cours 2 Flashcards

1
Q

Comment son nommés les micro-organismes du sol?

A

Micro-organismes telluriques

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2
Q

Vrai ou faux, les micro-organismes sont des acteurs majeurs des cycles biogéochimiques soit le cycle du carbone et de l’azote à l’exception du cycle du méthane?

A

Faux, les micro-organismes sont des acteurs majeurs dans tous les cycles biogéochimiques, même celui du méthane

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3
Q

Dans le cycle du carbone quel est le résultat de la photosynthèse?

A

La fixation du carbone atmosphérique soit le CO2 sous forme de sucre dans les plantes

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4
Q

Quels sont les produits de la respiration autotrophe?

A

Les produits de la respiration végétale sont de l’ATP, de l’eau et du CO2

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5
Q

Vrai ou faux, la respiration autotrophe donne les mêmes produits que la respiration hétérotrophe?

A

TRUE, le CO2, l’ATP sont les produits qui en découle

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6
Q

Vrai ou faux, les micro-organismes joue un rôle important dans le passage du carbone inorganique à du carbone organique?

A

Vrai, les micro-organismes peuvent utiliser le carbone organique. Ils gèrent le recyclage de celui-ci

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7
Q

Vrai ou faux, la photosynthèse est une réaction implique dans le cycle du méthane?

A

Vrai, les plantes captent le CO2 et de l’eau pour en faire du sucre et relâcher de l’O2

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8
Q

Comment se nomment les micro-organismes responsables de la conversion des sucre organiques stockés dans le sol en méthane?

A

Les methanogènes

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9
Q

Vrai ou faux, l’on retrouve du méthane atmosphérique à cause des micro-organismes méthanotrophes?

A

Faux, les métanotrophes consomment le méthane pour relâcher du CO2 dans l’atmosphère. Il est toutefsoi possible de retrouver du méthane atmosphérique qui dérive de l’action des métanogènes

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10
Q

Vrai ou faux, le cycle du méthane repose sur un équilibre entre la quantité de méthane atmosphérique et de méthane accumulés dans les sols

A

Vrai

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11
Q

Quels sont les conséquences d’une augmentation du CO2 atmosphérique (plusieurs éléments)
A) Une augmentation de la biomasse des plantes
B) Une diminution de la biomasse des plantes
C) Augmentation de la fixation du carbone dans le sol
D) La communauté de micro-organismes copiotrophe domine
E) La communauté de micro-organismes oligotrophe domine

A

A) Une augmentation de la biomasse des plantes

C) Augmentation de la fixation du carbone dans le sol

D) La communauté de micro-organismes copiotrophe domine

L’augmentation du CO2 atmosphérique permet aux plantes de faire d’avantage de photosythèse donc d’augmenter leur biomasse. De plus, une quantité supérieure de carbone est fixée dans le sol ce qui permet à la communauté copiotrophe de dominer et de libérer encore plus de CO2.

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12
Q

Dans le cycle de l’azote en quoi consiste le passage de l’ammonium en nitrite? et quels sont les acteurs principaux responsables de ce processus?

A

La nitrification qui est effectuée par les micro-organismes oxidateurs d’ammonium

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13
Q

Vrai ou faux, les plantes sont la capacité d’utiliser l’azote sous forme d’ammoniac et sous forme d’ammonium?

A

Faux, les plantes utilisent l’azote sous forme d’ammonium et principalement sous forme de nitrate

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14
Q

Quelles sont les sources d’ammonium qui se retrouve dans le sol? (pluieurs éléments possibles)

A) les fertilisants
B) les animaux
C) La fixation du dinitrogène atmosphérique par les bactéries
D) Les végétaux
E) Toutes ses réponses
A

Toutes ses réponses

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15
Q

En quoi résulte en la dénitrification?

