Communication cellulaire Flashcards

1
Q

Quels sont les principes généraux de la communication cellulaire?

A

Mécanismes pour répondre aux changements
physiques et chimiques de l’environnement
se sont développés depuis les unicellulaires

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Q

Quels sont les quatre modes de signalisation cellulaire?

A
  1. Contact dépendante: le ligand reste fixé à la surface de la cellule émettrice
  2. Signalisation paracrine: affecte les cellules dans
    l’environnement immédiat
  3. Signalisation synaptique: Une signalisation
    pour les longues distances
  4. Signalisation endocrine: Fait intervenir les
    hormones sécrétées dans le sang
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3
Q

Qu’est-ce qu’un ligand? Qu’est-ce qu’un récepteur?

A

1) Ligand: Protéine, peptide ou petite molécule (ex: médicament); généralement soluble, extracellulaire (exceptions); constitue le 1er messager

2) Récepteur: servent à la réception des signaux. Ce sont:
– Protéines: modifiées ou non (post-traductionnel)
– Habituellement situés à la surface, mais peuvent aussi être présents dans le cytosol ou le noyau
– Activent une ou des voies de signalisation
intracellulaires –> cibles spécifiques

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4
Q

Comment les cellules sont programmées pour répondre à des combinaisons spécifiques de molécules de signalisation extracellulaires?

A

Les cellules sont exposées à des centaines de signaux (facteurs de stress, signaux physiologiques…). Elle doit pouvoir intégrer un nombre presqu’illimité de combinaisons de signaux, d’où la complexité. Les récepteurs permettent une réponse sélective aux molécules de signalisation. => Mène au contrôle de:
1. La survie
2. La prolifération
3. La différenciation
Le signal induit une réponse en fonction de l’état de détermination de la cellule, des gènes exprimés, i.e. de sa capacité à répondre dans un sens ou dans l’autre.
Sans signal, la cellule déclenche l’apoptose.

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5
Q

Donner les définitions des concepts suivant:

  • Agoniste
  • Antagoniste
A

Agoniste: molécule qui se lie à un récepteur
spécifique et qui déclenche les mêmes effets que le
ligand naturel = un amplificateur (substance analogue)

Antagoniste: molécule qui se lie à une molécule
de signalisation ou son récepteur spécifique à la place
du ligand naturel ou de l’agoniste, et bloque son
activité (ex: médicaments anti-cancéreux tels flutamide et tamoxifène)

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6
Q

Quelles sont les différences entre seconds messagers et protéines de signalisation?

A
  1. Seconds messagers:
    • Produits en grand nombre, diffusent rapidement
    • AMPc, Ca2+ (diffuse au cytosol), NO, Zn, O2
    • Diacylglycérol (DAG: diffuse dans la membrane)
    • Transmettent le signal aux protéines de signalisation
  2. Protéines de signalisation:
    • Grosses molécules
    • Produisent de petits médiateurs
    • Activent la protéine de signalisation suivante: sentier
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7
Q

Que fait l’addition ou la perte d’un groupement phosphate ou la liaison de GTP?

A

Cela active ou inactive les deux principales classes de commutateurs moléculaires (Protéines phosphorylées (-PO4) et Protéines liant le GTP

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8
Q

Quel est le fonctionnement général des voies de signalisation intracellulaires et le rôle des différents types de protéines de signalisation impliquées dans la transduction du signal depuis la membrane jusqu’au noyau?

A

La communication entre cellules se fait essentiellement par des molécules de signalisation extracellulaires (1er messager)
La réception du signal dépend de récepteurs protéiques membranaires, pour la plupart.
Les protéines intracellulaires de signalisation (souvent des kinases) permettent des cascades de réactions pour transmettre le signal.
La voie de signalisation débouche sur des protéines cibles qui affectent le comportement de la cellule selon le signal.

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9
Q

Quels sont les principaux domaines de liaison modulaire et comment fonctionnent ces domaines dans la signalisation intracellulaire?

