Cours 1: L’arbre de la vie et les principaux groupes de microorganismes Flashcards

1
Q

Donner les 3 caractéristiques définissant un microorganisme.

A
  • Entité biologique cellulaire ou acellulaire
  • Capable de se répliquer ou transférer son matériel génétique
  • Invisible à l’oeil nu
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2
Q

Quels sont les 2 grands types d’organisation cellulaire et leurs définitions?

A
  • Procaryote: Matériel génétique pas contenu dans une enveloppe nucléaire
  • Eucaryote: Matériel génétique délimité par une enveloppe nucléaire qui forme un noyau
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3
Q

Quelle est la théorie de la génération spontanée du 19ème siècle?

A

Petits organismes sont assez simples pour être engendrés spontanément par la matière inerte.

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4
Q

Qu’est-ce que la théorie de la biogenèse de Rudolf Virchow en 1858?

A

Une cellule vivante ne peut être engendrée que par une cellule vivante préexistante.

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5
Q

De quelle science sont à l’origine Pasteur et Koch?

A

Microbiologie

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6
Q

Quelle fût la découverte de Louis Pasteur en 1861?

A

Microorganismes présents dans l’air et peuvent contaminer les solution stériles mais l’air lui-même ne crée pas les microorganismes (en contradiction aux théorie de la génération spontanée et biogenèse).

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7
Q

De quelle science sont à l’origine Pasteur et Koch?

A

Microbiologie

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8
Q

Qu’est-ce que la taxonomie?

A

Science de la description et définitions des taxons.

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9
Q

Que sont des taxons?

A

Unités d’organismes basées sur des degrés de similitude.

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10
Q

Qu’est-ce que la science de la systématique?

A

Étude de la diversité biologique, elle dénombre et classe les taxons dans un ordre hiérarchique.

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11
Q

Qu’est-ce que l’arbre de la vie?

A

Concept représentant tous les organismes vivants comme reliés entre eux par le moyen d’une ascendance partagée (un ancêtre commun à tous).

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12
Q

Donner 4 exemples de critères et méthodes de classification.

A
  • Caractères morphologiques
  • Caractères génétiques
  • Épreuves biochimiques (activité enzymatique)
  • Épreuves sérologiques (sérum sanguin et réponse immunitaire)
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13
Q

Donner 3 exemples de caractères morphologiques.

A
  • Forme
  • Groupement
  • Taille
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14
Q

Pour quel type d’organisation cellulaire les critères morphologiques sont-ils peu utilisés afin de les classer?

A

Procaryote

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15
Q

Donner 3 caractéristiques du séquençage.

A
  • Permet de contourner le problème de la mise en culture des microorganismes non cultivables
  • Séquencer des gènes/génomes
  • Séquencer de l’ADN environnementale
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16
Q

Donner 4 caractéristiques des ribosomes.

A
  • Complexes composés de protéines/d’ADN ribosomique
  • Extrêmement conservés au cours de l’évolution
  • Présents chez les Eucaryotes/Procaryotes
  • Synthétise les protéines en décodant l’information contenue dans l’ARNm (messager)
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17
Q

Donner 4 caractéristiques des ribosomes.

A
  • Complexes composés de protéines/d’ADN ribosomique
  • Extrêmement conservés au cours de l’évolution
  • Présents chez les Eucaryotes/Procaryotes
  • Synthétise les protéines en décodant l’information contenue dans l’ARNm (messager)
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18
Q

Quels sont les types de microorganismes (3)?

A
  • Acellulaires
  • Procaryotes (unicellulaires)
  • Eucaryotes (uni/pluricellulaires)
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19
Q

Qu’est-ce qu’un microorganisme acellulaire?

A

Entité biologique avec un niveau d’organisation plus simple qu’une cellule.

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20
Q

Qu’est-ce qu’un prion?

A

Agent pathogène de nature protéique sans acide nucléique comme support génétique de leur potentiel infectieux.

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21
Q

Qu’est-ce qu’un virus?

A

Structure très simple dont la partie dont la particule virale est composée d’un seul type d’acide nucléique et entourée d’un capside protéique.

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22
Q

Qu’est-ce qu’une bactérie?

A

Assemblage diversifié de microorganismes unicellulaires et forme souvent la majorité des procaryotes.

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23
Q

Donner 2 caractéristiques des cyanobactéries.

A
  • Font de la photosynthèse (comme végétaux)

- Source de nourriture dans écosystème d’eau douce/salée

24
Q

Que sont les halophiles extrêmes?

A

Archaea dans les environnements salés

25
Q

Que sont les hyperthermophiles extrêmes?

A

Archaea dans les environnements chauds à très chauds (40 à 110C)

26
Q

Quelles sont les caractéristiques des mycètes (3)?

A
  • Peuvent être unicellulaires (levure) ou pluricellulaires (moisissures)
  • Reproduction asexuée ou sexuée
  • Paroi cellulaire composée de chitine
27
Q

Quels sont les 3 types de microorganismes eucaryotes?

A
  • Mycète
  • Protozoaire
  • Algue
28
Q

À quoi associe t’on les microbes (3)?

A
  • Infection
  • Aliments gâtés
  • Pathologies graves (ex: SIDA)
29
Q

Donner 5 rôles des microbes.