A

La dénitrification consiste en le passage de l’ammoniac sous forme de N2, donc du relâchement de N2 dans l’atmosphère

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16
Q

Quelles sont les effets d’une concentration faible de CO2 atmosphérique?
A) Une augmentation du relâchement du carbone séquestré dans le sol
B) Une domination de la communauté oligotrophe chez les micro-organismes
C) Une domination de la communauté copiotrophe chez les micro-organismes
D) Toutes ses réponses

A

A) Une augmentation du relâchement du carbone séquestré dans le sol
B) Une domination de la communauté oligotrophe chez les micro-organismes

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17
Q

Vrai ou faux, lorsque l’on évalue l’effet de la disponibilités des éléments chez les micro-organismes à long terme, il est important de prendre en compte la disponibilité du carbone, mais aussi de l’azote et du phosphate

A

Vrai, à court terme l’azote et le phosphate ont un effet moins drastique que le carbone, mais un effet important à long terme

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18
Q

Vrai ou faux, les variables climatiques tels que la concentration de CO2 ou température on un effet qui pourrait être caractérisé comme étant unidirectionnel sur les variables biologiques soit les communautés animales et végétales, les communauté microbiennes et la géochimie du sol?

A

Faux les variables climatiques affectent directement les variables biologiques et vice-versa, c’est une relation bidirectionnelle.

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19
Q

Vrai ou faux, la location géographique détermine les populations autant au niveau des animaux, des végétaux et des micro-organismes qui l’habite?

A

Vrai, les facteurs de la location géographique tels que la présence d’eau, l’énergie disponible, la température et la latitude influence les communautés résidentes

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20
Q

Quels caractéristiques concordent le mieux avec la description du sol?
A) - Chaque sol contient des micro-organismes différents.
- La majorité des m-o ne sont pas encore connus
- Plusieurs micro-organismes pathogènes y habitent
B) - Chaque sol contient des micro-organismes différents.
- La majorité des m-o ne sont pas encore connus
- Peu de micro-organismes pathogènes y habitent
C) - Chaque sol contient des micro-organismes similaires.
- La majorité des m-o ne sont pas encore connus, mais cultivables en laboratoire
- Peu de micro-organismes pathogènes y habite
D) - Chaque sol contient des micro-organismes différents.
- La majorité des m-o ne sont pas encore connus, mais cultivables en laboratoire
- Plusieurs micro-organismes pathogènes y habitent

A

B) - Chaque sol contient des micro-organismes différents.

  • La majorité des m-o ne sont pas encore connus
  • Peu de micro-organismes pathogènes y habitent
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21
Q

Vrai ou faux, les micro-organismes du sol ont un effet sur la croissance et la santé des plantes?

A

Vrai

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22
Q

Vrai ou faux, seuls les zones macroscopiques de la terre peuvent être divisés en différentes zones, différents environnements?

A

Faux, les petites particules de terre peuvent contenir différents micro-envionnements selon la matière, la disponibilité de l’oxygène et la disponibilité en nutriments

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23
Q

Quelles sont les 4 zones macroscopiques du sol?

A
  1. La zonne saturée
  2. La zone capillaire
  3. La zone vadose
  4. La terre de suface
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24
Q

Décrivez brievement la terre de surface.

A

La terre de suface est la strate au haut du sol. Elle contient 0,1% à 5% de matière organique ce qui représente la plus grande proportion du sol

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25
Q

Pourquoi la zone la plus profonde du sol au niveau macroscopique est-elle nommée la zone saturée?

A

La zone saturée est saturée en eau d’où son nom

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26
Q

La zone vadose contient-elle de la matière organique?

A

Oui, mais en bas de 0,1%

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27
Q

Comment peut-on savoir qu’il y a des milieux anaérobies au niveau des micro particule dans toutes les strates?

A

On retrouve des bactéries anaéérobies dans toutes les strates

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28
Q

Vrai ou faux, si l’abondance d’un milieu est très élevée, la diversité microbienne l’est aussi?

A

Faux, l’abondance n’est pas un indicateur de diversité

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29
Q

Quel est le but de “the earth microbiome project”?

A

Analyser des communautés microbiennes à traver le monde, dans tous les types d’habitats

30
Q

Compléter la phrase…

Les bactéries représentant la proportion la plus importante dans les sols sont membres des__1__ et des __2__

A
  1. bactéries gram+

2. bactéries pourpres

31
Q
Les organismes les plus abondants du sol font partie des bactéries gram+ tels que: (plusieurs éléments)
A) Les streptomyces
B) Les Lactobacillus
C) Les arthrobacters
Les mycobacteriums
A

A) Les stresptomyces

C) Les arthrobacters

32
Q

Vrai ou faux, les bactéries majoritairement retrouvées dans le sol ont une haute proportion de G et C?

A

Vrai!

33
Q

Qui suis-je?