A
• SH2: domaine d’homologie Src2
• PTB: phosphotyrosine-binding domain
– SH2 et PTB lient les Tyr-PO4
• SH3: domaine d’homologie Src3:
– lie une séquence riche en Prolines
• PH: domaine d’homologie à la pleckstrine
(principal substrat de la PKC dans les plaquettes)
– lie les PIP membranaires
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10
Q

Comment fonctionnent les trois types de complexes de signalisation intracellulaire qui augmentent la vitesse, l’efficacité et la spécificité de la réponse?

A

1) Complexes de signalisation pré-formés sur les protéines d’échafaudage (scaffold proteins)
2) Assemblage du complexe de signalisation sur un récepteur activé
3) Assemblage du complexe de signalisation sur
des sites d’arrimage de phosphoinositides

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11
Q

Expliquer le concept d’intégration du signal.

A

La cellule doit souvent intégrer l’information (les signaux) provenant d’origines distinctes. Tous les signaux sont pris en compte et le signal le plus fort déterminera le comportement de la cellule.

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12
Q

Quelles sont les rois grandes classes de récepteurs membranaires?

A

Récepteurs couplés aux

  1. canaux ioniques
  2. protéines G
  3. aux enzymes
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13
Q

Quelle est la différence entre une réponse rapide, une réponse lente et une réponse transitoire?

A

a. Réponse lente si requiert l’expression de gènes et la synthèse de nouvelles protéines
b. Réponse rapide si requiert la modification de protéines déjà existantes (phosphorylation ou autres modifications post-traductionnelles; canaux ioniques)
c. Réponse transitoire: contôle de la durée de la réponse par 1. Par l’alternance entre une forme active et inactive (via l’effaceur: phosphatase ou GAP)
2. Par la stabilité de la molécule
La réponse cesse quand le signal et la signalisation cesse

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14
Q

Comment la demi-vie d’une molécule de signalisation peut affecter la vitesse à laquelle une cellule peut répondre à l’arrivée ou à l’arrêt d’un signal?

A

La vitesse à laquelle la cellule répond à l’arrivée ou l’arrêt d’un signal dépend de la stabilité des molécules de signalisation affectées par ce signal. La réponse cessera plus ou moins vite selon que la molécule signalisatrice affectée par ce signal est stable (longue demi-vie) ou labile (courte demi-vie).

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15
Q

Quelles sont les différences entre une réponse progressive (ou additive), discontinue (ou « tout
ou rien ») et coopérative.

A

Réponse progressive (ou additive): proportionnelle à
la force du signal, hyperbolique

Réponse abrupte (ou coopérative) : pas de réponse au-delà d’un seuil

  • discontinue (ou « tout ou rien »): passage abrupt au-delà d’une concentration du signal, ou par rétrocontrôle positif
  • sigmoïdale: Pas de réponse à faibles [ligand].
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16
Q

Comment les mécanismes de rétrocontrôle positif et négatif affectent la réponse à un signal?

A

Avec le rétrocontrôle positif, une fois activé, la réponse persiste même si le signal disparaît.
Avec le rétrocontrôle négatif:
Si le rétrocontrôle est rapide –> réponse brève –> diminution de la réponse
• Si le rétrocontrôle est retardé –> réponse oscillante –> laisse le temps au système de se réactiver complètement

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17
Q

Par quels mécanismes sont contrôlés un système bistable et une réponse oscillante?

A

Le système bistable se produit lors d’un rétrocontrôle positif. Le système va soit être allumé ou éteint.
Une réponse oscillante se produit lors d’un rétrocontrôle négatif retardé et est contrôlée dans le temps. La réponse cesse rapidement quand le signal cesse même si la protéine est très stable.

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18
Q

Par quels mécanismes les cellules peuvent-elles ajuster leur sensibilité à un signal?

A

L’exposition prolongée au stimulus diminue la réponse de la cellule à ce signal (processus de désensibilisation) . Cela peut se produire de différentes façons: en affectant soit les récepteurs ou les protéines de signalisation.

