Chapitre 8 Flashcards

1
Q

Définissez l’homéostasie.

A

Caractéristique d’un système dont les propriétés varient très peu dans le temps
(température, pH, concentration des solutés).
Capacité à maintenir constant l’ensemble des paramètres physico-chimiques de
l’organisme (exemple : glycémie, température, taux de sel dans le sang, etc.) malgré la
variation des paramètres extérieurs.

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2
Q

Les hormones participent à la régulation en contrôlant la quantité d’enzyme ou
l’activité enzymatique?

A

En fait, les hormones permettent généralement de faire les deux à la fois. Les messagers
cellulaires produits à la suite de la transduction de signal activent aussi bien des facteurs
de transcription (qui agiront sur la quantité d’enzyme) que des kinases qui entraîneront
des modifications covalentes (modification de l’activité enzymatique).

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3
Q

Énumérer quatre mécanismes utilisés par la cellule pour réguler la quantité d’une
enzyme.

A

La vitesse de synthèse peut être modulée par des facteurs de transcription. Un signal
active un facteur de transcription particulier qui peut alors inactiver ou activer la
transcription de tous les gènes d’un même sentier. Le nombre de molécules d’enzymes
synthétisées dépend également de la stabilité de l’ARN messager transcrit et de la vitesse
à laquelle il est traduit en protéine. La vitesse de dégradation d’une protéine diffère d’une
protéine à l’autre et dépend également des conditions cellulaires.

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4
Q

Énumérer quatre mécanismes utilisés par la cellule pour réguler l’activité
enzymatique.

A

La cellule peut contrôler la disponibilité des substrats (par la séquestration du substrat ou
le contrôle des transporteurs). Elle peut également réguler l’activité enzymatique par
allostérie (présence d’effecteurs allostériques), par modifications covalentes (souvent par
phosphorylation/déphosphorylation) ou encore par la liaison de l’enzyme à une protéine
régulatrice

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5
Q

Lequel de ces énoncés sur le contrôle de la transcription des gènes est faux?
Pourquoi?
Les gènes codant pour les enzymes d’un même sentier partagent souvent le
même élément de réponse reconnu par le même facteur de transcription.
b. Un facteur de transcription active la transcription de tous les gènes précédés
d’une région spécifique de l’ADN (éléments de réponse).
La transcription des gènes codant pour certains transporteurs peut également être
régulée.

A

b FAUX. Un facteur de transcription peut activer, mais également
réprimer la transcription d’un gène

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6
Q

La transcription des gènes de quels sentiers est activée en présence d’insuline?

A

La transcription de plusieurs gènes de la glycolyse, de la voie des pentoses phosphate et
de la synthèse des lipides est activée.

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7
Q

La transcription des gènes de quels sentiers est inhibée en présence d’insuline?

A

Celle des gènes de la gluconéogenèse.

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8
Q

Vrai ou faux. Expliquer. C’est la Km d’une enzyme qui déterminera la sensibilité de
celle-ci à une variation dans la disponibilité du substrat.

A

Vrai. La relation entre la Km et la concentration de substrat [S] est importante. Lorsque la
concentration cellulaire des substrats est similaire ou plus faible que la Km (comme c’est
souvent le cas), la vitesse de ces enzymes n’est pas maximale et varie suite à un
changement dans la concentration de ces substrats. Cependant, pour une enzyme dont la
Km est largement inférieur à la concentration physiologique de substrat, la vitesse est déjà
presque maximale et une variation dans la concentration de substrat (dans les limites
physiologiques permises) n’aura pas un effet important sur l’activité de l’enzyme.

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9
Q

Comment appelle-t-on l’équivalent de la Km pour une enzyme allostérique?

A

k0,5

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10
Q

Les enzymes allostériques existent sous la forme d’un équilibre entre deux formes.
Quelles sont ces formes?

A

Ces protéines adoptent deux conformations appelées état T (inactif ou presque inactif) et
état R (actif).

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11
Q

L’enzyme A a un coefficient de Hill de 0,5 alors que l’enzyme B a un coefficient de
Hill de 2. Laquelle de ces deux enzymes est la plus sensible à une variation de la
concentration de substrat?

A

L’enzyme B. Plus le coefficient de Hill est élevé, moins le changement de concentration
doit être important pour que l’activité de l’enzyme passe de 10 à 90 % de la Vmax.

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12
Q

Quelle est la modification covalente la plus fréquente? Comment affecte-t-elle
l’activité enzymatique (positivement ou négativement)? Est-ce que cette
modification est réversible? Quel avantage cela apporte-t-il?

