Cours 1: L’arbre de la vie et les principaux groupes de microorganismes Flashcards

1
Q

Donner les 3 caractéristiques définissant un microorganisme.

A
  • Entité biologique cellulaire ou acellulaire
  • Capable de se répliquer ou transférer son matériel génétique
  • Invisible à l’oeil nu
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Quels sont les 2 grands types d’organisation cellulaire et leurs définitions?

A
  • Procaryote: Matériel génétique pas contenu dans une enveloppe nucléaire
  • Eucaryote: Matériel génétique délimité par une enveloppe nucléaire qui forme un noyau
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Quelle est la théorie de la génération spontanée du 19ème siècle?

A

Petits organismes sont assez simples pour être engendrés spontanément par la matière inerte.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Qu’est-ce que la théorie de la biogenèse de Rudolf Virchow en 1858?

A

Une cellule vivante ne peut être engendrée que par une cellule vivante préexistante.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

De quelle science sont à l’origine Pasteur et Koch?

A

Microbiologie

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Quelle fût la découverte de Louis Pasteur en 1861?

A

Microorganismes présents dans l’air et peuvent contaminer les solution stériles mais l’air lui-même ne crée pas les microorganismes (en contradiction aux théorie de la génération spontanée et biogenèse).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

De quelle science sont à l’origine Pasteur et Koch?

A

Microbiologie

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Qu’est-ce que la taxonomie?

A

Science de la description et définitions des taxons.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Que sont des taxons?

A

Unités d’organismes basées sur des degrés de similitude.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Qu’est-ce que la science de la systématique?

A

Étude de la diversité biologique, elle dénombre et classe les taxons dans un ordre hiérarchique.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Qu’est-ce que l’arbre de la vie?

A

Concept représentant tous les organismes vivants comme reliés entre eux par le moyen d’une ascendance partagée (un ancêtre commun à tous).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Donner 4 exemples de critères et méthodes de classification.

A
  • Caractères morphologiques
  • Caractères génétiques
  • Épreuves biochimiques (activité enzymatique)
  • Épreuves sérologiques (sérum sanguin et réponse immunitaire)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Donner 3 exemples de caractères morphologiques.

A
  • Forme
  • Groupement
  • Taille
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Pour quel type d’organisation cellulaire les critères morphologiques sont-ils peu utilisés afin de les classer?

A

Procaryote

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Donner 3 caractéristiques du séquençage.

A
  • Permet de contourner le problème de la mise en culture des microorganismes non cultivables
  • Séquencer des gènes/génomes
  • Séquencer de l’ADN environnementale
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Donner 4 caractéristiques des ribosomes.

A
  • Complexes composés de protéines/d’ADN ribosomique
  • Extrêmement conservés au cours de l’évolution
  • Présents chez les Eucaryotes/Procaryotes
  • Synthétise les protéines en décodant l’information contenue dans l’ARNm (messager)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Donner 4 caractéristiques des ribosomes.

A
  • Complexes composés de protéines/d’ADN ribosomique
  • Extrêmement conservés au cours de l’évolution
  • Présents chez les Eucaryotes/Procaryotes
  • Synthétise les protéines en décodant l’information contenue dans l’ARNm (messager)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Quels sont les types de microorganismes (3)?

A
  • Acellulaires
  • Procaryotes (unicellulaires)
  • Eucaryotes (uni/pluricellulaires)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Qu’est-ce qu’un microorganisme acellulaire?

A

Entité biologique avec un niveau d’organisation plus simple qu’une cellule.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Qu’est-ce qu’un prion?

A

Agent pathogène de nature protéique sans acide nucléique comme support génétique de leur potentiel infectieux.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Qu’est-ce qu’un virus?

A

Structure très simple dont la partie dont la particule virale est composée d’un seul type d’acide nucléique et entourée d’un capside protéique.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Qu’est-ce qu’une bactérie?

A

Assemblage diversifié de microorganismes unicellulaires et forme souvent la majorité des procaryotes.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Donner 2 caractéristiques des cyanobactéries.

A
  • Font de la photosynthèse (comme végétaux)

- Source de nourriture dans écosystème d’eau douce/salée

24
Q

Que sont les halophiles extrêmes?

