Chapitre 6 - Transcription Flashcards
Quelle base est la plus stable; uracile ou thymine?
Thymine
La fonction alcool du ribose sur son C 2’ permet l’hydrolyse alcaline causée par la _______________
cyclisation du phosphate
Vrai ou faux. La thymine est moins couteuse à produire que l’uracile
faux
Quelle mutation est réparée par l’enzyme ‘uracil DNA glycosylase
désamination de cytosine
Vrai ou faux. L’ARN forme des structure secondaires très variées
vrai
Quel appariement non conventionnel est possible dans l’ARN
G-U
Comment se nomment les enzymes formées d’ARN
ribozyme
Quel ARN est le plus important en terme de masse totale dans la cellule
ARNr
Quel ARN est le plus important en terme de nombre par cellule
ARNt
Vrai ou faux. Si le brin matrice de l’ADN est de 5’ vers 3’, le brin d’ARN transcrit sera de 5’ vers 3’.
faux
Combien de nucléotides entrent dans la transcriptase
10
Vrai ou faux. La transcriptase a besoin d’une hélicase pour ouvrir l’ADN double brin quand elle s’accroche au promoteur
faux
Vrai ou faux. La transcriptase synthétise de 3’ vers 5’.
faux
L’ARNm possède la même séquence que
a) le brin matrice
b) le brin codant
b
Combien de tours de l’ADN double brin sont déroulés lors du passage de la transcriptase
1
Vrai ou faux. La transcriptase est très variable d’espèces en espèces
vrai
La transcriptase possède combien d’entrées-sorties
5
Vrai ou faux. Les eucaryotes ont une seule transcriptase, tout comme les bactéries.
faux
Quelle transcriptase synthétise les ARNm chez les eucaryotes
ARN pol II
Vrai ou faux. La transcriptase n’a pas besoin d’amorces
vrai
Sur quel nucléotide commence la polymérisation de l’ARNm chez les procaryotes
adénine
Vrai ou faux. En hétérochromatine, il n’y a pas de transcription
vrai
Qu’est-ce qui permet la régulation de la transcription
a) l’enroulement de la chromatine
b) la force de la transcriptase
c) le promoteur
d) le pH de la cellule
e) a-b-c
f) a-c
g) a-b-c-d
h) b-c
f
Quel ion métallique du site catalytique de la transcriptase permet le détachement du brin nouvellement synthétisé
a) Mg2+
b) Zn2+
b
Vrai ou faux. il y a plus d’erreurs commises lors de la réplication que lors de la transcription
faux
L’initiation de la transcription se fait en 3 étapes. Dans quel ordre apparaissent ces complexes.
a) complexe ouvert, complexe de transcription initiale, complexe fermé
b) complexe ouvert, complexe fermé, complexe de transcription initiale
c) complexe fermé, complexe ouvert, complexe de transcription initiale
d) complexe de transcription initiale, complexe ouvert, complexe fermé
c
Vrai ou faux. La transcriptase doit s’y prendre à plusieurs reprises avant de commencer la polymérisation de l’ARNm
vrai
Ou se situe le promoteur d’un gène
a) avant
b) après
c) au milieu
d) pas d’importance
a
Vrai ou faux. La liaison de la polymérase au promoteur peut se faire dans n’importe quelle orientation, soit de 5’ vers 3’ et de 3’ vers 5’
faux
Vrai ou faux. Le promoteur détermine l’orientation du gène
vrai
Quels sont les 3 facteurs qui influencent la force d’un promoteur
- capacité du promoteur à lier la polymérase
- isomérisation efficace
- facilité de la polymérase à échapper au promoteur
Quel genre de séquence permet d’ouvrir facilement le db d’ADN
A-T
Vrai ou faux. Après avoir échappé au promoteur, la polymérase risque d’arrêter la transcription plusieurs fois.
faux
Vrai ou faux. Chez les procaryotes, la transcriptase peut commencer la transcription n’importe ou.
