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Cours 11: ARN Flashcards

1
Q

Quels sont les deux types d’ARN

A

ARN codant et ARN non codant

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Q

La structure des ARN, qu’est-ce qui est spécial (5)

A
  1. Forme 3D variée
  2. Appariemment des bases intramoléculaire: forme donc des structure secondaire variable
  3. Uracile à la place de thymine
  4. Ribose au lieu de désoxyribose
  5. Bases modifiées
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Q

Ce sont quoi des bases modifiées et servent à quoi?

A
  1. Méthylation des bases
  2. Pseudo-uridylation (Lien C-Glycodique)
    Servent à augmenter la diversité des bases de l’ArN
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4
Q

Qu’est-ce qui suggère qu’au départ l’information génétique est contenue dans l’ARN

A

Capacité de créer des structures 3D complexes: suggère donc qu’au début juste ARN et ribozyme

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Q

C’est quoi un ribozyme

A

ARN doué d’activité enzymatique

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6
Q

Exemple de ribozyme

A

RNASE P et ribosome

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7
Q

Définition de la transcription

A

Processus par lequel info conservée dans ADN est communiqué par ARN (ARNm) et disponible pour la synthèse des protéines

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8
Q

La synthèse de l’ARN est catalysée par quel enzyme?
chez les eucaryotes?

A

ARN polymérase
ADN pol II

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9
Q

L’ARN nouvellement synthétisée est libérée sous quel forme?

A

Molécules simple brin sauf une ptite hélice ADN/ARN de 8-9NT

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10
Q

Comment l’ARN est synthétisé?

A

Complémentaire au brin matrice
Liaison par phosphate à partir du OH 3’
Liaison phosphodiester entre les 2 nucléotides

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11
Q

Structure de l’ARN polymérase

A

Comme une crabe, ADN glisse entre les deux pinces
Noyau central de 5 sous-unités

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12
Q

Comment recruter la polymérase ARN?

A

Par une région d’amorce: le promoteur et avec l’aide de ses facteurs auxiliaires

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13
Q

Différence entre bactéries et eucaryote pour le promoteur

A

Bactérie: 1 seul promoteur pour tous les gènes d’un enzyme ->génère un ARNm commun
Eucaryote: Les gènes d’un enzyme ont chacun leur promoteur : plusieurs ARNm différents

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14
Q

Quelles sont les séquences consensus pour le promoteur chez les bactéries

A

-35, -10 et +1

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15
Q

Quelles sont les séquences consensus pour le promoteur chez les eucaryotes

A

TATA box (équivalent au -10), région d’initiation et autres

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16
Q

Facteurs auxiliaires chez les bactéries

A

Élément sigma de l’ARN polymérase: lie les séquences -35 et -10

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17
Q

Facteurs auxiliaires chez les eucaryotes

A

facteurs généraux

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18
Q

Les étapes de l’initiation de la transcription de l’ARN (slm chez les eucaryote)

A
  1. Liaison des facteurs de transcription autour de la région promotrice
  2. Recrutement le complexe de remodelage
  3. Recrute médiateur
  4. Recrute FG (TFIID)
  5. Recrute ADN Pol II
  6. Bulles de transcription, dégage promoteur et mode élongation par TFIIH
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19
Q

Complexe de remodelage: rôle et structure

A

Déroule chromatine et expose la région du promoteur
1. Catalyse glissement des nucléosomes ou déroulement
2. Éviction des histones
3. Modification PT des histones: code des histones permettant de déterminer conformation ouverte ou fermée

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20
Q

rôle du médiateur

A

se lie au promoteur une fois la chromatine déroulée, recrute FG et ARN pol

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21
Q

TFIID: rôle et quelle protéine lui permet de remplir ce rôle

A

reconnait le promoteur (TATA box) et recrute le ARN POL grâce au TBP

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22
Q

TFIIH: rôles et quelles protéines remplit ce rôle

A
  1. Bulles de transcription (par ses hélicases)
  2. Dégagement du promoteur (Pol II fait une transcription abortie et dégage le promoteur grâce à TFIIH lorsque hybride mature)
    3.Mode élongation
    - Kinase DK9: permet de switcher de mode initiation à élongation
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23
Q

Rôle du kinase DK9

A

Une enzyme faisant partie du TFIIH qui vient switcher à élongation

24
Q

Le facteurs de transcriptions pour l’initiation de la transcription se lie où?