A

Archaea dans les environnements salés

25
Que sont les hyperthermophiles extrêmes?
Archaea dans les environnements chauds à très chauds (40 à 110C)
26
Quelles sont les caractéristiques des mycètes (3)?
- Peuvent être unicellulaires (levure) ou pluricellulaires (moisissures) - Reproduction asexuée ou sexuée - Paroi cellulaire composée de chitine
27
Quels sont les 3 types de microorganismes eucaryotes?
- Mycète - Protozoaire - Algue
28
À quoi associe t'on les microbes (3)?
- Infection - Aliments gâtés - Pathologies graves (ex: SIDA)
29
Donner 5 rôles des microbes.
- Premiers maillons de la chaîne alimentaire en milieux aquatiques - Dégrade les déchets dans le sol - Rôle dans la photosynthèse - Équilibre et santé chez les humains - Servent dans des applications industrielles
30
Quel fût la découverte d'Antonie van Leeuwenhoek au 18ème siècle?
Découverte du ''monde invisible'' (microorganismes) par des lentilles grossissantes (qu'il appelle animalcules).
31
Qu'est-ce que l'asepsie et qui est à l'origine de cette découverte?
Méthodes permettant de prévenir la contamination (Louis Pasteur).
32
Quelles sont les 3 méthodes de classement des organismes?
- Taxonomie - Systématique - Phylogénie
33
Qu'est-ce que la phylogénie?
Étude des relations évolutives entre les organismes vivants.
34
Que réunit les Protistes selon Haeckel en 1866 (4)?
- Bactérie - Protozoaire - Algue - Champignon
35
Que réunit le système à 5 règnes de Whittaker en 1969?
- Monère (procaryote) - Protiste - Mycète - Plante - Animaux (eucaryotes)
36
À quoi sert un cladogramme et quelle méthode de classement l'utilise?
Montrer l'histoire évolutive des espèces, populations et gènes (phylogénie).
37
À quoi sert un modèle de classification?
Fournit une liste de caractéristiques/comparaisons pour faciliter l'identification des organismes.
38
Pour quelles raisons les critères morphologiques ne sont pas utilisés pour classer les procaryotes (3)?
- Beaucoup se ressemblent - Certains paraissent semblables mais propriétés physiologiques et métabolismes différents - Fournissent peu d'informations sur les relations phylogénétiques
39
Donner 4 caractères ou techniques génétiques et leurs définitions.
- Composition des bases de l'ADN: Propriété constante pour une espèce donnée - Technique des empreintes génétiques: Comparaison des bases de différents organismes - Test d'amplification des acides nucléiques: PCR permet de multiplier l'ADN microbien en ciblant un gène particulier - Séquençage: Déterminer l'ordre d’enchaînement des nucléotides pour un fragment d'ADN donné
40
Qu'est-ce que l'anomalie du dénombrement?
Différence entre le nombre de cellules dans des environnements naturels vs nombre mesuré au microscope en laboratoire (non cultivables).
41
Comment peut-on séquencer l'ADN environnemental (2 façons)?
- Séquençage de gènes particuliers dans l'environnement (ex: PCR) - Séquençage de l'ADN total dans l'environnement (ex: métagénomique)
42
Pourquoi le gène ARNr est-il un bon gène pour construire une phylogénie/comprendre l'arbre de vie (4 raisons)?
- Distribué chez tous les organismes vivants - Fonction similaire entre les organismes (synthèse des protéines) - Séquence évolue lentement donc conservé sur de longues périodes - Facile à extraire, amplifier, séquencer et aligner
43
Quels sont les 3 domaines de la vie selon Woese?
- Archaea - Bactérie (Procaryote) - Eucaryote
44
Sur quoi se base le nouvel arbre de la vie pour la classification?
Génomes entiers et non sur les gènes ARNr
45
Que sont les stromatholithes?
Plus vieux fossiles connus constitués de couches de procaryotes et sédiments; producteurs de O2.
46
Donner 2 caractéristiques de virus.
- Pas vivants mais partagent notre code génétique | - Rôles écologiques/évolutifs importants
47
Quels sont les rôles écologiques et évolutifs des virus (3)?
- Participent au transfert de gènes entre organismes - Prédateurs des procaryotes - Agents infectieux chez eucaryotes
48
Donner 2 exemples de microorganismes acellulaires.
- Prion | - Virus
49
Donner 2 exemples de microorganismes unicellulaires procaryotes.
- Bactérie | - Archaea
50
Donner 3 caractéristiques des bactéries.
- Matériel génétique est un seul chromosome circulaire - Reproduction asexuée - Paroi cellulaire composée de peptidoglycane
51
Donner 3 caractéristiques des Archaea?
- Paroi cellulaire souvent dépourvue de peptidoglycane - Plusieurs capables de vivre/prospérer en milieux extrêmes - Pas pathogènes
52
Donner 4 types de bactéries.
- Cyanobactérie - Proteobactérie (ex: E. coli) - Spirochetes (ex: syphilis/Lyme) - Actinobactérie (très diversifiés)
53
Que sont les méthanogènes et donner 2 exemples d'environnement?
Vivent dans les environnements anaérobies relâchant du méthane comme déchet. - Marais - Intestins humains
54
Où se situent les Archaea des environnements modérés?
Océans
55
Donner 2 caractéristiques des protozoaires.
- Unicellulaire | - Reproduction sexuée/asexuée
56
Donner 4 caractéristiques des algues.
- Uni/pluricellulaires - Reproduction sexuée/asexuée - Capables de photosynthèse - Paroi cellulaire composée de cellulose