Cours 3 Nutrition et Croissance Flashcards
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Comment se définit la croissance chez les procaryotes ?
2 éléments de réponse
-La croissance est l’augmentation du nombre de cellules
-La croissance d’une cellule se termine à la division en 2 nouvelles cellules
Comment peut être représenté la croissance bactérienne ?
Quelles sont les unités de cette représentation ?
-Par une courbe de croissance bactérienne
-Log10 [Bactérienne] (bact/ml) selon le temps (heures).
Quelles sont les phases de croissance ?
4 éléments de réponse
-La latence
-L’exponentielle
-La stationnaire
-La mortalité
La phase de latence:
C’est quoi ?
Varie selon quoi ?
2 éléments de réponse
-Phase sans division cellulaire où les bactéries s’addaptent
-Varie selon l’âge et l’origine des bactéries
Que se passe-t-il durant la phase exponentielle ?
3 éléments de réponse
-La croissance bactérienne augmente
-L’uniformité de la population
-La phase est courte et il y a une relation entre la concentration et nutriments
Pour la phase stationnaire:
Il se passe quoi ?
C’est quoi qui le cause ?
2 éléments de réponse
-Le nombre de microorganismes viables reste constant (équilibre division/mort)
-Limitation des nutriments et l’accumulation de déchets
Pour la phase de mortalité:
Il se passe quoi ?
C’est quoi qui la cause ?
3 éléments de réponse
-Un arrêt de la division cellulaire et une réduction du nombre de bactéries viables
-Des dommages vont engendrer une perte de viabilité et la mort cellulaire génétique
-Des cellules viables non cultivables (VNC)
La mesure de la croissance des microorganismes
Quels sont les types ?
2 éléments de réponse
-Les méthodes directes
-Les méthodes indirectes
La mesure de la croissance des microorganismes
Quels sont les méthodes directes ?
2 éléments de réponse
-Le décompte total des microorganismes
-Décompte des unités viables
Pour la méthode de décompte total:
Quelles sont les méthodes pour compter ?
On peut compter quoi ?
2 éléments de réponse
-Compte les cellules par méthode Coulter ou Cytomètre
-Protistes, levures et Cell Mammifères
Pour la méthode de décompte total:
Quelles chambres peuvent être utilisées pour compter quel organisme ?
2 éléments de réponse
-Hémocytomètre pour les levures et cellules mammifères
-Cellule Petroff-Hausser pour les bactéries
Pour la méthode de décompte total:
Quels sont les avantages ?
2 éléments de réponse
-Facile à utiliser
-Donne des informations morphologiques/taille de la cellule
Pour la méthode de décompte total:
Quels sont les inconvénients ?
2 éléments de réponse
-Il faut une grande densité microbienne
-Ce n’est pas tous les models qui vont différencier les vivantes des mortes
Pour la méthode de décompte des unités viables:
Quelles sont les méthodes pour compter ?
2 éléments de réponse
-Dilution de milieu liquide et l’étalement sur gélose
-Les filtres de cellulose
Pour la méthode de décompte des unités viables:
Quels sont les avantages ?
Quels sont les inconvénients ?
-Les colonies proviennent seulement de cellules vivantes
-Le résultat ne donne pas un nombre direct de cellules
Pour la méthode de décompte des unités viables:
Comment peut-on obtenir le nombre de cellules ?
Multiplier le nombre de colonies par le facteur de dilution (UFC/ml)
Pour les méthodes de mesure de croissance indirectes:
Quels sont les types ?
2 éléments de réponse
-Mesure de l’Activité
-Mesure de la masse cellulaire
Pour la mesure de l’activité:
Qu’est-ce qui est détecté pour évaluer la [Microbienne] ?
3 éléments de réponse
-La consommation de substrat (C, N2, O2 etc…)
-La [Constituatnts Cellulaires] (ATP, ADN, etc…)
-L’excrétion de produits (CO2 et NH3)
Pour la mesure de la masse cellulaire:
Quels sont les types ?
2 éléments de réponse
-Poids sec
-Turbidité
Pour la mesure de la masse par poids sec:
Quelles sont les étapes ?
4 éléments de réponse
-Récolte de micro-organismes
-Lavage et dessication
-Pesé des bactéries en g/L (Mort/vivant)
-Décompte cellulaire en cellules/mL
Pour la mesure de la masse par turbidité:
Ça marche selon quel principe ?
Qu’est-ce qui pourait réduire la précision ?
2 éléments de réponse
-Selon la D.O. qui est proportionnel à la [Solution microbienne] (pour 10^6/mL et 10^8/mL)
-Si la culture est trop dense ou trop dilué, le moins que les résultats seront précisent
D.O. = Densité Optique
Pour la mesure de la masse par turbidité:
Qu’est-ce qui doit être fait préalablement ?
-On doit établir une courbe de référence des [Microbiennes] connues grâce à un spectrophotomètre
La culture continue (Ouvert):
Quelles sont les caractéristiques ?
