Chapitre 5 - Manipulation ADN Flashcards
Qu’est-ce que la transgénèse?
Introduction d’un gène étranger dans un génome d’intérêt
Comment se nomme la technique par laquelle on modifie le génome de manière aléatoire par des radiations
mutagénèse
Il y a deux types de transgénèse. La première est l’insertion d’un gène étranger dans un organisme d’intérêt, le a deuxième, la _________, permet d’insérer un gène modifié ou d’un proche parent dans cet organisme
cisgénèse
On clone un gène d’intérêt dans quel type d’ADN
plasmide
On s’assure de l’incorporation du plasmide ayant le gène étranger par la méthode ___________
antibiorésistance
Quelle technique est utilisée pour créer de grandes copie d’une séquence d’ADN précise?
Polymérisation en chaîne
Par quoi est délimité un fragment d’ADN que l’on doit copier, dans la technique PCR
amorces
Quelle enzyme est utilisée en PCR
Taq polymérase
Dans quel ordre se passe la PCR
a) dénaturation, polymérisation, hybridation
b) hybridation, dénaturation, polymérisation
c) dénaturation, hybridation, polymérisation
c
Chaque cycle de PCR _____ la quantité de molécules d’ADN initiale
a) double
b) triple
c) quadruple
d) exponentielle
a
à partir de quel cycle (PCR) on obtient les 2 fragments délimités par les amorces et rien d’autre?
a) cycle 1
b) cycle 2
c) cycle 3
d) cycle 4
c
À partir de quel cycle (PCR) la quantité de molécules désirées représente la majorité des molécules obtenues ?
a) cycle 3
b) cycle 5
c) cycle 7
d) cycle 10
e) cycle 12
b
la formule (2exp(n)-2n)x s’applique à quelle phase du PCR
exponentielle
Pourquoi, en PCR, on utilise la Taq polymérase et non une polymérase normale?
spécificité
Le PCR donne du matériel pour les autres techniques.
Quelles techniques peuvent être utilisées?
a) identification des polymorphismes (allèles)
b) diagnostic d’infections
c) diagnostics anténataux
d) recherche de séquences spécifiques
e) toutes ces réponses
f) aucune de ces réponses
g) a,b,c
h) b,d
i) a,d
e
Quelles enzymes permettent de travailler l’ADN avec des fragments plus courts?
endonucléases de restriction
Une enzyme de restriction coupe
a) sb
b) db
b
Endonucléase versus exonucléase?
a) endonucléase coupe au centre du fragment, exonucléase au bout
b) exonucléase coupe au centre du segment, endonucléase au bout
a
Les enzymes de restriction viennent de quel microorganisme?
a) protistes
b) levures
c) moisissures
d) bactéries
e) virus
d
Quel est le nom de l’endroit ou coupe une enzyme de restriction spécifique?
site de restriction
le site de restriction correspondant à une enzyme de restriction est composé de combien de nucléotides (écrire la réponse #-#)
4-8
la plupart des sites de restrictions sont des __________.
palindromes
La probabilité qu’un site de restriction apparaisse dans le génome de l’organisme séquencé _______ plus le site de restriction est grand
diminue
Il y a deux types de coupures causées par une enzyme de restriction. La première étant franche, comment se nomme la deuxième?
cohésive
Quelle enzyme est utilisée pour catalysée l’insertion des fragments coupés par les enzymes de restrictions
ligase
Les ligases forment quel type de liaisons
a) phosphodiester
b) liaisons H
c) liaison glycosidiques
a
La distance parcourue par la molécule d’ADN est
a) proportionnelle
b) inversement proportionnelle
à sa longueur
b
Pourquoi l’ADN se déplace vers l’électrode plus?
Phosphate négatif
Quelle est la différence entre un vecteur de propagation et un vecteur d’expression dans le clonage?
La présence de ___-
promoteur
Par quel phénomène l’ADN bactérien est protégé des enzymes de restrictions (versus l’ADN étranger)?
méthylation
Si on souhaite couper recoller un fragment d’ADN complémentaire, est-il mieux d’utiliser 1 ou 2 enzymes de restriction?
2
Vrai ou faux? En coupant l’ADN db avec une enzyme de restriction, l’ADN peut se recoller ensemble à la manière d’un 180 degrés. Ce phénomène s’appelle le clonage non-directionnel
vrai
Quel mécanisme, en plus de la ligase, doit on utiliser pour souder les fragments ayant une coupure franche causé par une enzyme de restriction
NHEJ
Vrai ou faux? Le colorant bleu est utilisé, lors de l’électrophorèse, pour visualiser la longueur des fragments
faux
Peut-on utiliser la bromure d’éthidium pour marquer l’ARN
non
Durant le séquençage , on utilise le clonage d’ADN pour construire une…
banque génomique
Vrai ou faux. Le plasmide contient des gènes nécessaire à la survie de la bactérie
faux
Vrai ou faux. La réplication du plasmide est autonome
vrai
Que signifie ORI
origine de réplication
On valide la présence du plasmide dans l’organisme modifié en y insérant un….
marqueur de sélection
Les sites de restriction des enzymes dans le plasmide se trouvent toutes dans le….
site de multiclonage
Deux facteurs sont importants dans une séquence d’ORI. La première est la facilité de l’ouverture, soit le nombre de AT versus GC. Quelle est la deuxième?
facilité de reconnaissance par la protéine initiatrice
Quel est le marqueur de sélection généralement utilisé pour permettre de savoir si le plasmide a été inséré dans la bactérie? Gène de
antibiorésistance
Vrai ou faux. Le fragment de restriction et le vecteur peuvent être coupés avec n’importe quelle enzyme
faux
À part la construction de banque génomiques, à quoi sert le clonage dans des vecteurs
production de protéines
Le vecteur de propagation.
a) possède un promoteur actif qui correspond à la régulation génique habituelle
b) réplique le vecteur en grande quantité
b
Un vecteur d’expression
a) possède un promoteur actif qui correspond à la régulation génique habituelle
b) réplique le vecteur en grande quantité
a
Si on utilise un vecteur d’expression et qu’on veut produire beaucoup de copie du gène, on crée un….
mutant de surexpression
Comment appelle-t-on la capacité des bactéries à faire de la transformation, soit d’incorporer l’ADN extérieur à leur ADN?
compétence génétique
Vrai ou faux. Le vecteur recombinant est le vecteur qui s’est refermé sur lui-même lors de la transformation
faux
Vrai ou faux. Si une colonie de bactérie transformée est bleu, le gène lacZ a été interrompu, ce qui signifie que la bactérie a recombiné le vecteur.
faux
Vrai ou faux. Les eucaryotes ne peuvent pas garder de plasmides dans leur organisme, ce qui signifie que le plasmide sera inséré dans leur ADN.
vrai
Comment se nomme le phénomène se produisant lorsqu’un gène est incorporé au hasard dans le génome de l’hôte
incorporation ectopique
Les gènes incorporés dans la cellule par “remplacement d’un gène” seront introduit dans l’organisme par quelle voie.
Recombinaison homologue