A

Près de la région promotrice

25
Rôle du gouvernail
séparé l’hybride arn-adn
26
Pendant la transcription/elongation: qu’en est-il des nucleosome et des histones
toujours resté !
27
Mécanismes de terminaison de la transcription de l’ARN
1. Boucle qui forme à la séquence palindrome que de l’ARN, le suivant est le U qui provoque la liaison avec le A: liaison faible qui déstabilise 2. Rho: se lie à la séquence de ribosome libre, se déplace tout le long de l’Arn et dénoue l’hybride ARN-ADN
28
Qui est le répresseur pour les gènes codant pour le gallactosidase
LAC 1
29
Opéron vs opérator vs repésseur vs promoteur
30
La séquence opérator est une séquence....
palindromique (même chose si on lit à l'envers)
31
Mécanisme d'activation de la transcription de l'ARNm galactosidase: pr le crp et ampc
Quand pas assez de glucose -> ampc -> liaison AMPC- CRP -> se fixe à l'amont du promoteur (amplificateur)-> active la transcription
32
CRP: c quoi?
un activateur de transcription
33
Quels sont les mécanismes d'inhibition des répresseurs LAC
1. empêche attachement du ARN POL 2. Empêche les réactions d'initiation 3. Empêche l'ARN pol de quitter le promoteur
34
Où se lient la CRP?
Amplificateur, en amont du promoteur
35
en général ce sont quoi les facteurs de transcription?
Ce sont des facteurs qui peuvent réguler l'expression des millions de gènes, à distance
36
les facteurs de transcription ont un effet représsif ou activateur?
les deux
37
Quels sont les deux catégories de facteurs de transcription
régulatoire et constitutive
38
Site de liaison des facteurs de transcription et son mécanisme ensuie
Response elements, recrute ses amis (médiateur, FG et ARN pol) Amplificateur
39
Régulation des facteurs de transcription
- FT sont régulés eux-même par **modifications post traductionnelles, liaisons de hormones ou par d’autre FT**
40
Les facteurs de transcription contribuent à quoi?
Développement, différenciation cellulaire, transformer cellule somatique en cellule souche et surtout initie la transcription
41
Lorsque les facteurs de transcriptions sont liés à un amplificateur: c'est quoi qui se passe
Médiateur se lie au facteur de transcription, les autres se lient au promoteur et forme un boucle
42
Facteurs de transcriptions: coactiveurs et codeprésseurs
coactiveurs: à l'aide plusieurs autres éléments: active l'expression codépresseur: même chose mais pour répresser l'expression
43
Maturation de l'ARN chez les procaryotes?
NON
44
Maturation de l'ARN: Pour les modifications de l'extrémité 5' commence quand
Avant même que la transcription soit finie, dès que le brin de ARN est fraichement sortir de l'ARN polymérase
45
Pourquoi on forme la coiffe?
1. Protéger des exonucléase (triphosphate) 2.Substrat pour les enzymes d'épissage 3. Accrocher plus facilement ribosome
46
Maturation ARN: Pour les modifications de l'extrémité 5 procédure
1. Déphosphoryler pour former le 5' disphophate (phosphohydrolase) 2. Ajout d'un GTP pour former le 5'-5' triphosphate 3. Donne la coiffe ici 4. Méthylaiton de la guanine 5. Méthylation OH des deux premiers 2' qui suivent
47
Comment les bactéries terminent la transcription ?
1. Formation de boucle à séquence parlindromique, près du U, forcant celui-ci de se lier a 2. Facteur RHO: liaison séquence ribosome dénouement
48
Maturation ARN: Poly-A: procédure
1. Séquence polyadénylation sert d'amorce pour l'enzyme Poly-A polymérase 2. Création de série adénine (Poly-A) bcp bcp
49
Maturation ARN: Poly-A Utilisation matrice?
Non
50
Maturation ARN:Exonucléase RAT1
Après clivage, vient dégrader tout ARN qui vient d'être crée (d'où l'utilité de la création de la coiffe)
51
PABP: utilité
s'associe au poly-A, protégeant une déformation partant du 3'
52
C'est quoi un splicesome
Composés de ribonucléoprotéines (RBN) qui s'assemblent et désassemblent tout en long de l'épissage
53
Création liaison polypeptides: bilan ATP
4
53
Procédure de l’epissage
Boite de branchement (2' OH de l'adénine) Attaquer site d'épissage en 5' 2'OH s'associe avec 5' phosphate 3' phosphate de l'exon s'associe avec
53
Épissage alternatif
1. Attaque **nucléophile du 2’-OH du ribose de l’adénosine de la boite de branchrement sur le phosphate de la jonction exon-intron en 5’ (site d’épissage)** 2. Résultat de cette réaction: Libération de l’extrémité 3’ de l’exon en amont 3. une nouvelle liaison phosphodiester entre le **5’OH du premier nucléotide de l’intron** et le **2’OH de l’adénosine de la boite de branchement** 4. Le 3’OH libéré au niveau de l’exon en amont attaque le phosphate de la jonction intron-exon en aval Les deux exons ligaturés correctement + intron cyclisé au niveau de l’adénosine de la boite de branchement
53
où se retrouve arn polymérase I et son rôle
ARNr et nucléole
54
Rôle ARN polymérase II
ARNt et ARNr 50s

iw (3 decks)

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