Cours (3) Métabolisme des acides aminés Flashcards
Est-ce que les acides aminés peuvent être emmagasinés?
Non
Comment sont obtenus les acides aminés? (3)
Par l’alimentation Biosynthèse (anabolisme) Dégradation (catabolisme) des protéines
D’où provient la source la plus importante d’azote?
De notre alimentation (diète)
La catabolisme des acides aminés fait partie du ________ du nitrogène.
Métabolisme
L’azote quitte le corps sous quelles formes (3) ?
Sous forme d’urée, d’ammoniac et de d’autres composés du métabolisme des acides aminés.
Quelles sont les sources des acides aminés?
- Dégradation des protéines - Alimentation - Synthèse d’acides aminés non-essentiels
Les acides aminés sont utilisés pour faire quoi?
- Synthèse de protéines - Former des précurseurs de composés contenant de l’azote - Être transformé en glucose, glycogène, acides gras et corps cétoniques.
Vrai ou faux : Les protéines du corps sont continuellement renouvelées?
Vrai
Vrai ou faux : La quantité de protéine n’est pas maintenue constante dans le corps.
Faux. La quantité de protéine est maintenue constante dans le corps.
Le niveau protéique intracellulaire est déterminé par… (2)
Rythme de synthèse Rythme de dégradation
Quelle masse de protéines sont dégradées et re-synthétisées chaque jours?
300 à 400g
Vrai ou faux : Ce n’est pas toutes les protéines qui ont une demi-vie.
Faux. Toutes les protéines ont une demi-vie.
Que signifie une courte/longue durée de demi-vie pour une protéine?
Courte = hautement régulée Longue = très stable
Quels sont les deux systèmes responsables de la dégradation des protéines?
- Protéasome - Dégradation lysosomale
Le protéasome est régulé par _____
L’ubiquitine
Est-ce que les deux systèmes responsables de la dégradation des protéines sont dépendants de l’ATP?
Oui
Le protéasome dégrade principalement ____
Les protéines cytologiques
La dégradation lysosomales dégrade principalement ____ et ____
Les protéines extracellulaires Les protéines à la surface de la membrane plasmique
Quel est le pH à l’intérieur des lysosomes?
4,5 < pH < 5,5
Les lysosomes sont issus de quels endroits? (2)
-Appareil de Golgi -RE
La membrane des lysosomes est riche en ___ (3)
- Pompes à proton 2. Protéine LAMP 3. Phosphatases acides
Vrai ou faux : Les lysosomes contiennent des hydrolases.
Vrais
Quels sont les deux types de digestion effectuées par les lysosomes?
Hétérophagie Autophagie
Qu’est-ce que l’hétérophagie?
Dégradation de composés exogènes (fusion avec les endosomes).
Qu’est-ce que l’autophagie?
Renouvellement des composés cellulaires (fusion avec un autophagosome pour former un autophagolysosome).
QSJ : Protéine régulatrice trouvée dans presque tous les tissus?
Ubiquitine
L’ubiquitine est activée par combien d’étapes enzymatiques?
trois
Vrai ou faux : L’ubiquitine peut être dégradée par les protéasomes.
Faux. L’ubiquitine ne peut pas être dégradée par les protéasomes.
De combien d’acides aminés est formé l’ubiquitine?
76 acides aminés
Par quoi est influencé les temps de demi-vie des protéines?
Par la nature du résidus N-terminal
La sérine ou la méthionine signifie un long ou court temps de demi-vie?
Long
L’aspartate ou l’arginine signifie un long ou court temps de demi-vie?
Court
Vrai ou faux : La séquence d’acide aminé donne un indice sur le temps de demi-vie.
Vrai
Vrai ou faux : L’urée est la forme majoritaire d’excrétion des acides aminés.
Vrai
L’urée est produite dans le foie et transportée via ___ vers ____ pour être excrétée sous forme d’urine.
le sang les reins
Combien de % de l’urée diffuse du sang vers l’intestin où elle est clivée en CO2 et en NH3 par les bactéries?