3 éléments de réponse
-L’apport de nutriments
-L’élimination des déchets
-La phase de croissance exponentielle maintenu et [Biomasse] est constante
Pour la culture continue (ouvert):
Pourquoi cette méthode est utile pour l’industrie pharmaceutique ?
Quels sont les types de culture continue ?
3 éléments de réponse
-C’est utile, car certaines bactéries en phase stationnaire ou exponentielle fond des antibiotiques
-Le Chémostat
-Le Turbidostat
Pour la culture continue (ouvert):
Qu’est-ce que le Chémostat à de différent au Turbidostat ?
2 éléments de réponse
-Le Chémostat va garder constante la quantité de nutriments ce qui limite la croissance de microorganismes
-Le Turbidostat va ajuster la quantité de nutriments pour garder la D.O. constante
Pour les milieux de culture:
La croissance bactérienne est limité par quoi ?
Est-ce qu’il y a un nombre fix de milieux ?
2 éléments de réponse
-Elles est limitée par l’exigence nutritive des micro-organismes
-Non
Pour les milieux de culture:
Quels sont les sortes de culture ?
Pourquoi utiliser de l’agar ?
2 éléments de réponse
-Liquide (Bouillon à suspension)
-Solide (Même composition que le bouillon, mais avec de l’agar)
-Pas décomposable par les bactéries et facile à stériliser
Pour les milieux de culture:
Quelles sont les classes de composition ?
2 éléments de réponse
-Synthétiques/Définis (Composition connue et spécique au microorganisme)
-Empiriques/Complexes (Composition indéterminée qui permet la croissance de beaucoup de microorganismes)
Pour les milieux de culture:
Quelles sont les classes de l’usage ?
3 éléments de réponse
-Milieux de base (Permet la croissance de la plupart des microorganismes)
-Milieux sélectifs (Inhibe de façon sélective la croissance de certains microorganismes)
-Milieux différentiels (Contiennent des substance qui distingues les bactéries par la couleur)
Pour les besoins des microorganismes:
Quels sont les grands types
3 éléments de réponse
-Les macroéléments (besoins de grandes quantités)
-Les microéléments (moins grands besoins)
-Les éléments restreints (Besoins spéciaux)
Pour les macroéléments:
Quels sont les groupes et les éléments individuels ?
3 éléments de réponse
-Eau (HO)
-Molécules Organiques (CHONPS)
-Ions/cofacteurs d’enzymes (CaFeMgK)
Quel est la définition d’un nutriment ?
-Substance utilisée pour la biosynthèse et l’utilisation d’énergie requise pour la croissance microbienne
Qu’est-ce qui est nécessaire aux microorganismes pour survivre ?
3 éléments de réponse
-Source de carbone (Auto/hétérotrophe)
-Source d’énergie (Photo/Chimiotrope)
-Source d’électron (Organo/Lithotrophe)
Chimiotrophe = oxydation de molécules In/organique
Lithotrophe = Réduction de molécule inorganique
P.28 lire et comparer les types de nutritions et les mircoorganismes
Pour les exigences en carbone:
Quelle est l’utilité du carbone ?
Quelles sont ses sources ?
3 éléments de réponse
-Carbone est l’unité de base de toutes molécules organiques
-Source inorganique pour autotrophe (Chimio/Phototrophe utilise CO2)
-Source organique pour hétérotrophe
(Substances hydrocarburés)
Qu’est qui fait une substance non biodégradable ?
Lorsque les chimiohétérotrophe ne peuvent pas dégrader cette substance
Pour les exigences en azote:
Quelle est l’utilité de l’azote ?
Quelles sont ses sources ?
3 éléments de réponse
-Synthèse d’a.a. (protéines) , de bases azotés, de glucides etc…
-Source inorganique: Fixation de NH2, oxydation + NH3 = NO2 + oxydation = NO3, Sels d’ammonium (NH4+)
-Source organique: a.a., bases azotés etc…
Pour les exigences en Phosphore:
Quelle est l’utilité du phosphore ?
Quelles sont ses sources ?
2 éléments de réponse
-Essentiel aux a.a., phospholipides, ATP et Coenzymes
-Source inorganique PO4 2-
Pour les exigences en Souffre:
Quelle est l’utilité du Souffre ?
Quelles sont ses sources ?
3 éléments de réponse
-Essentiel pour les cystéine et autres a.a.
-Source inorganique: le sulfate (SO4 2-)
-Source organique: les cystéines
Pour les exigences en Ions inorganiques:
Quels sont leurs utilités ?
Quels sont-ils ?
2 éléments de réponse
-L’équilibre physicochimique de la cellule (intégrité des membranes)
-Na+, K+, Mg2+, Fe2+, Ca2+, Co2+, Cu2+, Mn2+, Zn2+
Pour les exigences en facteurs de croissance:
Quels sont leurs utilités ?
Quels sont-ils types de substances ?
