approches évolutives

Question 1

Systématique classique (évolutive,
traditionnelle)

Answer 1

-démarche typologique
et intuitive sans méthodologie liée à la
reconstitution les liens de parenté

• vraies et fausses ressemblances

processus -> patron

Question 2

Phénétique

Answer 2

interprétation des liens de
parenté entre les espèces basés sur la
similitude globale des organismes

Similitudes : globales (vraies et fausses
ressemblances

processus <-> patron

Question 3

Démarche phénétique

Answer 3

• (4) Utiliser une mesure de similarité mathématique :
  e.g., coefficient de simple concordance (s) =
  nombre de concordance / nombre total de caractères
• (5) Calculer une matrice symétrique de similarité (S)
• (6) Choisir une méthode de groupement afin de construire le phénogramme
  (e.g., UPGMA, neighour-joining

Question 4

Taxonomie numérique

Answer 4

• relations entre taxons fondées sur la similitude
  globale; il s’agit de «relations phénétiques» et
  non phylogénétiques
• plus grandest le nombre de caractères étudiés
  meilleure sera la classification des taxons

Question 5

Cladistique (phylogénétique)

Answer 5

: étude des
liens de parenté entre taxons basés
sur le partage de caractères dérivés
en commun ; classification basée sur
des liens de parenté
-> vraies ressemblances

Question 6

Démarche Cladistique

Answer 6

Démarches
* (1) Identifier les taxons (OTUs)
* (2) Définir les caractères et les états de caractères
* (3) Valider l’homologie des caractères
* (4) Polariser les caractères
* (5) Construire une matrice caractères X OTUs
homologues
* (6) Construire le cladogramme à partir du partage en commun de caractères dérivés
* (7) Choisir le cladogramme le plus parcimonieux

Question 7

Différence phénétique et cladistique

Answer 7

Phénétique : similitudes globales (ressemblances vraies et fausses)
Cladistique : similitudes vraies (ancêtres proches)