20%
QSJ : Permet la formation d’une liaison entre les résidus glycine de l’ubiquitine et les résidus lysine de la protéine cible
Ubiquitine ligase
Comment on peut détecter les protéines qui devront être dégradées par le protéasome?
Elles sont marquées à l’ubiquitine, c’est comme ça que le protéasome va les reconnaître
QSJ : Complexe protéique dont la principale fonctione est de dégrader les liens peptidiques
Protéasome
À quoi ressemble un protéasome
Complexe en forme de tonneau dont le centre est séparé du cytosol
À quoi servent les coiffes que nous retrouvons sur les protéasomes? (3)
Regule l’entrée des protéines
Fixent les protéines
Déplient les protéines
Les coiffes contiennent combient d’ATPase?
6
Les anneaux intérieures du protéasome sont composées de quoi?
des enzymes responsable de la dégradation
La dégradation des protéines effectuée par le protéasome est catalysée par quoi?
Protéases
Qu’est-ce qu’on observe à la sortie du protéasome
Petits peptides (fragments de 7-8 acides aminés)
À l’aide d’un schéma expliquer comment un protéasome fonctionne.
Vrai ou faux : Comme l’ubiquitine n’est pas dégradée par le protéasome, elle pourra être recyclée.
Vrai
Comment s’appele le processus de marquage des protéines par l’ubiquitine
ubiquitinylation
Vrai ou faux : On retrouve 30 000 protéasomes par cellules
Vrai
Vrai ou faux : La dégradation des protéines se fait aléatoirement
Faux
Pourquoi les protéines alimentaires ne sont pas directement absorbées par le corps?
Car elles sont trop grosses
Les enzymes ____ sont responsables de la dégradation des protéines
protéolytiques
Les enzymes protéolytiques responsables de la dégradation des protéines sont sécrétées par quels organes? (3)
Estomac
Pancréas
Intestin grêle
L’HCl est sécrété par quel organe?
Estomac
L’HCl rend le ___ ___ très acide
liquide gastrique
Quel effet le pH de l’estomac à sur les protéines?
Dénaturation des protéines à cause du pH très acide
Quelle enzyme est activée par le pH acide de l’estomac?
Pepsine
La pepsine est acitvée par quoi?
pH acide de l’estomac
Que fait la pepsine?
Dégrade les protéines en acides aminés libres et en longs fragments peptidiques
À partir d’un schéma, décrire le chemin qu’emprunte les protéines alimentaires.
Lors de la digestion des protéines alimentaires, les longs peptides produits dans l’estomac poursuivent leur dégradation dans l’intestin grêle par l’intermédiaire des ___ ___
protéases pancréatiques
Qu’est-ce qu’on va observer sur l’absorption des protéines si on a une diminution du nombre de sécrétions pancréatiques
Diminution d’absorption des protéines
Combien de transports sont impliqués pour l’absorption des acides aminés et des petits peptides par les entérocytes
deux
Où les peptides sont dégradés en acide aminé libre? Et par quelle enzyme?
Dans le cytosol
Peptidase intracellulaire
Quels sont les deux types de transport observés pour l’absorption des acides aminés et des petits peptides par les entérocytes?
Pour les Di/Tri peptides : Symport grâce au gradient de H+
Pour les acices aminés libre : Symport grâce au gradient de Na+
À partir d’un schéma, décrire les deux transports (acides aminés libres et petits peptides) qui permettent l’absorption de ceux-ci.
(Après les transports symport) Les acides aminés sont relachés où? Et quel type de transport est utilisé? Est-ce que ce type de transport nécessite de l’ATP?
Veine porte
Diffusion facilitée (transport passif)
Non, pas besoin d’ATP
Lorsque les acides aminés librent arrivent dans la veine porte, ils vont où par la suite?
Les acides aminés ont deux choix :
- Foie pour être métabolisé
- Circulation sanguine
Vrai ou faux : La concentration intracellulaire en acides aminés est beacoup plus importante que la concentration extracellulaire
Vrai
Quel type de transport permet aux acides aminés d’entrer dans les cellules?
Est-ce que ce type de transport nécessite de l’ATP? Pourquoi?