  1. Je représente jusqu’à 40% des bactéries cultivables dans le sol
  2. Je suis aérobie stricte, hétérotrophe et capable de dégrader une grande gamme de substrats organiques à l’exception de la cellulose
  3. Je subit une modification de ma morphologie entre la phase exponentielle et la phase de latence
A

Actinomycète

34
Q

Choisir présent (+) ou absent (-) pour les différentes caractéristiques chez les actinomycètes

  1. Gram (+/-)
  2. mobile (+/-)
  3. endospores (+/-)
  4. catalase (+/-)
A
  1. +
  2. -
  3. -
  4. +
35
Q

Qui suis-je?

  1. 5-20% des bactéres cultivables
  2. Aérobie stricte, hétérotrophe
  3. Rôle important dans le recyclage des nutriments, la production d’antibiotiques et la production des composées qui donnent l’odeur à la Terre
A

Streptomyces

36
Q

Choisir présent (+) ou absent (-) pour les différentes caractéristiques chez les streptomyces:

  1. exospores (+/-)
  2. production d’antibiotiques (+/-)
  3. Gram (+/-)
A
  1. +
  2. +
  3. +
37
Q

Pourquoi la microscopie est-elle une technique limitée pour identifier les streptomyces?

A

Les streptomyces peuvent prendre plusieurs morphologie telle qu’une forme filamenteuse lorsque les cellules sont à l’état végétatif (semblable au mycètes) et les spores peuvent être très différents

38
Q

Qui suis-je?

  1. je représente de 2 à 10% des bactéries cultivable du sol
  2. Je suis aérobie stricte, gram-
  3. J’occupe un rôle important dans le recyclage des nutriments, la biodégradation et je peux représenter un agent de biocontrôle
A

Bacillus

39
Q

Choisir présent (+) ou absent (-) pour les différentes caractéristiques chez les bacillus:

  1. Gram (+/-)
  2. Endospore (+/-)
  3. Exospore (+/-)
  4. Cellumonas (+/-)
A
  1. +
  2. +
  3. -
  4. +
40
Q

Donnez un exemple d’agent de contrôl chez les bacillus

A

Le BTK fait pas bacillus thuringiensis

41
Q

Qui suis-je?

  1. Anaérobie stricte, gram+
  2. Occupe une fonction de dégradation de la cellulose, dans la formation des acides organiques et d’hydrogène
  3. Forme de batônnet
A

CLOSTRIDIUM THE ONE AND ONLY

42
Q

Donnes des exemples de clostridium?

A

Clostridium tetani, clostridium perfingens, clostridium difficile

43
Q

Qui suis-je?

  1. Je suis aérobie ou anaérobie facultative
  2. je suis un bacille gram-
  3. Je représente de 10 à 20% des bactéries cultivables
  4. J’occupe un role important dans le recyclage des nutriment, la biodégradation, dégradation des xénobiotiques et je produis un pigment fluorescent
A

Pseudomonas

44
Q
Quels microrganismes ont une fonction de recyclage des nutriments?
A) Bacillus
B) Clostridium
C) Pseudomonas
D) Rhizobium
A

A et C

45
Q

Quelles bactéries sont principalement responsables de la fixation de l’azote atmosphérique?

A

Azotobacter et Azospirillum

46
Q
Quelles bactéries sont aérobie strictes?
A) Azotobacter
B) Azospirillum
C) Lactobacillus
D) Rhizobium
E) Pseudomonas
F) Clostridium
A

Toutes sauf Clostridium

47
Q

Vrai ou faux seuls les bactéries sont des micro-organismes telluriques?

A

Faux, le terme micro-organisme tellurique recoupe aussi les champignon, les mycorhizes et autres

48
Q

Les espèces Azotobacter, Azospirillum et Rhizobium fixent l’azote toutefois cette dernière est dans un catégorie bien différente de bactérie fixatrice pourquoi?

A

Les espèces Azotobacter et
Azospirillum sont des bactéries libres du sol tandis que Rhizobium est absolument en association avec une plante hôte comme les légumineuses

49
Q

Quels sont les fonctions des bactéries lactobacilles dans le sol?

A
  1. Elles sécrètent des enzymes permettant de dégrader la matière organique fraîche comme la lignine ou la cellulose
  2. Elle inhibe certains germes pathogènes
50
Q

Quelle est la différence en terme de capacité métabolique entre les actinomycètes et les lactobacilles?

