cours 3 : le phylum Ascomycota Flashcards
Quels sont les sous-phylums d’Ascomycota?
Sous-Phylum Taphrinomycotina
Sous-Phylum Sacchaomycotina
Sous-Phylum Pezizomycotina
Quelle phylum cela s’apparente?
Caractérisés par la formation, d’asques (sporange sexué)
Les ascospores ont une formation endogène
Groupe de champignons le plus important et le plus grand
Plus de 65% du nombre total des champignons
3,200 genres,
La multiplication asexuée est plus fréquente
Ascomycota
Organe sexué qui produit des spores, qui est endogène (différence avec baside qui est exogène!)
Quel est-il?
Asque
Vrai ou faux :
Les ascomycètes ont un septa avec micropores (permet le passage du noyau d’un compartiment à l’autre)
Groupe moins évolué que les basidiomycètes à dolipore (processus différent)
vrai
Vrai ou faux : ascomycètes
La formation des septa est liée à la division des noyaux, elle est mise en place dépendamment.
La formation des septa n’est pas liée à la division des noyaux, elle est mise en place indépendamment.
faux
Le pore des septa d’environ 0,3 à 0,5 µm.
Au niveau des hyphes (=filaments) âgées, les pores sont obturés. *formation de septa imperméable pour délimiter la partie vivante de celle morte.
Quel type de septa?
à micropore
Est-ce que le groupe des ascomycètes à micropore est moins évolué que les basidiomycètes à dolipore (processus différent)?
Oui
Quels sont les rôles des septa?
rigidité des hyphes
résistance à la pression de turgescence
évite les pertes de cytoplasme en cas de blessure
Chez les ascomycètes, les filaments (septas) permettent de développer des structures qui ne sont pas là chez les espèces primitives :
Plexus qui se complexifie pour donner des pseudo-tissus.
C’est quoi plexus et pseudo-tissus?
Plexus: simple entrelacs d’hyphes
Pseudo-tissus: stromas, sclérotes, rhizomorphes, sporophores (multiplication asexuée)
Qu’est-ce qu’un slérote?
Sclérote : structure de conservation (paroi imprimées de mélanine pour résister aux intempéries)
Différenciation du mycélium, définir :
stromas, sclérotes, rhizomorphes, sporophores (multiplication asexuée)
Stroma : Structure primitive, ensemble de filaments entremêlés, les articles mycéliens demeurent allongés, puis par évolution, deviennent globuleux ou polyédriques, l’aspect devient de type tissulaire = plectenchyme.
Sclérote : Paroi deviennent très dure et imperméable, la cohésion des hyphes sont renforcées par un dépôt de ‘ciment’, à la périphérie les hyphes sont colorées par des anthocyanes (protection contre les UV). Rôle de résistance, chez l’ergot de seigle, le sclérote permet aussi la dissémination.
Rhizomorphe : En forme de racines, sont des cordons mycéliens dont les hyphes centrales se sont spécialisées dans le transfert de liquide.
Sporophore : Certains appareilles conidiogènes sont d’autres exemples de pseudotissus
Quel est le cycle de vie général des ascomycètes?
Prédominance de la phase haploïde chez presque tout
les ascomycètes, spores mitotiques
Caryogamie, Phase diploïde (2N) de courte durée, formation de dicaryon, puis méiose.
Quelle est la différence majeure dans le cycle de vie des basidiomycètes en comparaison aux ascomycètes?
Différence majeure : caryogamie et la phase dicaryotique dominantes chez les basidiomycètes vs haploïde dominante chez les ascomycètes.
Qu’est-ce que le cycle de vie d’un ascomycète (Pézize)
- nombre de noyaux méiose et nombre d’ascospores
2 individus sexuellement compatibles (MAT ) ; caryogamie et formation du zygote (2n)
Méiose (4 noyaux) dans l’asque : chacun se divise pour donner au total 8 ascospores!
