COURS 2: LES MO TERRESTRES 🌱 Flashcards
décrire le cycle du carbone
les plantes font de la respiration autotrophe et les animaux de là respiration hétérotrophe
du coup il y a du CO2 dans l’atmosphère
il a photosynthèse et donc le CO2 est fixé dans les sucre des plantes 🌱
le carbone fixé est libéré par les racines des plantes OU il est décomposé par les MO du sol et les animaux
que se passe-t-il lorsqu’il y a beaucoup de carbone vs quand il y en a peu?
beaucoup: il est stocké
peu: il est utilisé par les MO pour leur croissance
décrire le cycle du méthane
les plantes font de la photosynthèse et donc il y a fixation du CO2 dans les sucres des plantes
stockage de CO2 dans le sol (carbone organique et sucres)
processus de methanogenese convertit les résidus organiques en méthane (CH4)
le CH4 est consommé par les bactéries méthanotrophes (oxydation du méthane)
l’oxydation du méthane fait qu’il y a un refoulement de CO2 dans l’atmosphère
aussi noter qu’au début il y du méthane dans l’atmosphère qui peut être consommé par les méthanotrophes et donc oxydé (etc)
quels organismes sont favorisés par le réchauffement climatique?
autotrophes car utilisent le CO2 inorganique
nommer des effets à court terme du réchauffement climatique sur les microbes
plus de CO2 atmosphérique, augmente la biomasse des plantes et la fixation du carbone du sol
nommer un effet à long terme du réchauffement climatique sur les microbes
appauvrissement du sol
pourquoi il est difficile d’évaluer la réponse à long terme du réchauffement climatique sur les microbes?
parce qu’elle dépend de d’autres facteurs comme la disponibilité de N, P, etc
décrire le cycle de l’azote
nitrogène (N2) dans l’atmosphère
des bactéries dans les nodules des plantes fixent le nitrogène
AMMONIFICATION: ces bactéries fixatrices du nitrogène donnent de l’azote au sol et permettent la formation d’ammonium (NH4+)
NITRIFICATION: les bactéries nitrificatrices transforment l’ammonium en nitrite (NO2-) puis en nitrate (NO3-) (note: la foudre donne du nitrate aussi)
ASSIMILATION: les plantes assimilent le nitrite (animaux mangent➡️décomposeur permettent ammonium, ainsi de suite)
les bactéries dénitrificatrices prennent le nitrate (NO3-) et le transforment en nitrogène (N2)
décrire le phénomène d’eutrophisation
processus naturel qui se déroule sur une très longue période de temps, dizaines de milliers d’années
quel phénomène explique la transformation des lacs en marias, en tourbière ou en praire
eutrophisation
quel phénomène cause une baisse de la biodiversité et des zones anoxiques?
eutrophisation
nommer la particularité du cycle du fer
partie anaérobiose et aérobiose
décrire le cycle du fer
AÉROBIOSE
oxydation spontanée/respiration : Fe2+ ➡️ Fe3+
oxydation: Fe3+ ➡️ Fe(OH)3
précipitation: Fe(OH)3 descend genre
ANAÉROBIOSE
réduction dissimilatoire: Fe(OH)3 ➡️ Fe2+ (il peut y avoir une oxydation anaérobie qui transfo Fe2+ ➡️ Fe(OH)3 )
solubilisation: Fe2+ monte et ça recommence
qu’est ce qui mène au cycle du soufre (SO4-)?
engrais, rejets industriels, roches, eaux, ruissellement
que font les sulfato-réducteurs?
réduction SO4-➡️ S2-
VRAI OU FAUX
S2- ➡️ H2S et aller dans l’atmosphère?
VRAI
VRAI OU FAUX
il y a aussi de l’oxydation chimique dans le cycle du soufre?
VRAI
en pensant à l’ensemble des cycles vu, on comprend que les MO sont importants pour?
le recyclage de nombreux éléments
VRAI OU FAUX
plus on descend dans le sol, plus il y a de la matière organique?
FAUX, plus de matière en haut, terre de surface
ORDRE des zones du sol de la surface au fond
terre de surface ➡️ zone adosse ➡️ zone capillaire ➡️ zone saturées
nommer les 3 bactéries telluriques majoritaires
protéobactéries, actinobactéries, acidobactéries
nommer les 2 types de protéobactéries telluriques
➡️ alphaproteobacteria : gram-, symbiotiques de plantes et animaux, peu pathogènes : rickettsiaceae
➡️ betaproteobacteria: gram-, symbiotiques de plantes, pathogènes: neisseriaceae et burkholderia
décrire les actinobactéries telluriques
gram + et beaucoup de GC
produisent un mycélium et certaines se reproduisent par sporulation
laquelle des 3 bactéries telluriques majoritaires représente 40% des bactéries cultivables du sol?
les actinobatéries
décrire les acidobactéries telluriques
gram -, beaucoup sont acidophiles
TRÈS PEU SONT CULTTVABLES
quelle type de bactéries forment une frontière et d’où elles viennent?
les bactéries souterraines (2,8km!)
enterrés avec des sédiments, métabolisme lent? de la surface, avec de l’eau?
