Cours 2 : Épidémiologie des infections virales et santé publique Flashcards

1
Q

Nommez 6 facteurs d’influence dans l’évolution des maladies virales dans le temps.

A

1) Réservoirs
2) Modes de transmission
3) Caractéristiques de la maladie (incubation, virulence)
4) Conditions socio-démographiques
5) Intrastructures de santé
6) Changements climatiques.

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2
Q

Sur quelles types d’évidences peut-on se baser pour déterminer l’origine d’un virus?

A
  • Écologique. Par exemple, on peut étudier les zoonoses.
  • Génétique
  • Horloge moléculaire (étude des mutations)
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3
Q

Quels sont les facteurs environnementaux pouvant favoriser les zoonoses?

A
  • Changements climatiques poussant à la migration des animaux
  • Élimination de la biodiversité.
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4
Q

Quels sont les comportements humains favorisant les zoonoses?

A
  • Les animaux sont plus proches des humains à cause de la destruction des forêts, de la construction des routes, de l’urbanisation, machés humides (Ventes d’animaux sauvages)
  • augmentation de la population humaine
  • Mondialisation
  • Voyages fréquents.
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5
Q

Comment a-t-on pu trouver la possible origine du coronavirus grâce à l’écologie? Quelles sont les hypothèses actuelles?

A

On a pu étudier les zoonoses. Les coronavirus ont bien souvent pour réservoir les chauves-souris, chez qui ces types de virus sont en croissance constante et peuvent même être endémiques. Il pourrait y avoir eu des évènements d’introduction du virus chez différents animaux servant d’hôtes intermédiaire, comme le pangolin, la civet ou le serpent, suivis d’infections chez l’humain.

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6
Q

Comment a-t-on pu trouver la possible origine du coronavirus grâce à la génétique? Quelles sont les hypothèses actuelles? Est-ce que le virus pourrait provenir d’un laboratoire?

A

On a trouvé que la région ORF-1 du virus est très près de celle des chauves souris, et celle de la protéine S très près de celle des pangolins, ce qui pourrait expliquer une certaine recombinaison entre les séquences des deux virus.
De plus, on a pu déterminer qu’il y aurait pu avoir eu acquisition d’un motif de liaison au recepteur Ace-2 humain ayant une plus grande affinité.

Les hypothèse actuelles ne croient pas que le virus aurait pu émerger d’un laboratoire. Par contre, ils pensent que le SARS-COV2 aurait pu subir une sélection naturelle avant ou après le transfert zoonotique chez l’humain.

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7
Q

Pourquoi est-il important d’applatir la courbe dans une pandémie?Qu’est ce que ça veut dire?

A

Il ne faut pas que le taux d’infection dépasse la capacité du système de santé, et que le système de santé se retrouve débordé et ne puisse plus prendre en charge les malades. En diminuant la courbe, on évite plusieurs morts. Il est important de limiter le nombre de cas pour être capable de les prendre en charge, et c’est un facteur important dans le contrôle d’une pandémie.

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8
Q

Quelle maladie est la plus contagieuse : Une maladie transmissible par aérosol (ex. rougeole) ou une maladie transmissible par goutelettes? Pourquoi?

A

Une maladie transmissible par aérosols, car les goutelettes sont plus lourdes que les aérosols, et donc tombent par terre sans voyager très loin dans l’environnement. Au contraire, les aérosols, peuvent flotter dans l’air plus longtemps, et sont donc plus contagieux. La Rougeole, par exemple, a un R0 de 15 à 18 personnes.

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9
Q

pour l’instant, quelle est le mode de transmission qui est suspecté pour la covid-19?

A

Goutelettes et surfaces. Le mode aérosol ne correspond pas à la transmission présentement, malgré qu’on ne l’exclut pas.

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10
Q

Quele est la conclusion sur la transmission mère enfant de la COVID-19?

A

Il y a potentiellement une transmission mère enfant, mais on a pas assez d’analyses et de données pour l’affirmer hors de tout doute.

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11
Q

Comment est-ce que le R0 pour un même pathogène peut varier?

A

Il peut varier tout dépendant de la population.
Par exemple, si on a une population avec une certaine immunité contre le virus, le R0 diminue. Au contraire, si on a une population pas immune du tout, le R0 augmente, car on risque de contaminer plus d’une personne.

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12
Q

Vrai ou faux. Le VIH est une zoonose.

A

Vrai!

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13
Q

Quel est le réservoir du VIH?

A

Les humains.

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14
Q

Globalement, qui sont les plus atteints du VIH? Et en Amérique du Nord, qui est plus à risque?

A

Globalement : Les femmes.

En Amérique du Nord : Hommes gais et injection de drogues.

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15
Q

Quelle est la différence entre l’épidémie de VIH au Canada et en Europe de l’Ouest par rapport aux gens qui s’injectent des drogues? Quelle pourrait être la raison?

