Cladistique Flashcards
démarche de la cladistique
Démarches
* (1) Identifier les taxons
* (2) Définir les caractères et les états de caractères
* (3) Valider l’homologie des caractères
* (4) Polariser les caractères
* (5) Construire une matrice [caractères X taxons]
* (6) Construire le cladogramme à partir du partage en commun de caractères dérivés
* (7) Choisir le cladogramme le plus parcimonieux
définition taxon
tout groupe taxonomique qui est monophylétique
vivant ou fossile
définitions des caractères
(1) tous les attributs d’un organisme
pouvant être hérités et qui varient
entre les taxons étudiés
(2) variations observables ou
quantifiables produisant des
caractéristiques permettant de
différentier les taxons
2 conditions des caractères
- structures homologues
- indépendants
définition homologie
(1) similitude héritée d’un ancêtre commun
(2) caractère partagé par deux espèces et qui était présent dans leur ancêtre commun
Critères de reconnaissance de Remane
(1) Critère ontogénétique : deux structures sont homologues si elles possèdent un développement embryonnaire semblable
(2) Critère topographique : deux structures homologues occupent une position relationnelle similaire
(3) Critère du détail : deux structures homologues
possèdent des caractéristiques fines similaires
(voire identiques)
Critère de reconnaissance de Patterson
(1) Critère de ressemblance
(2) Critère de non-coexistence : deux structures
sont considérées comme homologues si elles
ne se retrouvent pas simultanément dans un
même organisme
(3) Critère de congruence : les patrons
congruents de distribution des caractères
permettent de valider l’homologie des
caractères
différence caractère et état de caractère
caractère = concept
États de caractères = expressions observables qui doivent être homologues entre eux
définition polarisation
détermination de la polarité de la
série de transformation entre un état
plésiomorphe et un (ou plusieurs) état(s)
apomorphe(s)
plésiomorphe vs apomorphe
- plésiomorphe (général, primitif) = 0
- apomorphe(spécifique, dérivé, « évolué ») = 1,2
Critères de polarisation pour déterminer si apomorphe ou plésiomorphe
- (1) Critère stratigraphique
- (2) Critère ontogénétique
- (3) Critère de comparaison avec
groupes externes (out-group)
Critères de polarisation : Critère stratigraphique
Les structures que l’on retrouve chez les organismes fossiles les plus vieux correspondent à l’état plésiomorphe (ex: fossiles dans les couches de roches)
Critères de polarisation : Critère ontogénétique
Les premiers stades de développement embryonnaire correspondent à l’état plésiomorphe
Critères de polarisation : Comparaison avec groupes externes
- Utiliser plus d’un groupe externe (préférablement plus de 3) : le caractère en majorité chez ces groupes seront plésomorphes
- le choix des groupes externe a une influence sur la polarisation = doit choisir un groupe proche
Ordination
Détermination d’une séquence d’événements (états de caractère) dans une série de transformation (l’ensemble des états de caractère)
Synapomorphie vs Autapomorphie
Synapomorphie : caractère dérivé
partagé par deux taxons ou plus
Autapomorphie : caractère dérivé
unique à une espèce
Homoplasie
caractère n’ayant pas
une distribution congruente avec
l’ensemble des caractères
résultant soit de convergence (apparition indépendante d’un caractère) ou de réversion (retour à l’état plésiomorphe)
Monophylie (monophylétique)
un groupe monophylétique inclus un ancêtre commun et tous ses descendants
Paraphylie (paraphylétique)
un groupe taxonomique est dit
paraphylétique si les taxons possèdent un ancêtre commun proche mais tous les descendants de cet ancêtre ne sont pas inclus
Polyphylie (polyphylétique)
un groupe taxonomique est dit polyphylétique si les taxons ne possèdent pas un ancêtre
commun proche