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19
Q

Par quels mécanismes fonctionnent les récepteurs couplés aux protéines G?

A

Lorsqu’un ligand se lie à un récepteur couplé à une protéine G, cela provoque un changement de conformation qui permet à une protéine G de se lier. Dans la protéine G, le domaine AH de la sous-unité α fait des échanges GDP –> GTP. La sous-unité α peut être inactivée par son activité GTPase intrinsèque ou/et une GAP: RGS (Regulator of G protein signaling).

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20
Q

Quel est le rôle de l’AMPc dans le fonctionnement des CPRG?

A

Dans la voie de l’adénnylate cyclase, lorsque celle-ci est active, elle convertit l’ATP en AMPc. L’AMPc se lie ensuite à une sous-unité régulatrice de la PKA, se qui permet l’activation des 2 sous-unités catalytiques. La PKA est ainsi activée et se rend au noyau pour phosphoryler un facteur de transcription (CREB).

+ AKAP qui lie les sous-unités régulatrices de PKA
et l’ancre sur cytosquelette ou une membrane

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21
Q

Quel est le rôle du Ca2+ et des inositol phospholipides dans le fonctionnement des CPRG?

A

Le CPRG activé, active à son tour une protéine Gq. Celle-ci active la phospholipase c-β qui va couper le PIP2 en en IP3 et DAG. IP3 se lie à des cannaux Ca2+ dépendant du RE. La Ca2+ sort et se lie à la PKC. Elle se lie à DAG et est activée. Elle peut ainsi phosphoryle des protéines cible et continuer la voie de signalisation.

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22
Q

Quelles sont les étapes du mécanisme de la signalisation par le monoxyde d’azote (NO)?

A
  • Nerfs des parois des vaisseaux sanguins libèrent acétylcholine qui active RCPG sur cellules endothéliales
  • RCPG active Gq, qui stimule la synthèse de IP3 et la libération de Ca+2 qui active l’enzyme qui synthétise le NO (NOS)
  • Les cellules endothéliales répondent à l’acétylcholine en libérant du NO (second messager)
  • Qui relâche les muscles lisses de la paroi qui se dilate
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23
Q

Par quel mécanisme fonctionne le citrate de sildénafil (Viagra)?

A

Le NO est produit par la désamination de l’arginine par la NO synthase (NOS). Le NO se lie au fer de la guanylyl cyclase. Cela catalyse la réaction GTP–> GMPc, ce qui permet de maintenir la vasodilatation.
Une phosphodiestérase dégrade le GMP cyclique rapidement pour maintenir un équilibre avec la production de GMP cyclique par la guanylate cyclase. Le Viagra inhibe la phosphodiestérase stabilisant ainsi le GMP cyclique dans les muscles lisses. Le GMP cyclique maintient donc les vaisseaux sanguins dans un état de vasodilatation ce qui augmente le flux sanguin.

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24
Q

Par quels mécanismes fonctionnent les récepteurs à activité tyrosine-kinase (RTK), incluant les mécanismes d’activation et d’inhibition?

A

Activation: 1) Liaison du ligand –> dimérisation et activation des domaines kinase, 2) auto/transphosphorylation 3) activation complète + formation de sites d’arrimage –> recrutement
4) Formation de complexes de signalisation pour différentes voies

Inhibition: Des protéines à domaines SH2 (ex: c-Cbl) lient les RTK via P-Tyr et vont causer leur inhibition

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25
Q

Quels sont les membres de la superfamille Ras des GTPases monomérique?

A

– Ras-GTP actif vs Ras-GDP inactif
– Ras-GEF active Ras en dissociant GDP et captant GTP
– Ras-GAP inactive Ras en ⇑ l’hydrolyse du GTP

26
Q

Par quel mécanisme le RTK Sevenless contrôle l’activité de Ras dans l’œil de drosophile?

