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Cours 1 Flashcards

Comprendre le routage intracellulaire: Naissance d'un récepteur et voie de sécrétion

1
Q

Nomme les différents compartiments de la voie de secretion?

A

De gauche à droite

1) L’enveloppe nucléaire

2) Le réticulum endoplasmique

ERGIC entre les deux

3) L’appareil de Golgi (avec citernes)

4) A) Endosomes précoces

B) Vésicules de sécrétion

C) Granules de sécrétion

5) Membrane plasmique

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Q

Dessine la voie de sécretion?

A

p.15

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3
Q

Qu’est ce que le réticulum endoplasmique?

A
  • composé du REL et du RER
    -joue un rôle crucial dans la biosynthèse des protéines et des lipides, le stockage du calcium et le métabolisme des glucides
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4
Q

Quels sont les deux types de RE et qu’est ce qui les différentie? Lequel est le site de sortie du RE?

A

les deux ont une structure différente qui marchent leurs fonctions respectives

RER: Reticulum endoplasmique rugueux
-Granulaire
-Surface tapissée de ribosomes

REL: Reticulum endoplasmique lisse ( SITE DE SORTIE)
-Surface sans ribosomes avec bourgeons et réseau tubulaire +/- élaboré

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5
Q

Nomme les fonctions du RER? (EXAM)

A

production et glycosylation

1) Site de production des protéines sécrétées et transmembranaires

2) Site de production des protéines résidentes du RE, Golgi,
endosome et lysosomes

3) N-glycosylation des protéines

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6
Q

Nomme les fonctions du REL (EXAM)

A

1) Site de sortie du RE ( formation vésicule)

2) Synthèse lipidique

3) Stockage et relargage de calcium

4) Production d’hormones stéroïdiennes

5) Production de glucose

6) Production d’acide chlorhydrique

7) Siège des processus de détoxification (cytochrome P450)

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7
Q

Quels sont les types de translocations protéique au niveau du RER?

A

1) Translocation co-traductionnelle (pdt la traduction)

protéines sont transloquées à travers la membrane du réticulum endoplasmique tandis que leur synthèse est en cours

2) Translocation post-traductionnelle ( après)
après la synthèse complète des protéines, leur transfert dans le RE

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8
Q

Nomme les 6 étapes de la trasnlocation proteique au niveau du RER? (EXAMEN)

A

1) Le SRP (particule de reconnaissance du signal) lie le peptide signal sur la protéine naissante et inhibe temporairement la traduction.

2) Le SRP lie son récepteur membranaire et permet au ribosome de s’associer à la membrane du RE.

3) Liaison de GTP au SRP et récepteur du SRP, entraînant l’ouverture du pore (translocon) et l’insertion du peptide signal dans le translocon.

4) GTP est hydrolyse ce qui entraine la relâche du SRP

5) Synthèse du polypeptide continue et translocation dans lumière du RE

6) Le peptide signal est clivé par une peptidase, libérant la protéine dans la lumière du RE. (ribosome se détache et porc se referme)

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9
Q

De quoi est composé un peptide signal et à quoi servent elles? méthode de clivage

A

composée d’une region N terminale chargée +, d’une region hydrophobe a-a, d’une région C-terminale polaire avec sequence de clivage

clivée de façon co-traductionnelle

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10
Q

Qu’est ce qu’une SRP? Décris son role et comment elle se lie

A

particle de reconnaissance du signal

role: permettre au ribosome de lier la membrane au RE avant la synthèse protéique

se lie au peptide signal

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11
Q

Qu’est ce qu’un translocon?

A

-pore membranaire

-fente permettant le transfert du peptide signal clivé et protéinenmembranaire dans la bicouche lipidique

-Lie l’oligosaccharyl trasnférase, le récepteur SRP et la signal peptidase

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12
Q

fais un schema des étapes de synthèse d’une protéine soluble à une domaine transmembrannaire?

A

p.32

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13
Q

Fais un schema des étapes de synthèse d’une protéine à 2 domaines transmembranaires?

A

p.36

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14
Q

Quel est la difference entre une protéine de topologie type 1 et 2?

Examen

A

TYPE 1: C terminal dans cytosol

TYPE 2: N terminal dans cytosol

p.34

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15
Q

Qu’est ce qui guide l’orientation signal d’ancrage? Ou se trouve la region en acides aminés positives vs celles négatives

A

Règle du positif à l’intérieur

(acides aminés chargés positivement toujours du coté du cytosol)

+: cytosol
- : dans la lumière du RE

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16
Q

Quel sequence peut agir comme codon start et stop selon sa localisation dans la chaine polypeptidique?