Transport actif
Oui, car on est contre le gradient
Vrai ou faux : Il existe au moins 7 systèmes de transports pour les acides aminés. De plus, certains transports sont spécifiques à certains acides aminés.
Vrai
À quoi sert le groupement NH2 des acides aminés?
Prévient leur dégradation
Quelle étape est nécessaire pour pouvoir effectuer le catabolisme des acides aminés?
Clivage NH2
Quelle est la première étape du catabolisme des acides aminés (nom de la réaction + qu’est-ce qui se produit).
Cette réaction est catalysée par quelle enzyme?
Où on retrouve cette enzyme?
Transamination
Transfert du groupement amine de l’acide aminé vers l’a-cétoglutarate, donc on forme le glutamate
Transaminase
Cytosol + Mitochondrie de tous les tissus
Est-ce que les transamidases sont spécifiques à certains acides aminés?
Oui spécifique à un ou quelques acides aminés
Quel groupement les transaminases doivent avoir?
pyridoxal-phosphate
Les transaminases ont un groupement pyridoxal-phosphate, elles agissent comme __
coenzyme
Pyridoxal phosphate = dérivé ___
vitamine B6
Vrai ou faux : On peut doser l’activité de la transaminase
Vrai
Vrai ou faux : La concentration normale des transaminases dans le sang est assez élevée
Faux.
[transaminase] élevée = anormal
[transaminase] faible = normal
Vrai ou faux : Un trauma physique ou une maladie peut augmenter la lyse cellulaire et faire augmenter les niveaux de transaminases plasmatiques
Vrai
La désamination oxydative des acides aminés est catalysée par quelle enzyme?
Qu’est-ce qui est libéré suite à cette réaction?
Dans quels organes ces réactions s’effectuent en majeure partie?
Glutamate déshydrogénase
Groupement amine NH3 (ammoniaque libre) + a-cétoglutarate
Foie + Reins
Quel est le seul acide aminé qui peut subir la désamination oxydative?
Glutamate
La glutamate déshydrogénase peut utiliser ___ ou ___ comme coenzyme pour effectuer la désamination oxydative
NAD+
NADP+
Régulateur allostérique de la glutamate déshydrogénase
- ___ inhibiteur de la glutamate déshydrogénase
- ___ activateur de la glutamate déshydrogénase
- GTP
- ATP
L’ammoniaque produit dans les tissus périphériques sera acheminée où? Et elle sera convertie en quoi?
Foie
Urée
Vrai ou faux : L’ammoniac est un composé toxique
Vrai
Comme l’ammoniac est toxique, pour se rendre au foie, elle devra utilisé un mécanisme non toxique.
Donner deux mécanismes.
- Formation glutamine
- Transamination du pyruvate pour former l’alanine (cycle glucose-alanine)
Vrai ou faux : L’urée représente jusqu’à 90% des composés contenant de l’azote dans l’urine
Vrai
Où est produite l’urée?
Foie
Donner la réaction qui à partir de l’ammoniac, on forme de l’urée. Est-ce que cette réaction nécessite de l’ATP?
NH3 + HCO3- + aspartate –> Urée + Fumarate
Oui 3 ATP
Le cycle de l’urée est composé de combien de réactions?
5
Lors du cycle de l’urée, est-ce que certaines réactions se produisent dans la mitochondrie? Si oui, quelles réactions?
Oui
Réaction 1 et 2
Nommer les 5 réactions du cycle de l’urée
- Formation carbamyl-P
- Formation citrulline
- Synthèse arginosuccinate
- Clivage arginosuccinate
- Clivage arginine
Quelles étapes du cycle de l’urée nécessite de l’ATP?
Réactions 1 et 3
Décrire en détail les 5 réactions du cycle de l’urée
Quelle est l’étape limitante du cycle de l’urée? Pourquoi?
Première étape, car elle demande beaucoup d’énergie
Dans les reins l’urées est ___ et ___ dans l’urine
filtrée
excrétée
Vrai ou faux : L’urée est excrétée en partie dans les fèces sous forme d’allantoïne
Vrai