Quel est l’avantage de la division par mitospore?
le plus rapide et le moins énergivore
Vrai ou faux :
Chez les Ascomycota : il n’y a pas de plasmogamie pour la fructification
faux
Quel sont les 3 types de la reproduction sexuée, existent chez les ascomycètes?
Trichogamie
Autogamie
Périttogamie
Expliquer Trichogamie, autogamie et Périttogamie, dans la reproduction sexuée des ascomycètes …
Trichogamie : Morphologie qui différentie les gamétanges mâle et femelle
Fécondation : le trichogyne fusionne avec le spermatocyste.
Autogamie : autofécondation, les spermatocyste ne peuvent plus s’accoler au trichogyne : les noyaux du gamétocyste s’apparient pour former des dicaryons
Périttogamie : rencontre de deux filaments haploïdes compatibles issus de spores distinctes (hétérothallisme), fusion des filaments (pas s’ascogones ni de anthéridie) : pas de différenciation.
Comment appelle-t-on les gamétanges mâle et femelle?
gamétange femelle appelé ascogone (forme une structure mycélienne = trichogyne (du grec trichos = poil)).
gamétange mâle appelé anthéridie, structure la plus complexe
Reproduction sexuée (morphologie différentiée: trichogamie)
Comment se passe la différenciation d’un appareil reproducteur ?
Noyau de anthéridie (spermatocyste) migre et formation du dicaryon : migre vers les cellules apicales pour former le zygote, méiose et subir une autre mitose
Vrai ou faux : ascomycètes
La caryogamie se passe généralement dans la cellule apicale! Il y a formation des asques, qui constitue la partie fertile
vrai
Système d’incompatibilité sexuelle des ascomycètes :
2 types…
incompatibilité homogénique et hétérogénique
homogénique : Contrôle la reproduction sexuée (mating)
Favorise les croisements entre individus différents. Elle est contrôlée par un gène (Mat) avec un seul locus et deux allèles (Mat1-1 et Mat1-2) Mat1-1 et Mat1-2 sont deux séquences différentes mais occupent le même site dans le génome (idiomorphes). Uniquement les thalles avec séquences différentes peuvent fusionner
hétérogénique : Système végétatif, il faut qu’il y ait une diversité, mais pas trop différent pour pouvoir faire la reproduction sexuée (espèce/sous-espèces pareilles), par les gènes Vic ou Het
Compatibilité sexuelle : expliquer
1. Hétérothallie ou auto-incompatibilité
- Homothallie ou auto-compatibilité (1 seul individu)
- Homothallie secondaire (rare)
- (individus différents) Présent entre thalles ayant différents types de Mat
- Reproduction sexuée présente dans un thalle simple; mais les deux allèles idiomorphes sont présent dans le même noyau
- Thalle avec deux types de noyaux
Comment se passe le système MAT chez la levure boulangère?
MAT sur le chromosome III, Système unifactoriel
2 allèles : a et alpha
chaque individu porte les 2 idiomorphes (les 2 gènes) mais un seul locus est fonctionnel : peut changer de sexe par recombinaison homologue en fonction de la population.
Libération de phéromones
Comment se passe la transmission du signal pour le système MAT chez la levure boulangère?
transmission du signal par transmission du signal par un complexe de protéine (kinase et phosphorylation) jusqu’au facteur de transcription Ste pour la reproduction sexuée. (fonctionnels que si les phéromones sont reconnues par le récepteur)
Si on a pas de signal : le facteur de transcription est bloqué
Quels sont les types d’asques ?
Prototuniqués
Unituniqués
Expliquer les types d’asques prototuniqués et unituniqués
Prototuniquées : Asques avec paroi mince, sphères retrouvées en nombre de 8 (dans l’Asque), libération des ascospores par la destruction de l’Asque (retrouvée chez les ascomycètes sous forme de levure)
Unituniquées : asques plus allongées et une seule paroi. Structure spécialisée de la libération des spores (opercule apical) ;(morphologie différente)
Ouverture de l’opercule :
Plusieurs morphologies pour la libération de spores selon les espèces et le type de libération (actif vs passif)
Quel est le plus aérodynamique possible?
actif
Asque bitunicatée, c’est quoi?
