CM1: Abondance et diversité des microorganismes Flashcards

1
Q

Quelles sont les entités cellulaires?

A

Eucaryotes :
-Protistes
-Champignons
Procaryotes :
-Bactéries
-Archées

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Quelles sont les entités acellulaires?

A

Les virus, les virusoides/viroides/prions

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Pourquoi les microorganismes sont importants pour la planète et dans notre quotidien?

A

IMPACT ENVIRONNEMENTAL
- 1er organismes apparus sur la planète
-présents dans les 3 domaines du vivant
-Organismes les plus abondants et diversifiés sur la planète

IMPACT ECONOMIQUE et SOCIETAL
- Organismes à l’origine des
biotechnologies
-Organismes impactant notre santé
-Organismes utilisés en industrie
(agroalimentaire et pharmaceutique) et dans divers traitements

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Micro-organismes (MO) :
* 1ère forme de vie sur Terre (env. ______(a) milliards d’années)
* Les premiers étaient _______b)
* Puis les _____(c) apparaissent (2.5-3 milliards
d’années) et vont jouer un rôle prépondérant dans la _________(d) de la vie sur Terre en produisant de l’__(e) :
apparition des premiers eucaryotes env. 2 milliards d’années

A

a. 3,8
b. anaérobes
c. cyanobactéries
d. diversification
e. O2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

L’arbre phylogénétique du Vivant tel que défini par le séquençage comparatif des gènes d’ARNr ______(a) (procaryotes) et ____(b)
(eucaryotes). Adapté de celui proposé par Carl Woese en 1977.

A

a. 16S b.18S

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Comment est la nomenclature pour nommer les espèces? Donnez deux exemples

A

Nomenclature :
- Nom de genre: Majuscule au début du nom
- Nom d’espèce: minuscule au début du nom
- Tout en italique
Ex. Homo sapiens; Escherichia coli

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Etymologie « eucaryote »:
provient du grec eu, « _____(a) » et karyon, « _____(b) ».
Désigne donc toutes cellules qui présentent bien un noyau

A

a. bien b. noyau

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Procaryotes : Les Bactéries (Bacteria)
Un domaine extremement diversifié, on rencontre des bactéries capables de quoi?
Quel est leur phylum le plus important?

A
  • croître à haute température
    (Ex. Aquifex, Thermotoga…)
  • photosynthèse anoxygénique
    (Ex. Bactéries vertes (non) sulfureuses…)
  • De photosynthèse oxygénique
    (Cyanobacteria)
  • Etc…
    Le phylum le plus important en nombre
    d’espèces est celui des Proteobacteria.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Procaryotes : Les Archées (Archaea)
Domaine également très diversifié, on rencontre des archées capables de quoi? Sont-elles plus proches des bacteries ou des eucaryotes?

A

On rencontre des archées capables :
* De croître à des températures, pH, salinité extrêmes… mais attention toutes les archées ne sont pas extrêmophiles
* Tous les MOs méthanogènes sont des archées

=>Elles sont plus proches pour certains mécanismes moléculaires des
eucaryotes que des bactéries (réplication, transcription, traduction)

=>Elles ont par ailleurs des caractéristiques uniques n’existant ni chez les eucaryotes, ni chez les bactéries.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Quels sont les 5 super-groupes eucaryotes?

A

-Archéoplastidés
-Excavates
-Amoebozoaires
-Opisthokonta

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

C’est quoi un protiste ?

A

→ Regroupent tous les MOs eucaryotes qui ne sont ni des animaux, ni des
champignons et ni des plantes.
→ Enorme diversité : d’un point de vue phylogénie et morphologie. Certains
sont unicellulaires, d’autres pluricellulaires. Certains hétérotrophes
(protozoaires) d’autres autotrophes (protophytes)… et d’autres peuvent être
les deux (mixotrophes) !

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Donnez des exemples de protistes

A

Excavates: euglènes (algues)
Rhizariens: foraminifères
Straménopiles: diatomés
Alveolates: paramécie

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Donnez un exemple d’un amoebozoaire

A

Le « Blob » Physarum polycephalum, un géant parmi les amibozoaires
MO unicellulaire sporulant, mobile, visible à l’œil nu et présentant plusieurs noyaux

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

À quel règne appartiennent les champignons (fungi)?
Donnez un exemple

A

Appartient au super-groupe des Opisthokonta
> Ils sont distincts des protistes et sont les MOs les plus proches des animaux sur un plan phylogénétique

ex: penicilum

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Quelle est la limite majeure de l’etude des MO?
Comment résoudre plus ou moins ce problème?

