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B.M > Chapter 1 > Flashcards

Chapter 1 Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qu’un atome ?

A

La plus petite unité possédant les propriétés d’un
élément.

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Q

Chaque atome est constitué d’environ combien de particules élémentaires ? Quels sont les 3 principales ?

A

200 particules élémentaires.
Les trois plus important sont les suivants : neutron, proton (+) et l’électron (-).

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3
Q

Vrai ou Faux : Les protons gravitent autour du noyau à la vitesse de la lumière ?

A

Faux, ce sont les électrons qui gravitent autour du noyau. (300 000 km/s)

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4
Q

Qu’indiquent les rangées (configuration électronique) ?

A

Le nombre de couches d’électron, qui peut contenir 2n^2 électrons.

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5
Q

Comment se nomme la dernière couche d’électron ? Que permet-elle ?

A

La couche de la valence.
Elle permet les interactions entre les atomes = formation de liaisons chimiques)

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6
Q

Quelles sont les éléments important pour les molécules organiques à retenir ?

A

CAPOSH

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7
Q

De quoi dépendent les propriétés d’un atome à former des liaisons chimiques ?

A

De sa dernière couche électronique = les électrons de valence.

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8
Q

Qu’est-ce que la règle de l’octet ?

A

Un atome cherchera à compléter sa dernière couche avec 8 électrons afin d’être stable et ce, en faisant des liaisons chimiques avec d’autres atomes. exception de H et He

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9
Q

Qu’indique l’état électriquement neutre ?

A

Le nombre de protons (+) est égal au nombre d’électrons (-) pour un atome donné.

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10
Q

Vrai ou Faux : L’état électriquement neutre est équivalent à être énergétiquement stable ?

A

Faux.

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11
Q

Complète l’équation suivante :

Moins de mouvement = …

A

Moins de mouvement = plus de stabilité

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12
Q

La formation d’une liaison chimique entre 2 atomes (requiert/dégage) de l’énergie ?

A

La formation d’une liaison chimique entre 2 atomes dégage de l’énergie.

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13
Q

Qu’est-ce qui est nécessaire pour briser une liaison ?

A

Il faut fournir de l’énergie. Les deux atomes retournent à leur mouvement initial.

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14
Q

Les liaisons chimiques (5)

A
  • Covalentes
  • Ioniques
  • Hydrogènes
  • Interaction hydrophobes
  • Forces d’attraction Van der Waals
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15
Q

Quelle liaison s’effectue avec des liaisons covalentes non polaires ?

A

La formation des chaînes carbonées

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16
Q

Quelles sont les possibilités de liaisons pour les atomes de carbones ?

A
  • Simple
  • Double
  • Triple
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17
Q

Avec des liaisons simples, doubles et triples, que finissent par former les atomes de carbones ?

A

Des chaînes, parfois longues et rectilignes, ramifiées ou cycliques.

Ce sont les squelettes des macromolécules biologiques

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18
Q

Est-ce que les chaînes carbonées peuvent faire des liens avec d’autres molécules?

A

Oui, permettre de construire tissu, organes, macromolécules.

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19
Q

Que sont les groupements fonctionnels ?

A

Groupements d’atomes qui participent le plus aux réaction chimiques des molécules organiques.

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20
Q

Que peuvent contenir les groupements fonctionnels (en terme de liaisons) ?

A

Des liaisons :
- Covalentes polaires
- parfois ionisés

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21
Q

Quel est l’avantage de posséder des liaisons covalentes polaires, par rapport aux liaisons covalentes non polaires ?

A

Permet d’avoir des rôles précis, d’avoir une autre fonction.

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22
Q

De quoi est déterminée la structure 3D d’une macromolécule ?

A

Par sa séquence de monomères (liés les uns aux autres par des liaisons covalentes.)

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23
Q

Vrai ou Faux : La structure 3D d’une macromolécule est stabilisée par des liaisons covalentes seulement ?

A

Faux, par des liaisons covalentes et non covalentes.

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24
Q

Pourquoi les macromolécules ont besoin de beaucoup d’acides aminés pour fonctionner si 20% des acides aminés sont nécessaires pour avoir la fonction de la macromolécule ?

A

Le 80% s’assure de la forme de la macromolécule. Les acides aminés sont important et assurent les propriétés physico-chimique de la macromol.

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25
Q

De quoi dépend la survie de la cellule ? Quels sont en général, les interactions entre deux cellules ?

A

Des nombreuses interaction entre les molécules qui la composent.
Elles vont interagir ensemble par des liaisons non covalentes.