A
  • Premiers maillons de la chaîne alimentaire en milieux aquatiques
  • Dégrade les déchets dans le sol
  • Rôle dans la photosynthèse
  • Équilibre et santé chez les humains
  • Servent dans des applications industrielles
30
Q

Quel fût la découverte d’Antonie van Leeuwenhoek au 18ème siècle?

A

Découverte du ‘‘monde invisible’’ (microorganismes) par des lentilles grossissantes (qu’il appelle animalcules).

31
Q

Qu’est-ce que l’asepsie et qui est à l’origine de cette découverte?

A

Méthodes permettant de prévenir la contamination (Louis Pasteur).

32
Q

Quelles sont les 3 méthodes de classement des organismes?

A
  • Taxonomie
  • Systématique
  • Phylogénie
33
Q

Qu’est-ce que la phylogénie?

A

Étude des relations évolutives entre les organismes vivants.

34
Q

Que réunit les Protistes selon Haeckel en 1866 (4)?

A
  • Bactérie
  • Protozoaire
  • Algue
  • Champignon
35
Q

Que réunit le système à 5 règnes de Whittaker en 1969?

A
  • Monère (procaryote)
  • Protiste
  • Mycète
  • Plante
  • Animaux (eucaryotes)
36
Q

À quoi sert un cladogramme et quelle méthode de classement l’utilise?

A

Montrer l’histoire évolutive des espèces, populations et gènes (phylogénie).

37
Q

À quoi sert un modèle de classification?

A

Fournit une liste de caractéristiques/comparaisons pour faciliter l’identification des organismes.

38
Q

Pour quelles raisons les critères morphologiques ne sont pas utilisés pour classer les procaryotes (3)?

A
  • Beaucoup se ressemblent
  • Certains paraissent semblables mais propriétés physiologiques et métabolismes différents
  • Fournissent peu d’informations sur les relations phylogénétiques
39
Q

Donner 4 caractères ou techniques génétiques et leurs définitions.

A
  • Composition des bases de l’ADN: Propriété constante pour une espèce donnée
  • Technique des empreintes génétiques: Comparaison des bases de différents organismes
  • Test d’amplification des acides nucléiques: PCR permet de multiplier l’ADN microbien en ciblant un gène particulier
  • Séquençage: Déterminer l’ordre d’enchaînement des nucléotides pour un fragment d’ADN donné
40
Q

Qu’est-ce que l’anomalie du dénombrement?

A

Différence entre le nombre de cellules dans des environnements naturels vs nombre mesuré au microscope en laboratoire (non cultivables).

41
Q

Comment peut-on séquencer l’ADN environnemental (2 façons)?

A
  • Séquençage de gènes particuliers dans l’environnement (ex: PCR)
  • Séquençage de l’ADN total dans l’environnement (ex: métagénomique)
42
Q

Pourquoi le gène ARNr est-il un bon gène pour construire une phylogénie/comprendre l’arbre de vie (4 raisons)?

A
  • Distribué chez tous les organismes vivants
  • Fonction similaire entre les organismes (synthèse des protéines)
  • Séquence évolue lentement donc conservé sur de longues périodes
  • Facile à extraire, amplifier, séquencer et aligner
43
Q

Quels sont les 3 domaines de la vie selon Woese?

A
  • Archaea
  • Bactérie (Procaryote)
  • Eucaryote
44
Q

Sur quoi se base le nouvel arbre de la vie pour la classification?

A

Génomes entiers et non sur les gènes ARNr

45
Q

Que sont les stromatholithes?

A

Plus vieux fossiles connus constitués de couches de procaryotes et sédiments; producteurs de O2.

46
Q

Donner 2 caractéristiques de virus.

A
  • Pas vivants mais partagent notre code génétique

- Rôles écologiques/évolutifs importants

47
Q

Quels sont les rôles écologiques et évolutifs des virus (3)?

A
  • Participent au transfert de gènes entre organismes
  • Prédateurs des procaryotes
  • Agents infectieux chez eucaryotes
48
Q

Donner 2 exemples de microorganismes acellulaires.

A
  • Prion

- Virus

49
Q

Donner 2 exemples de microorganismes unicellulaires procaryotes.

A
  • Bactérie

- Archaea

50
Q

Donner 3 caractéristiques des bactéries.

A
  • Matériel génétique est un seul chromosome circulaire
  • Reproduction asexuée
  • Paroi cellulaire composée de peptidoglycane
51
Q

Donner 3 caractéristiques des Archaea?

A
  • Paroi cellulaire souvent dépourvue de peptidoglycane
  • Plusieurs capables de vivre/prospérer en milieux extrêmes
  • Pas pathogènes
52
Q

Donner 4 types de bactéries.

A
  • Cyanobactérie
  • Proteobactérie (ex: E. coli)
  • Spirochetes (ex: syphilis/Lyme)
  • Actinobactérie (très diversifiés)
53
Q

Que sont les méthanogènes et donner 2 exemples d’environnement?

A

Vivent dans les environnements anaérobies relâchant du méthane comme déchet.

  • Marais
  • Intestins humains
54
Q

Où se situent les Archaea des environnements modérés?

A

Océans

55
Q

Donner 2 caractéristiques des protozoaires.

A
  • Unicellulaire

- Reproduction sexuée/asexuée

56
Q

Donner 4 caractéristiques des algues.

A
  • Uni/pluricellulaires
  • Reproduction sexuée/asexuée
  • Capables de photosynthèse
  • Paroi cellulaire composée de cellulose