A

Au Canada, grâce aux mesures prises, il y a une diminution du nombre de nouvelles infections. En Europe de l’Ouest, il y a une forte répression par rapport aux drogues, et peu de diagnostic… Cela cause donc une importante montée de cas.

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16
Q

Vrai ou faux. Généralement, une épidémie a une trajectoire similaire dans tous les endroits du monde.

A

Faux!!! La trajectoire varie grandement selon les différentes partie du monde. Au Canada, par exemple, il y a une forte diminution de Cas de VIH, alors qu’en Europe de l’Ouest il y a une remontée.

17
Q

Quelles sont les étapes de la cascade de soins en VIH? Quel est le but de cette cascade?

A

La cascade de soins indique la séquences d’étapes pour obtenir une charge virale indétectable dans la population, ainsi que la proportion de personnes vivant avec le VIH impliquées.

Étapes :
Prévalence, diagnostic, arrimmage aux soins, continuité des soins, introduction du traitement, suppression virologique.

18
Q

De quoi a l’air la cascade de soins pour le VIH a l’international?

A

L’objectif 90-90-90 n’est pas encore atteint. C’est surtout à cause des systèmes de santé dans certains pays, les caractéristiques des populations, l’accès aux soins… Par contre, malgré que ça soit loin du 90%, la suppression de la charge virale augmente chaque année. De plus, l’accès aux antirétroviraux augmente aussi chaque année, ce qui contribue à réduire la mortalité. Par contre, ce n’est pas encore tout le monde qui en a besoin qui y a accès.

19
Q

De quoi a l’air la cascade de soins pour le VIH au Canada?

A

On a presque réussi! Par contre, ce n’est pas encore tout à fait le 90% qui connaissent leur statut. On a par contre beaucoup de succès auprès de la suppression de la charge virale.

20
Q

Quelles utilités peuvent avoir l’épidémiologie moléculaire dans le cas du VIH?

A

Ça sert surtout à comparer les séquences de 2 virus et d’identifier les liens génétiques. On peut former un arbre phylogénétique, et voir les distances génétiques. On peut alors enquêter sur les éclosions, ou faire des interventions de prévention si c’est nécessaire en situant géographiquement l’éclosion et la source.

21
Q

Quelles sont les étapes de l’épidémiologie moléculaire dans le cas du VIH?

A

1) Amplification des séquences virales par PCR
2) Séquençage de première et 2e génération
3) Assemblage des séquences pour former un arbre phylogénétique.

22
Q

Vrai ou faux. La PREP empêche la transmission de toutes les ITSS.

A

Faux. C’est seulement pour le VIH. En effet, on voit souvent que quand des gens commencent à prendre la PREP, il y a une augmentation des autres ITSS car ils arrêtent de porter le condom.

23
Q

Comment va-t-on pouvoir en finir avec le VIH?

A

Avec un vaccin! Or, c’est très dur de faire un vaccin car le VIH attaque directement le système immunitaire, et on a besoin d’une réponse immune pour que le vaccin fonctionne.

24
Q

Quels sont les réservoirs de l’influenza?

A

Oiseaux aquatiques, porcs, humains.

25
Q

Qui a un plus grand R0? SARS-CoV2 ou influenza?

A

SARS COV2 avec 2.2, influenza a 1.5.

26
Q

Quel est le mode de transmission de l’influenza?

A

Par gouttelettes.

27
Q

Pourquoi est-ce que l’Ébola se propage moins vite que la COVID-19? Qu’en est-il de la létalité de ces deux maladies?

A

Le moyen de transmission est différent! En effet, la transmission se fait par contact direct avec le sang ou les liquides corporels, alors que la COVID-19 se fait par goutelettes. Le fait que ça ne soit pas par goutelettes ou aérosols limite la capacité d’infecter rapidement beaucoup de gens.
Une autre différence avec la COVID-19 est que l’Ébola est beaucoup plus létal que la COVID-19.

28
Q

Quel est le réservoir de l’Ébola?

A

Il est inconnu, mais on suspecte les chauves-souris.

29
Q

Quel est l’état des infrastructure de santé dans les pays qui sont aux prises avec l’Ébola? Quel est l’impact?

A

Les systèmes de santé de ces pays sont bien souvent peu développés, et on sous-estime les cas et causeune propagation rapide dans les travailleurs de la santé.

30
Q

Quel est le lien entre les changements climatiques et l’évolution de l’Ébola dans le temps?

A

La déforestation faites par les humains fait en sorte que les singes, qui sont des vecteurs de la maladie, entrent en contact avec les humains, pouvant occasionnellement être la cause d’éclosions.

31
Q

Qu’est ce qui distingue le virus du Zika des autres virus?

A

Il peut causer des malformations congénitales, comme la microencéphalie.