A
  1. Bridge-of-sevenless (Boos) = ligand
  2. Sevenless (Sev) = code pour un RTK
  3. Grb2 = adaptateur (lie RTK via SH2 et Sos via SH3)
  4. Son-of-sevenless (Sos) = Ras-GEF
  5. Ras = GTPase
27
Q

Quelle est la composition du module des protéines kinases activées par le mitogènes (MAP kinase)?

A

MAPKKK (Raf-­1, A-‐Raf, B-­‐Raf, MOS)
MAPKK (Mek 1 et 2)
MAPK (Erk-1 et 2)

28
Q

Comment se réalise l’activation par Ras d’un module de phosphorylation sérine/thréonine de MAP kinase?

A

Ras est active lorsqu’elle est liée au GTP. Raf reçoit un signal d’activation directement de Ras et est phosphorylé. Raf phosphoryle et active Mek qui à soon tour phophoryle et active Erk.

29
Q

Quels sont les trois principaux modules MAP-kinases?

A

Erk (p42/p44): activé par facteurs de croissance, croissance et différenciation
JNK et p38: activés par facteurs de stress ex: UV, choc thermique, hypoxie, stress, osmotique, cytokines inflammatoires )
JNK: croissance, différenciation survie et apoptose, activé par stress, facteurs de croissance et de différenciation
p38: , production de cytokines et apoptose, activé par stress
Ras -> MAPK3 -> MAPK2 ->MAPK -> cibles

30
Q

Quel est le rôle des protéines d’échafaudage dans le fonctionnement des modules de signalisation MAP-kinase?

A

L’utilisation de protéines d’échafaudage permet d’éviter les réactions croisées et assurent la spécificité de chaque réponse.
Chez la levure, la même MAPKKK est utilisée pour les réponses d’accouplement et d’osmolarité, mais elle utilise deux protéines d’échafaudage différentes, qui la relient à des MAPKK et MAPK différentes.

31
Q

Quelles sont les GTPases de la famille Rho?

A

Rho, Rac et Cdc42

Rho-GEF active, Rho-GAP inhibe, Rho-GDP –>inactif

32
Q

Quels sont les principaux rôles des GTPases de la famille Rho?

A

Elles régulent l’actine et les microtubules du cytosquelette, ce qui affecte la forme des cellules,
leur polarité, leur motricité et leur adhésion.
Elles contrôle la progression du cycle cellulaire, le transport membranaire, la migration cellulaire et croissance de l’axone des cellules neuronales.

33
Q

Par quel mécanisme les GTPases de la famille Rho contrôlent la migration de l’extrémité de l’axone, ou cône de croissance?

A

Liaison d’éphrine A1 d’une cellule voisine au récepteur RTK EphA4 sur le cône de croissance
EphA4 activé recrute une TK cytoplasmique qui phosphoryle et active l’éphexine (Rho-GEF)
RhoA est activé par la Rho-GEF et stimule la contraction du cytosquelette d’actine –> effondrement du cône de croissance.

34
Q

Par quel mécanisme les PI 3-kinases produisent des sites d’arrimage pour différentes protéines de signalisation sur la face cytosolique de la membrane plasmique?

A

La PI3K phosphoryle le cycle inositol sur le C3
PI –> peut être phosphorylé, de façon réversible, sur
plusieurs sites du groupement inositol ce qui génère
plusieurs phosphoinositides (PIP).
• La réaction la + importante: PI(4,5)P2 –> PI(3,4,5)P3
(sert de site d’arrimage aux protéines de signalisation
par l’intermédiaire de leur domaine d’interaction PH)

35
Q

Quel est le rôle de la phosphatase PTEN dans la régulation des phosphoinositides et de la voie de signalisation PI3K?

A

PTEN déphosphoryle et inactive PI(3,4,5)P3 qui est dans la membrane plasmique.

36
Q

Quelle particularité a PTEN?

A

PTEN est une protéine suppresseur de tumeur, « gardien du génome » comme p53
Antagonise la voie PI3K et à ce titre possède des propriétés anti-prolifératives et inhibe la survie cellulaire

37
Q

Par quel mécanisme la voie de signalisation PI3-kinase/Akt stimule la survie et la croissance des cellules animales?

