cours 3 - outils et caractères utilisés en taxo Flashcards
Qu’est-ce qu’un caractère taxinomique?
Attribut quelconque d’un membre d’un taxon par lequel il diffère ou pourrait différer d’un membre d’un taxon différent
Comment fait-on le choix d’un caractère?
- Justification nécessaire
- Dépend de l’information qu’il procure vs sa capacité de résolution ou sa signification évolutive
Le choix d’un caractère dépend de quoi?
De l’information qu’il procure vs sa capacité de résolution ou sa signification évolutive
Qu’est-ce que la résolution dans un choix de caractère?
EX: espèces de parulines vs familles d’oiseaux
Qu’est-ce que la signification évolutive dans un choix de caractère?
Cladistique (important de savoir le caractère ancestral et dérivé) vs phénétique (pas important de savoir le caractère ancestral et dérivé)
Quelles sont les trois grandes familles de caractères?
- Caractères morphologiques
- Caractères écologiques
- Caractères biochimiques et moléculaires
Qu’est-ce que les caractères morphologiques?
- Morphologie et anatomie générale
- Développement embryologique
Quelles sont les deux sortes de données que l’on peut utiliser dans les caractères morphologiques?
- Données quantitatives
- Données qualitatives
Qu’est-ce que les caractères écologiques?
- Niche écologique et habitat
- Caractères éthologiques (régime alimentaire, mode de reproduction)
Qu’est-ce que les caractères biochimiques et moléculaires?
- Structure des protéines
- Structure des acides nucléiques (code génétique)
Quelles sont les techniques utilisées pour la structure des protéines?
- Électrophorèse
- Distance immunologique
Quelles sont les techniques utilisées pour la structure des acides nucléiques?
- Hybridation ADN-ADN
- Comparaison des séquences d’ADN et de protéines
Quelle est la technique de caractère biochimiques et moléculaire la plus utilisée?
La comparaison des séquences d’ADN et de protéines
Quelle est une ancienne méthode utilisée pour les caractères biochimiques et moléculaires?
La distance immunologique
Qu’obtient-on avec la distance immunologique?
Une similarité brute entre les protéines de deux espèces, aucun détail sur les structures des protéines (composition en acides aminés)
Quels sont les objectifs de la séquence moléculaire?
- Déterminer l’ordre d’enchaînement des nucléotides d’un fragment d’ADN donné
- Comparer le % de différences entre taxons
Est-ce que la séquence moléculaire est plus appropriée pour l’analyse phénétique ou cladistique?
Phénétique, puisqu’on observe ce qui se passe actuellement dans la génétique, on ne pas pas retourner dans le passé
Inventer un exemple de déduction des transformations d’un caractère morphologique.
Tout se joue dans l’embryologie; on détecte la progression et on peut observer le changement dans l’ordre d’un animal à l’autre
EX: os impliqués dans l’articulation de la mandibule… os de l’oreille moyenne des mammifères actuels
Quelles sont les cinq propriétés des données moléculaires?
- Caractères simples à analyser
- Grande quantité d’informations disponibles
- Indépendance des caractères
- Poids égal entre les caractères
- Accessibilité des données moléculaires
Qu’est-ce que la propriété des caractères simples à analyser des données moléculaires?
ADN = 4 choix possibles (A,C,T,G)
Acides aminés = 20 possibilités
Qu’est-ce que la propriété de la grande quantité d’informations disponibles des données moléculaires?
EX: la protéine cytochrome C possède 104 acides aminés. Chacun est traité comme un caractère; une étude morphologique classique utilise rarement autant de caractères
Qu’est-ce que la propriété de l’indépendance des caractères des données moléculaires?
Les mutations de l’ADN indépendantes; chaque site peut évoluer indépendamment des autres, tandis qu’avec la morphologie, les organes séparés constituent une même unité évolutive
Qu’est-ce que la propriété du poids égal entre les caractères des données moléculaires?
La mutation d’un nucléotide a le même poids, peu importe le site où il se produit.
Cela est impossible pour les caractères morphologiques; qu’est-ce qui a le plus d poids entre une modification de l’articulation du genou et un changement de la boite crânienne (on présume)
Quels sont les deux caractères vu en classe et que l’on compare?
- Morphologique
- Moléculaire
V/F: la génétique ne résout pas toutes les questions de phylogénie
Vrai, on ne perçoit pas toujours la différence génétique avec l’ADNmt (il y a une chance sur deux que ça fonctionne)
Quel est un défi des données moléculaires?
Les molécules évoluent à des vitesses différentes
Qu’est-ce que la vitesse relative d’évolution des données moléculaires?
Vitesse de changement d’acide aminé par année ou par génération
Quelle notion permet le choix du type de données moléculaires?
La notion d’horloge moléculaire
Qu’est-ce que la notion d’horloge moléculaire?
Les molécules sont des horloges, mais les aiguilles tournent à des vitesses inégales
Selon la notion d’horloge moléculaire, quel type de molécule utiliserait-on pour des taxons anciens?
Pas une molécule à évolution rapide; l’horloge aura faite plusieurs tours au cours de l’histoire que l’on veut retracer
Selon la notion d’horloge moléculaire, quel type de molécule utiliserait-on pour des taxons récents?
Pas une molécule à évolution lente; l’horloge n’aura pas enregistré assez de changements
Comment choisit-on le type de données moléculaires?
Ça dépend de l’évolution de celles-ci (notion d’horloge moléculaire)
Quelle est la molécule très utilisée pour la recherche phylogénétique?
L’ADN mitochondrial
Quelles sont les trois raisons qui expliquent pourquoi l’ADN mitochondrial est la molécule la plus utilisée pour la recherche phylogénétique?
- Petite molécule
- Transmission maternelle
- Taux de mutation élevé (évolution rapide)
Qu’est-ce que la raison de transmission maternelle qui fait que l’ADN mitochondrial est très utilisée pour la recherche phylogénétique?
Pas de recombinaison méiotique (pas de pollution par le père)
Les variations sont alors dues aux mutations cumulées random
Qu’est-ce que les “sneaky fuckers” d’une espèce amène dans une autre espèce lorsqu’un individu s’accouple avec un individu d’une autre espèce?
Un flux de gène incompatible
Les femelles peuvent choisir leur partenaire, plus que les mâles. Cela entraîne quoi et malgré quoi?
De l’hybridation, donc de la divergence (création d’une autre espèce), malgré la présence de flux génique