A

une sequence hydrophobe

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17
Q

Le signal peptique pour couper une protéine fonctionne SEULEMENT dans le cytosol ou la lumière du RE?

A

La lumière du RE
( donc pas de coupure quand on est dans le cytosol)

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18
Q

Qu’est ce que la glycosylation co-traductionnelle, plus précisément la N-glycosylation?

A

Glycosylation: processus biologique ou des sucres sont attachées à des protéines (modification se faisant en meme temps que la traduction des protéines)

Dans le cas de la N-glycosylation= Chaine de glucide attaché à un atome d’azote d’une ASPARAGINE (N)

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19
Q

Decris le mechanisme de la synthese du precurseur de la N-glycosylation ?

A

se fait du coté luminal du RE

etapes

1) Assemblage sucre par sucre sur le dolichol pyrophosphate

2) Les sucres sont activés dans le cytosol par la formation d’intermédiaires sucres-nucléotides qui sont ajoutés de façon ordonnée sur le dolichol
(Ex: 2 GlcNAC et 5 Mannose)

3) Flippase (transporteur) permet transfert dans la lumière du RER

4) Dans la lumière: ajout de 4 autres mannoses et 3 glucoses (à partir de dolichol-P-mannose/glucose)

5) Transfert en bloc, en une seule étape, sur la protéine naissante par l’oligossacharyl transferase

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20
Q

Quel est le role de la N-glycosylation dans la voie de synthèse des protéines ? (examen)

A

2 roles qui leurs sont associées

1) Controle de qualité: Assurer une bonne conformation du sucre avant la sortie du RE

2) Reconnaissance et action des chaperonnes dans la lumière du RE

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21
Q

comment sont reconnues les protéines mal pliés

A

en utilisant des chaperonnes (LECTINES)

ces lectines lient des oligosaccharides sur les protéines mal repliées

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22
Q

Qu’arrive il aux protéines mal repliées après avoir leur liaison aux lectines?

A

Retenues dans le RE

daubers chaperonnes catalysent a bonne conformation ( CALNEXINE et CALRETICULINE)

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23
Q

fais un schema des étapes du contrôle du repliement et de la sortie du RE des protéines (

de quel coté de la cellule sont ils?

A

p.40

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24
Q

Quelle est la protéine chaperonne la plus abondante et quel est son type?

A

1) BIP (binding protein)