A

C’est la principale voie activée par l’insuline et les facteurs de croissance de type insuline (IGF).
IGFs –> agissent via leur RTK respectif –> PI3K –> PI(3,4,5)P3 –> recrutement de 2 kinases à la membrane via leur domaine PH: Akt et PDK1
• PDK1 participe à l’activation de Akt
• Akt activée inactive des protéines de l’apoptose avec pour effet global ⇑ survie + croissance

38
Q

Quel est le rôle des complexes mTOR-C1 et mTORC2 dans la voie de signalisation PI3-kinase?

A
  1. mTOR1: stimule la croissance : synthèse protéique - sensible à la rapamycine
  2. mTOR2: Insensible à la rapamycine
    • Contrôle le cytosquelette d’actine via Rho
    • Contrôle la fonction des mitochondries
39
Q

Par quels mécanismes les protéines Tsc2 et Rheb activent mTOR-C1?

A

En absence de facteur de croissance, mTORC1
est inactif parce que la GTPase Rheb qui l’active, est inhibée par Tsc2 (une GAP)
• En présence de facteur de croissance, Tsc2 est inhibée par Akt
La MAPK/ERK peut aussi phosphoryler et
inhiber Tsc2 –> favorise la croissance.

mTor-C1 est activé lorsque Akt qui est active inhibe Tsc2. Tsc2 inactive ne peut pas inhiber Rheb. Cela permet à Rheb d’activer mTor-C1.

40
Q

Par quoi est causé le Syndrome de Protée (« Elephant man »)?

A

Il est causé par la mutation dominante et
mosaïque d’un seul nucléotide du gène AKT, ce qui active la protéine (PI3K –>Akt –> mTORC1)
Apoptose insuffisante => excroissance des tissus portant la mutation
Peu de tumeurs malignes

41
Q

À quoi ressemble le chevauchements des voies de signalisation?

A
  1. Certaines voies activées par les RTK et les RCPG
    sont les mêmes
  2. Différentes voies peuvent converger vers les mêmes protéines cibles
42
Q

De quoi dépend l’activité des récepteurs associés à une tyrosine-kinase?

A

Elle dépend de tyrosine-kinases cytoplasmiques associées.

43
Q

Quelles est la plus grande famille des tyrosine-kinases cytoplasmiques?

A

La famille Src constitue la plus grande famille des tyrosines-kinases cytoplasmiques.

44
Q

Par quel mécanisme les tyrosine-kinase cytoplasmiques fonctionnent pour transmettre le signal provenant d’un récepteur membranaire vers l’intérieur de la cellule?

A

La signalisation des tyrosines kinase cytoplasmiques , via FAK (associée avec des intégrines) et Src, est relayée de la matrice extracellulaire vers l’intérieur
de la cellule

45
Q

Quel est le rôle et le mécanisme d’action de la kinase d’adhésion focale (FAK) lors de l’assemblage des plaques d’adhésion focale?

A

Liaison entre matrice extracellulaire - intégrines →
active des voies de signalisation intracellulaire → modification du comportement de la cellule (survie, croissance, division)
• Déclenche l’assemblage de jonctions cellule-matrice = plaques d’adhésion (ou contacts focaux)
La Tyr-kinase Fak (Focal Adhesion Kinase) se fixe à la
partie cytosolique des intégrines. Les kinases Fak se
phosphorylent mutuellement ce qui forme des sites
d’amarrage de phosphotyrosines où va se fixer Src

46
Q

Quel est le rôle des protéines tyrosine-phosphatases?

A

Activation d’une des voies de signalisation par phosphorylation de Tyr est inversée par une déphosphorylation par des protéines tyrosine phosphatases (effaceurs): trans-membranaires et cytoplasmiques
Elles assurent que les phosphorylations sont de courte durée: => cellule au repos = niveau de phosphorylation très bas

47
Q

Quel est le rôle principal des récepteurs NOTCH?