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26
Q

Complète la phrase : Plus les deux molécules s’assemblent bien (complimentarité), …

A

Plus les deux molécules s’assemblent bien (complimentarité), plus elles forment des liens non covalents entre elles.

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27
Q

Quelle est la force derrière des interactions de faibles énergies (non covalentes) ?

A

Elles peuvent être nombreuses.

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28
Q

Dis moi le dogme central de la biologie moléculaire (1956 Crick).

A

Réplication ADN -> Transcription en ARN-> Traduction de la protéine

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29
Q

Dis moi la structure d’un nucléotide (3).

A
  • Sucre
  • Base azotée
  • Gr. phosphate
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30
Q

Combien de phosphate peut avoir un nucléoside ?

A
  1. Ce sont les nucléotides qui ont des gr. phosphates.
31
Q

Quelle est la différence entre un Ribose et un désoxyribose ?

A

Le ribose possède un OH sur son C2’ tandis que le désoxyribose possède un H sur son C2’.

32
Q

Combien de phosphates peuvent avoir les nucléotides ?

A

Un nucléotide peut avoir 1 à 3 P
(mono, di, triphosphate)

33
Q

Dis moi les deux purines. Dis moi les deux pyrimidines.

A

Purines : Adénines et Guanines
Pyrimidines : Cytosines et Thymines (Uraciles)

34
Q

Qu’est-ce qui différencie un nucléotide d’un nucléoside ?

A

Un nucléotide possède une base azotée, un sucre et un phosphate -> le nucléoside n’a pas de phosphate.

35
Q

Le pentose (sucre à 5c) fait sa liaison avec le gr. phosphate sur quel C du sucre ?

A

Le 5’ du sucre avec le gré phosphate -> lien phosphoester (covalent).

36
Q

Le pentose (sucre à 5c) fait sa liaison avec la base azotée sur quel C du sucre ?

A

Le 1’ du sucre avec la base azotée ->
lien glycosidique.

37
Q

Comment s’allonge un monomère de nucléotides ?

A

Par l’extrémité 5’ vers 3’ (par liaison phosphodiester = phosphate-5’-3’-phosphate-…)

38
Q

La polymérisation d’ADN nécessite un apport en quoi ?

A

En nucléotides 3-p (NTP)

39
Q

Quels sont les fonctions des nucléotides ? (3)

A
  • Source d’énergie (liaison entre gr. phosphate hydrolysable) = ATP
  • Association pour former coenzymes (CoA)
  • Molécules de signalisation intracell. (AMP cyclique)
40
Q

Comment est-il possible d’obtenir un bilan final positif lorsqu’un brise une liaison (qui nécessite de l’énergie) ?

A

Libérer un phosphate d’une molécule ATP rend la molécule plus stable (les molécules bougent moins). Il faut investir de l’énergie pour hydrolyser l’ATP, mais le gain d’énergie est un surplus de 7.3 kcal/mol.

41
Q

L’ADN est un polymère de nucléotides, mais par quel lien se fait la polymérisation ?

A

Par la formation du lien phosphodiester qui relie les deux sucres de deux nucléotides différents via le groupement phosphate.

5’-P-3’

42
Q

Que requiert le processus de polymérisation de l’ADN ? (2)

A
  • Une enzyme : polymérase
  • Un apport en nucléotides triphosphate (dNTP)
43
Q

Sur quel carbone du sucre est ajouté le nouveau dNTP ?

A

Sur le carbone 3’ (sucre) du nucléotide précédant et une molécule du pyrophosphate et libérée (* 2 phosphate *)

44
Q

Qu’est-ce qui est libéré chaque fois qu’un nouveau nucléotide est ajouté sur le C3’ ?

A

2 phosphates (pyrophosphate)

45
Q

Comment se déroule la polymérisation ? 3’->5’ ou 5’->3’ ?

A

5’–>3’

46
Q

Quelle est la charge globale de l’ADN ?

A

(-) à cause du gr. p.

47
Q

Les liaisons phosphodiesters entre
les nucléotides assurent quoi?

A

La polymérisation de la charpente sucre-phosphate d’un brin d’ADN

48
Q

Vocabulaire : qu’est-ce qu’un brin ou ADN monocaténaire ?

A

Une chaîne de désoxyribonucléotides

49
Q

Vocabulaire : qu’est-ce qu’un ADN bicaténaire ?

A

Associations de 2 brins complémentaires.

50
Q

Vocabulaire : qu’est-ce qu’une nature antiparallèle

A

Polarité inversée des 2 brins complémentaires

51
Q

Qu’est-ce qui assure les liens entre les nucléotides ?
Qu’est-ce qui assure la structure secondaire bicaténaire de l’ADN?