vrai
Le facteur sigma force la transcriptase à commencer la transcription au _________
promoteur
Quel facteur sigma est le plus répandu chez E.Coli
sigma 70
Quelle séquence le facteur sigma le plus répandu chez E.Coli reconnaît-il sur le promoteur associé
a) -35 et -5
b) -70 et -10
c) -70 et -35
d) -35 et -10
e) -30 et -5
d
Vrai ou faux. Plus un promoteur s’approche de la séquence consensus, moins il est fort
faux
À quoi sert le discriminateur (PROCARYOTES)
stabilise l’enzyme sur le promoteur
Combien de régions comporte la sous unité sigma
4
Quelle région de la sous unité sigma reconnaît le discriminateur
1
Quelle région de la sous-unité sigma reconnait la région -10
2
Quelle région de la sous-unité sigma reconnait l’extension -10
3
Quelle région de la sous-unité sigma reconnait le -35
4
Quelle région de la sous-unité sigma participe à l’isomérisation
1
Quelle région de la sous-unité sigma stabilise le brin codant de la même manière que les protéines SSB
2
À partir de quel moment dans l’initiation de la transcription chez les procaryotes on passe du complexe fermé au complexe ouvert
isomérisation
Comment on passe du complexe fermé au complexe ouvert
- les pinces se resserrent sur l’ADN db devant l’enzyme
- la région 1 de sigma 70 est expulsée du site actif, ce qui permet d’accommoder le brin matrice
Quelle partie de la sous-unité sigma empêche d’échapper au promoteur
3.2
Lors de l’élongation de la transcription chez les procaryotes, comment se nomme la correction “Ctrl-Z” qui permet d’enlever le dernier nt en lui remettant son grp PPi perdu
Correction pyrophosphorolytique
Lors de l’élongation de la transcription chez les procaryotes, comment se nomme la correction “retour en arrière et excision d’une séquence de quelques nucléotides et ensuite enzymes de réparation via TRCF
correction hydrolytique
Lors de la transcription chez les procaryotes, qu’est ce qui permet le passage vers le complexe ternaire stable
Expulsion du 3.2
Qu’est ce que la TRCF
Transcription repair coupling factor
Quelles enzymes recrutent la TRCF (le nom du groupe)
UVR
TRCF se lie à quoi exactement
ADN
Quand la TRCF entre en collision avec ARN polymérase, il y a soit reprise des activités de l’enzyme ou bien….
dissociation
Chez les procaryotes, la terminaison de la transcription par la fin intrinsèque est causée par la formation d’une épingle entre deux régions
a) riche en AT complémentaire
b) riche en GC complémentaire
c) la queue polyA
d) riche en UG complémentaire
b
Chez les procaryotes dans la terminaison de la transcription par la fin intrinsèque. Place les événements en ordre:
- détachement de la deuxième séquence complémentaire riche en GC
- détachement de la transcriptase
- Arrêt de la transcription
- Les liaisons U-A se dissocient et l’ARN est relâché
* écrire la réponse comme suit: #-#-#-#
1-3-4-2
Le facteur Rho est un facteur de
a) initiation
b) élongation
c) terminaison
c
Quelle séquence lie le facteur Rho
rut
Pourquoi les régions Rut sont libre de ribosomes
Elles sont _____ le site de terminaison de la traduction (codon stop)
après
Comment se nomment les gènes qui ont chacun leurs promoteurs chez les eucaryotes multicellulaires.
monocistroniques
Chez quel règne la transcription est plus régulée
a) euk
b ) prok
a
Par combien d’ARN pol se fait la transcription chez les eucaryotes
3
L’ARN polymérase II des eucaryotes possède combien de sous-unités
12
Sur quelle sous unité se situe la queue CTD de l’ARN polymérase des eucaryotes?
RPB1
Que veut dire CTD
carboxy terminal domain
La queue CTD est une répétition de combien d’acides aminés
7
Nommez les acides aminés qui se répètent en tandem dans la queue CTD (en ordre).