2 parois : Les parois (externe et interne) se séparent à la libération des ascospores Degré d’évolution intermédiaire, 2 membranes pour une meilleure protection. Le sac se déchire pour libérer les ascospores
Fructification sexuée : 4
Quels sont ces types d’ascocarpes?
Apothétie : plus complexe et évoluée (structure ouverte chez la majorité des ascomycètes)
Périthèce : opercule qui communique avec l’extérieur (ouverture vers l’extérieur)
Pseudothèse : renfermée et renforcée, asques libres
Cleitothèce : renfermé et renforcé, asque fixées à la base (le moins évolué), oïdium pour conservation
Multiplication asexuée chez les ascomycète, fait par l’appareil conidiogène, vrai ou faux
La multiplication asexuée n’est pas prédominante chez les ascomycètes, elle est réalisée par des spores uninucléées = conidies provenant du bourgeonnement de sporocystes spécialisés appelés phialides.
faux, elle est prédominante
Où sont retrouvées les phialides?
Les phialides sont souvent groupées à l’extrémité de pédoncules = conidiophores
Phialide : bourgeonnement des sporocystes.
Vrai ou faux :
quand les conditions sont défavorables, le noyau entre en méiose et on fait la reproduction sexuée (diploïde)
vrai
Quel est le mode de formation des conidies?
Par bourgeonnement, le noyau est en perpétuelle division pour former des chaînettes
La formation de chacune des spores s’accompagne de l’individualisation d’une nouvelle paroi interne qui amène la rupture de la paroi externe primitive
Ascomycètes phytopathogènes :
vrai ou faux :
Font des organes de fructification asexuée (en nombre de 4)
vrai étrangement
Nomme les principaux organes de fructification asexués au sein desquels les conidies sont produites chez les ascomycètes
- pycnide (contient des conidies) ressemble à la morphologie du périthèce (contient les asques)
- acervule (forme des conidies et le conidiophore est court)
- Corémie : conidiophore est plus long (ressemble à un bouquet de persil) :
- sporodochium : Floraison à la surface
Vrai ou faux.
La classification des Ascomycota est fondée sur l’existence ou non d’un basidiocarpe, sa morphologie et sont mode de développement
faux :
fondée sur l’existence ou non d’un sporophore (ascocarpe)
Quels sont les 3 sous-filum (mycotina) des ascomycètes ?
APPARITION DES SEPTA À MICROPORE vs basidiomycota;
- Sous-Phylum Taphrinomycotina
- Sous-Phylum Sacchaomycotina ; Absence d’ascocarpe, asques sans opercule
- Sous-Phylum Pezizomycotina : Présence d’ascocarpe, asques avec opercule, septa à micropores, formation de conidie
Les Phylum : Ascomycota et Basidiomycota font partie de quel règne?
Eumycota
Vrai ou faux ; Sous-phylum Taphrinomycotina
Schizosaccharomycetales = levure boulangère
faux, celle de bière
Vrai ou faux; Genre Schizosaccharomyces,
Espèce Schizosaccharomyces pombe = division cellulaire par bourgeonnement)
Faux : Saccharomyces serevisiae (levure boulangère oui)
S. pombe ; c’est une levure fissipare (division cellulaire par fission). Lors de la mitose, les deux cellules filles se séparent à la suite de la formation d’une paroi transversale dans la cellule mère.
Cycle de vie de Schizosaccharomyces pombe (levure de bière)
2 phases : haploïde et diploïde
Asque = seulement 4 ascospores, division par fissiparité.
cellules compatibles font la plasmogamie, zygote
Quand les conditions deviennent défavorables :, réplication sexuée (méïose) : on a besoin de 2 individus, plasmogamie, formation du zygote
4 ascospore dans l’asque
Espèce Taphrina deformans, dans l’Ordre Taphrinales :
Vrai ou faux :
sont des pathogènes des plantes, qui causent des déformations des organes. Produisent des conidies et des asques nus sur la surface des tissus infectés des plantes.