A

Les liens phosphoesters 5’->3’.

Les liaisons hydrogènes.

52
Q

Vrai ou faux : Les sucres sont identiques ?

Vrai ou faux : les bases azotés sont identiques ?

A

Vrai, Faux

53
Q

Pour former des pots H entre les nucléotides (les bases azotées) il faut : (2)

A
  • un couple compatible A-T ou C-G
  • l’orientation des deux nucléotides est antiparallèle = C5’ en face du C3’ de l’autre)
53
Q

Pourquoi la complémentarité des bases est important dans la réplication ?

A

Pour quelle soit juste, afin d’éviter les erreurs.

54
Q

Que veut la règle de Chargaff sur la composition en nucléotides de l’ADN ?

A
  • %A = %T et %C = %G
  • rapport purines/pyrimidines = 1 (dépend de l’espèce)
55
Q

Vrai ou faux : La complémentarité des nucléotides dépend aussi de la forme ?

A

Vrai, le couple A-T a la même géométrie que le couple G-C (la charpente sucre-P demeure stable)

56
Q

Où sont situé les bases azotées dans l’ADN ?

A

Vers l’intérieur (sucre et phosphates à l’extérieur)

57
Q

Vrai ou Faux : Tous les gènes, dans la structure de l’ADN, ont la même forme générale 3D ?

A

Vrai, ils ont la même forme générale 3D.

58
Q

Vrai ou Faux : Le nombre et l’ordre précis de bases (ATCG) constituent l’information génétique ?

A

Vrai

59
Q

Afin de lire une séquence d’un gène, il faut avoir accès …

A

Aux bases, car ceux-ci constituent l’information génétique.

60
Q

Quels sont les deux moyens de voir les bases qui sont à vers l’intérieur de l’ADN bicaténaire ?

A
  • Ouverture de la double hélice d’ADN
  • Sans ouverture de la double hélice d’ADN
61
Q

Comment et quand ouvrir la double hélice d’ADN pour lire les bases azotées ?

A

Durant la réplication de l’ADN et la transcription.

L’ouverture est dû au bris des liens H entre les bases.

62
Q

Comment lire les bases azotées sans ouvrir la double hélice d’ADN ?

A

À travers des sillons (majeurs et mineurs), car la charpente Sucre + P bloque la vision de l’intérieur.

63
Q

Comment sont formés les sillons majeurs et mineurs de l’ADN ?

A

Les sillons sont formés à cause de l’angle entre 2 liens glycosidiques d’un couple de nucléotide.

64
Q

Que peut-on voir dans le sillon mineur : (2)

A
  • paire AT
  • paire CG
65
Q

Que peut-on voir dans le sillon majeur : (4)

A
  • AT
  • TA
  • CG
  • GC
    plus d’info dans sillon majeur
66
Q

Rappel :
- Les nucléotides sont liés ensemble par quel liaison ?
- Les chaînes antiparallèles (les bases) sont liés ensemble par quel liaison ?

A
  • Lien phosphodiester covalent
  • Pont H
67
Q

Comment briser un pont H entre les deux chaînes antiparallèles ?

A

Si on chauffe (dénature) les pont H. On obtient deux brin d’ADN monocaténaire, car les liens phosphodiesters restent intacts.

68
Q

Que se passe-t-il à la suite d’une dénaturation de l’ADN bicaténaire en le chauffant, nous faisons redescendre la température ?

A

Les brins d’ADN se réassocient selon la complémentarité de leurs bases.

(HYBRIDATION)

69
Q

Vrai ou faux : L’hybridation peut se faire entre les deux brins initiaux ou avec d’autres molécules monocaténaire d’ADN ou d’ARN ajoutées dans la solution ?

A

Vrai! L’hybridation est possible entre un brin de départ et un brin ajouté.

70
Q

Que permet l’hybridation ?

A

De détecter la présence d’une séquence spécifique dans un échantillon (production d’une sonde -> séquence d’ADN monocaténaire complémentaire à la séquence recherchée)

71
Q

Vocabulaire : qu’est-ce que la spécificité ?

A

C’est le degré de complémentarité entre deux molécules. Lorsqu’elles se reconnaissent et se lient ensemble.

72
Q

Vrai ou Faux : La spécificité de l’hybride est régie par la température d’hybridation ?

A

Vrai : plus la température est élevée (proche de la dénaturation), plus l’hybride est spécifique.

73
Q

Voir diapo 40 et 41 pour les techniques d’hybridation sur membrane

A

!

B.M (3 decks)

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