activité ATPase

25
Decris le mecanisme de degradation des protéines mal repliées? Quel est le nom de ce processus?
nom du processus: ERAD: ER-Associated Degradation
26
comment est ce se passe la signalisation des protéines mal repliées? Quel est le nom de ce processus
STRESS DU RETICULUM: signalisation des protéines mal repliées signalisation dy IRE! du RE au noyau
27
Quel est le nom du mecanisme de retour vers le RE pour les protéines résidentes du RE après leur conception. décris comment ca marche EXAMEN
mécanisme KDEL (ou signal KDEL) 1) Signal KDEL: Les protéines résidentes du RE possèdent une séquence KDEL à leur extrémité C-terminale. 2) Transport vers le Golgi: Elles peuvent être accidentellement transportées vers l'appareil de Golgi. 3) Reconnaissance: Les récepteurs KDEL dans le Golgi reconnaissent et lient ces protéines. 4) Formation des vésicules COPI: Un complexe se forme et des vésicules recouvertes de COPI sont produites. 5) Transport rétrograde: Les vésicules transportent les protéines liées de retour au RE. 6) Libération dans le RE: Dans le RE, les récepteurs libèrent les protéines résidentes en raison du changement de pH.
28
Nomme les structures composants l'appareil de Golgi. Quel face représente l'entrée et la sortie?
composé de 4-6 citernes Face cis: entrée fas trans. Sortie 1) Envellope nucléaire 2) RER 3) ERGIC 4) Réseau-cis-Golgien 5: réseau trans-Golgien
29
Comment est maintenu la structure de GOLGI?
1) Interaction avec le cytosquelette 2) protéines matricielles associée aux membranes des saccules Golgiens
30
De quoi sont également responsables les protéines matricielles?
gardent les vésicules golgiennes à proximité -Responsable de l'étape d'arrimage de la fusion membranaire des vésicules Golgi
31
Nomme les fonctions de l'appareil de Golgi ( EXAMEN)?
1) Maturation des proteines synthétisée dans le RE 2) Modification post-traductionnelle: GLYCOSYLATION 3) Contrôle d'adressage des proteines 4) Retour vers le RE, adressage à la MP, aux endosomes 5) traffic membrannaire
32
Nomme en quoi la structure du GOLGI aide en sa fonction : Glycosylation
les enzymes nécessaires (proteines transmembranaires) pour la glycosylation sont enrichies dans des citernes du Golgi - il ya des marqueurs spécifiques pour identifier les citernes Golgi plus dev. dash les cellules fabriquant des glycoprotéines
33
Quel est la diiference entre la N-glycosylation et la O-glycosulation ?
N-Glycosylation: -plus commun ( 90% des glycoprotéines) -Sur groupement NH2 de ASPARAGINE (N) - a lieu dans le RE ( co-traductionnel) sequence N-X-S/T O-glycosylation: -sur groupement hydroxyl d'une SER, THRE, Hydroxylisine - a lieu dans le GOLGI
34
Nomme les cinq fonctions de la glycosylation? pourquoi est ce important (EXAMEN)
1) Maturation/ repliement: empêche agrégation 2) Glyco-code: reconnaissance et triage 3) Augmente résistance à la digestion protéique, infection par pathogène 4) Modifie les propriétés antigéniques d'une protéines ( pas reconnues par le système immunitaire) 5) Module la signalisation et spécificité des récepteurs mémbrannairës 6) Adhésion cellulaire, interaction cellule-cellule ( lectine)
35
Comment se fait l'adhésion cellulaire et les interaction cellule-cellule?
selectness ( rcptrs) reconnaissent les leucocytes à cause de la glycosylation et forment une interaction faible permettant le roulement des leucocytes roulement ---- active les integrines-----(lien leucocytes-integrines) ------adhesion forte
36
Nomme les deux modèles de transport intra-golgien et leurs differences
1) Transport vésiculaire: citernes avec enzymes sont STATIQUES - les protéines cargo sont transportées par des vésicules d'une citerne à l'autre 2) Maturation citernale citernes avec protéines sont DYNAMIQUES enzymes du goglu sont transportées de façon RETROGRADE par des vésicules -Les complexes théoriques sont trop grand pour être mis dans des vésicules
37
Decris le mecanisme des différents étapes du transport vésiculaire?
p.64
38
Quels sont les deux mécanismes moléculaires utilisées lors du traffic vesiculaire?
1) Pour le bourgeonnement: Manteaux COP I et COP II 2) pour la reconnaissance et fusion: MACHINERIE SNAREE
39
Quel sont les composantes structuraux des manteaux? ainsi que leur role
Role: permet de trier les cargos et deformer la membrane les protéines s'assemblent pour former des structures 1) clathrine 2) COPI 3) COP2
40
Nomme les roles des manteaux formées?
1) concentrer et trier les protéines cargos à transporter 2) Deformer la membrane
41
Parmi COP I et COP II, lequel est responsable du transport antérograde et retrograde?
COP II : transport antérograde ( RE vs membrane) COP I: transport retrograde (membrane vers RE)
42
Decris le cycle d'activation des petites protéines G ( EXAMEN)? p.71
1) on a du GDP liée au Sar1p (COPII) /ARF1(COPI) par une hélice amphipatique 2) liaison de ce complexe au GEF (facteur d'échangeguanosidique) sur la membrane hydrolyse le GDP en GTP sur Sar1p 3) la petite proteine est donc activé et deviens une protéine effective
43
Nomme les étapes de la formation de vésicule COPII?
1) activation ( se fait dans LUMIERE DU RE) 2) capture des cargos 3) assemblage du manteau/deformation de la membrane 4) Etranglement 5) Desassemblage du manteau ( (action GAP: hydrolyse du GTP sur Sar1p)