A

L’isolement/la culture

Raisons majeures à cette limite :
* Cellules viables mais non cultivables (VBNC)
* Conditions de laboratoire inadéquates pour
la croissance de MO environnementaux
(cultures d’enrichissement impossible)

Resoudre–>études métagénomique

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Combien de procaryotes sont-estimés d’exister sur Terre?

A

Estimation =10^30 procaryotes sur Terre

17
Q

Estimation de la distribution de la biomasse de carbone sur Terre
Biomasse microbienne =______(a) C vs Biomasse animale = _____(b) C
Plantes = ____(c)% Biomasse totale
Microbes = 17% Biomasse totale
Animaux = 1% Biomasse totale

A

a) 93 Gt b) 2 Gt c)82

18
Q

Contribution des cellules microbiennes à la biomasse mondiale.
=> Les MOs constituent une fraction importante du _______(a) et une majorité de
l’azote (N) et du phosphore (P) de la biomasse de tous les organismes sur Terre.
Le a) le N et le P sont les __________(b) dont les organismes vivants ont besoin en plus grande
quantité.

A

a. carbone (C) b. macronutriments

19
Q

Les MO sont les plus abondants et diversifiés sur la planète, comment est cela possible?

A

Cette diversité d’habitat est rendue possible grâce à une incroyable diversité métabolique <–> diversité génomique notamment en taille (pb).

20
Q

Donnez des exemples de voies métaboliques spécifiques

A
  • Respiration anaérobie
    -Photosynthèse anoxygénique
    (uniquement procaryotes) + multitude de pigments photosynthétiques différents
    -Chimiolithotrophie (procaryotes)
    -Fermentations
21
Q

Quels sont les différents types d’extrêmophiles?

A
  • Hyperthermophiles
  • Psychrophiles (cryophiles)
  • Barophiles (piézophiles)
    -Halophiles
  • Acidophiles et alcalinophiles extrêmes
    -Xérophiles
22
Q

Organismes impactant notre santé :
microbiote vs pathogènes

La très grande majorité des MOs sont non
______(a), mais…
Certains constituent une menace permanente
pour les autres êtres vivants et notamment
pour l’être humain
Influence constante sur l’histoire de l’humanité
= Lutte permanente

Il existe des pathogènes dans toutes les
classes de MO (sans compter les virus)
… sauf chez les _____(b) !

A

a. pathogènes
b. Archées

23
Q

Associez un germe pathogène à une maladie:

-Borrelia burgdorferi
-Mycobacterium tuberculosis
-Neisseria meningitidis
-Bordetella pertussis
-Plasmodium falciparum

Malaria, Maladie de Lyme, Tuberculosis, Méningite, Coqueluche

A

Borrelia burgdorferi → Maladie de Lyme,
Mycobacterium tuberculosis → Tuberculosis,
Neisseria meningitidis → Méningite,
Bordetella pertussis → Coqueluche,
Plasmodium falciparum → Malaria

24
Q

Chez les bactéries, dans le système CRISPR-Cas9

a. des ADN de bactériophages agresseurs sont intégrés dans l’ADN bactérien

b.une séquence ADN étrangère est reconnue via un ARN guide et est clivée

c.la nucléase coupe l’ADN étranger aléatoirement

d.CRISPR est une endonucléase

A

a. des ADN de bactériophages agresseurs sont intégrés dans l’ADN bactérien,

b. une séquence ADN étrangère est reconnue via un ARN guide et est clivée

25
Q

V/F: En taxonomie le nom d’espèce précède le nom de genre

26
Q

Quels types trophiques ou mécanismes métaboliques sont restreints au monde microbien ?

a.L’autotrophie
b. L’hétérotrophie
c. La phototrophie
d.La chimiolithotrophie

A

La chimiolithotrophie

27
Q

Quelles sont les caractéristiques de la bactérie Thiomargaita namibiensis?
et de Epulopiscium?
Quelle est leur taille?
Quel est leur volume?

A

-Bactérie sphérique chimiolithotrophe:
750 micromètre
200 000 000micromètre^3
-Bactérie
chimio-organotrophe
80*600 micromètres
3 000 000 micromètres^3

28
Q

Quelles sont les caractéristiques de la bactérie Escherichia coli?
De mycoplasma pneumaniae?

A

-Bactérie chimio-organotrophe
-taille: 1*2
-volume: 2 micromètre^3

-Bactérie pathogène
-taille: 0,2
-volume: 0,005 micromètre^3