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DIVERSITÉ MICROBIENNE 🧫 > COURS 2: LES MO TERRESTRES 🌱 > Flashcards

COURS 2: LES MO TERRESTRES 🌱 Flashcards

1
Q

décrire le cycle du carbone

A

les plantes font de la respiration autotrophe et les animaux de là respiration hétérotrophe

du coup il y a du CO2 dans l’atmosphère

il a photosynthèse et donc le CO2 est fixé dans les sucre des plantes 🌱

le carbone fixé est libéré par les racines des plantes OU il est décomposé par les MO du sol et les animaux

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2
Q

que se passe-t-il lorsqu’il y a beaucoup de carbone vs quand il y en a peu?

A

beaucoup: il est stocké

peu: il est utilisé par les MO pour leur croissance

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3
Q

décrire le cycle du méthane

A

les plantes font de la photosynthèse et donc il y a fixation du CO2 dans les sucres des plantes

stockage de CO2 dans le sol (carbone organique et sucres)

processus de methanogenese convertit les résidus organiques en méthane (CH4)

le CH4 est consommé par les bactéries méthanotrophes (oxydation du méthane)

l’oxydation du méthane fait qu’il y a un refoulement de CO2 dans l’atmosphère

aussi noter qu’au début il y du méthane dans l’atmosphère qui peut être consommé par les méthanotrophes et donc oxydé (etc)

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4
Q

quels organismes sont favorisés par le réchauffement climatique?

A

autotrophes car utilisent le CO2 inorganique

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5
Q

nommer des effets à court terme du réchauffement climatique sur les microbes

A

plus de CO2 atmosphérique, augmente la biomasse des plantes et la fixation du carbone du sol

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6
Q

nommer un effet à long terme du réchauffement climatique sur les microbes

A

appauvrissement du sol

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7
Q

pourquoi il est difficile d’évaluer la réponse à long terme du réchauffement climatique sur les microbes?

A

parce qu’elle dépend de d’autres facteurs comme la disponibilité de N, P, etc

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8
Q

décrire le cycle de l’azote

A

nitrogène (N2) dans l’atmosphère

des bactéries dans les nodules des plantes fixent le nitrogène

AMMONIFICATION: ces bactéries fixatrices du nitrogène donnent de l’azote au sol et permettent la formation d’ammonium (NH4+)

NITRIFICATION: les bactéries nitrificatrices transforment l’ammonium en nitrite (NO2-) puis en nitrate (NO3-) (note: la foudre donne du nitrate aussi)

ASSIMILATION: les plantes assimilent le nitrite (animaux mangent➡️décomposeur permettent ammonium, ainsi de suite)

les bactéries dénitrificatrices prennent le nitrate (NO3-) et le transforment en nitrogène (N2)

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9
Q

décrire le phénomène d’eutrophisation

A

processus naturel qui se déroule sur une très longue période de temps, dizaines de milliers d’années

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10
Q

quel phénomène explique la transformation des lacs en marias, en tourbière ou en praire

A

eutrophisation

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11
Q

quel phénomène cause une baisse de la biodiversité et des zones anoxiques?

A

eutrophisation

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12
Q

nommer la particularité du cycle du fer

A

partie anaérobiose et aérobiose

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13
Q

décrire le cycle du fer

A

AÉROBIOSE
oxydation spontanée/respiration : Fe2+ ➡️ Fe3+

oxydation: Fe3+ ➡️ Fe(OH)3

précipitation: Fe(OH)3 descend genre

ANAÉROBIOSE

réduction dissimilatoire: Fe(OH)3 ➡️ Fe2+ (il peut y avoir une oxydation anaérobie qui transfo Fe2+ ➡️ Fe(OH)3 )

solubilisation: Fe2+ monte et ça recommence

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14
Q

qu’est ce qui mène au cycle du soufre (SO4-)?

A

engrais, rejets industriels, roches, eaux, ruissellement

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15
Q

que font les sulfato-réducteurs?

A

réduction SO4-➡️ S2-

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16
Q

VRAI OU FAUX

S2- ➡️ H2S et aller dans l’atmosphère?

A

VRAI

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17
Q

VRAI OU FAUX

il y a aussi de l’oxydation chimique dans le cycle du soufre?

A

VRAI

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18
Q

en pensant à l’ensemble des cycles vu, on comprend que les MO sont importants pour?

A

le recyclage de nombreux éléments

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19
Q

VRAI OU FAUX

plus on descend dans le sol, plus il y a de la matière organique?

A

FAUX, plus de matière en haut, terre de surface

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20
Q

ORDRE des zones du sol de la surface au fond

A

terre de surface ➡️ zone adosse ➡️ zone capillaire ➡️ zone saturées

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21
Q

nommer les 3 bactéries telluriques majoritaires

A

protéobactéries, actinobactéries, acidobactéries

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22
Q

nommer les 2 types de protéobactéries telluriques

A

➡️ alphaproteobacteria : gram-, symbiotiques de plantes et animaux, peu pathogènes : rickettsiaceae

➡️ betaproteobacteria: gram-, symbiotiques de plantes, pathogènes: neisseriaceae et burkholderia

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23
Q

décrire les actinobactéries telluriques

A

gram + et beaucoup de GC

produisent un mycélium et certaines se reproduisent par sporulation

24
Q

laquelle des 3 bactéries telluriques majoritaires représente 40% des bactéries cultivables du sol?

A

les actinobatéries

25
Q

décrire les acidobactéries telluriques

A

gram -, beaucoup sont acidophiles

TRÈS PEU SONT CULTTVABLES

26
Q

quelle type de bactéries forment une frontière et d’où elles viennent?

A

les bactéries souterraines (2,8km!)

enterrés avec des sédiments, métabolisme lent? de la surface, avec de l’eau?