44
Fais un tableau décrivant les differences entre les types de vésicules COP I et II EXAMEN
minitest
45
Nomme les étapes de la formation de vésicule COPI? Difference
1) activation ( se fait dans LUMIERE DU GOLGI) 2) capture des cargos 3) assemblage du manteau/deformation de la membrane 4) Etranglement 5) Desassemblage du manteau (action ARFGAP: hydrolyse du GTP sur ARF1)
46
Qu'est ce que le transport rétrograde et qu'est ce que le transport antérograde des vésicules? quel proteine entre la kinésine et la dyneine est responsable du quel? EXAMEN
antérograde: RE vers Golgi ( vers - des microtubules ) causé par les DYNEINES rétrograde (retour): Golgi au RE ( vers + des microtubules causée par les kinésines
47
Qu'est ce qu'une SNARE et comment ca fonctionne?
proteines importantes pour la fusion cellulaire divisée en 2 types selon leur localisation V-snare ( sur les membranes des vésicules de transport): monomere T-snare (sur les membranes des compartiments cibles): 2-3 proteines
48
qu'est ce qui permet une fusion spécifique et maintien de l’intégrité des compartiments intracellulaires?
reconnaissance entre les proteines V-Snare et T-Snare car ils sont complémentaires (fusion)
49
Comment sont formés les SNARES?
domaines helices alpha qui s'enroulent et forment un complexe de 4 helices tres stables qui force le rapprochement des membranes (fermeture eclair)
50
Comment sont désassemblés les snares?
energie nécessaire: NSF ( atpase permettant de dissocier le complexe)
51
Qu'est ce que la voie de secretion constitutive: examen
-Utilise des vésicules de sécrétion -dans toutes les cellules -se fait de façon CONTINUE -permets R/N des proteines et lipides -exocytose: fusion des vésicules avec la membrane à l'aide des snares -necessite pas de motif ou signal ( voie par défaut) -Snares sont impliquées
52
Qu'est ce que la voie de secretion régulée:
-cellules spécialisées dans la secretion - Stockage -se fait via des GRANULES de secretion - Préassemblage des SNARES pour une fusion rapide -secretion par exocytose seulement en réponse à un stimulus ( exemple: influx de calcium) - secrete des petites molecules ( histamine, neuropeptides)
53
Qu’est ce qu’une granule de sécrétion? Examen
-( utilisé dans voie RÉGULÉE Vésicules de stockage qui s’accumule près de la membrane plasmique -sécrétion rapide sur demande -exocytose ( dégradation) en réponse à un stimulus( calcium, ou liaison cible recptr) Les snares sont pré assemblées pour fusion rapide
54
Décris le concept de comment une granule est formé au nieau transgolgien et les différentes? EXAMEN
aggregation selective des proteines provenant du golgi permets leur concentration dans des granules de secretion 1) Reconnaissance des Signaux : Les agrégats destinées à la sécrétion possèdent des signaux spécifiques. 2) Récepteurs de Tri : Ces signaux sont reconnus par des récepteurs d'agrégats au niveau du trans-Golgi. 3) Assemblage des vésicules : Des complexes protéiques de clathrine aident à former des vésicules autour des protéines triées dans le TGN. 4) Maturation : Les vésicules contenant les protéines se détachent du trans-Golgi, formant des granules de sécrétion mature.
55
Quelle est la difference des granules et vésicules de sécrétion? EXAMEN
Granule de secretion = voie de secretion régulée= granule libérée par exocytose régulée: après des signaux spécifiques (calcium, neurotransmetteur, hormone) Vésicule de secretion: Voie de secretion constitutive= granule libérée par exocytose continue = exocytose continue
56
Qu'est ce que la synaptotagmine?
- capteur de calcium - mene fusion des vésicules synaptiques avec la membrane - déclenche exocytose des granule de secretion plasmique en réponse à une augmentation de la concentration en calcium intracellulaire
57
Quel est le role des granules de secretion?
1) accumulation des proteines de secretion 200-400x plus concentrées que dans RE prêtes pour la fusion membranaire 2) Maturation/Biosynthese des hormones contenues dans les granules (insuline)
58
Comment est c e que le calcium permet l'exocytose? EXAMEN
à cause protéine liant le calcium: synaptotagmine senseur de calcium qui permet assemblage complet des SNAREs
59
Nomme les différentes étapes de l'exocytose des granules ou vésicules synaptiques ? EXAMEN
1) Arrimage: Les vésicules synaptiques sont acheminées vers la membrane plasmique et se lient à celle-ci par des interactions spécifiques. 2) Entrée du calcium et liaison à la synaptotagmine: L'arrivée d'un potentiel d'action entraîne l'ouverture des canaux calciques voltage-dépendants, permettant une entrée rapide du calcium dans la cellule. La synaptotagmine, qui est un senseur de calcium, lie les ions calcium, ce qui permet l'assemblage des complexes de protéines SNARE. 3) Amorçage: Les protéines SNARE commencent à s'enrouler ensemble, mais le processus de "zippage" n'est pas encore complet. Cela prépare la vésicule pour la fusion. 4) Fusion: Le "zippage" des protéines SNARE se complète, entraînant la fusion de la membrane de la vésicule avec la membrane plasmique, et libérant ainsi le contenu de la vésicule dans la synapse.

TP de pharmacodynamic (2 decks)

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