cours 2 - cladistique et phénétique Flashcards
Quelles sont les deux méthodes de construction d’un arbre phylogénétique?
- Cladistique
- Phénétique
La classification cladistique est basée sur quoi?
La proximité évolutive
Quels sont les grands principes de la classification cladistique?
- Deux taxons apparentés ont un ancêtre (individu) commun (noeud) dans l’arbre
- C’est le reflet de l’évolution et non du degrés de ressemblance
La classification cladistique est le reflet de quoi?
De l’évolution, et non du degré de ressemblance
Qu’est-ce que la phylogénie?
Rapport de proximité évolutive
- Généaologie incomplète
Quelle est la question que l’on s pose quand on parle de phylogénie?
“Qui est plus proche parent de qui?”
Qu’est-ce que la généalogie?
Rapport d’ancêtre à descendant
Quelle est la question que l’on s pose quand on parle de généalogie?
“Qui est ancêtre de qui?”
Qu’est-ce qu’un noeud?
Déduction des innovations spécifiques de l’ancêtre présumé, par rapport au design de base
Que sont les innovations spécifiques?
Caractères dérivés
- L’invention (caractère) du moment au point de vue morphologique et de comportement
Que sont les innovations fortes?
Ressemblances non-superficielles/de profondeur venant de longues étapes évolutives
SIGNIFIANTS du point de vue évolutif
Exemple: os qui a allongé, nombre de doigts
Quelles sont les deux méthodes utilisées pour la cladistique?
- Observation
- Déduction
Qu’est-ce que le principe de parcimonie?
L’évolution est lente et procède par petites étapes partir d’un design de base:
Une innovation va donc conservé les traces de ces modifications, permettant d’en déduire l’origine à partir d’un ancêtre commun
Sur quoi le principe de parcimonie est-il fondé?
Sur le caractère improbable des changements évolutifs (la nature fait avec ce qu’elle a…)
Qu’est-ce qu’un caractère homologue?
Témoignage de la nature
Même si le caractère est différent, il est issu d’une structure de base qui témoigne de l’acquisition de ce caractère chez un ancêtre commun
Qu’est-ce qu’un caractère analogue (convergence évolutive)?
Caractère similaire non-hérité d’un ancêtre commun
- souvent superficiel
Quel est un synonyme de caractère analogue?
Homoplasie
Quels sont les deux types d’homoplasie?
- Convergence
- Réversion
Qu’est-ce que l’homoplasie par réversion?
Un descendant perd un caractère acquis ultérieurement
Que contient un groupe monophylétique?
- Contient tous les descendants d’un ancêtre commun et seulement eux
- Contient une espèce ancestrale et tous ses descendants
Que contient un groupe paraphylétique?
Contient une espèce ancestrale et seulement une partie de ses descendants
Exemple: oiseaux, reptiles et crocodiles
Quelles sont les sept étapes de l’analyse cladistique?
- Délimitation du groupe d’intérêt (humain, chauve-souris, oiseau)
- Taxons dont on veut résoudre la phylogénie - Définir un groupe de référence (poisson)
- Présente les caractères ancestraux du groupe d’intérêt
- Racine l’arbre - Déterminer toutes les combinaisons d’arbres phylogénétiques possibles
- Choix des caractères utilisés et identification de l’état ancestral (0) et dérivé (1)
- Codage de la matrice des caractères
- Évaluation de chaque arbre
- Sélection d’un arbre
Comment sélectionne-t-on le bon arbre phylogénétique?
- Calculer le nombre de transformations des caractères pour chaque arbre (nombre de pas)
- Une convergence compte pour deux pas
- Sélection de l’arme le plus économique en événements évolutifs (principe de parcimonie)
- Sélection de l’arbre
Quel est le principe de base de la classification phénétique?
La comparaison d’un grand nombre de caractères (ressemblance) doit refléter l’évolution et donc la phylogénie