A

Rôle important dans la destinée des cellules et le contrôle de leur organisation spatiale ex: cellules neurales chez la mouche drosophile.

48
Q

Par quel mécanisme NOTCH active-t-il ses gènes-cibles?

A

Protéine ayant un domaine transmembranaire
qui nécessite une protéolyse pour fonctionner
• Liaison Delta => coupure de la queue cytoplasmique de Notch qui migre au noyau pour activer des gènes
• Notch agit en liant un inhibiteur transcriptionnel
(Rbp) et le transformant en un activateur

49
Q

Qu’est-ce que la pré-séniline?

A

C’est une sous-unité de la ɣ-sécrétase impliquée dans la voie NOTCH.

50
Q

Quelles sont les conséquences si le gène codant pour la pré-séniline est muté?

A

Cela cause une forme précoce familiale de la maladie d’Alzheimer.
accumulation de fragments peptidiques extracellulaires à partir d’une protéine neuronale transmembranaire
• L’excès de ces fragments –> formation d’agrégats de protéines mal repliées = plaques amyloïdes

51
Q

Quelle est la fonction des protéines Wnt?

A

Ce sont des molécules de signalisation sécrétées (restent liées à la membrane) ≡ morphogènes

52
Q

Quelles voies de signalisation intracellulaire les Wnt peuvent-elles activer?

A

La voie canonique impliquant la β-caténine (adhésion cellules) et la voie de polarité planaire via GTPase Rho.

53
Q

Par quel mécanisme les différentes protéines agissent-elles dans la voie de signalisation canonique des Wnt?

A

Liaison Wnt-Frizzled –> recrutement du co-récepteur LRP
• Phosphorylation de LRP par GSK3 et CK1 –> recrutement de Dishevelled –> liaison de l’axine sur LRP –> inactivation axine => inactivation du complexe APC
–> stabilisation β-caténine et migration au noyau
–> activation transcription

54
Q

Quel est le rôle de la protéine APC dans le développement du cancer du colon?

A

ne fixe plus la β-caténine qui s’accumule et
active la transcription en absence de Wnt
–> Active gènes cibles incl. c-Myc–> G1Cdk
–> ⇑ prolifération cellulaire –>cancer ….

55
Q

Quel est le rôle de la protéine NF-kB?

A

NF-kB joue rôle important dans réponse au stress, à
l’inflammation et à la réponse immunitaire
• Protéines de stress
• Joue aussi un rôle important lors de l’embryogenèse

56
Q

Par quel le mécanisme par lequel NF-kB est-il activé?

A

L’activation du récepteur
–> activation du complexe IKK
–> phosphorylation de IkB
–> dégradation au protéasome
–> libération de NF-kB qui migre au noyau
–> Active la transcription,
5 protéines NF-kB: RelA, RelB, c-Rel, NF-kB1 et
NF-kB2
–> Forment des homo- et des hétérodimères

57
Q

le mécanisme de régulation de NF-kB par une boucle de rétroaction négative

A

NF-kB active la transcription du gène IkBα qui se lie à NF-kB et l’inhibe.
TNF court = pic de NF-kB –> activation gène A
TNF long = oscillation NF-kB –> activation gènes A et B

58
Q

la structure des ligands des récepteurs nucléaires

A

Ils sont hydrophobes. La plupart ont une structure comme celles des hormones sexuelles.
(métabolisme et vitamines)

59
Q

Par quel mode de signalisation les récepteurs nucléaires peuvent être activés?

A

Par le mode d’action autocrine.

60
Q

Par quels mécanismes les récepteurs nucléaires activent-t-ils la transcription?

A

Voie d’activation classique: homodimérisation.
Les récepteurs sont liés à des complexes de protéines inhibitrices. Lorsque le ligand se lie, le récepteur change de conformation et le complexe de protéines inhibitrices se dissocie. Le récepteur se lie à une protéine co-activatrice qui stimule la transcription de gène.