Écrire la réponse comme suit: ###-###-###-###. (chaque ### stands pour les 3 lettres de l’acide aminé en question)
Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser
La queue CTD est contrôlée par _________ sur ses a.a.
phosphorylation
Vrai ou faux. La CTD est impliquée dans le recrutement des facteurs de maturation des pré-ARNm.
vrai
Quels a.a. de la CTD sont phosphorylés lorsque l’ARN pol II s’attache au promoteur
aucun
Combien de séquences conservées dans les promoteurs sont utilisés par l’ARN pol II
4
Quel facteur de transcription général lie la séquence BRE
TFIIB
Quel facteur de transcription général lie TATA
TBP
Quel facteur de transcription général lie DPE
TFIID
Quel facteur de transcription général lie Inr
TFIID
Qu’est-ce qui joue le même rôle que la sous unité sigma chez les eucaryotes
facteurs de transcription généraux
Quel promoteur, chez les eucaryotes, est le plus fréquent
Inr
Sur quel facteur de transcription général survient la formation du complexe de pré-initiation
TATA
Vrai ou faux. Chez les eucaryotes, le promoteur est toujours devant le gène
faux
La boîte TATA est un promoteur fort ou faible
fort
Vrai ou faux. Une seule modification de nt au niveau de la séquence TATA diminue drastiquement la force du promoteur
vrai
La boîte TATA se situe a combien de nt devant le gène (entre # et #, écrire la réponse #-#)
25-35
Vrai ou faux. Les GTF (facteurs de transcription généraux) sont optionnels pour lier l’ARN pol II à l’ADN
faux
Quel facteur de transcription général est le plus grand et le premier à agir
TFIID
Sur quel sillon le domaine C-terminal de TBP se replie
mineur
Quelle est la seule séquence ADN que TBP peut plier
TATA
Dans quel canal de la pol II s’insère TFIIB
canal de sortie d’ARN
Quel domaine de TFIIB entre en contact avec la pol II en premier
N-terminal
Quel est le site de liaison de TFIIH au complexe d’initiation
TFIIE
Vrai ou faux. TFIIH a trois activités, soit l’hydrolyse de l’ATP, hélicase et phosphorilation de CTD
vrai
Quelle est l’étape limitante de l’initiation de la transcription chez les eucaryotes
Scan de l’ADN par TBP
Vrai ou faux. Le complexe initiateur, chez les eucaryotes, continue la transcription avec pol II
faux
Vrai ou faux. Tous les facteurs généraux se détachent du promoteur lorsque la pol II s’éloigne du site d’initiation
faux
À quoi sert le facteur TFIIA lors de l’initiation de la transcription chez les eucaryotes
stabiliser
Comment se nomme le complexe qui donne accès au génome à l’ARN polymérase et aux facteurs de transcription, quand l’ADN eucaryote est enroulé dans les nucléosomes
Complexe médiateur
Quel groupement est ajouté aux queues N des histones pour faciliter leur expulsion lors du passage de la machinerie de transcription
acétyl
La synthèse de l’ARNm est plus _____ lors du recrutement des facteurs d’élongation par la phosphorylation de la queue CTD
rapide
Vrai ou faux. Le complexe médiateur permet de dérouler le promoteur et tous les nucléosomes de brin matrice
faux
Quelle protéine permet de déroulé les nucléosomes après le complexe médiateur
FACT
Vrai ou faux. Il ne faut qu’enlever le dimère H2A-H2B des histones pour permettre le passage de la machinerie de transcription
vrai
Combien d’adénines son ajoutés à la fin de l’ARNm chez les eucaryotes
200
Vrai ou faux. C’est la transcriptase qui ajoute la queue poly-A sur l’ARNm
faux
La protéine Rtt103 qui lie le CTD recrute quelle exonucléase
Rat1
Comment se nomme le modèle de terminaison de la transcription qui implique que la protéine Rat1 entre en collision avec pol II, ce qui cause son détachement
torpedo model
Vrai ou faux. La maturation des ARNm commence dès l’élongation de la transcription
vrai
