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Génétique évolutive > Cours 2 > Flashcards

Cours 2 Flashcards

1
Q

Les mitonchondries et chloroplastes prossèdent-elles un génome ?

A

OUI et OUI

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2
Q

Caractéristiques du génome mitochondrial ? (2)

A
  1. Forme = Circulaire
  2. Taille variable (généralement petit)
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3
Q

Ovule contient beaucoup de mitochondries ?

A

OUI et nettement plus que le spermatozoide

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4
Q

Mode de transmission des mitochondries ?

A
  1. Homoplasmie (par descendance)

Transfert identique à la descendance

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Q

Les mitochondries de chaque tissus possèdent leur propre génome, différent des autres. Vrai ou faux ?

A

FAUX. Tous les génomes mitochondriaux sont identiques entre-eux au sein d’un même individu.

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6
Q

Le génome mitochondriaux des plantes vs ceux des animaux est .
a) Très différent ?
b) peu différent ?

A

a) Très différent
Le génome mitochondriaux des plantes est très gros et possède beaucoup de gène.

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7
Q

Le génome mitochondrial chez les champignon est:
a) Très gros
b) Petit

A

b) petit

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8
Q

Le génome mitochondrial de Amoebidium parasiticum ? (2)

A
  1. Unique
  2. 3 types de chromosomes : sans gènes codants, un seul gène, plusieurs gènes
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9
Q

Groupe frère des animaux ?

A

Choanoflagellés

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10
Q

Les choanoflagellés ont des mitochondrie plus grandes ou plus petites que celles des animaux ?

A

Plus grande, possèdent de nombreux gènes qui ne sont pas présents chez les animaux.

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11
Q

Note 1 –>

A

Les génomes mitochondriaux sont spécifiques aux espèces

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12
Q

Qu’est-ce qu’un kinétoplaste ?

A

C’est une grosse mitochondries qui appartient au kinoplastides (longue mitochondrie)
EX: Trypanosoma

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13
Q

De quoi sont constitués les kinétoplastes ?

A

Maxi et mini cercle. ADN entremêlé.
Maxi cercle : Majorité de l’information semblable au Mitoch, mais incomplet
Mini cercle : composé d’ARN guide qui permettent de corriger les ARNm des maxi cercles.

Organisation mini cercle dépend des espèces

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14
Q

Premier génome extra cellulaire découvert comment ?

A

Par les kinétoplastides et leur kinétoplaste !
ADN foncés lors de la coloration.

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15
Q

Les génomes chloroplastiques
(fonctionnement)

A
  1. Se duplique d’un coté à l’autre (À confirmer)
  2. Insertion d’un coté et se duplique de l’autre coté.

Mutation sont copiés de l’autre coté par inversions géniques

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16
Q

Les dinoflagellés et leur génome chloroplastique ?

A
  1. Organisation unique de leur gènes chloroplastiques
  2. Chaque gènes est placés dans son propre minicercle.
    En gros, ses gènes sont dans les minicercles et non dans les maxicercles.
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17
Q

Taille des génomes chloroplastiques des dinoflagellés?

A

Les gènes chloroplastiques des chloroplastes des dinoflagellés sont vraiment peu nombreux. Petit génome.

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18
Q

C’est quoi un apicoplaste ?

A

C’est un génome circulaire (est un chloroplaste) retrouvé chez les apicomplexes (possèdent aussi une mitochondrie)
EX: Plasmodium et Toxoplasma

Était au paravant utilisé pour la photosynthèse, demeure essentiel

19
Q

Quel est le phénomène observé sur la taille des génomes des endosymbiotes ?

A

Ils possèdent les plus petits génomes connus

20
Q

Comment se transfèrent les génomes extra-cellulaire ?

Choloplaste et mitochondrie

A
  1. Asexué et uniparentale (via les oocytes et destruction chez le mâle dans le zygote)
    Un peu comme avec le chms Y.

Génome nucléaire = sexué (méiose et recombinaison)

21
Q

Comment fonctionne la transmission uniparentale ?

A
  1. Ovule et spermato fusionne
  2. Les génomes mito des spermato sont marqués à l’ubiquitine (ubiquitination) et détruit à la suite de la fécondation
22
Q

Cas exceptionnel de la transmission des mitochondries chez l’humain?

A

Bi-parentale. La non-destruction est causé par une mutation dans les gènes mitochondriaux qui empêcherait leur destruction.

23
Q

Hétéroplasmie 2 types (différentes mitochondries)

A
  1. Hétéroplasmie par mutation (mutation apres la suppression des mitochondries males)
  2. Hétroplasmie par fuite parternelle (erreur lors de l’ubiquination)
24
Q

Problème lors de l’hétéroplasmie par mutation ?

A

Si trop de mitochondries mutées se retrouvent dans le même ovule, les chances pour un enfant de développer une maladie sont plus grandes

25
Q

Particularité de l’hétéroplasmie chez la levure ?

Hétéroplasmie Aléatoire

A

Si les petites mitochondries sont mutées, la prochaine lignée ne peut plus croitre en présence d’O2. Chaine de respiration cellulaire déficiente.