Typiquement, ces maladies causent des enflures et déformations des feuilles.
vrai
par exemple : la pochette du pommier, la cloque du pêcher et la cloque des feuilles de chêne
Type de reproduction sexuée primitive
Ascospores désorganisées, Déformé : apparition des asques et les ascopores (8) par asque
Symptômes de la maladie : des enflures et déformations des feuilles et des fruits du pêcher
Quelle espèce ont parle ici?
Taphrina deformans
Ordre Protomycetales, espèce Pneumocystis carinii
Maladie difficile à guérir, elle cause quoi?
est un type de pneumonie qui est causée par P. carinii. La pneumonie est une infection qui touche les tissus du poumon. À mesure que l’infection progresse, les alvéoles se remplissent de liquide.
En quoi l’espèce Neolecta vitellina constitue une exception dans le sous-phylum Taphrinomycotina ?
Seul capable de faire une fructification macroscopique dans les Taphrinomycotina grâce aux données moléculaires
Dans le genre Neolecta du sous-phylum Taphrinomycotina :
vrai ou faux :
Des Asques qui tapissent la surface fertile et présence d’hyphes ascogènes et libération des ascospores
vrai
Qu’est ce que les Deuteromycetes ont de spéciale quant à la phylogénie des ascomycètes?
Absence de la reproduction sexuelle (Anamorphes)
Analyse phylogénétique a permis de classer les Deutéromycètes vers les Ascomycètes même sans morphologie sexuelle
Sous-phylum Saccharomycotina : classe Saccharomycetes
Vrai ou faux :
Les levures sont présentes en hiver dans le sol où elles mènent une vie ralentie. En été, les conditions favorables les font se multiplier : emportées par le vent, les poussières du sol, et les insectes, elles se déposent sur les fruits mûrs où elles se développent.
vrai
Levures qui tapissent naturellement la surface des fruits: blanchâtre
comment s’appelle-t-elle?
pruine
Qu’est-ce que les Blastospores chez les levures?
Les blastospores sont des éléments levuriformes se multipliant continuellement par voie asexuée en bourgeonnant : le stade mycélium est réduit à une succession de blastospores, souvents disposé en chaînettes.
Vrai ou faux :
La taille des blastospores est très variable dans la même espèce (en fonction des conditions et l’âge de la culture)
Le bourgeonnement a lieu n’importe quand.
faux :
Le bourgeonnement n’a lieu que lorsque la cellule a atteint une taille optimale propre à chaque espèce
Chez les blastospores :
Chaque fois qu’elle bourgeonne : laisse des cicatrices
vrai
Les levures représentes des caractères physiologiques remarquables, quels sont- ils? (5)
Fermentation: développement abondant sur milieux sucrés, en anaérobiose, produisent de l’alcool et le CO2
Croissance très rapide
Présence de plusieurs copies d’ADN circulaires (2 µ) comme des plasmides chez les bactéries (S. cerevisiae possède de 50 à 100)
Ces ADN circulaires sont capable d’incorporer des fragments de gènes de 400 Kb et plus, très utilisés dans le clonage (YAC = Yeast Artificial Chromosome)
S. cerevisiae est utilisé en transgénèse (fabrication d’un vaccin contre l’hépatite B, synthèse de l’insuline…)
Vrai ou faux :
Les levures sont employées depuis très longtemps comme agents de fermentation des moûts ou des pâtes amylacées
vrai
exemple :
Saccharomyces ellipoideus et S. pasteurianus => vinification
S. cerevisiae => brassage de bière, boulangerie…
S. apiculatus => fabrication du cidre à partir du jus de pommes
S. minor => panification…
Mycoderma aceti => fabrication du vinaigre
Divers Saccharomyces, Hansenula et Pichia => obtention du cacao, du thé, du café…
Exemple d’effets négatifs des levures (2 exemples)
Exemples d’effets indésirables des levures:
Mycoderma aceti est une levure aérobique, qui forme un voile à la surface des liquides et transforme l’alcool en acide acétique (vinaigre), eau et CO2.