27
Q

nommer des caractéristiques des bactéries souterraines

A

-2,8 km
-un seul génome complet
-bactérie Candidatus Desulforudis audaxviator
-thermophile, mobile, sporulante, sulfato-reductrice, chimioautotrophe

28
Q

quel facteur influence vraiment la diversité microbienne?

A

le pH

(pcq en gros plusieurs facteurs connus comme importants dans la diversité des communautés des macro-organismes n’affectent pas la diversité microbienne)

29
Q

nommer 3 rôles bénéfiques des bactéries telluriques

A

induction de la croissance des plantes

dépollution des sols

lutte contre les pathogènes

30
Q

définir une nodule

A

boursouflure se formant sur les racines de nombreuse espèces de plantes sous l’action des bactéries Rhizobiales

31
Q

définir une relation symbiotique plante-bactérie

A

plante fournie les substances carbonées et les bactéries les substances azotées

32
Q

décrire le processus de formation des nodules

A
33
Q

qui sont les MO phytostimulateurs libres?

A

communauté microbienne du sol/microbiote du sol

34
Q

chez les MO phytostimulateurs libres le microbiote racinaire est si important qu’il est qualifié de?

A

second génome de la plante!

35
Q

nommer 5 mécanismes de phytostimulation

A

1-amélioration de la nutrition azotée : diazotrophie, production d’une nitrogénase codée/gène nifh

2-amélioration de la nutrition en P: végétaux absorbent que P organique, bactérie peuvent solubiliser le P minéral, bactéries utilisent aussi P organique

3-amélioration de la nutrition en Fe: super imp pour synthèse chlorophylle etc… donc FeIII insoluble est transfo en FeII (cycle du fer)

4-effet positif sur la croissance racinaire: atténuation voie hormonale éthylène ➡️ réduction effets du stress et levée de l’inhibition de la croissance racinaire

5-émission de composés organiques volatils bactériens-COVs: dépendent de la souches bactérienne et du milieu de culture

36
Q

décrire ce qu’est une bactérie dépolluante

A

bactérie qui dégrade les polluants grâce à leurs enzymes, les réduisants en molécules moins nocives

37
Q

VRAI OU FAUX

si on ne choisi pas la bonne bactérie dépolluante pour un polluant spécifiques, il se peut qu’il devienne encore plus toxique6

A

VRAI

38
Q

nommer un endroit où sont utilisées les bactéries dépolluantes

A

dans les biofiltres pour assainir eux contaminées et l’air pollué

39
Q

nommer des types de pollution qui nécessitent des bactéries dépolluantes

A

nitrates, phosphates, pesticides, hydrocarbures lourds et légers, métaux lourds

40
Q

quels MO dégradent les hydrocarbures?

A

les MO hydrocarbonoclastes

41
Q

qu’est ce que les bactéries hydrocarbonoclastes utilisent comme source de carbone?

A

surfactants (agissent comme émulsifiants, gouttelettes)

42
Q

nommer des mécanismes de biotransformations des métaux

A

-adsorption à la surface de la cellule
-volatilisation
-oxydation
-biominéralisation
-réduction
-accumulation intracellulaire

43
Q

qu’est ce que la phytorémédiation?

A

technique qui reposent sur l’aptitude de certaines plantes:

-phytodégradation:à absorber polluants et les transformer en composés moins toxiques

-phytoextraction: à les accumuler en vue de leur extraction

-phytostabilisation: à les immobiliser notamment lorsque les racines sont associées à des additifs cap de fixer ou absorber les métaux lourds

44
Q

des nouveaux mécanismes combinent la phytorémédiation à ?

A

phytorémédiation + biodégradation

en ajoutant des bactéries qui favorisent la pousse de la plante ou de bactéries dépolluantes dans le sol

45
Q

VRAI OU FAUX

la phytovolatilisation existe?

A

VRAI

46
Q

les moyens de lutte les plus répandus contre les pathogènes sont organiques ou inorganiques?

A

organiques

47
Q

nommer un inconvénient de l’utilisation d’antibiotique

A

se dissémine dans l’environnement = résistance

48
Q

nommer un inconvénient de l’utilisation de bactéricide et fongicides

A

se dissémine dans l’environnement = pollution des sols

49
Q

définir le contrôle microbien

A

utilisation de MO pour contrôler les pathogènes des plantes

50
Q

nommer deux avantages du contrôle microbien

A

ne pollue pas l’environnement et pas de résistance aux Ab pcq y’en a pas du coup :)

51
Q

nommer un champignon ubiquiaiëe du sol

A

Trichoderma (colonies incolores)

52
Q

quels sont les intérêts à utiliser Trichoderma?

A

bio-fongicide

croissance rapide en culture

agent de contrôle microbien

53
Q

Trichoderma est un ?

A

mycoparasite: champignon qui parasite d’autres champignons

54
Q

décrire le mécanisme de protection de Trichoderma

A

par les hyphes, hyphes entourent hyphes du pathogène, les hyphes de Trichoderma pénètrent dans le pathogènes = pores = dissolution du pathogène

55
Q

nommer un autre mécanisme utilisé par Trichoderma

A

production d’antibiotiques, soit la gliotoxine

56
Q

nommer 2 choses importante que Trichoderma doit être capable de faire pour « lutter avec le pathogène »

A

1) compétion par la compétence dans la rhizosphère: compétence de la rhizosphère = importante, car un agent de contrôle microbien ne peut pas concurrencer l’espace et les nutriment s’il est incapable de croître dans la rhizosphère

20 stimulation de la réponse immunitaire de la plante: induction de terpénoides qui sont importante pour lutter contre les pathogènes dans les racines en présence de Trichoderma

DIVERSITÉ MICROBIENNE 🧫 (2 decks)

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