Control transcripcional Flashcards
Región necesaria para la regulación del inicio de traducción
Región 5´UTR
CAP → AUG
La región 3´UTR puede influir en:
- Poliadenilación (cant. de A)
- Eficiencia de traducción
- Localización (a dónde va el ARNm)
- Estabilidad del ARNm
Mientras más adeninas más dura el ARNm
Empalme alternativo
- Manera en la que los pre-ARNm son procesados
- Los intrones se eliminan y dejan a
los exones - En diferentes tipos de células
Proteínas que activan los sitios de empalme
Proteinas SR
(asociadas a exones)
Ricas en serina/arginina
ProteÍnas que inactivan los sitios de empalme
Proteínas hnRNP o snRNP
(asociadas a intrones)
Ribonucleoproteína heterogenea nuclear
Composisión del espliceosoma
- 5 ribonucleuproteínas pequeñas
- 300 proteínas
- NTC: (nineteen –complex)
- NTR: (nineteen complex related)
Transcritos primarios o hnRNA
- ARN precursores → maduran mediante splicing → mRNA maduro
- 10 veces más grande que el RNA maduro
¿Qué es la maquinaria de splicing, espliceosoma o maquinaria de corte y empalme? ¿Qué hacen? Tipos
- Ribonucleoproteína ( o sea RNA) + proteínas
- Reconocen extremos 5’, 3’ y adenina
Subunidades del espliceosoma
Mayor → U1- U6
- 5’: identifica GU
- 3’: AG
Menor → U11, U12 U4atac, U5, U6atac
- 5’: reconoce AU y GU
- 3’: AC y AG
U1
- Proteína de reconocimiento
- Identifica la secuencia GU 5’ del intron
Asociada a una proteínade corte (U1 snRNP)
U1 snRNP
- Proteína de corte
- Se une al 5’ del intron
U2AF
- Proteína de reconocimiento
- Identifica la secuencia AG del 3´del intron
Asociada a una proteína de corte (U2 snRNP)
U2
- Reconoce a la A central solita
¿Quién se encarga de desplazar a U1?
Complejo U4/U6 y U5 snRNP se unen al preRNAm → sale U1 del extremo 5’
U6 (ribozima) se une a ………… y se desplaza U4
U2
U4 está inhibiendo a U6 para que no esté cortando siempre
¿Qué sucede una vez que U6 se une a U2?
U1 sale junto con U4 → U6 se activa → CORTA
U5
Ayuda a emparejar exones
Apoya a U6 para el corte
Edición del ARN
Modificación en una o mas bases del RNA
maduro
Desaminaciones de ARN
- Adenina → Inosina
- Citosina → Uracilo
(Puede producir un cambio en la secuencia
de aa de una proteína)
Adenosin deaminasas
Modificaciones que sufre el ARN para poder salir del núcleo al citoplasma¿Quién le dice a dónde ir?
- Caperuza (metilguanosina en 5’)
- Cola de poli A en 3´
- Eliminación intrones (SOLO queden exones)
Región 3’ UTR dice a dónde ir
Búsqueda de escape
Regulación traduccional
- Mismo RNAm, solo cambia secuencia de señalización
- Se bloquea el primer AUG → sale un amino terminal diferente → cambia la secuencia señal → cambia el destino de la proteína
Se utiliza cuando se requiere la misma proteína en diferentes localizaciones
¿Dónde se unen las proteínas inhibidoras de la traducción?
Extremo 5´
Sistema de emergencia UPR
En situaciones de estrés del RE…
Se fosforila eIF2 → desacoplamiento del ribosoma → inhibición de la traducción
¿Dónde ocurre la degradación de mRNA?
Un ARNm vive de 30 min - 10 hr
Citoplasma
Cola de poli A se va acortando (inestable-25 a 30 nt) en el citoplasma
Tipo de degradación de 5’ a 3
Deadenilasa → quita cola de poli A
Enzima de descapsulación → quita caperuza
Exonuclease (5’ a 3’)
Tipo de degradación de 3’ a 5’
Deadenilisa → quita cola de poli A
Exosoma (3’ a 5’) → va quitando nucleótidos hasta llegar a la caperuza
Diferencias en la secuencia en la UTR 3’ determinan la velocidad de acortamiento de la cola poli A…
- Ricos en AU vida media
corta - Ricos en C vida media larga
