Cours 3 Flashcards
C’est quoi la valeur C ?
C’est la taille du génome haploide
Synonyme: Valeur Constante
Au sein des espèce d’un même genre, y a t’il de la variation de la valeur C ?
Oui peut quand meme etre grande
Plus le génome est gros plus le nombre de gènes est volumineux ?
Faux. seulement chez les bactéries et archées
Génome très compacte. Pas d’intron
C’est quoi la relation entre la taille du génome et le nombre de gènes chez les eucaryotes ?
Inversement proportionnel. Plus la taille est grande, moins il y a de gènes
Plus de séquences parasites que de gènes fonctionnels.
C’est quoi le paradoxe de la valeur C ?
Un organisme d’apparence très complexe ne possède pas nécessairement plus de gènes. Ex: amibe Polychaos
combien de % du génome occupe les séquences parasites chez les eucaryotes ?
99%
L’augmentation de la valeur C est elle associée au nombre de chromosomes ?
Vraiment pas
Y a t’il une corrélation entre la taille des cellules et la valeur C ?
Oui, plus la valeur C est grande, plus la taille des cellules est grande
Proportionelle
Y a t’il un lien en le métabolisme et la valeur C ?
Oui, plus la valeur C est grande moins le métabolisme est rapide. Ex: consommation d’O2 moins grande
Inversement proportionnel
Les plantes annuelles ont des cycles cellulaires très rapide contrainement aux vivaces, pourquoi ?
Les annuelles ont un génome plus petit que ceux des vivaces. Métabolisme plus rapide
Y a t’il un lien ente les stades de développement et la valeur C ?
Oui, les stades de développement complets (holométabole) ont des valeurs C plus petites.
Inversement proportionelle
Hémimétabole = cycle de développment non complet
Les amphibiens ont’ils une grande valeur C ?
Non, ils subissent une forte pression de sélection
Les oiseaux ont’ils une plus grande valeur C que les mammifères ?
Non, une plus petite. Le métabolisme pour voler est très exigeant (donc rapide)
Petit génome, petits érytrhocytes. Plus de liaison à l’O2
Événement particulier en lien avec les globules rouges des mammifères ?
Érytrhocytes anuclés. Perte du noyau et affranchissement de la loi en lien avec la valeur C. Sinon humains auraient un trop gros génome
A quoi ont servi les chromosomes de Drosophila ?
A mesurer les inversions. Parce qu’ils sont gros
À la suite d’une inversion la recombinaison est impossible pour qui ?
Les hétérozygotes
Suite à une inversion chez les hétérozygotes, que se passe t’il avec les deux chromosomes ?
Ils évoluent indépendamment
c’est quoi la problématique avec les génomes hétérozygotes inversés ?
Ils accumulent des mutations sans possibilité de réparation. Cliquet de Muller.
Comme dans le cas des Chromosome Y
Comment le chms Y fait il pour se recombiner puisqu’il est complètement différente du chms X ?
Il se recombine grace à la région pseudoautosomale homologue (PAR)
Que se passe-t-il avec les gènes présent sur le Y qui ont subi une inversion ?
Ils deviennent asexués. Les mutations s’accumulent.
C’est quoi la fusion de chromosomes ? Et cela implique quoi ?
Que c’est’il passé dans le cas des humains ?
Le nombre de chromosomes diminue, mais la quantité de matériel génétique reste la même. Cela permet de creer de nouvelles espèces. Augmente la diversité.
Suite à la divergence des chimpanzés, le chms 2 est apparu suite à la fusion de 2 chms.
La fission consiste en quoi ?
Fomration de deux chromosomes à partir de la cassure de un.
c’est quoi les microchromosomes?
Particularités? (2)
Fait par rapport aux microChms?
Historique des micro chromosomes ?
Se sont de petits chromosomes qui ont une grande densité de gènes. Les microchromosomes sont typiques des oiseaux et des reptiles.
Riche en G+C. Chez le poulet par exemple.
Ils ont un plus haut taux de recombinaison que les gros chromosome
Ils ont complètement disparu chez les mammifères
Étaient présent chez l’ancêtre des vertébrés, mais suite a de nombreuses fusions, les macrochromosomes sont apparus.
C’est quoi la délétition et duplication B1 ?
C’est une facon d’éliminer ou de dupliquer du matériel génétique sur un chromosome.
Il se passe quoi avec un gène dupliqué ? Trois devenir possible.
3
- Les deux copies sont exprimées en même temps et exprime deux fois plus.
- Une des deux copies conserve sa fonction originale et l’autre diverge en un nouveau gène.
- Une des deux copies conserve sa fonction originale et l’autre devient non fonctionnel. Devient un pseudogène. La majorité des gènes dupliqués
C’est quoi l’aneuploidie ?
C’est que le nombre de base est différent dans une paire de chromosome (exemple: trisomie.) Au lieu que tout les chromosomes sont diploide, un est triploide.
Fun fact: syndrome de Down = Trisomie 21
Polyploidie ?
Augmentation du chiffre devant n. Duplication intégrale du génome.
La synthénie c’est quoi ?
Région qui a résisté au réarrangement du génome depuis l’ancêtre commun. Exemple: Qui na pas subit d’inversion.
Comment le nombre de régions synthéniques augmente ?
Lors qu’une mutation survient à l’intérieur d’une région synthénique, elle en produit deux nouvelles. Chaque région synthénique diminue en taille. Elles sont plus courtes
C’est quoi le critère pour qu’une région soit synthénique ?
Les séquences doivent être identiques. Peu importe le sens de la lecture
iiijlk
jbbkjbk
La duplicaiton du génome cause l’apparition d’une région synthénique ? Vrai ou faux ?
VRAI
C’est quoi la structure mosaique du génome ?
C’est le fait que le génome des eucaryotes est composé à 60% A+T et 40% G+C. En alternance en régions riches en A+T ou C+G.
se souvenir que les microchromosomes c’est l’inverse
C’est quoi un isochore ?
C’est une région dans l’ADN qui est riche et uniforme soit en C+G. Différents isochores existent en fonction de leur densité en G+C
L1, L2, H1, H2 et H3 Low/High
C’est qui les exceptions en isochores ?
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Humains et oiseaux. Les autres espèces possèdent beaucoup moins d’isochores.
Association générale des gènes A+T et C+G ?
Les gènes riches A+T sont souvent associés aux mécanismes de transcription et traduction. Tandis que les gènes C+G sont souvent associés aux gènes de processus fonctionnels de la cellule.
Pourquoi il y a eu des enrichissement dans les génomes humains et oiseaux en C+T ?
Les bases C+G (triple liaisons hydrogène) résistent mieux aux mutations. Donc, ils ont tendance à rester.
Pourquoi les isochores sont plus nombreux chez les mammifères et oiseaux ?
Fait qui est contradictoire sur l’apparition des isochores ?
Serait une adaptation. En raison de la température du sang (sang chaud). Les homéothermes ont le sang chaud et la chaleur augmente la chance de subir des mutations (stabilité). Hors, les isochores (riche en C+G) sont progressivement apparue pour rendre le génome plus résistant.
Ils sont arrivés avant les homéothermes dans l’histoire.
