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B.M > Chapitre 2.6 - Gène et densité génique > Flashcards

Chapitre 2.6 - Gène et densité génique Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qu’un gène?

A

Ensemble de sengments d’acide nucléiques contenant l’information nécessaire pour produire un ARN fonction de façon contrôlée -> devient protéine.

Caractère transmissible (héréditiare) porté par l’ADN

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Q

Comment sont les gènes bactériens ?

A
  • Généralement oranisés en opérons
  • transcrits d’ARN polycistroniques = information pour +sieurs protéines.
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3
Q

Comment sont les gènes eucaryotes ?

A
  • plus longs et discontinues (introns)
  • ARNm code pour une seule protéine (pas polycistronique) et peuvent être modifiés par épissage alternatif.
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4
Q

Par quoi mesure-t-on la densité génique ?

A

Le nombre de gènes/ Mb d’ADN

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5
Q

Comment est la densité des bactéries ?

A

Haute densité génique (1000 gènes/ Mb)
- génôme majoritairement séquences codantes
- peu de séquences non codantes régulatrices
- une origine de réplication

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6
Q

Comment est la densité génique des eucaryotes

A

Plus complexe est organisme = moins de gènes par Mb.
(10 gènes/Mb)

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7
Q

Que représente les gènes codantes dans le génôme humain ?

A

1,5% du génome humain.
- plusieurs facteurs influenceront la régulation de l’expression.

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8
Q

Est-ce que les gènes non codant sont important ?

A

Oui, dans la régulation des gènes codants.

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9
Q

Que doit-on retenir de la densité génique chez les organismes plus complexes ?

A

Plus grand génome, mais pas plus de gènes.
Nombre de gènes par mégabase est faibles.

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10
Q

Que sont les introns ?

A

La portions non codantes d’ADN située dans un gènes.
Ils sont transcrits puis éliminés par épissage dans les ARN mature.

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11
Q

Chez les humains, quelle est la longueur moyenne d’ADN transcrit en ARN ?

A

27kb/gènes, mais seulement 1,3 kb code pour une protéine.
Donc 95% d’ADN représente les introns.

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12
Q

ADN intergénique

Qu’est-ce que l’ADN intergénique ?

A

Ce sont les segments d’ADN situés entre les gènes (régulation).
Séquence régulatrice de l’expression génique.

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13
Q

Qu’est-ce qu’un pseudogène ?

A

Séquence d’ADN qui a perdu sa capacité à coder pour une protéine en raisons de mutations/duplication ou incorporation de gènes viraux.

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14
Q

Qu’est-ce qu’un ARN régulateurs ?

A

Long ARN (IncRNA) et petit ARN (microARN ou snARN) non traduit impliqués dans la régulations

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15
Q

Quels sont les 4 exemples de séquences uniques ?

A
  • séquence régulatrice
  • les fossiles (pseudogènes et fragments de gènes)
  • ARN régulateurs
  • Les orginies de réplication (séquence spécifique du génome où la réplication commence.)
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16
Q

Trois exemples de séquences répétées ?

A
  • microsatellites
  • Télomères
  • Transposons
17
Q

Relation dynamique entre histones et ADN

Quand est-ce que les protéines liant une séquences spécifique de l’ADN peuvent trouvé leur séquence ?
Qu’est-ce que cela dit sur la chromatine ?

A

Quand la section spécifique est déroulée.
En effet, la chromatine doit être constamment remodelée pour permettre :
- réplication, réparation, transcription..
Chromatine est dynamique

18
Q

Est-ce que tous les gènes se réplique en même temps ?

A

Non.

19
Q

Que requiert le dynamisme de la chromatine ?

A

Des facteurs protéiques qui favorisent ou non la dynamisme.

20
Q

Quels sont deux facteurs protéines important qui favorise ou non le dynamisme entre les histones et l’ADN.

A
  • complexes remodelant de la chromatines (ATP-dépendants)
  • Complexes de modifications post-traductionnelles des queues d’histone
21
Q

Est-ce que les régions d’ADN non utilisées par la cellules sont dynamiques ?

A

Non.

  • les régions d’ADN utilisés sont dynamiques.
  • les régions d’ADN non utilisées par la cellule ne sont pas dynamiques (transcriptionnal silencing)
22
Q

Complexes remodelant de la chromatine (ATP-Dépendant)

Qui recrutent les complexes remodelant de la chromatines (ATP-Dépendant) ? (facteurs protéiques) (2)

A
  • recrutés par les facteurs de transcription
    ou
  • recrutés par les queues N du nucléosomes
23
Q

Pourquoi les complexes remodelants de la chromatines nécessite de l’ATP ?

A

Pour permettre une redistribution des liens entre l’ADN et les histones

24
Q

Comment les compelxes remodelant de la chromatines (ATP-dépendant) «remodulent» la relation dynamique entre les histones et l’ADN ?

A

Ils déplacent des liens non-covalents (Pont H) où leur ADN est déjà déroulé légèrement par glissement.

25
Q

Relation dynamique entre histones et ADN

Combien existent-ils de complexes remodulant de la chromatines (ATP-dépendant) ? Peuvent-ils tous permettent le glissement ?

A
  • 4
  • tous peuvent permettre le glissement de l’ADN et des nucléosomes.
26
Q

Est-ce que tous les complexes remodulants de la chromatines (ATP-dépendant) peuvent permettre l’éjection des nucléosomes ?

A

Non, seulement SW1/SNF peut.

27
Q

Quels compexes remodulant permettent l’échange d’histone ?

A

La sous-famille INO80

28
Q

Est-ce que les variants d’histones (nucléosomes positionnés) sont spécifiques à certaines espèces ?

A

Oui : ils sont spécifiques à certaines espèce.Type ou phases cellulaires.

29
Q

Qu’est-ce que les variants d’histones ont de différence avec les histones conventionnelles ?

A

Leur séquence protéique diffère sur quelques acides aminés -> modifient grandement propriété.

30
Q

Comment les variants d’histones sont positionés ?

A

De manière spécifique à la séquence. Ils régulent ainsi la transcription (de manière spécifique).

31
Q

Trangénèse

Qu’est-ce que la trasngénèse ?

A

Introduction d’un gène étranger dans un génome d’intérêt

32
Q

Qu’est-ce que la sélection classique ?

A

Croisement entre même espèce pour obtenir les meilleurs gènes.

33
Q

Qu’est-ce que la mutagenèse ?

A

Introduction de mutation/radiation pour avoir un trait particulier.

34
Q

Comment fonctionne la transgénèse chez les plantes ?

A
  1. Sélection du gène d’intérêt + rés à kanamycine
  2. Clonage dans le plasmide Ti
  3. Transformation bactérienne (mets plasmide dans la bactérie) et l’intègre dans cell. vegetal (on croise les doigts pour que ça fonct)
  4. Sélection des cell.s trasnformées et croissance de plantules (dans milieux où il ya Kanamycine
  5. Obtenir les plantes trasngéniques avec gènes d’intérêt (toutes les cell. vont être transgénique)
35
Q

Comment fonctione la transfection (transgénèse chez les animaux) ?

A

besoin d’ADN, vecteur viral et gène de sélection
1. Culture cell. souches
2. Vecteur contenent ADN homologues à l’ADN cible + gène à pertber + gène sélection
3. Transfection dans cell. embryonnaires. Par recomb. homologues, séquence du génome est échangée par celle du vecteur.
4. Prolifération
5. Injection dans blasotcyte de souris femelle
6. développement d’une souris mutante

B.M (3 decks)

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