A

La phosphorylation/déphosphorylation. La modification la plus fréquente est la
phosphorylation/déphosphorylation. L’effet de la phosphorylation varie selon les
protéines : certaines sont activées par la phosphorylation alors que d’autres sont inhibées
par l’ajout d’un groupement phosphate. La réversibilité de la phosphorylation permet à la
cellule de restaurer le niveau d’activité original de l’enzyme lorsque cela est nécessaire.
En général, la phosphorylation est catalysée par une kinase et la déphosphorylation par
une phosphatase.

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13
Q

Quelle est la distinction entre régulation et contrôle métabolique?

A

Le terme régulation métabolique réfère au mécanisme capable de moduler l’activité
d’une enzyme spécifique via une interaction moléculaire. Il s’agit de mécanisme
permettant de maintenir l’homéostasie au niveau moléculaire, c’est-à-dire de maintenir
un ou des paramètres cellulaires (concentration d’un métabolite, par exemple) à un
niveau constant dans le temps, même si le flot des métabolites dans un sentier est
modifié.
Le terme contrôle métabolique est utilisé lorsqu’un régulateur à un effet direct sur le
flux à travers tout le sentier. Bref, la régulation est une propriété locale influençant
l’activité d’une seule enzyme. Tandis que le contrôle est une propriété locale affectant le
flux dans tout le réseau métabolique.

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14
Q

Quel est l’impact des réactions loin de l’équilibre dans les sentiers métaboliques?
Comment identifie-t-on ces réactions?

A

Ces enzymes permettent de réguler le flux ainsi que la direction d’un sentier métabolique.
Ils forment les points de contrôle des sentiers.
Il est possible d’identifier les réactions qui sont loin de l’équilibre en comparant le Q et
K´eq. Lorsque Q et K´eq diffèrent de plus de deux ordres de grandeur (plus de 100 fois), la
réaction est considérée comme loin de l’équilibre. On peut également regarder le ∆G,
plus sa valeur est grande, plus la réaction est loin de l’équilibre.

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15
Q

L’AMP est un indicateur de l’état énergétique plus sensible que ne l’est l’ATP.
Pourquoi?

A

Si on considère un changement de 0,1 mM dans la concentration de ces deux molécules,
le changement relatif (en pourcentage) de la concentration d’AMP est beaucoup plus
grand que celui de l’ATP puisque leur concentration de départ est différente. En général,
la concentration d’ATP est beaucoup plus grande que celle d’AMP (environ 50 fois plus
grande). Puisque la [ATP] intracellulaire (5-10 mM) est beaucoup plus grande que celle
de l’AMP (0,1 mM), une faible variation dans la [AMP] est plus facile à détecter qu’une
variation identique dans la [ATP]

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16
Q

Quelle kinase est activée par une augmentation de la concentration d’AMP?

A

L’AMPK aussi appelé AMP-activated protein kinase.

17
Q

À quoi sert l’analyse du contrôle métabolique?

A

L’activité des enzymes de tous les sentiers interconnectés doit aussi être ajustée afin de
maintenir l’homéostasie. Lorsqu’on étudie une enzyme in vitro, on la purifie ce qui la
sépare de ses partenaires physiologiques. De plus, lors de ces études, les concentrations
utilisées d’enzymes, de substrats et de modulateurs sont parfois très loin des
concentrations observées dans un contexte physiologique. Bien que cela soit pratique
pour comprendre le mécanisme d’une enzyme et identifier les régulateurs potentiels, il
n’est pas possible d’évaluer l’impact de la régulation d’une enzyme sur le flux de la voie
métabolique entière si tous les autres aspects de cette voie ont été éliminés.

18
Q

Définir les 3 paramètres au centre des analyses de contrôle métabolique.