A

Les lactobacilles ont la capacité de dégrader la cellulose en revanche les lactobacilles n’ont pas cette capacité

51
Q

Qu’est-ce que le Phanerochaete sp?

A

Un champignon filamenteux qui produit des enzymes qui dégradent la lignine et la cellulose

52
Q

Qu’est-ce qu’un mycorhize?

A

Le mycorhize est une association entre les racines des plantes et des champignons

53
Q

Quels (2) champignons crée une barrière physique et stimule le développement racinaire?

A

Coniothyrium et trichoderma

54
Q

Quel point en commun entretiennent Phanerochaete sp et les lactobacillus?

A

Ils peuvent dégrader la cellulose

55
Q

Vrai ou faux, les communautés des macro-organismes sont plus facilement affectés par les facteurs environnementaux tels que la lattitude et la température que les communauté microbienes?

A

Vrai, seul le pH semble avoir un réel effet sur les communautés microbiennes

56
Q

Vrai ou faux, comme les macro-organismes, le type d’habitat affecte fortement la diversité microbienne?

A

Faux, il y a peu de relation entre l’habitat et la diversité microbienne

57
Q

Qu’est-ce que la rhizosphère?

A

La rhizosphère est une région formée et influencée par les racines et micro-organismes associés

58
Q

Quelles caractéristiques correspondent à la rhizosphère?
A) nombreuses symbioses et synergies
B) Exclusivement une association de champignons avec les racines des plantes
C) Permet l’augmentation de la croissance de la plante
D) Apport accru et minéraux disponibles grâce à la plante

A

A, C, D

B est faux, car la rhizosphère est riche en micro-organismes de tout type soit des bactéries et des moisissures

59
Q

Qu’est-ce que les microbes en symbiose avec la plante lui apporte?

A
  1. Des facteurs de croissance
  2. La disponibilité de certains minéraux
  3. La protection
  4. Des régulateurs d’hormones
  5. Des antibiotiques
60
Q

Est-ce juste d’affirmer que les interactions entre les microbes et les racines de plante vont déterminer la santé du sol?

A

YES MADAME OU MONSIEUR

61
Q

Vrai ou faux, les bactéries qui poussent le mieux dans le sol (déterminé selon l’approche moléculaire) sont égalment celles qui poussent le mieux en culture classique?

A

Faux, les bactéries qui poussent le moins bien en culture classique sont celles qui sont retrouvées le plus dans le sol

62
Q

Qu’est-ce que la phyllosphère?

A

La flore de la feuille d’une la phyllosphère est l’ensemble des parties des plantes situées au-dessus du niveau du sol et considéré comme habitat pour les micro-organismes.

63
Q

La phyllosphère est composée majoritairement de…

A

De bactéries (99,07%)

64
Q

Qu’est-ce qui a pu biaiser l’analyse de la diversité de la phyllosphère?

A

Les procédés de filtrations des cellules de feuilles ont peu-être éliminé beaucoup d’eucaryotes du fait qu’il ressemble beaucoup à la feuille

65
Q

Vrai ou faux, il est possible de retrouver des bactéris même à près de 3 km sous la surface?

A

Vrai! Sont-elles des bactéries souterraines? WHO KNOWS

66
Q

Quels sont les hypothèses par rapport à comment les bactéries souterraines se sont-elles retrouvées aussi profond?

A
  1. Elles ont été enterrées avec les sédiments et ont survie grâce à un métabolisme très lent
  2. Elle ont suivit l’eau de la surface de la Terre
67
Q

Qu’est-ce que la bactérie Candidatus Desulforudis audaxviator a de particulier?

A

Elle a été retrouvée à 2,8 km de profondeur dans une mine d’or en Afrique. Elle est termophile, mobile, sporulante, sulfate-réductrice et chimiautotrophe.

68
Q

Que signifit l’acronyme PGPR?

A

PGPR: Plant Growth Promoting Rhizobacteria.

69
Q

Les PGPR peuvent être divisés en deux groupes, lesquels?

A
  1. Les micro-organismes nodulaires ou iPGPR (intracellular PHPR)
  2. Les micro-organismes libres ou ePGPR (extracelluar PGPR)
70
Q

Quelles sont les 3 (ou 4) moyens de défenses (anti-microbiens) utilisé par trichoderma? Contre qui?

A
  1. Glyotoxine
  2. Chitinase & Glucanase
  3. Terpénoide

Contre R. solani