2 éléments de réponse
-Composés essentiels à la croissance des bactéries qu’elle ne peut pas synthétiser
-a.a., Vitamines, Bases azotés (Purines/Pyrimidines)
Pour les exigences en facteurs de croissance:
Quelles sont les catégories bactériennes ?
2 éléments de réponse
-Prototrophe: Peut survivre sans ajout de Facteur de croissance en milieu minimal
-Auxotrophe: Incapable de produire les facteurs de croissance et nécissite leur ajout sur milieu minimal
Pour les exigences en eau:
Quelle est son utilité ?
Quelles sont les disponibilités de l’eau ?
3 éléments de réponse
-Constituant cellulaire principale et nécessaire comme solvant
-Liée aux molécules et non disponible aux bactéries
-Libre de molécules et disponilbe pour être absorbé
Pour les exigences en oxygène:
Quelle est son utilité ?
Quels sont les niveaux de tolérance des microorganismes ?
4 éléments de réponse
-Accepteur final de CTE pour É dans aérobique
-Oxygène toxique chez anaérobique
-Procaryote : Nécessaire, Toléré ou toxique
-Eucaryote: Toujours nécessaire
CTE = Chaine de transport des électrons
Pour la réponse à l’O2:
quels sont les 5 groupes ?
-Aérobie strict (O2 obligatoire pour CTE)
-Microaérophile (O2 à faible pression 2-10%)
-Anaérobie facultatif (Croitre en anaérobie ou aérobie)
-Anaérobie aérotolérant (En O2, croissance lente comparé à Facultatif, mais ne tue pas)
-Anaérobie strict (O2 va tuer et fait l’anaérobie avec Nitrate ou Sulfate)
Quelle est la définition longue de la fermentation ?
Quel oragnisme en fait ?
-Respiration anaérobique qui utilise un composé organique comme accepteur final dans la CTE
-Levures
Qu’est qui rend l’O2 toxique
Qu’est qui manque aux Anaérobique strict ?
3 éléments de réponse
-La formation de radicaux libres (OH-)
-Dismutation par Superoxyde dismutase (SOD)
-Catalyse par catalase
Comment le système GasPak rend possible la croissance des bactéries anaérobiques ?
-Le GasPak va produire du H2 qui va transformer le O2 de l’air en H20
Dans le cas d’un bouillon Thioglycolate enssemencé des 5 types de bactéries:
Où seront chque type ?
5 éléments de réponse
-Aérobies stricts à la surface
-Microaérophiles proche de la surface
-Anaérobies facultatifs uniformément répendu
-Anaérobies aérotolérants répendu plus vert le fond
-Anaérobies stricts juste au fond
Quels sont les 3 facteurs physiques qui influencent la croissance ?
-La température
-L’acidité
-La pression osmotique
Pour la température:
Quel est son effet sur les microbes ?
Pour la croissance, quels sont les étalons ?
4 éléments de réponse
-Elle affecte les réactions d’enzymes (métabolisme)
-Temp minimale (La plus basse pour croitre)
-Temp. optimale (Taux de croissance maximal)
-Temp.maximale (La plus haute pour croitre)
Quels sont les 5 types de bactéries selon leur température optimale ?
-Psychrophile (moins 10ºC)
-Psychotrophe (20-30ºC)
-Mésophile (20-45ºC)
-Thermophile (55-65ºC)
-Hyperthermophile (80-133ºC)
-Phile = Aimer / Trophe = manger
-Psychro = Froid
-Méso = moyen
-Thermo = Chaud
Pour le pH:
Quel est son effet sur les microbes ?
Pour la croissance, quels sont les étalons ?
4 éléments de réponse
-Affecte l’activité des enzymes et des pH trop acide ou alcalin vont les inactivés
-pH minimal
-pH optimal
-pH maximal
Quels sont les 3 types de microorganismes selon leur pH optimale ?
4 éléments de réponse
-Acidophiles (pH 0 à 5.5)
-Neutrophiles (pH 5.5 - 8.0)
-Alcalophiles (pH 8.5 - 11.5)
Qu’est-ce qui est préféré par les bactéries et mycètes ?
En générale il y a plus de Acidophiles ou Alcalophiles ?
-Mycètes (5 - 6) et Bactéries (6 - 7) sont neutrophiles
-Il y plus d’acidophiles
Pour la pression osmotique:
Quel est son effet sur les microbes ?
2 éléments de réponse
-Hypotonique l’eau entre et la cellule gonfle
-Hypertonique l’eau sort, il y a plasmolyse et moins d’eau libre
Pour la pression osmotique, quels sont les étalons ?
3 éléments de réponse
-Osmotolérant (Tolère haute osmose, 5 à 20 % NaCl)
-Osmophile (Requiert haute osmose et vont croitrent en hypertonique)
-Halophile (Requiert haute [NaCl]
osmose = pression
halo = sel
Qu’est-ce qu’un composé osmocompatilble/régulateur ?
donner des exemples
2 éléments de réponse
-Ajuste le niveau d’eau du cytoplasme sans affecter les réactions
-Glycine, bétaine ou glycérol