Altération des denrées alimentaires (viandes, fruits, sucreries…) souvent un goût désagréable s’ajoute.
La reproduction asexuée est prédominante (sous deux formes haploïde (a et alpha ) et diploïde)
La reproduction sexuée à lieu souvent quand les conditions de vie deviennent défavorable
c’est la reproduction de qui?
Des levures
Classification et identification des espèces :
Tests moléculaires : techniques utilisées qui consiste a avoir un profil du chromosome (permet d’identifier les souches et les espèces)
- Apparence microscopique
Unicellulaire ou bourgeonnement
Taille et forme des cellules
Bourgeonnement multilatéral ou bipolaire
Forme, structure et mode de formation des asques
Forme de l’ascospores - Tests physiologiques (~91 différent tests)
Fermentation de différent sucres
Test d’assimilation (source de carbone et d’azote)
Vitamine, croissance à 37°C… - Tests moléculaires
Electrophorèse en champs pulsé
Phylogénie (homologie des séquences d’ADN
Genre Candida
Quelle maladie cause-t-elle?
Une infection mycotique primaire ou secondaire provoquée par des membres du genre Candida. Les manifestations cliniques peuvent être aiguës, subaiguës ou chroniques à épisodique. La participation peut être localisée à la bouche, gorge, peau, cuir chevelu, vagin, doigts, ongles, bronches, poumons, ou l’appareil gastro-intestinal, ou bec
Tous sont omniprésents et se produisent naturellement sur des humains
Chez Candida albicans, quelle est l’exception si on compare aux autres levures?
Levure diploïde : exception
C. albicans se multiplie uniquement par voie asexuée sous forme diploïde
vrai ou faux
Candida albicans n’a pas la possibilité de faire la reproduction sexuée
faux
Presque toujours en reproduction asexuée : mais elle contient tous les gènes pour la reproduction sexuée (mais on ne l’a jamais prouvé)
Sous-phylum Pezizomycotina :
vrai ou faux :
Ensemble monophylétique
Les hyphes s’agrégent entre elles pour former un sporophore, Septa à micropore, le pore contient des inclusions lipoprotéiques = corps de Woronin
Phase dicaryotique est réduite
Phase levuriforme est de moins en moins fréquente
vrai
Qu’est-ce qu’une apothétie?
Apothécie : appareil producteur d’ascospores en forme de coupe. L’intérieur de la coupe, ouvert à l’air libre, est tapissé d’un hyménium constitué d’asques
Qu’est-ce que la périthèce ?
Périthèce : apothécie fermée
Qu’est-ce que les asques bituniqués
Asques bituniqués de type fissituniqué dont les parois interne et externe se séparent à maturité
Qu’est-ce que la pseudo-thèce?
Pseudothèce : pour la dispersion, structure ouverte
Chez Tavelure
nomme 3 classes de Pezizomycotina
*Ascomycètes à apothécie
Pezizomycetes
Leotiomycetes
Lecanoromycetes
Classe Pezizomycetes :
Vrai ou faux :
Asques unituniquées - operculées, Multiplication : conidies, mais beaucoup d’espèces n’en produisent pas, Fréquemment hétérothalique,
vrai
Vrai ou faux :
Les Pezizales produisent les plus grands organes de fructification des Ascomycètes et beaucoup sont mycorhiziennes
vrai
Vrai ou faux :
Evolution de l’organe de fructification complexe de la morille et de l’ascocarpe fermé de la truffe ne peut pas s’expliquer à partir d’une apothécie typique de la pézize.
faux, elle s’explique par cela
Pourquoi les morilles sont récoltées au printemps?
Morilles prennent naissance à partir d’un sclérote : c’est pourquoi il est récolté au printemps
Famille Tuberaceae :
Fructification hypogée : protection des apothécies
vrai ou faux :
comprend les espèces de truffes
vrai
Qu’est-ce qui distingue la truffe chinoise de celle de Périgord?