A

Le coefficient de contrôle de flux (C) exprime la contribution relative de chaque enzyme
au flux d’un sentier entier. C n’est pas une constante et dépend du système en entier, de la
concentration des substrats et des effecteurs. C a une valeur de 0 pour une enzyme qui n’a
pas d’impact sur le flux et de 1 pour une enzyme qui détermine à elle seule le flux d’un
sentier.
Le coefficient d’élasticité (ε) permet exprimer quantitativement la réponse d’une enzyme
spécifique à un changement dans la concentration d’un substrat ou d’un modulateur
(inhibiteur ou activateur). ε est déterminé par les propriétés cinétiques intrinsèques de
l’enzyme. On le mesure à l’aide de graphiques de vitesse en fonction de la concentration
du substrat, une expérience classique en enzymologie. Cependant, pour calculer les
coefficients d’élasticité, tous les réactifs et tous les effecteurs doivent être présents dans
des concentrations aussi proches que possible de celles rencontrées dans les cellules. Ceci
inclut les produits, bien sûr, et implique que les réactions doivent être étudiées dans des
conditions où elles sont réversibles.
Le coefficient de réponse (R) permet de relier entre eux les trois coefficients, C, ε et R. La
réponse (R) d’un sentier à un facteur externe influant sur l’une des enzymes du sentier est
fonction de (1) la sensibilité du sentier aux changements de l’activité de l’enzyme en
question (coefficient de contrôle du flux (C)) et de (2) de la sensibilité de l’enzyme aux
changements dans la concentration du facteur régulateur externe (le coefficient
d’élasticité (ε)) : R = C · ε
La réponse de chacune des enzymes d’un sentier peut être étudiée de cette façon, et les
effets de n’importe quel facteur externe sur le flux d’un sentier peuvent être déterminés
séparément. Ainsi, en principe, il est possible de prédire les variations du flux d’un
sentier quand il y a un changement dans la concentration d’un ou de plusieurs facteurs
externes contrôlant le sentier.

19
Q

Classez du plus rapide au plus lent ces 3 modes de régulation des sentiers métaboliques.

A

régulation allostérique , phosphoryation/déphosphorylation , contrôle génétique

20
Q

Hormone sécrétée par le pancréas lorsque la concentration de glucose sanguin est élevée.
Hormone sécrétée par les glandes surrénales lors d’un activité musculaire ou d’un stress.
Hormone sécrétée par le pancréas lorsque la concentration de glucose sanguin est faible.

A

insuline, épinéphrine, glucagon

21
Q

Comment nomme-t-on les séquences spécifiques d’ADN où se lient les facteurs de transcription?

A

élément de réponse

22
Q

Lequel de ces énoncés est faux?
A.

L’état stationnaire (steady-state) définit un ensemble de conditions (paramètres) physiologiques compatibles avec la vie d’un organisme.
B.

Le terme « équilibre thermodynamique » a le même sens que « l’état stationnaire ».
C.

Pour demeurer vivante, une cellule doit capturer, transformer, emmagasiner et utiliser l’énergie.

A

B

23
Q

Lequel de ces énoncés est vrai?

A.

Les enzymes ne peuvent être régulées que par un mécanisme à la fois.
B.

Le substrat d’une réaction ne peut être un effecteur allostérique de l’enzyme qui catalyse cette réaction.
C.

L’allostérie permet de changer rapidement l’activité d’une enzyme en réponse aux changements locaux de concentration d’une petite molécule.

A

C

24
Q

Lequel ou lesquels de ces énoncés sont faux?

A.	

Dans un sentier, l’enzyme catalysant la réaction la plus lente détermine la vitesse du flux dans le sentier entier.
B.

Les valeurs de contrôle du flux (C) sont toujours entre 0 et 1.
C.

La somme des coefficients de contrôle de flux pour toutes les enzymes d’une voie métabolique sera approximativement égale à 1.
D.

Pour une enzyme classique, les valeurs de ε se situe entre 0 et 1.
E.

Pour les enzymes allostériques, les valeurs de ε peuvent dépasser 1 mais ne peuvent excéder le coefficient de Hill de cette enzyme.

A

A,B

25
Q

equel de ces énoncés sur le coefficient de contrôle de flux de chaque enzyme d’un sentier est vrai?

A.

C’est une valeur intrinsèque à chaque enzyme d’un sentier.
B.

C’est la mesure relative de l’impact de chaque enzyme sur le flux dans un sentier.
C.

La somme des coefficients de contrôle pour un sentier complet est de 0.
D.

C’est la mesure absolue de l’impact de chaque enzyme sur le flux dans un sentier.

A

B

26
Q

Une cellule métaboliquement active est dans l’état stationnaire seulement si :

A

Les intermédiaires sont formés et consommés à des vitesses égales.

27
Q

Asscie les choses
Sensibilité d’une enzyme aux changements dans la concentration d’un facteur régulateur externe

2.

Représenté par la lettre C

3.

Contribution relative de chaque enzyme au flux d’un sentier entier

4.

Réponse d’un sentier à un facteur externe influant sur l’une des enzymes du sentier

5.

Représenté par la lettre ε

6.

Représenté par la lettre R

A

Coefficient d’élasticité, Coefficient de controle de flux,Coefficient de controle de flux, coefficient de réponse , Coefficient d’élasticité,Coefficient de réponse

28
Q

Comment se nomme la conformation active d’une enzyme allostérique?

A

état R