26
Q

Grande origine des mitochondries et chloroplastes ? (5)

A
  1. Taille = a celle d’une bactérie
  2. Constitué de matériel génétique
  3. ADN circulaire comme celui de bactéries
  4. Chaque organelle possèdent la machinerie de transcription et de traduction protéique
  5. Division indépendante de celle du noyau
27
Q

L’endosymbiose primaire

A
  1. Une cellule eucaryote aurait invaginé une bactérie aérobique **(alpha-proéto) qui est devenue plus tard la mitochondrie - Lynn margulis
  2. Le chloroplastes eux proviendraient des cyanobactéries

Aquisition des chloropaste est apparue plus tardivement dans l’histoire

28
Q

Note 3

A

Le génome des organelles est différent de ceux des noyaux. Il a permis de faire des relations phylogénétiques et de s’apercevoir que les génomes nucléaires sont bien distinc, mais ceux des organelles sont tous reliés inter-domaine (bactérie, eucaryote et archée)

29
Q

Pourquoi il existe plusieurs types de chloroplastes chez les plantes ?

A

Les différents types de chloroplastes sont du au temps de divergence (temps de spéciation ?)

Revoir la diapo 61

30
Q

Endosymbiose secondaire et tertiaire

A
  1. Un eucryote plus gros qui invagine une endosymbiose primaire.
31
Q

Combien de membrane possède l’organelle de l’endosymbiose primaire ?

A

2

32
Q

Combien de membrane possède l’organelle de l’endosymbiose secondaire ?

A

4

membrane de phagocytose et plasmatique

33
Q

L’exemple de Paulinella chromatophora

A
  1. Est un cilié qui possède déjà une mitochondrie (endosymbiose primaire)
  2. Elle a éventuellement acquis une cyanobactérie alpha. Elle est maintenant doté d’un chloroplaste
  3. Se nomme une espèce chromatophore

Endosymbiose secondaire

34
Q

Les génomes des organelles sont aussi volumineux que le génome nucléaire des bactéries. Vrai ou faux ?

A
  1. FAUX
    Les génomes de mitochondries et chloroplastes sont plus petits
35
Q

La diminution réduction du génome des organelles est causé par quoi ? (1)

A
  1. Un délestage des gènes inutiles.
    Si le gène de la mitochondrie ou chloroplaste est déja présent dans le génome nucléaire, le gène devient non-essentiel et disparait naturellement. Sinon ils peuvent etre transféré dans le génome de l’hote
36
Q

Les nuclémorphes c’est quoi ? (5)

A
  1. Petit génome linéaire qui conserve les plastes suite a une endosymbioses secondaires
  2. C’est un génome extra-nucléaire additionnel
  3. possède 4 génomes a. mitochondrial b. chloroplastique c. génome nucléaire originel (hote) d. génome nucléaire de la cellule phagocyté (le nucléomorphe)
  4. Le nucléomorphe possède des gènes essentiels à l’hote
  5. Le nucléomorphe possède les quelques gènes restants pour préserver les chloroplastes. Ces gènes vont peut etre éventuellement migrer dans le noyau comme les autres l’ont fait.
37
Q

Pourquoi les génomes bactériens s’enrichissent en AT ?

A
  1. Les dommages oxydatifs naturels transforme les G en O. Transition G pour un A
  2. La polymérase insère un T à la place du O pour correspondre à A.
  3. Nucléotides AT sont plus facile à produire et moins couteux énergitiquements. On délaisse les gènes avec GTP et CTP (CG)
  4. Sélection des génomes économiques
38
Q

Note 4

A

Les gènes de la respiration cellulaire font partie du génome intra et extra nucléaire

39
Q

C’est quoi les cybrides ?

A
  1. Hybride cytoplasmique
  2. Noyau vs cytoplasme (avec mitochondries) on des origines différentes
40
Q

Pourquoi analyse t’on la production d’acides lactiques ?

A
  1. Plus la distance phylogénétique entre le génome du noyau et le génome de la mitochondrie est grande, il y a souvent la production d’acide lactique, ce qui témoigne d’une respiration anaérobie.

Rho = 0 = cellule sans mitochondries

41
Q

Les cybrides naturels sont ils fréquents?

3

A
  1. OUI
  2. Les cybrides ont une moins bonne valeur adaptative dans les conditions envrionnementales ou ils sont formés contrairement aux hybrides
  3. La mitochondries peut procurer un avantage dans des conditions environnementales spécifiques. Cybrides peuvent etre avantagés
42
Q

Avantages du transfert du génome des organites vers le noyau

2

A
  1. Un génome recombinant peut facilement résister à l’accumulation de mutation (phénomène du cliquet de Muller) –> Chaque mutation est transmis à la génération suivante sans possibilté de retour en arrière. (chez les asexués)
  2. Les génomes de petites tailles se répliquent plus souvent que les plus gros génomes (it is just a fact)
43
Q

Les plus petites mitochondries sont moins bien transmises ? Vrai ou faux

A

FAUX.
Elles se transmettent mieux.

Génétique évolutive (4 decks)

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