nommer des caractéristiques des bactéries souterraines
-2,8 km
-un seul génome complet
-bactérie Candidatus Desulforudis audaxviator
-thermophile, mobile, sporulante, sulfato-reductrice, chimioautotrophe
quel facteur influence vraiment la diversité microbienne?
le pH
(pcq en gros plusieurs facteurs connus comme importants dans la diversité des communautés des macro-organismes n’affectent pas la diversité microbienne)
nommer 3 rôles bénéfiques des bactéries telluriques
induction de la croissance des plantes
dépollution des sols
lutte contre les pathogènes
définir une nodule
boursouflure se formant sur les racines de nombreuse espèces de plantes sous l’action des bactéries Rhizobiales
définir une relation symbiotique plante-bactérie
plante fournie les substances carbonées et les bactéries les substances azotées
décrire le processus de formation des nodules
qui sont les MO phytostimulateurs libres?
communauté microbienne du sol/microbiote du sol
chez les MO phytostimulateurs libres le microbiote racinaire est si important qu’il est qualifié de?
second génome de la plante!
nommer 5 mécanismes de phytostimulation
1-amélioration de la nutrition azotée : diazotrophie, production d’une nitrogénase codée/gène nifh
2-amélioration de la nutrition en P: végétaux absorbent que P organique, bactérie peuvent solubiliser le P minéral, bactéries utilisent aussi P organique
3-amélioration de la nutrition en Fe: super imp pour synthèse chlorophylle etc… donc FeIII insoluble est transfo en FeII (cycle du fer)
4-effet positif sur la croissance racinaire: atténuation voie hormonale éthylène ➡️ réduction effets du stress et levée de l’inhibition de la croissance racinaire
5-émission de composés organiques volatils bactériens-COVs: dépendent de la souches bactérienne et du milieu de culture
décrire ce qu’est une bactérie dépolluante
bactérie qui dégrade les polluants grâce à leurs enzymes, les réduisants en molécules moins nocives
VRAI OU FAUX
si on ne choisi pas la bonne bactérie dépolluante pour un polluant spécifiques, il se peut qu’il devienne encore plus toxique6
VRAI
nommer un endroit où sont utilisées les bactéries dépolluantes
dans les biofiltres pour assainir eux contaminées et l’air pollué
nommer des types de pollution qui nécessitent des bactéries dépolluantes
nitrates, phosphates, pesticides, hydrocarbures lourds et légers, métaux lourds
quels MO dégradent les hydrocarbures?
les MO hydrocarbonoclastes
qu’est ce que les bactéries hydrocarbonoclastes utilisent comme source de carbone?
surfactants (agissent comme émulsifiants, gouttelettes)
nommer des mécanismes de biotransformations des métaux
-adsorption à la surface de la cellule
-volatilisation
-oxydation
-biominéralisation
-réduction
-accumulation intracellulaire
qu’est ce que la phytorémédiation?
technique qui reposent sur l’aptitude de certaines plantes:
-phytodégradation:à absorber polluants et les transformer en composés moins toxiques
-phytoextraction: à les accumuler en vue de leur extraction
-phytostabilisation: à les immobiliser notamment lorsque les racines sont associées à des additifs cap de fixer ou absorber les métaux lourds
des nouveaux mécanismes combinent la phytorémédiation à ?
phytorémédiation + biodégradation
en ajoutant des bactéries qui favorisent la pousse de la plante ou de bactéries dépolluantes dans le sol
VRAI OU FAUX
la phytovolatilisation existe?
VRAI
les moyens de lutte les plus répandus contre les pathogènes sont organiques ou inorganiques?
organiques
nommer un inconvénient de l’utilisation d’antibiotique
se dissémine dans l’environnement = résistance
nommer un inconvénient de l’utilisation de bactéricide et fongicides
se dissémine dans l’environnement = pollution des sols
définir le contrôle microbien
utilisation de MO pour contrôler les pathogènes des plantes
nommer deux avantages du contrôle microbien
ne pollue pas l’environnement et pas de résistance aux Ab pcq y’en a pas du coup :)
nommer un champignon ubiquiaiëe du sol
Trichoderma (colonies incolores)
quels sont les intérêts à utiliser Trichoderma?
bio-fongicide
croissance rapide en culture
agent de contrôle microbien
Trichoderma est un ?
mycoparasite: champignon qui parasite d’autres champignons
décrire le mécanisme de protection de Trichoderma
par les hyphes, hyphes entourent hyphes du pathogène, les hyphes de Trichoderma pénètrent dans le pathogènes = pores = dissolution du pathogène
nommer un autre mécanisme utilisé par Trichoderma
production d’antibiotiques, soit la gliotoxine
nommer 2 choses importante que Trichoderma doit être capable de faire pour « lutter avec le pathogène »
1) compétion par la compétence dans la rhizosphère: compétence de la rhizosphère = importante, car un agent de contrôle microbien ne peut pas concurrencer l’espace et les nutriment s’il est incapable de croître dans la rhizosphère
20 stimulation de la réponse immunitaire de la plante: induction de terpénoides qui sont importante pour lutter contre les pathogènes dans les racines en présence de Trichoderma