Chinoise : il y a du blanc à l’intérieur vs Truffe noire du Périgord est noire à l’intérieur
Classe Leotiomycetes (sous-phylum Pezizomycotina)
Ordre Helotiales
vrai ou faux :
comprend les familles de Geoglossaceae, Famille Helotiaceae (champi bleu trop beau) et Sclerotiniaceae (formation de sclérote)
vrai
Qu’elle espèce forme un agent de la tache goudronneuse de l’érable
Espèce Rhytisma acerinum,
Quelle classe des Ascomycètes forment des lichens?
Classe Lecanoromycete
Symbiose avec des cyanobactéries
Pezizomycotina : classe Sordariomycetes
Ascomycètes avec périthèces, comment sont les asques ?
Asques unituniquées - inoperculées
Asques fixés à la base : garde l’ordre des ascospores.
Classe Sordariomycetes, genre neurospora
En quoi l’utilisation de cette espèce constitue un avantage en génétique?
Avantage pour la génétique mendélienne : Peut avoir la fructification et plusieurs ascospores, plusieurs périthèce par mycélium. Échange génique plus efficace.
Quel est le cycle de vie de Neurospora crassa?
Multiplication : micro- et macrononidies
Champignon hétérothallique
Ascoma : périthèce avec hyménium
*Culture sur milieu pauvre et avec lumière : impliqué dans la fructification
Genre : Fusarium, Espèce Fusarium oxysporum
Conidies : grandes (sous forme d’un fuseau)
Il s’attaque à quoi?
Redoutable pathogènes qui attaque le système vasculaire. Mycotoxine de couleur rougeâtre
s’attaque à la tomate, coton et banane
Classe Eurotiomycetes, Ordre Erysiphales
- comment sont les asques
- comment est le type ascocarpe pour la fructification sexuée?
Ascomycètes avec cleistothèces
Asques prototuniquées,
Genre Erysiphe
Les agents des oïdiums ou des blancs :
Le feuillage est quel couleur et est-il possible de l’isoler?
Feuillage blanc : peut pas les isoler, car il faut qu’ils passent par la phase parasitaire
Classe Eurotiomycetes
Penicillium
comment se fait la reproduction sexuée et asexuée?
Reproduction asexuée par des conidies formées sur un conidiophore, donnant la couleur verte-grisâtre à la moisissure.
Reproduction sexuée (très rare) par cleistothèces qui contiennent des asques.
Qu’est-ce qu’un conidiophore?
Filament qui porte la structure qui produit les conidies
Chez Penicillium :
mettre en ordre interne vers externe de :
metula, conidiophore, conidie et phialide
interne : conidiophore
meula
phialide
externe : conidie (en chaînette)
Penicillium camemberti vs Penicillium roqueforti
sur le sens de la pousse du fromage
camemberti : Champignon pousse vers l’extérieur
roqueforti: Champignon pousse à l’intérieur
Applications de pénicillium :
fromages
antibiotique
Applications du Genre Aspergillus :
sauce soya, Mycotoxine
Différence entre pénicillium et aspergillus sur la structure du conidiophore
Conidiophore non ramifié chez aspergillus, Vésicule qui porte plusieurs métules
penicillium : Conidiophore ramifié
Qu’est-ce que l’Aspergillose ?
Par les agents: Aspergillus fumigatus Aspergillus flavus Aspergillus niger Aspergillus nidulans
L’aspergillose est un éventail les maladies de l’Homme et des animaux provoqués par des espèces du genre Aspergillus
1 - Mycotoxicose due l'ingestion des nourritures infectées (mycotoxine) 2 - Allergie aux conidies 3 - Infection des voix respiratoires
Onygenales, pathogenes de l’Homme…
Trichophyton rubrum, relié à quel type de maladie de peau (infection)?
Pieds d’athlète, Mycose superficielle