l'ADN a un impact dans l'interaction?)
On ne veut pas reconnaitre une séquence spécifique, on veut reconnaitre l'hélice au complet. Les interactions sont donc avec le squelette de l'ADN (donc pas de spécificité, les noyaux d'histone peuvent s'attacher n'importe où) et non le sillon majeur.
36
Il y a combien de points de contact entre l'ADN et l'histone à l'intérieur d'un nucléosome?
14 points, un pour chaque fois que le sillon mineur fait face au noyau.
37
Est-ce que les histones peuvent se lier partout?
oui, mais certaines régions sont dépourvues de noyaux d'histones (ex: endroit où on doit avoir accès fréquemment)
38
Combien de liens hydrogènes sont formés (histones-ADN)?
140, la plupart impliquant l'ossature autour du petit sillon
39
Combien de liaisons impliquent les bases du petit sillon (histones-ADN)?
7
40
Est-ce qu'il peut y avoir les liaisons avec le sillon majeur? (histones-ADN)
Non, JAMAIS, il faut le laisser accessible
41
Les queues N-terminales des histones stabilisent l'ADN autour du noyau? VRAI ou FAUX?
VRai
42
Les 4 queues des histones __ et __ émergent entre les 2 brins d'ADN, où 2 sillons ___ (majeur/ mineur) se font face, créant une brèche juste assez grande pour la chaîne peptidique
Les 4 queues des histones H2B et H3 émergent entre les 2 brins d’ADN, où 2 sillons mineurs se font face, créant une brèche juste assez grande pour la chaîne peptidique
43
Les queues des H4 et H2A émergent en haut et en bas des deux hélices. Vrai ou Faux?
Vrai
44
Les queues peuvent être sujettes à plusieurs modifications post-traductionnelle, pourquoi?
pour réguler la transcription d'une région (on condense la queue pour stopper la transcription d'un gène et on libère la queue pour faciliter la transcription.
45
Quelle histone interagit avec l'ADN intercalaire entre les nucléosomes? Que fait-elle d'autres?
H1, elle interagit aussi avec une partie de l'ADN autour du nucléosome. ET elle rapproche les nucléosomes
46
Quel est le rôle des histones dans le maintient de la fibre condensée? Et l'ADN
Les queues des histones des nucléosomes adjacents dans les fibres compactées peuvent former de nombreuses interactions qui aideraient à maintenir la structure en hélice des nucléosomes dans la chromatine compacte. L'ADN se mélange au tout afin d'aider la chromatine à prendre sa conformation finale.
47
La double hélice d'ADN sert de matrice pour sa propre réplication, VRAI ou FAUX?
VRAI
48
Quel est le modèle utilisé lors de la réplication?
Modèle semi-conservateur: Les deux brins mère de sépare, Il en résulte 2 chromosomes identiques avec un brin matrice et un nouveau brin. Les nucléotides du nouveau brin sont insérés selon les règles d'appariement des bases.
49
Qui synthétise le nouveau brin?
L'ADN polymérase
50
La polymérase attache un nucléotide à partir d'une extrémité 5'. Vrai ou faux
FAUX: à partir de l'extrémité 3' OH d'un nucléotide déjà en place
51
La sous-unité catalytique de l'ADN polymérase possède la capacité d'ajouter des nucléotides, à quelle condition?
l'ADN polymérase a besoin d'une amorce qu'elle peut allonger pour produire un nouveau brin. La polymérase ne fait qu'ajouter à quelque chose, il faut donc une amorce pour ajouter le 1er nucléotide.
52
La géométrie de la double hélice est reconnue par la polymérase, ce qui assure l'insertion du bon nucléotide. Que se passe-t-il si c'est introduit du mauvais côté?
Il y aura une mutation. Un signal sera envoyé à l'ADN polymérase pour dire que l'appariement des bases est incorrect.
53
Chez les bactéries, la réplication commence toujours à un endroit différent. VRAI ou FAUX
FAUx, commence toujours au même endroit sur le chromosome.
54
Comment se nomme l'endroit où commence la réplication de l'ADN chez les bactéries? qu'est-ce que c'est?
L'origine de réplication, il s'agit d'une séquence spécifique où se fixe un gros complexe protéique capable d'attirer l'hélicase.
55
Chez les Eucaryotes, il y a multiples origines réplications sur un même chromosomes. Il peut y avoir des dizaines voir des centaines d'origine de réplication sur l'ADN!! VRAI ou FAUX?
VRAI, donc la synthèse d'ADN peut commencer simultanément en multiples points , ce qui accélère grandement le processus.
56
Primase?
ARN polymérase, agit dans le début de la réplication de 'ADN
57
Il y a deux modèles de réplication de l'ADN, lequel est le bon?:
Le premier choix: 2 enzymes sur la même origine de réplication dans les directions différentes. On retrouve au microscope la fourche. Deuxième choix: l'ADN défile au milieu du complexe, les enzyment ne bougent pas. On retrouve souvent les ligase lier ensemble.. MAIS..Personne se sait quel modèle est le bon
58
La réplication des extrémités de l'ADN?
L'amorce ne peut pas mettre son ribonucléotide directement collé sur l'autre brin d'ADN, donc le brin raccourcie de plus en plus après chaque réplication. Parce que les ADN polymérase ont besoin d'une amorce, l'extrémité 3' d'un chromosome linéaire se peut être répliqué.
59
Quel brin du chromosome est raccourci à chaque ronde de réplication?
Les deux!
60
Quest-ce que la différence entre une transition et une transversion (mutations ponctuelles)?
- Transitions: Changement de base (purine pour purine..) | - Transversion: Changement de pyrimidine en purine ou vice versa!
61
Quel est le double défi pour la réparation des mésappariements de bases?
- Remplacer le nucléotide mésapparié avant le prochain cycle de réplication - Identifier lequel des deux brins contient l’erreur
62
Il y a-t-il plus de ribonucléotides ou désoxyribonucléotides?
Il y a bcp plus de ribonucléotides (en nombre) que de désoxyribonucléotides.
63
Pourquoi les ribonucléotides de peuvent pas s'aligner correctement?
À cause de la présence de l'OH en 2'. C'est pourquoi les ribonucléotides ne peuvent être utiliser , même si leur concentration est plus élevée.
64
Télomérase?
synonyme de ADN polymérase
65
La réaction de polymération est dite processive, qu'est-ce que cela signifie?
Une fois positionnée, l'ADN polymérase reconnait l'extrémité et commence à répliquer l'ADN sans briser le complexe.
66
L'activité exonucléase permet à l'ADN polymérase de ?
D'éditer les séquense d'ADN, couper le dernier nucléotides introduit pour enlever le mauvais nucléotide et le changer.
67
À quoi sert la primase?
La synthèse de l'amorce (les premiers nucléotides) et l'ajout de courtes séquences d'ARN sur le brin matrice.
68
La primase ajoute de ribonucléotides ou les désoxyribonucléotides?
Les ribonucléotides

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